Heatmap: Cluster_113 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.91 -1.28 0.02 -3.34 1.78 -0.04 -0.37 -0.72 -0.84 0.72 -2.48 -2.67 0.12 -0.32 0.28 -0.88 -0.13 -0.46 0.22 0.95 1.18 0.97 -3.02 -2.07 0.42 -2.09 -1.19 0.01 -0.38 -0.22 0.23 -0.54 0.5 0.18 -0.95 0.26 0.32 0.7 -0.53 0.39 -0.23 -0.26 0.61 0.12 0.59 0.68 -0.07 -0.68
0.07 -0.9 -0.97 -1.85 1.38 -0.58 -0.8 -1.03 -0.95 -0.0 0.18 0.06 0.12 -0.02 -0.09 0.24 -0.64 -1.13 -0.22 0.01 0.05 -0.16 -2.01 -1.66 -0.29 -1.7 -0.04 0.68 0.5 0.02 0.11 0.4 0.41 0.54 0.15 0.93 0.36 -0.18 0.54 0.27 -0.33 -0.6 0.29 0.54 0.31 -0.15 0.43 0.21
-1.15 -0.37 0.05 -2.54 1.67 -0.19 -0.08 -0.03 -0.65 0.04 -0.51 -0.49 0.34 0.34 -0.03 -1.33 0.08 -0.44 0.22 0.38 0.35 0.14 -0.66 -1.3 -0.04 -0.32 -0.34 0.24 -0.19 0.04 -0.02 -0.08 0.23 0.32 -0.5 -0.04 0.37 0.43 -0.35 0.18 0.0 -0.2 0.18 0.21 0.22 0.45 -0.06 0.01
-1.52 -0.46 0.12 -1.94 2.02 0.48 0.81 0.64 -0.3 0.25 -0.68 -0.7 0.53 0.45 0.02 0.84 -0.28 -0.06 0.08 0.3 0.01 0.54 -1.64 0.09 0.71 0.1 0.27 -0.69 -0.77 -0.66 -0.22 -0.47 -0.42 -0.44 -1.04 -0.8 -0.18 0.24 -0.75 -0.25 0.1 -0.13 0.07 -0.67 -0.55 0.12 -0.84 -0.57
-2.39 -2.45 -0.36 -2.08 1.23 0.53 0.12 0.33 -1.78 0.43 -0.33 -0.47 -0.0 -0.89 0.01 -1.4 -0.94 -0.49 0.29 0.62 0.84 0.47 -0.37 -1.92 0.65 -1.52 0.3 0.11 -0.13 -0.12 0.2 0.1 0.5 0.26 -0.22 0.38 0.31 0.23 -0.49 0.25 -0.06 -0.16 0.47 0.18 0.06 0.29 0.21 0.05
-2.0 -1.76 -1.3 -1.25 1.84 0.53 0.45 0.54 -1.02 -0.3 -0.56 -0.53 -0.36 -1.05 -0.37 -1.27 -0.87 -1.68 -0.24 -0.05 0.01 -0.38 -0.58 0.13 -0.32 -1.34 -0.11 0.45 0.18 0.27 -0.02 0.16 0.47 0.42 0.28 0.14 0.28 0.6 -0.33 0.37 0.09 -0.04 0.41 0.15 0.28 0.55 0.19 0.43
-1.76 -0.95 -0.21 -2.42 1.65 -0.58 -0.53 -0.78 -0.8 -0.08 -0.58 -0.62 -0.53 -1.36 -0.32 -1.3 0.59 -1.16 0.88 0.84 1.02 0.5 -0.66 -2.0 -0.24 -1.58 -0.18 0.67 0.01 0.23 -0.02 0.31 0.54 0.46 -0.49 0.59 0.07 0.14 -0.27 0.17 -0.46 -0.75 0.35 0.35 0.26 0.11 0.46 0.34
-1.04 -0.95 0.58 -2.29 2.01 -0.29 -0.31 -0.16 -0.33 0.04 -1.53 -1.77 -0.01 0.24 0.02 -1.55 -0.47 -1.1 0.69 0.73 0.86 0.38 -0.41 -1.06 0.07 -1.51 0.2 -0.01 -0.15 -0.23 -0.21 -0.56 0.4 0.23 -1.54 -0.32 0.12 0.02 -0.25 0.64 0.23 0.03 0.65 0.31 0.31 0.1 -0.18 -0.35
