Heatmap: Cluster_21 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
0.34 -0.89 -0.01 -0.95 -2.18 -0.02 -0.14 -0.42 -0.76 0.56 -1.43 -0.97 0.17 -1.08 1.12 -0.08 -0.21 0.34 -0.39 -0.14 -0.67 -0.4 -1.42 2.16 0.75 1.45 -0.24 1.26 -0.71 -0.44 0.44 -0.47 -0.49 0.02 0.66 -0.45 1.0 0.37 -0.96 -1.26 -4.87 -4.28 -1.3 -0.46 -1.09 0.48 0.27 -1.04
-1.72 -2.04 -1.23 -1.48 1.01 -0.2 -0.7 -0.62 -1.47 0.28 -0.23 -0.12 0.32 -0.07 0.3 -1.42 -0.47 -1.44 -0.96 -0.72 -0.3 -0.24 -1.32 2.03 0.66 -0.43 0.59 0.08 -0.72 -0.31 0.2 0.1 0.34 0.32 1.85 0.52 0.16 -0.26 0.08 -0.36 -0.35 -0.71 -0.21 -0.18 0.06 -0.08 0.14 -0.09
-1.64 -1.46 0.02 -2.75 0.07 0.31 0.23 0.58 -1.22 -0.07 -2.24 -2.32 -0.85 -1.54 -0.64 -1.78 -0.1 -0.62 0.34 0.52 -0.11 -0.37 -2.04 1.35 -0.11 -0.87 -0.42 1.31 -0.01 0.44 1.06 0.61 0.55 0.65 0.05 0.86 1.07 0.39 -0.63 -0.37 -0.91 -1.17 -0.65 -0.04 -0.52 0.34 0.56 0.49
-1.63 -1.78 -1.76 -0.72 -0.73 -1.78 -2.17 -1.86 -1.91 0.49 -4.76 -4.62 0.02 -1.94 0.25 -2.74 -2.25 -1.11 -2.23 -1.89 -1.48 -1.15 -4.98 1.96 -0.37 -1.29 -1.18 1.12 1.71 0.35 1.65 0.03 1.03 0.93 0.65 1.69 1.71 0.05 -0.07 -0.33 -1.82 -1.64 -0.36 0.18 0.1 0.03 1.09 -0.36
-2.81 -1.05 -0.72 -3.82 -0.19 -0.47 -0.74 -0.26 -0.52 0.07 -4.2 -4.47 -0.92 -1.69 0.77 -0.59 -0.73 -0.1 -1.8 -0.25 -0.45 -0.09 1.14 3.18 1.19 -0.32 -0.2 0.41 0.57 -0.11 0.4 -0.94 0.43 0.27 -0.49 0.95 -0.03 -0.61 -0.53 -0.79 -2.99 -3.2 -1.42 -0.08 -0.76 -0.77 0.67 0.09
-0.52 -0.05 1.05 -2.41 0.27 0.9 0.71 0.8 -0.81 0.23 -4.45 -4.54 -1.51 -4.31 -0.37 -0.9 -0.52 1.06 -1.12 -1.64 -1.12 -0.64 -2.15 0.74 0.49 -0.09 -1.57 0.93 0.99 0.59 1.44 -3.48 0.22 0.13 2.1 0.33 0.35 -0.56 -0.77 -1.42 -2.28 -1.28 -1.2 -2.05 -1.19 -0.55 1.46 -0.38
-2.87 -1.06 -0.68 0.54 0.86 1.15 0.67 0.68 -0.5 0.16 -1.61 -1.64 -0.95 -2.58 -0.61 -4.64 -0.33 -0.84 -0.23 -0.3 -0.5 -0.5 -1.74 0.84 0.3 -1.71 0.32 1.19 0.69 0.29 0.95 0.6 0.57 0.68 -1.01 0.76 0.76 0.06 -0.45 -0.52 -1.91 -1.87 -0.45 0.09 -0.29 -0.0 0.83 -0.06
-0.64 -0.58 -0.27 -3.09 -0.72 0.4 0.6 0.51 -0.31 -0.79 -1.5 -1.53 -0.85 -0.98 -0.56 -1.05 0.65 -1.61 0.28 0.14 -0.89 -1.38 -0.29 0.98 -0.93 -1.96 -0.52 0.69 0.68 0.41 0.99 0.36 0.4 0.57 0.42 0.17 0.58 0.2 0.2 0.18 -0.0 0.1 0.12 -0.05 0.01 0.31 0.52 0.44
