Heatmap: Cluster_53 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_11550V3.1 (Pp3c10_11550)	-	-	2.27	-0.38	-0.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.22	0.52	-	-	-	-	-	-	-	-	1.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c10_19370V3.1 (Pp3c10_19370)	-	-	2.55	-	-1.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.85	2.93	-0.02	-	-	-	-	-	-	-	2.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_1925V3.1 (Pp3c11_1925)	-	3.19	-1.21	0.86	-1.47	0.67	-0.39	0.73	-	-3.17	0.22	0.76	-3.07	-2.62	-1.71	3.74	0.76	0.43	1.61	1.33	-2.09	-1.03	-2.66	-2.08	-0.55	-0.57	-1.65	-3.66	-0.57	-3.12	-3.65	-2.74	-4.08	-2.39	-	-3.0	-2.49	-3.66	-	-3.69	-2.15	-1.95	-0.36	-1.37	-4.44	-	-2.0	-2.2
Pp3c11_21550V3.1 (Pp3c11_21550)	-	-	-0.5	0.52	2.05	0.85	-	-	2.92	-1.38	-	-	-	-	-3.93	4.55	0.35	-	-	-	-	-	-	1.67	0.39	1.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_2190V3.1 (Pp3c11_2190)	-	2.05	-	1.61	-	-	-	-	2.38	-	-	-	-	-	-3.21	4.85	2.12	-	-	-	-	-	-	-	-	1.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_220V3.1 (Pp3c11_220)	-	-	1.86	-	-	-	-	-	1.82	-	-	-	-	-	-	5.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_22570V3.1 (Pp3c12_22570)	-	4.96	-	-0.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.69	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	1.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_22600V3.1 (Pp3c12_22600)	-	4.96	-	-0.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.69	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	1.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_5590V3.1 (Pp3c12_5590)	-	4.97	1.44	1.06	-2.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.31	-0.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_14700V3.1 (Pp3c13_14700)	-	1.9	1.59	0.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.31	4.85	1.17	-0.08	-	-	-	-	-	-	-	2.99	-	-	-	-6.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_13380V3.1 (Pp3c15_13380)	-	4.04	0.11	-1.51	-2.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.19	3.74	2.64	0.04	-	-	-	-	-	-	-	3.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_7950V3.1 (Pp3c15_7950)	-	-	-0.32	-	-	-	-	-	0.16	-	-	-	-	-	-	4.81	2.52	-	-	-	-	-	-	-	-	3.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_860V3.1 (Pp3c15_860)	-	-	2.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_7740V3.1 (Pp3c16_7740)	-	-	-	0.56	-	-	-	-	2.2	-	-	-	-	-	-	4.52	2.88	2.31	-	-	-	-	-	-	-	2.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c17_12270V3.1 (RPB2)	-	-	-0.35	-0.5	-	-	-	-	3.02	-	-	-	-	-	-	4.91	2.2	-1.93	-	-	-	-	-	-	-	1.79	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_19380V3.1 (Pp3c19_19380)	-	3.03	0.08	-2.3	-	-	-	2.21	1.55	-	-	-1.47	-1.67	-	-2.87	4.27	-2.04	-0.14	-	-1.88	-	-	-	-	-2.52	0.21	-0.83	-0.19	-1.37	-1.81	-1.08	-	-2.84	0.24	-1.36	-0.16	-	0.19	-	-	-	-	-	-0.69	-	-0.88	-0.94	-3.46
Pp3c1_30590V3.1 (Pp3c1_30590)	-	-	2.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.06	3.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_33640V3.1 (Pp3c1_33640)	-	-	-	-	2.15	2.22	-	-	1.6	-	-	1.08	-	-	-	4.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.56	-	-	-	-	-	1.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_8199V3.1 (Pp3c1_8199)	-	3.49	0.91	-1.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.45	3.31	2.96	0.19	-	-	-	-	-0.91	-	3.1	2.39	0.06	-	-	-4.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.14
Pp3c1_870V3.1 (Pp3c1_870)	-	4.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_1301V3.1 (Pp3c20_1301)	-	4.68	1.4	-	-	-	-	-	0.57	-	-	-	-	-	-	3.42	1.39	-1.9	-	-	-	-	-	-	-	2.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_14180V3.1 (Pp3c20_14180)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.52	-	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_3298V3.1 (Pp3c20_3298)	-	4.39	3.17	1.25	-3.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.47	3.35	0.87	-1.81	-	-	-	-	-	-	-	1.65	-	-	-	-4.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_17680V3.1 (Pp3c21_17680)	-	3.46	2.37	-	-	-	-	-	2.85	-	-	-	-	-	-1.02	4.59	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_21199V3.1 (Pp3c21_21199)	-	1.98	0.63	-1.76	-1.69	2.18	1.5	0.35	0.29	-	-	-	-	-	-4.62	4.56	1.14	-	-	1.22	0.56	-	-	-1.03	-	0.1	-	-	-1.66	-1.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.92