-1.92 -1.25 -0.69 -1.76 1.77 0.24 0.5 0.41 -1.25 0.28 -0.38 -0.49 0.44 0.16 0.2 -1.28 -0.77 -0.64 -0.21 0.47 0.51 0.26 -0.76 -0.63 0.62 -0.9 0.69 -0.17 -0.01 -0.3 -0.11 0.01 -0.06 -0.07 -0.45 -0.1 0.4 0.06 -0.49 0.13 0.46 0.3 0.33 0.13 -0.08 0.03 -0.27 -0.36
-0.84 -0.56 0.21 -1.34 1.21 0.03 0.06 -0.0 -1.43 0.27 -0.54 -0.75 0.04 -0.19 -0.02 -0.29 0.48 0.61 0.1 0.73 0.7 0.8 -3.03 0.53 0.36 0.08 -0.38 -0.57 -1.72 -0.33 -0.15 -0.52 0.05 -0.16 -1.89 -0.52 -0.09 -0.11 -0.5 0.37 0.67 0.74 0.47 0.12 -0.14 -0.07 0.02 -0.31
-0.36 -0.56 0.07 -2.82 1.43 -0.06 -0.41 -0.66 0.02 0.19 -0.88 -0.89 -0.12 -0.47 -0.38 -0.54 0.2 -0.85 0.4 0.42 0.5 0.39 -0.58 0.24 -0.06 -1.34 -0.21 0.23 0.36 0.15 -0.02 0.21 0.29 0.31 -0.02 0.15 0.05 -0.0 -0.45 0.25 -0.29 -0.27 0.37 0.23 0.12 0.01 0.31 0.22
-4.9 -1.63 -0.98 -3.6 1.9 0.05 -0.04 -0.51 -2.06 -0.03 -1.22 -1.31 -0.29 -0.13 -0.58 -0.94 -1.44 -1.95 0.82 0.62 0.55 0.66 0.3 -2.89 0.12 -2.1 -0.25 0.44 -0.43 -0.06 0.62 0.25 0.66 0.44 -1.82 -0.11 0.63 0.51 0.32 0.46 0.1 -0.02 0.44 0.36 0.41 0.46 0.46 -0.31
-0.54 -0.43 -0.65 -2.37 1.74 0.2 0.07 0.23 -0.58 0.25 -2.55 -2.72 0.19 -0.64 -0.14 -0.21 0.13 -0.73 0.02 0.42 0.68 0.43 0.23 -1.78 0.62 -0.76 0.34 0.12 0.13 -0.2 0.4 -0.35 0.29 0.13 -0.05 -0.24 0.47 0.21 -0.78 0.1 0.01 -0.13 0.3 -0.08 0.08 0.21 -0.15 -0.43
-1.1 -0.38 -0.24 -3.07 1.81 -0.41 -0.55 -0.83 -0.58 -0.42 -1.2 -1.19 -0.39 -0.33 -0.5 -1.51 0.55 -1.59 1.01 1.02 0.84 0.12 1.42 -2.48 -0.51 -1.63 -0.02 0.67 -0.63 0.08 -0.16 0.25 0.31 0.29 -1.11 -0.28 0.04 -0.39 -0.27 0.56 -0.14 -0.38 0.65 0.33 0.33 -0.46 0.3 -0.22
-1.34 -0.43 0.18 -3.12 1.61 -0.13 -0.47 -0.39 -1.1 -0.05 0.08 0.19 -0.52 -1.4 -0.02 -1.01 -0.06 -0.79 0.52 0.71 0.74 0.3 -0.39 -2.06 0.22 -0.97 1.05 0.25 -0.77 0.11 -0.31 0.31 0.2 0.05 -0.5 0.3 -0.14 0.25 -0.7 0.26 -0.32 -0.72 0.23 0.54 0.04 0.33 0.28 0.32
-0.58 -0.11 0.44 -1.63 1.38 0.77 0.59 0.69 -0.13 0.25 0.04 -0.1 -0.18 -1.26 -0.12 -0.03 0.26 -0.14 0.37 0.33 0.23 0.04 -1.41 -0.5 0.11 -0.07 0.25 0.25 -0.82 -0.17 -0.15 0.82 0.13 0.2 -1.51 0.2 0.24 0.09 -0.87 -0.47 -0.96 -1.45 -0.45 -0.13 -0.34 0.08 0.11 -0.25
-1.4 -1.02 -0.45 -1.26 1.65 -0.5 -0.5 -0.34 -1.03 -0.01 -0.56 -0.46 0.19 0.56 0.27 -0.89 -0.45 -1.28 0.48 0.39 0.57 0.46 0.41 -0.88 0.18 -0.35 0.26 -0.19 -0.2 -0.22 -0.2 -0.51 0.23 -0.01 -0.09 -0.06 -0.1 0.04 0.12 0.13 0.53 0.47 0.37 0.07 0.16 0.09 -0.15 0.09
