Heatmap: Cluster_306 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g005220.3.1 (Solyc01g005220.3)
2.35 -3.17 0.45 -0.86 -1.85 -0.13 -8.85 -2.71 -2.46 0.76 -0.5 -1.0 1.07 0.66 -2.14 -3.45 -1.94 - - 1.32 0.69 -0.72 -1.58 0.05 0.23 -0.23 -0.13 0.55 0.78 -0.59 -1.14 0.87 -2.03 1.48
Solyc01g009820.3.1 (Solyc01g009820.3)
1.0 -0.38 -0.49 -0.89 -0.24 0.15 0.16 -0.9 0.07 0.6 0.18 0.35 0.69 0.58 0.01 0.06 0.12 -0.67 -1.92 0.76 0.06 -0.46 -0.57 -0.58 -0.72 1.07 -0.39 -0.31 -0.37 -0.43 -0.33 -0.42 -2.12 0.93
Solyc01g094330.3.1 (Solyc01g094330.3)
-0.49 -0.32 -0.06 0.54 -0.11 -0.19 0.62 -0.79 -0.4 0.27 -0.21 0.12 -0.08 0.03 -0.72 -1.48 -0.4 - - 0.8 0.38 0.06 -0.2 -0.15 -0.24 2.05 0.45 0.34 -0.05 0.02 0.09 -0.1 -2.97 -0.05
Solyc01g101140.3.1 (Solyc01g101140.3)
0.88 -1.38 -0.39 -0.38 -0.29 -0.52 0.37 -1.33 -0.09 -0.29 -0.47 -0.43 -0.18 -0.25 -0.04 0.27 0.19 -4.94 -3.76 0.83 0.06 0.32 -0.22 0.14 0.14 1.36 -0.1 0.13 0.21 0.16 0.14 0.51 -2.02 0.93
Solyc01g106500.3.1 (Solyc01g106500.3)
0.18 -3.84 -0.05 -2.35 -2.14 -1.35 -4.49 -5.26 -2.33 0.23 1.63 1.4 2.1 2.2 -0.21 -1.21 0.62 -10.09 - 0.55 0.45 -1.77 -0.78 -1.16 -1.84 1.73 -1.27 -1.02 -0.02 -2.42 -1.68 -1.24 -2.8 0.49
Solyc01g109120.3.1 (Solyc01g109120.3)
1.07 -3.05 1.57 0.7 1.69 2.09 -4.18 -2.58 0.93 0.59 -0.67 -0.44 1.48 -1.27 -1.39 -2.59 -1.65 -2.8 -2.21 -0.17 -4.85 -7.06 -2.91 -3.8 -6.01 0.01 -6.08 -5.79 -5.87 -5.67 -5.56 -5.66 -1.01 2.91
Solyc01g112040.2.1 (Solyc01g112040.2)
0.02 -2.01 -0.51 -0.59 -0.45 -0.18 0.86 -0.98 -0.17 0.26 0.96 1.03 1.35 1.58 0.01 0.11 0.62 -5.72 -5.25 0.03 0.24 -0.76 -0.5 -0.69 -0.92 0.59 -0.51 -0.67 -0.8 -0.92 -0.58 -0.74 -3.13 1.13
Solyc01g112050.3.1 (Solyc01g112050.3)
-0.08 -1.66 -0.88 -0.53 -0.45 -0.35 0.37 -1.05 0.18 0.48 0.8 0.81 1.31 1.42 -0.11 0.15 0.59 -5.53 -4.87 0.51 0.43 -0.51 -0.47 -0.44 -0.71 0.48 -0.37 -0.4 -0.6 -0.49 -0.44 -0.34 -2.86 0.94
Solyc02g014090.3.1 (Solyc02g014090.3)
0.34 -0.49 -0.67 0.21 -0.13 -0.1 0.31 -0.9 0.2 0.01 0.18 0.13 0.57 0.45 -0.07 -0.1 -0.14 -1.4 -0.38 -0.0 0.08 0.05 -0.15 -0.1 -0.13 0.41 -0.15 -0.08 -0.01 -0.02 0.06 0.08 -0.37 0.65
Solyc02g070580.1.1 (Solyc02g070580.1)