-1.55 -2.26 -2.71 -4.12 -1.13 -1.1 -1.04 -1.48 -1.93 -0.29 0.77 0.7 -0.05 -0.82 0.89 -2.27 -1.59 -3.0 -2.96 -2.73 -2.13 -1.94 -4.8 -4.29 0.0 0.16 0.57 0.63 1.47 -0.1 0.44 0.29 0.83 0.67 -0.54 0.78 1.44 -1.23 0.86 0.19 0.37 0.38 0.36 1.31 1.22 -1.25 1.33 0.29
-0.59 -1.44 -1.83 -3.74 -0.12 -0.79 -1.12 -0.91 0.11 0.63 -2.86 -2.85 0.07 -0.8 1.06 -2.8 -0.77 -0.47 -0.44 -0.56 0.07 0.53 -1.71 1.41 0.19 -0.5 -0.77 0.52 -1.51 -0.01 1.26 -0.37 0.27 0.57 1.84 0.37 0.59 0.38 -0.25 -0.34 -0.85 -0.56 0.24 0.06 0.32 0.45 0.53 0.37
-1.63 -1.63 -0.81 -3.9 -0.38 -0.01 -0.09 -0.43 -1.63 0.52 -2.95 -2.47 0.73 -0.5 1.02 -1.69 -0.51 -1.16 -0.42 -0.1 -0.2 -0.53 -1.5 -2.18 0.43 -0.32 -0.01 0.5 0.54 0.28 0.7 0.33 0.82 0.64 2.1 1.36 1.44 -0.15 -0.44 -0.64 -1.03 -1.13 -0.22 -0.39 -0.4 -0.24 -0.02 0.15
-3.26 -1.08 -0.93 -3.26 0.38 0.06 -0.09 -0.27 -2.23 0.35 0.41 0.4 -0.09 -1.27 0.2 -1.28 0.05 -0.57 -0.78 -0.54 -0.41 -0.62 -1.79 1.96 -0.17 0.29 -0.45 0.7 -0.2 -0.07 1.01 0.21 0.33 0.32 1.05 0.43 0.97 0.29 -0.33 -0.58 -0.78 -1.23 -0.31 -0.2 -0.26 0.31 0.41 -0.07
0.2 -1.42 -0.15 -2.3 -0.81 -0.68 -1.36 -0.89 -0.46 0.53 -2.67 -2.91 -0.43 -0.8 0.03 -1.76 0.79 -0.25 -0.04 0.2 0.47 0.2 -2.79 0.31 -0.53 -1.06 -1.53 1.06 0.19 0.4 0.38 0.43 0.67 0.69 -1.3 0.44 0.4 0.41 0.11 0.36 -0.4 0.11 0.55 0.93 0.37 0.36 1.29 -0.67
-0.59 -1.11 -1.25 -2.06 0.01 0.09 0.19 -0.07 -0.31 0.67 0.8 0.82 -0.22 -0.79 -0.05 -0.3 -1.27 -2.54 -0.98 -1.09 -1.12 -1.33 -3.64 0.55 0.39 -2.21 0.16 0.97 1.35 0.39 -0.13 0.62 0.31 0.41 1.33 0.01 0.44 0.26 -0.06 -0.19 -1.39 -1.36 0.15 0.13 0.22 0.21 0.39 -0.05
-3.96 -3.05 -3.18 -5.58 -1.69 -0.92 -0.77 -1.54 -2.7 0.38 -7.69 -7.59 -1.86 -3.83 0.46 -3.21 -2.32 -0.74 -2.22 -1.14 0.27 0.16 -3.87 2.09 -0.47 -5.11 -3.85 1.89 -0.14 0.7 0.51 -0.0 0.42 0.7 -2.97 2.65 0.17 -1.3 0.93 -1.29 - -5.6 -0.91 1.81 -0.54 -1.78 2.56 -0.18
-1.52 -1.75 -1.51 -3.2 0.23 0.14 0.33 0.35 -0.58 0.26 -0.5 -0.71 0.17 0.31 0.07 -1.03 -1.44 -1.68 -0.27 -0.25 0.25 0.26 -2.06 1.31 0.38 -1.6 0.65 0.31 -0.32 -0.0 0.68 0.58 0.66 0.46 0.11 0.1 0.44 0.14 -0.19 -0.09 -0.14 -0.34 0.24 0.03 0.52 0.28 0.29 0.1
-1.73 -1.08 -0.72 -2.83 0.03 0.07 -0.3 -0.17 -1.3 -0.08 -4.8 -4.83 -0.69 -2.14 -0.1 -2.81 -0.6 0.34 -1.02 -0.62 0.17 0.36 -1.92 1.65 -0.11 -1.88 -1.73 1.26 1.24 0.3 0.92 -0.71 0.9 1.12 0.79 1.32 1.51 -0.49 0.38 -0.52 -3.46 -3.03 -0.36 0.27 0.17 -0.48 0.88 -0.44