-1.24 -1.31 0.39 -1.13 1.67 0.16 0.14 0.42 -0.39 0.16 0.79 0.6 -0.71 -2.24 -0.21 -1.6 -0.09 -0.71 0.74 0.57 0.8 0.41 -1.69 -1.62 0.22 -0.81 0.49 0.32 -0.11 -0.07 0.29 0.58 0.3 0.06 -1.12 0.1 0.29 -0.17 -0.88 -0.3 -0.85 -1.17 -0.02 0.05 -0.32 -0.17 0.24 -0.05
-1.61 -0.49 -0.11 -2.21 -0.28 -1.64 -1.6 -1.82 -1.92 0.24 -2.6 -2.85 0.18 -0.4 -0.27 -1.7 0.27 -1.31 0.26 0.18 0.05 -0.22 0.33 -3.01 -0.2 -1.33 -0.41 0.77 0.12 0.23 0.52 0.27 0.77 0.91 -0.94 0.98 0.65 0.77 0.85 0.44 -0.35 -0.38 0.48 0.61 0.65 0.79 1.01 0.21
-1.59 0.67 0.48 -1.1 0.91 0.18 0.23 0.45 -0.63 0.17 -2.75 -3.6 -0.54 -1.81 -0.7 -3.02 -0.06 0.28 0.81 0.68 0.76 1.01 -0.55 -0.9 0.82 -0.84 0.64 0.02 -0.37 -0.29 0.63 -0.01 0.05 0.13 -1.1 -0.78 0.56 0.47 -0.47 0.16 -0.92 -1.22 -0.01 0.18 -0.09 0.42 0.48 -0.22
-1.28 -0.04 0.37 -2.41 0.17 -0.17 -0.26 -0.19 -0.61 0.26 -2.08 -2.33 -0.32 -0.76 0.12 -0.16 0.62 -0.45 -0.3 0.24 0.28 0.22 -0.66 -2.37 -0.12 -0.42 -0.75 0.94 0.16 0.44 0.5 0.12 0.5 0.64 -0.21 0.43 0.47 0.32 0.13 0.08 -0.62 -0.64 0.1 0.48 0.3 0.28 0.88 0.17
-0.56 -0.35 -0.33 -2.58 1.47 0.09 -0.1 -0.79 -0.58 -0.16 0.05 -0.08 -0.58 -1.51 -0.35 -0.51 0.11 -1.01 0.75 0.74 0.61 0.42 -0.32 -1.51 0.17 -1.14 -0.1 0.57 0.47 0.18 0.02 0.26 0.3 0.25 -0.41 0.08 0.15 0.05 -0.47 0.05 -0.68 -0.71 0.17 0.32 0.02 0.07 0.57 0.28
-1.21 -0.18 0.3 -1.95 2.02 -0.19 -0.7 -0.36 -0.91 0.16 0.13 -0.06 0.1 -0.46 0.17 -0.34 0.03 -0.5 0.47 0.34 0.53 0.32 -1.22 -1.57 0.02 -0.44 0.33 -0.05 -0.19 -0.08 -0.07 0.02 0.29 0.11 -0.7 -0.21 -0.03 -0.09 -0.41 0.08 0.01 -0.14 0.32 0.11 0.17 -0.07 -0.1 0.13
-0.0 0.77 0.98 -2.64 2.31 0.96 0.28 0.14 -0.76 0.64 -2.09 -2.45 0.66 0.17 0.38 -0.21 0.04 0.01 0.35 0.43 0.78 0.58 -1.04 -1.01 0.3 -0.82 -0.47 -1.12 -2.73 -1.1 -0.58 0.25 -0.12 -0.82 -4.96 -0.92 0.12 0.15 -1.06 -0.29 -0.37 -0.57 0.16 -0.11 -0.21 0.12 -0.66 -0.74
-0.68 -1.0 0.11 -1.74 1.98 0.38 0.09 0.22 -0.44 -0.0 -0.33 -0.43 -0.25 -0.5 0.06 -1.06 -0.91 -1.05 -0.1 0.22 0.44 0.06 -1.4 -0.78 0.52 -1.36 0.21 0.17 -0.34 -0.26 0.2 0.16 0.32 -0.03 -1.2 -0.25 0.23 -0.29 -0.55 0.31 0.61 0.41 0.54 0.43 0.28 -0.31 0.35 -0.27