0.72 -1.63 1.54 0.8 1.62 0.21 -0.64 0.15 -0.23 -0.88 -1.36 0.0 -2.79 -2.04 -0.68 -1.16 -1.05 -7.49 -9.31 0.29 -1.82 -0.07 1.32 0.58 -0.15 1.44 0.12 -0.81 -1.26 -0.52 0.16 -2.05 -1.02 0.98
Solyc02g080890.3.1 (Solyc02g080890.3)
2.88 -1.41 -0.07 -1.44 -2.37 0.74 -6.99 -4.65 -1.51 -0.61 -1.04 1.57 -0.27 1.01 0.74 0.58 1.71 -5.2 -8.08 -1.11 -2.3 -5.21 -4.06 -3.41 -4.66 -0.13 -6.23 -5.39 -2.46 -6.14 -5.18 -2.48 -3.37 2.79
Solyc02g083400.3.1 (Solyc02g083400.3)
1.43 -5.59 -1.33 -3.02 -1.26 0.43 -0.64 -0.99 -0.11 1.79 -0.93 -0.57 0.07 -0.39 1.19 1.27 1.89 -2.0 -1.92 1.18 0.48 -1.15 -1.64 -0.99 -0.88 0.93 -1.69 -1.45 -1.04 -1.48 -1.25 -0.95 -0.46 -0.01
Solyc02g087070.3.1 (Solyc02g087070.3)
3.79 -7.96 2.97 -2.79 -1.45 1.58 - - -2.3 - - -2.93 -6.89 -5.31 -1.2 - -9.16 -5.88 - - - - - -8.64 - -4.0 - - -8.3 - - - - 2.99
Solyc03g081220.1.1 (Solyc03g081220.1)
-0.01 -1.11 -0.22 -0.66 0.8 0.67 -0.62 -0.04 -0.25 -0.39 0.19 0.4 0.62 0.29 -0.19 -0.09 -0.06 -2.55 -4.64 0.8 0.66 -0.18 -0.51 -0.02 0.13 0.68 -0.34 -0.0 0.18 -0.14 -0.35 0.03 0.28 -0.27
Solyc03g123570.3.1 (Solyc03g123570.3)
0.44 -0.54 0.29 0.51 0.01 -0.02 -0.63 -0.34 -0.53 0.01 -0.03 0.13 0.07 0.42 -0.05 -0.05 0.14 -3.5 -9.62 1.23 -0.03 -0.24 0.23 0.07 -0.28 1.33 -0.07 -0.07 -0.37 -0.27 -0.18 -0.37 -1.88 0.5
Solyc04g009800.3.1 (Solyc04g009800.3)
0.23 -0.18 0.71 0.14 0.21 -0.85 0.11 -1.2 -0.65 -0.98 0.47 0.98 0.59 1.48 -2.5 -3.01 -2.25 -9.76 -9.83 1.07 1.08 -0.53 0.25 0.01 -0.15 0.67 -0.15 -0.15 0.04 -0.61 -0.39 -0.52 -2.29 0.94
Solyc04g071590.3.1 (Solyc04g071590.3)
2.29 - -1.92 - -1.5 0.91 - -6.34 -3.67 -0.3 -2.71 1.4 -1.95 0.79 0.95 1.36 2.07 - - 0.18 1.1 -7.25 -3.87 -4.04 -3.44 2.24 -5.16 -4.4 -1.83 -5.29 -4.54 -1.73 -3.11 1.66
Solyc04g072560.3.1 (Solyc04g072560.3)
1.1 -0.98 0.69 0.3 -0.33 -0.58 -0.35 -0.95 -0.43 -0.77 -0.52 -0.65 -0.13 -0.2 -0.02 -0.03 0.02 -4.35 -6.4 0.75 0.36 0.12 -0.0 0.25 0.22 0.43 0.17 0.32 0.19 0.19 0.06 0.28 -0.99 1.05
Solyc04g073950.1.1 (Solyc04g073950.1)
1.85 -5.62 0.34 -2.37 0.32 0.18 0.62 -1.3 -0.24 -0.58 -1.75 -0.52 -3.93 -3.62 -0.94 -1.44 -1.0 - - 1.44 0.7 -0.74 -2.33 -0.51 -0.54 2.98 -5.37 -3.79 -2.53 -2.19 -1.68 -0.83 -2.86 2.22
Solyc04g079300.3.1 (Solyc04g079300.3)
1.06 -0.69 -2.28 -3.31 -0.44 0.96 -0.09 -2.28 0.42 1.81 -0.34 0.26 0.37 0.62 -1.32 -0.88 -0.1 -0.36 -0.42 -0.29 0.5 -1.77 -0.66 -1.14 -1.6 2.25 -0.93 -1.17 -0.59 -2.52 -2.12 -1.31 -2.31 1.45