-1.43 -0.97 -2.33 -2.15 -3.46 -2.19 -2.24 -2.34 -1.38 0.26 -3.91 -3.82 -0.11 -1.56 -0.45 -2.74 -1.63 -1.23 -2.8 -2.46 -2.17 -1.68 -3.51 1.23 -1.26 -2.08 -1.91 0.84 1.43 0.6 1.66 0.33 1.45 1.18 0.63 1.5 1.59 1.17 0.59 -0.07 -3.81 -3.33 -0.03 0.18 1.2 1.08 1.14 -0.51
-4.44 -0.74 -3.65 -3.03 -3.41 -2.1 -2.48 -1.75 - 0.84 -2.26 -3.01 0.17 -1.63 -0.57 - -2.92 -0.09 -3.89 -2.69 -3.2 -2.38 - 2.09 1.13 -2.04 0.23 1.1 0.03 0.22 2.15 0.49 1.25 0.95 -0.48 1.59 1.86 0.97 0.06 -0.86 -3.0 -2.82 -0.34 -0.41 0.06 0.96 0.84 -0.58
-2.35 -1.72 -1.03 -2.14 0.59 -0.69 -0.6 -0.72 -2.47 -0.4 -4.64 -4.4 -0.7 -1.48 -0.5 -4.2 -1.73 0.54 -0.83 -0.89 -0.11 0.74 -3.51 1.6 0.61 -0.28 1.59 0.83 -0.22 0.28 1.65 -2.1 1.15 1.05 -1.39 0.92 1.48 0.63 0.25 -0.5 -1.12 -1.53 -0.87 -0.7 -0.05 0.69 0.26 -0.11
-1.66 -1.69 -1.15 -3.99 0.27 -0.61 -0.09 -0.03 -0.49 0.11 -2.2 -2.27 -0.57 -1.12 -0.39 -0.69 -0.75 -0.63 -0.38 -0.14 -0.13 -0.19 -3.23 1.25 0.11 -1.56 -0.87 0.68 -0.21 0.36 1.34 0.57 0.89 0.55 -0.34 1.1 0.98 0.26 -0.21 0.21 0.39 0.12 0.15 0.14 0.48 0.13 0.78 0.23
0.47 -0.87 -0.17 -1.19 -3.55 -2.05 -2.18 -1.69 -0.55 0.35 -3.02 -3.32 0.48 -0.44 -0.05 -1.72 0.09 1.16 -0.29 -0.67 -0.52 0.04 -4.37 1.93 -0.12 -0.02 -1.31 0.79 0.38 0.29 0.54 0.48 0.3 0.92 0.23 0.97 0.61 0.37 0.21 -0.12 -1.8 -1.68 -0.41 0.39 -0.22 0.4 0.73 -0.15
-0.81 -0.75 -1.78 -2.58 -1.57 -1.24 -1.62 -1.31 -1.47 1.05 -3.23 -3.54 0.19 -0.34 0.48 -2.01 -0.83 -0.13 -1.67 -1.41 -0.9 -0.13 -3.58 0.72 -0.49 -0.37 -1.95 1.09 1.03 0.54 0.96 0.2 0.55 1.03 0.51 0.61 0.81 0.85 0.63 0.22 -2.62 -2.21 0.05 0.97 0.16 0.68 1.65 -0.04
-2.83 -0.49 -0.48 -1.81 0.05 -1.25 -0.77 -0.86 -1.12 0.1 -2.69 -3.03 -0.28 -0.72 -0.1 -1.51 0.17 0.62 -0.48 -0.36 -0.14 0.03 -3.21 1.81 0.47 -0.56 0.34 0.91 0.69 0.26 0.62 0.19 0.58 0.74 -0.4 0.53 1.09 0.28 0.24 -0.16 -0.9 -0.71 -0.13 0.24 0.25 0.26 0.39 -0.13
-0.72 0.25 -0.14 -2.45 1.46 -0.86 -1.13 -1.11 -0.55 -0.05 -3.41 -3.32 -0.73 -0.91 0.05 -1.21 0.38 0.8 -0.14 0.16 0.43 0.16 -0.79 2.27 0.24 -0.94 -1.35 0.7 1.06 0.23 0.08 -1.29 0.22 0.28 -0.42 0.46 0.12 -0.43 0.01 0.01 -1.88 -1.95 0.29 0.25 0.35 -0.57 0.19 -0.52
-0.19 -0.27 -0.45 -0.38 0.31 0.02 0.3 -0.2 -0.36 0.06 -0.03 -0.06 -0.24 -0.89 0.01 -0.8 -0.17 -0.53 -0.15 -0.08 -0.12 -0.4 -0.05 0.99 -0.33 -0.98 -0.49 0.57 0.47 0.11 0.19 0.13 0.44 0.51 -0.29 0.51 0.25 -0.02 -0.07 -0.06 -0.49 -0.48 -0.02 0.32 0.18 -0.08 0.61 0.07