-1.4 -0.81 -0.3 -2.06 1.81 -0.07 -0.02 -0.13 -0.96 0.11 -1.55 -1.74 0.34 0.52 -0.07 -0.72 -0.62 -0.65 0.05 0.51 0.57 0.34 -1.27 -0.28 0.66 -0.95 0.16 -0.15 -0.22 -0.19 0.06 -0.11 0.37 0.19 -0.5 0.11 0.44 0.04 0.02 0.25 0.25 0.23 0.54 0.01 0.37 0.05 -0.31 -0.25
-0.7 -1.26 -0.33 -3.22 1.18 0.77 0.43 0.52 -0.77 0.33 -0.54 -0.71 0.42 -0.07 0.07 -1.13 -0.03 -0.89 -0.13 0.2 0.33 0.0 -1.03 -2.34 0.01 -0.38 -0.23 -0.25 0.21 -0.05 -0.05 -0.11 0.35 0.43 -0.56 -0.44 0.32 0.2 -0.39 0.52 0.57 0.57 0.55 0.16 0.36 0.26 -0.27 -0.23
-0.85 -0.25 0.24 -2.26 1.29 0.21 -0.17 -0.29 -0.6 -0.24 -0.3 -0.37 -0.53 -1.22 -0.03 -2.09 0.31 -0.75 0.72 0.51 0.55 0.28 0.22 -2.05 -0.25 -0.76 -0.05 0.68 -0.47 0.18 -0.12 0.43 0.2 0.65 -0.57 0.51 0.14 0.24 0.06 -0.07 -0.77 -1.17 -0.08 0.35 -0.01 0.27 0.56 0.43
-1.07 -1.19 -0.14 -0.12 1.92 0.62 0.42 0.7 -1.95 0.26 -0.84 -0.83 0.26 -0.01 0.05 -0.31 0.23 -0.15 0.9 0.31 0.3 0.06 0.24 -1.0 0.42 0.09 0.01 -0.06 -1.12 -0.62 0.06 -0.84 -0.23 -0.33 -0.08 -0.45 0.06 0.44 -1.16 -0.34 0.28 0.3 -0.1 -0.8 -0.98 0.34 -1.25 0.08
-1.3 -0.74 -0.18 -3.15 -1.9 -1.19 -2.04 -1.82 -0.69 0.35 -1.63 -1.86 0.18 -0.16 0.15 -0.97 -0.26 -0.66 -0.33 0.11 -0.09 -0.23 -0.01 -2.19 -0.39 -0.82 -0.49 0.82 0.43 0.47 0.41 0.11 0.56 0.93 0.09 0.95 0.52 0.38 0.58 0.55 -0.3 -0.0 0.35 0.94 0.59 0.38 1.07 0.42
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-1.09 -0.84 -0.36 -2.45 1.28 -0.44 -0.39 -0.41 -1.2 -0.11 -0.03 0.04 -0.05 0.22 -0.29 -0.95 -0.39 -0.96 0.12 0.28 0.22 0.04 0.05 0.63 0.07 -1.45 -0.16 0.19 0.35 0.05 -0.0 0.02 0.18 0.13 0.05 -0.1 0.07 0.12 -0.09 0.35 0.45 0.46 0.5 0.23 0.17 0.16 0.19 0.19
-0.51 -1.29 -0.33 -3.78 1.15 -0.87 -0.96 -0.83 -0.81 0.08 -0.41 -0.49 0.3 0.52 -0.03 -1.97 -0.32 -1.05 -0.06 0.06 0.21 0.05 -0.82 -0.26 -0.31 -0.52 -0.57 0.2 0.38 0.16 -0.15 -0.33 0.48 0.42 0.25 0.03 0.19 0.44 -0.02 0.69 0.55 0.55 0.88 0.29 0.36 0.43 0.13 0.13
-3.13 -2.19 -0.86 -3.23 1.73 0.54 -0.22 0.23 -1.19 0.25 0.31 0.11 0.25 0.32 0.3 -0.88 -1.11 -2.17 0.34 0.74 0.88 0.81 -2.07 -1.11 0.89 -1.82 0.94 -0.44 -1.44 -0.57 -0.32 0.1 0.11 -0.17 -0.93 -0.46 -0.28 -0.37 -0.26 0.37 0.55 0.47 0.72 0.24 0.22 -0.36 0.05 -0.23