Solyc04g079305.1.1 (Solyc04g079305.1)
1.89 0.04 -3.86 -2.86 -2.58 1.14 -1.55 -2.51 -0.08 2.67 -1.01 -0.39 -0.16 -0.09 -0.45 -2.0 0.06 -0.1 0.12 -1.64 -1.4 -1.47 -0.81 -1.46 -1.82 2.27 -1.35 -0.9 -0.48 - -2.28 -1.9 -2.01 1.17
Solyc04g080680.3.1 (Solyc04g080680.3)
0.09 -1.3 0.74 -0.47 1.33 0.22 -1.38 -1.57 -0.15 0.33 -0.63 0.53 -0.45 0.59 0.58 0.83 0.75 -3.24 -5.28 0.42 0.29 -0.48 -0.67 -0.47 -0.06 0.18 -1.15 -0.35 0.07 -0.67 -0.73 0.22 -1.73 1.3
Solyc05g008430.3.1 (Solyc05g008430.3)
0.6 -1.02 -0.61 0.07 -0.41 -0.97 0.44 -1.37 -0.22 -0.26 0.27 0.4 0.76 0.98 -0.09 -0.21 0.2 -4.79 -5.04 0.94 0.72 -0.04 -0.02 0.2 -0.07 0.23 -0.22 -0.06 -0.11 -0.11 -0.1 -0.0 -2.2 0.8
Solyc05g041920.3.1 (Solyc05g041920.3)
2.45 -0.48 2.83 1.81 -0.92 1.05 -4.18 -0.65 -1.88 -0.33 -3.62 -1.68 -0.9 -0.3 -4.26 - -3.52 -5.98 -9.12 -6.15 -2.97 -6.51 -4.83 -5.54 -5.29 -6.67 -1.74 -1.5 -1.19 -3.68 -4.4 -5.82 -0.21 3.1
Solyc05g054770.3.1 (Solyc05g054770.3)
1.07 -0.88 1.43 0.62 0.34 -0.68 -1.97 -1.25 -1.41 0.17 -0.15 -0.41 0.75 0.19 -1.22 -0.4 0.08 -0.37 0.08 -0.0 0.41 -0.57 -0.56 -0.29 -0.27 0.66 -0.75 -0.29 -0.26 -0.29 -0.54 -0.21 -2.28 1.46
Solyc06g062990.2.1 (Solyc06g062990.2)
-0.0 -0.33 0.21 0.79 0.22 -0.39 0.71 -0.62 -0.34 -0.22 -0.2 -0.29 -0.43 -0.48 0.51 0.74 0.74 - -10.86 -0.59 -0.69 0.02 0.12 0.13 -0.02 0.23 0.18 0.1 -0.05 0.15 0.19 -0.17 -0.72 0.98
Solyc06g065720.1.1 (Solyc06g065720.1)
-0.01 -0.7 -0.6 0.59 -0.89 -0.66 0.34 -1.08 -0.23 -0.01 0.37 0.03 0.55 0.48 -0.08 -0.14 -0.3 -5.57 -5.77 0.78 0.96 -0.05 0.37 0.24 -0.06 0.92 0.1 0.15 -0.02 -0.15 -0.19 -0.33 -2.84 0.8
Solyc06g068820.3.1 (Solyc06g068820.3)
0.3 1.24 0.69 0.31 -0.52 0.1 -0.3 0.21 -0.35 0.05 0.18 0.59 0.02 0.55 -0.87 -0.57 -0.6 -5.65 -6.63 -0.1 -0.4 -0.06 0.09 0.02 0.11 -0.02 0.14 0.16 0.14 0.15 -0.07 -0.03 -0.66 0.24
Solyc06g073840.3.1 (Solyc06g073840.3)
0.4 -0.67 -0.19 0.53 -0.61 -0.58 -0.58 -0.93 -0.2 0.04 0.41 0.85 0.73 0.69 0.6 0.46 0.77 -2.44 -1.93 0.29 -0.26 -0.6 -0.34 -0.43 -0.63 1.0 -0.31 -0.43 -0.43 -0.54 -0.42 -0.42 -1.5 1.1
Solyc07g006130.2.1 (Solyc07g006130.2)