Pp3c22_19090V3.1 (Pp3c22_19090)	-	2.45	1.07	-	-	-	-	-	2.35	-	-	-	-	-	-	4.98	1.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.01	-	-	-	-2.78	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_20148V3.1 (Pp3c22_20148)	-	2.62	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.86	1.21	-	-	-	-	-	-	-	-	3.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_4300V3.1 (Pp3c22_4300)	-	-	2.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.94	2.85	0.73	2.24	-	-	0.5	-	-	0.19	3.02	1.67	-	-0.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_7480V3.1 (Pp3c22_7480)	-	-	0.68	1.12	-	-	-	-	3.23	-	-	-	-	-	-	4.91	1.28	1.28	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_22690V3.1 (Pp3c23_22690)	-	4.13	-	-1.82	-	-	-0.28	-1.33	-	-	-	-	-	-	-	3.6	2.1	0.25	-	-	-0.1	2.2	-	1.11	-1.2	1.27	-	-	-	-	-1.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.99	-	-	-	-	-
Pp3c24_13180V3.1 (Pp3c24_13180)	-	4.4	0.87	-	-	-	-	-	-	-1.48	-	-	-	-	-1.14	3.96	0.23	-0.87	-	-	-	-	-	-	-0.67	1.76	0.09	-	-	-	-1.62	-	-	-	-	0.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_29219V3.1 (Pp3c2_29219)	-	4.19	1.65	0.45	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.93	4.46	1.44	-0.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_6650V3.1 (Pp3c3_6650)	-	3.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_10810V3.1 (Pp3c4_10810)	-	2.97	1.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.19	-	0.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_28140V3.1 (Pp3c4_28140)	-	-	1.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.17	3.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_11560V3.1 (Pp3c5_11560)	-	-	1.04	-	-	-	-	-	1.05	-	-	-	-	-	-	4.59	3.43	-	-	-	-	-	-	-	-	3.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_16535V3.1 (Pp3c5_16535)	0.14	2.75	-0.11	0.39	0.52	-1.12	0.74	0.49	1.46	-4.87	0.18	0.96	-2.8	-2.32	-2.91	4.32	1.54	-0.72	-1.02	-3.44	-2.27	-	-	-1.91	-2.5	-0.4	-	-2.45	-2.93	-1.95	-4.44	-3.88	-	-	-3.88	-3.5	-	-2.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.51	-3.83
Pp3c5_17810V3.1 (Pp3c5_17810)	-	-	-	-	-0.27	-	-	-	3.51	-	-	-	-	-	-	4.91	1.82	-	-	-	-	-	-	-	-	1.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_2290V3.1 (Pp3c5_2290)	-	-	1.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.81	4.9	2.27	-	-	-	-	-	-	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_12165V3.1 (Pp3c6_12165)	-	3.82	0.03	-	3.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.57	1.72	0.63	-	-	-	-	-	2.57	-	-	-	-	-	-2.45	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.62	-	-
Pp3c6_14640V3.1 (Pp3c6_14640)	-	4.16	1.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.51	1.47	-	-	-	-	-	-	-0.46	-	0.59	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_7550V3.1 (Pp3c6_7550)	-	3.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.64	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_25700V3.1 (Pp3c7_25700)	-	4.56	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.68	4.4	-	-1.99	-	-	-	-	-	-	-0.79	1.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c8_450V3.1 (Pp3c8_450)	-	-	2.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.23	1.83	-	-	-	-	-	-	-	-	0.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c8_4630V3.1 (Pp3c8_4630)	-	4.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.63	-0.47	-0.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c8_8460V3.1 (Pp3c8_8460)	-	-	2.18	-1.46	-3.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.94	2.95	-0.91	-	-	-	-	-	-1.8	-	1.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_1690V3.1 (Pp3c9_1690)	-	3.55	-	-	2.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_25680V3.1 (Pp3c9_25680)	-	-	-	-	-	-	-	-	3.41	-	-	-	-	-	-	5.01	1.78	0.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_820V3.1 (Pp3c9_820)	-	2.51	2.03	-	-	-	-	-	3.09	-	-	-	-	-	-	4.54	1.1	-0.17	-	-	-	-	-	-	-	1.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.01	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.