-1.48 -1.22 -0.53 -1.59 1.42 -0.61 -0.18 -0.29 -0.16 0.2 -0.43 -0.5 0.19 -0.32 -0.03 -1.46 -0.3 0.12 0.29 0.83 1.04 0.91 -0.99 -0.13 0.68 -0.3 0.24 -0.31 -0.1 -0.16 -0.04 -0.22 0.08 -0.23 -0.76 -0.62 0.26 0.13 -0.83 0.14 0.51 0.24 0.37 0.19 0.19 0.11 -0.21 -0.21
-0.39 -0.9 0.31 -0.85 1.88 -0.01 -0.33 0.06 -0.16 0.09 -1.0 -1.18 0.01 -0.64 -0.41 0.09 0.03 -0.18 0.46 0.55 0.96 0.64 -0.68 -1.18 0.18 -1.16 -0.4 -0.33 0.16 -0.31 0.04 -0.46 0.25 0.08 -0.28 -0.65 0.04 0.42 -0.66 0.35 -0.33 -0.38 0.47 0.14 0.16 0.39 -0.17 -0.78
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-0.81 -0.42 -0.18 -1.41 0.89 0.0 -0.23 -0.17 -1.31 0.62 -0.35 -0.45 0.07 -1.12 0.05 -1.15 0.23 -0.32 0.49 0.48 0.41 0.43 -2.42 -0.82 0.23 -0.34 -0.2 0.05 0.3 0.08 0.3 0.28 0.47 0.44 -0.55 -0.0 0.45 0.48 -0.64 0.12 -0.24 -0.09 0.15 0.1 0.02 0.47 0.48 -0.18
-1.22 -1.84 -0.92 -1.61 2.43 0.31 -0.77 -0.87 -2.42 0.09 -0.43 -0.24 -0.11 -0.56 -1.29 -0.95 -0.07 -1.32 0.3 0.51 0.87 0.93 -3.67 -1.6 0.01 -1.54 -0.96 0.0 -0.99 -0.28 0.91 0.76 0.3 -0.03 -1.25 -0.03 0.06 0.51 -0.2 0.51 -0.26 -0.38 0.63 0.19 0.08 0.58 0.4 -0.22
-0.82 -0.63 0.02 -3.35 1.58 0.48 0.51 0.57 -0.84 0.25 -0.72 -0.61 -0.17 -0.12 0.09 -1.51 -0.36 -0.36 -0.69 0.2 0.15 -0.11 -0.79 -0.25 0.25 -0.8 -0.03 0.04 0.01 0.0 0.24 0.19 0.12 -0.06 -1.79 -0.74 0.4 0.22 -0.42 0.46 0.65 0.44 0.54 0.17 0.24 0.19 -0.2 0.03
-1.76 -0.78 -0.35 -2.17 1.23 0.09 -0.12 -0.49 -0.1 0.43 -1.09 -1.42 0.61 0.32 0.28 -1.47 -0.01 -0.45 0.03 0.38 0.29 0.42 -1.23 -0.88 0.39 -0.53 0.26 -0.08 -0.3 -0.13 0.28 0.05 0.36 0.41 -0.3 0.13 0.42 0.29 -0.11 0.03 0.03 -0.01 0.2 0.12 0.2 0.29 0.09 0.28
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-2.05 -0.6 -0.64 -1.41 1.47 -0.37 -1.02 -0.69 -0.97 0.17 -0.12 -0.15 -0.56 -0.71 -0.03 -1.88 -0.01 -1.13 0.09 0.13 0.22 -0.23 0.5 -1.73 -0.47 -1.1 -0.48 1.17 0.13 0.12 0.11 0.46 0.66 0.47 -0.69 1.21 0.38 -0.13 0.06 0.04 -0.59 -0.85 0.06 0.76 0.74 -0.07 0.56 0.12
-2.33 -0.8 0.71 -3.39 -0.09 -0.42 -0.31 -0.63 -0.51 0.35 -2.77 -2.45 -0.33 -1.08 0.04 -1.62 0.34 -0.43 0.71 0.43 0.31 0.29 -0.79 -1.96 -0.28 -1.2 -0.28 1.01 -0.67 0.4 0.23 0.49 0.75 1.03 -1.18 0.83 0.41 0.53 0.27 0.23 -0.9 -1.01 0.11 0.6 0.48 0.45 0.82 0.33
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.