0.06 -1.25 0.69 0.54 -1.64 -0.2 -1.39 -2.45 0.21 0.92 -2.27 -2.99 -0.64 -0.99 0.64 0.83 1.16 -1.41 -2.77 1.2 -0.17 -0.62 -2.16 -0.85 -0.25 2.34 -0.8 -0.21 0.2 -0.38 -0.51 0.58 -4.07 -0.04
Solyc07g008320.3.1 (Solyc07g008320.3)
0.54 -0.24 0.58 0.26 -0.72 -0.19 -0.05 -0.9 0.4 0.02 0.6 0.52 1.55 1.5 0.14 0.09 0.36 -5.21 -6.39 -0.63 0.43 -0.69 -0.54 -0.66 -0.91 -0.33 -0.46 -0.59 -0.81 -0.62 -0.5 -0.3 -2.88 0.97
Solyc07g042890.3.1 (Solyc07g042890.3)
0.38 -1.15 0.44 -0.27 0.55 0.3 0.4 -0.91 -0.31 -0.01 0.09 0.22 0.24 0.33 0.17 0.13 0.22 -7.28 -5.59 0.42 0.05 -0.21 -0.28 -0.16 -0.21 0.99 0.03 0.03 -0.08 -0.13 -0.22 -0.14 -0.73 0.65
Solyc07g043310.3.1 (Solyc07g043310.3)
0.97 0.0 1.51 0.9 -3.34 -0.61 -2.41 -2.14 -0.31 0.24 0.12 -0.06 0.18 -0.91 -0.07 -0.5 0.39 -4.18 -5.04 1.0 0.09 -1.08 -1.16 -0.97 -0.9 2.03 -0.28 -0.21 0.25 -0.9 -1.07 -0.33 -2.33 1.27
Solyc07g048120.3.1 (Solyc07g048120.3)
0.21 -0.56 0.43 0.32 -0.36 -0.22 0.37 -0.66 0.02 0.06 -0.49 0.75 0.14 0.91 0.25 0.51 0.39 -4.06 -3.26 0.31 0.13 -0.31 -0.35 -0.31 -0.28 0.49 -0.16 -0.03 -0.08 -0.19 -0.21 -0.33 -0.74 0.66
Solyc07g062620.3.1 (Solyc07g062620.3)
0.83 -1.17 2.3 0.34 -0.17 0.27 0.25 -0.19 0.14 0.21 0.11 -0.38 -0.2 -0.82 0.52 0.56 0.62 - - -0.15 -0.41 -0.74 -0.69 -0.37 -0.4 0.82 -0.97 -0.91 -0.91 -0.94 -0.7 -0.72 -1.47 0.66
Solyc08g006740.3.1 (Solyc08g006740.3)
3.79 -7.25 2.21 -2.42 -2.05 0.21 - -5.59 -2.08 -1.47 -2.01 -2.67 -5.5 -6.72 -2.47 -2.71 -1.54 - - -4.63 -6.08 -7.42 -5.18 -3.12 -3.55 -2.43 - -5.35 -3.53 -8.55 -6.07 -2.08 -7.09 3.51
Solyc08g080940.3.1 (Solyc08g080940.3)
1.53 -1.1 2.51 1.34 -1.09 -0.25 -0.53 -1.67 -1.06 -0.18 -1.39 -0.45 -0.8 0.07 0.01 0.56 0.61 -7.14 -8.3 1.02 -0.96 -0.88 -0.87 -0.68 -0.68 0.74 -1.05 -0.89 -0.72 -1.04 -0.95 -0.94 -0.71 0.74
Solyc08g080950.1.1 (Solyc08g080950.1)
0.91 - 2.78 2.16 - 0.58 - -0.96 - - 0.82 -0.84 0.55 1.54 -0.86 1.28 -0.36 - -3.37 1.11 - -0.18 - -1.44 - - - -2.98 -1.37 - -1.23 -2.01 -0.55 1.56
Solyc08g081240.3.1 (Solyc08g081240.3)
1.52 -0.95 -0.56 -0.35 -1.41 -0.43 -1.4 -1.87 -0.42 0.41 1.18 0.56 1.63 1.33 0.03 0.1 0.46 -9.88 -11.41 0.58 0.11 -0.93 -0.77 -0.53 -0.86 0.81 -1.09 -0.86 -0.76 -0.96 -0.92 -0.65 -1.86 1.18
Solyc09g005830.1.1 (Solyc09g005830.1)