-4.78 -1.05 0.72 -0.51 0.35 0.49 0.32 0.33 -1.06 0.77 -2.11 -1.88 -0.58 -1.59 0.25 -3.01 -0.71 -1.23 -0.67 -0.46 -1.22 -1.86 -0.38 2.5 -0.61 -1.18 -1.25 0.31 -1.17 0.12 0.66 0.54 0.51 0.31 -0.78 0.71 0.43 0.88 -0.28 -0.22 -0.83 -1.01 -0.38 0.27 -0.36 0.85 0.95 -0.32
-1.29 -0.35 -0.39 0.0 0.76 -0.31 0.23 0.0 -1.26 0.26 -0.89 -1.07 -0.58 -1.53 0.07 -2.87 -0.91 -0.73 -0.82 -0.26 -0.21 0.06 -3.76 2.51 0.36 -0.18 -0.1 0.63 0.15 0.08 -0.05 -0.57 -0.23 0.01 1.84 -0.17 0.04 0.15 -0.3 -0.91 -0.84 -0.52 -0.5 -0.65 -1.26 0.22 0.32 0.7
- -3.87 -0.36 -3.81 -3.3 -2.56 -1.95 -3.59 0.37 1.28 - - -0.3 -1.82 0.9 - -1.28 1.3 -0.6 -3.79 - -2.11 - 3.33 -0.42 -3.34 -5.33 1.47 -0.34 -0.35 0.46 -0.71 1.12 0.0 -2.14 2.62 1.66 0.33 -1.94 -2.44 -3.99 - -3.55 -0.76 -1.11 0.5 0.36 -1.51
-0.27 -2.73 -2.92 -2.16 -0.05 0.55 0.78 0.03 -0.53 -0.74 -2.56 -2.62 -2.52 -2.91 -0.61 -2.75 -2.37 -1.91 -0.49 -0.09 0.36 0.32 -0.83 2.27 -0.58 -2.66 -1.64 1.78 0.78 0.2 1.06 0.08 0.69 0.7 -2.03 0.28 0.83 -0.26 -0.17 0.29 -1.53 -1.74 0.63 0.54 -0.16 -0.25 1.46 -0.83
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-0.96 0.11 -0.35 -2.22 -0.67 -0.96 -0.72 -0.57 -0.44 0.48 -1.78 -1.88 -0.36 -0.86 0.31 -1.58 -0.03 -0.47 -0.18 -0.24 -0.21 -0.21 -1.44 0.77 -0.2 -0.51 -0.52 1.23 0.15 0.3 0.61 0.39 0.86 1.04 0.08 0.95 0.67 -0.13 0.54 -0.19 -1.44 -1.25 -0.08 0.57 0.52 -0.12 1.08 -0.09
-1.11 -4.78 -4.92 -6.01 -4.51 -1.11 -1.36 -1.62 -1.93 0.3 0.18 -0.19 0.61 -0.34 1.14 - -1.33 -4.05 -1.48 -1.48 -2.28 -1.99 -5.66 1.71 -0.45 -3.37 -0.85 0.48 1.12 0.65 0.83 -0.03 1.22 1.47 1.35 -0.05 1.34 0.29 0.15 0.24 0.17 0.03 0.55 0.07 0.18 0.36 0.0 0.34
-1.48 -1.28 -1.38 -2.29 -0.92 -0.77 0.16 0.11 -0.47 -0.71 -3.34 -4.12 -0.83 0.01 -0.92 -1.63 -1.51 -0.57 -0.54 -1.59 -13.26 -6.83 -1.42 2.51 -1.68 -0.31 -1.84 0.7 -0.11 0.88 1.01 0.1 1.77 1.69 -1.78 0.39 1.13 0.02 0.28 -0.7 -0.2 -1.17 -0.27 -0.27 1.12 0.3 0.43 0.52
-0.36 -0.5 -0.38 -2.43 -1.65 -0.79 -0.85 -1.13 -0.4 0.14 -2.64 -2.61 -0.11 -0.99 -0.14 -0.92 -0.51 -0.87 -0.35 -0.05 0.06 -0.18 -1.42 1.44 -0.94 -1.64 -1.53 1.17 0.42 0.64 0.41 0.11 0.26 0.98 -0.25 1.23 0.29 0.21 0.69 0.27 -1.35 -1.18 0.18 1.02 0.03 0.15 1.6 0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.