3.11 - 1.03 0.15 -3.47 1.54 -8.8 - -1.83 -0.73 -5.5 -2.16 -4.22 -1.36 -1.35 -2.52 -2.09 -6.14 -6.77 -3.44 -5.15 -4.75 - -5.47 -5.57 -4.32 - -6.51 -5.1 - - -4.14 -6.77 4.04
Solyc10g008280.3.1 (Solyc10g008280.3)
0.16 -2.32 -0.79 -2.66 0.34 0.13 -0.47 -1.16 -0.64 0.1 0.75 0.94 1.37 1.45 -0.21 -0.08 0.07 - -11.63 1.34 1.27 -0.73 -1.1 -0.83 -0.79 1.29 -0.98 -0.7 -0.32 -0.71 -0.73 -0.18 -3.09 0.27
Solyc10g054320.2.1 (Solyc10g054320.2)
-0.0 0.92 0.82 1.19 -0.73 -0.04 -0.69 -0.38 0.03 -0.21 0.14 0.43 0.17 0.64 0.65 0.73 1.33 -3.14 -3.91 -1.14 -1.78 -0.73 -0.02 -0.4 -0.83 -0.12 0.1 -0.23 -0.32 -0.41 -0.43 -0.91 -1.34 0.52
Solyc10g075040.2.1 (Solyc10g075040.2)
1.14 -1.42 0.93 -0.58 -0.75 -0.63 0.18 -1.33 -0.38 -0.48 -0.19 0.02 0.83 1.18 0.03 -0.0 0.3 -10.71 -9.86 -0.49 0.82 -0.11 -0.27 -0.05 -0.31 -0.22 -0.17 0.13 0.19 -0.08 -0.12 0.03 -1.85 1.17
Solyc10g079920.2.1 (Solyc10g079920.2)
1.01 0.2 -0.24 -0.02 -1.47 -0.22 0.34 -0.97 0.26 0.89 0.31 0.37 0.64 0.58 0.58 0.44 0.4 -5.51 -6.93 -0.48 -0.32 -0.27 -0.1 -0.12 -0.45 0.25 -0.33 -0.33 -0.29 -0.2 -0.07 -0.14 -2.24 0.79
Solyc10g080770.2.1 (Solyc10g080770.2)
1.15 0.07 0.78 -0.42 -0.17 0.14 -0.33 -1.46 -1.1 -0.2 0.35 0.27 1.19 1.35 -0.78 -0.47 0.14 -6.4 -8.59 1.04 0.48 -1.79 -1.54 -1.62 -1.8 1.89 -1.59 -1.36 -1.23 -1.81 -1.67 -1.2 -3.4 1.75
Solyc11g012780.2.1 (Solyc11g012780.2)
-0.24 -0.87 -0.44 -1.22 -1.67 0.03 0.55 -0.86 -0.04 0.37 0.66 0.58 0.85 1.02 0.45 0.33 0.43 -7.89 -9.47 0.64 -0.92 -0.27 -0.52 -0.44 -0.47 0.97 0.1 0.08 0.15 -0.13 -0.11 0.05 -0.19 -0.13
Solyc11g064950.2.1 (Solyc11g064950.2)
0.06 -0.68 0.19 -0.69 -0.4 -0.4 0.83 -1.25 0.13 -0.69 0.18 0.44 0.99 1.35 -0.36 -0.13 0.21 - - 0.17 0.43 -0.39 -0.01 -0.2 -0.43 0.95 -0.18 -0.26 -0.1 -0.46 -0.29 -0.19 -2.35 1.16
Solyc12g005980.2.1 (Solyc12g005980.2)
1.05 -1.96 0.58 -0.76 0.44 -0.03 -1.43 -1.22 -0.57 0.39 -1.58 -0.77 -0.96 -0.44 0.48 0.97 0.87 -2.59 -4.0 0.82 0.38 -0.32 -0.6 -0.25 -0.04 1.34 -0.76 -0.41 -0.2 -0.28 -0.74 0.02 -1.88 1.64
Solyc12g056790.2.1 (Solyc12g056790.2)
0.81 -1.27 -0.04 -0.43 0.4 0.29 -0.7 -1.64 -0.46 -0.31 0.74 0.73 1.04 0.85 -0.44 -0.41 0.37 -8.23 -8.93 0.33 0.85 -0.42 -0.57 -0.47 -0.48 1.02 -0.8 -0.52 -0.27 -0.38 -0.42 -0.04 -1.38 1.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.