Heatmap: Cluster_64 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.84 0.29 0.83 -1.61 -1.83 -0.09 -0.49 -0.39 0.63 0.25 -0.76 -0.77 0.09 0.28 -0.1 -0.12 0.66 -0.03 0.72 0.85 0.89 0.73 0.29 -1.57 -0.24 -0.73 -0.18 -0.32 -0.32 -0.28 -0.3 -0.05 -0.16 -0.1 -0.54 -0.7 -0.25 0.44 -0.37 0.2 -0.04 0.18 0.38 0.06 -0.2 0.54 -0.3 -0.16
0.27 0.53 1.2 -1.52 -1.19 -1.33 -0.81 -1.1 -0.33 -0.58 -0.43 -0.52 0.39 0.65 -0.74 -0.49 0.82 1.14 0.56 0.33 0.02 0.36 1.2 -1.06 0.04 0.29 0.14 -0.52 -0.77 -0.34 -0.91 -0.05 -0.34 -0.18 -0.37 -0.8 -0.61 0.35 -0.17 0.17 -0.12 0.06 0.13 0.14 0.07 0.42 -0.46 -0.34
-0.1 -0.12 0.93 -0.52 -1.11 -0.57 -1.3 -1.23 -0.04 0.61 -3.92 -4.16 -0.09 -0.44 -0.18 0.5 0.65 0.95 -0.01 0.05 0.08 0.44 -1.04 1.01 0.2 0.27 -1.14 0.18 -0.25 -0.15 0.1 -1.06 0.31 0.27 -0.85 -0.15 0.12 1.09 -0.59 0.27 -0.57 -0.22 -0.26 0.1 -0.55 1.26 0.27 -0.71
0.49 -0.2 1.52 -2.87 0.43 0.51 0.72 0.74 -0.34 -0.41 -1.2 -1.08 -1.13 -1.34 -0.69 -1.93 0.17 0.65 1.43 0.64 0.35 0.35 1.38 -0.25 -0.19 -1.23 -0.32 0.13 0.13 -0.07 -0.15 0.2 -0.2 -0.07 -1.57 -0.21 -0.18 0.26 -1.03 -0.76 -0.98 -1.39 -0.53 -0.23 -0.3 -0.01 -0.48 0.1
0.26 0.49 0.6 -1.7 -0.03 0.0 -0.68 -0.61 0.36 -0.15 -0.57 -0.8 -0.2 -0.54 -0.36 0.36 0.64 0.3 0.85 0.5 0.29 0.46 0.49 -0.93 -0.16 -0.52 -0.77 0.05 -0.12 0.02 -0.01 0.28 0.05 0.13 -0.23 -0.53 -0.03 0.14 -0.42 -0.13 -0.59 -0.29 0.14 0.06 -0.1 0.17 0.4 -0.11
0.0 0.73 1.18 -0.78 -0.44 -0.22 -1.1 -0.95 -0.06 -0.17 -1.27 -1.26 0.6 0.82 -0.25 0.51 1.32 0.47 0.78 0.71 0.35 0.18 1.48 -0.71 0.09 -0.08 -0.05 -0.84 -0.82 -0.55 -0.8 -0.98 -0.74 -0.69 -0.84 -0.86 -0.53 -0.01 -0.48 -0.18 0.14 0.31 0.11 -0.38 -0.49 -0.01 -0.93 -0.4
0.38 -0.38 1.33 -1.91 -0.92 0.82 0.82 0.52 0.8 0.54 -4.96 -4.64 -0.02 -1.52 0.24 -1.76 1.01 0.32 1.12 0.96 1.41 1.95 0.82 -1.19 -1.21 -2.95 -2.77 -0.01 -1.09 -0.58 -0.53 -3.11 -0.5 0.38 -1.7 0.09 -0.4 0.77 -0.96 -0.29 -2.78 -2.33 -0.16 -0.9 -0.84 0.58 -0.83 -1.89
-0.72 0.51 0.76 -1.14 -0.95 -1.46 -1.51 -1.46 -0.49 -0.06 -0.47 -0.56 0.26 0.53 0.02 0.26 0.83 0.41 0.7 0.39 0.38 0.63 1.67 -0.68 -0.25 -0.16 -0.21 -0.57 -1.03 0.13 -0.46 0.06 -0.25 0.12 -0.99 -0.91 -0.46 0.38 -0.73 0.18 0.27 0.3 0.08 -0.08 -0.26 0.32 -0.38 -0.01
0.0 0.22 0.94 0.05 -0.45 0.0 0.09 -0.28 0.12 -0.82 -3.69 -4.19 -1.01 -1.2 -0.81 0.5 1.2 0.84 1.22 1.13 1.33 1.03 0.79 -0.16 -0.24 -1.11 -1.55 -0.31 -1.21 0.0 -0.52 -1.33 -0.3 0.03 -1.11 -0.6 -0.78 0.28 -0.66 0.18 -0.33 -0.04 -0.05 -0.1 -0.26 0.3 -0.22 -0.61
0.25 0.53 1.1 -1.09 0.01 0.07 -0.44 -0.45 0.37 -0.88 -1.92 -1.95 -0.7 -0.78 -1.57 0.02 0.45 -0.0 1.02 1.08 0.76 0.46 0.09 -0.89 0.14 -0.38 0.23 -0.37 -0.36 -0.04 -0.16 -0.12 -0.28 -0.03 -0.45 -1.03 -0.29 0.15 -0.51 0.37 0.28 0.44 0.28 0.19 -0.19 0.26 0.02 -0.32
0.24 0.52 0.59 -1.24 0.46 -0.87 -1.01 -0.72 -0.17 -0.57 -2.28 -2.06 -0.28 -0.28 -0.57 0.4 1.24 0.34 0.78 0.77 0.67 0.54 1.09 -0.78 -0.44 -0.71 -0.88 -0.03 -0.18 0.02 -0.45 -0.51 -0.09 0.15 -0.25 -0.35 -0.38 0.13 -0.28 0.32 -0.09 0.06 0.24 0.18 0.06 0.13 -0.16 -0.26
-0.08 0.22 0.53 -1.36 -1.64 -0.03 -0.81 -0.31 -0.23 0.68 -1.85 -2.09 0.06 -1.31 0.4 0.25 1.24 0.73 1.02 0.93 1.4 1.27 -0.03 -0.68 0.3 -1.05 -1.03 -0.67 -0.43 -0.18 -0.06 -1.19 -0.02 0.0 0.15 0.25 -0.58 0.66 -1.34 -0.26 -1.4 -1.48 0.05 -0.18 -0.19 0.69 -0.82 -1.01
0.18 1.88 2.08 -2.04 -0.26 0.49 -0.46 0.24 -0.6 0.92 -5.05 -5.58 -0.28 -1.36 -0.72 -0.54 2.33 0.07 0.88 1.65 0.2 -0.5 -1.59 -1.28 -1.83 -2.01 -2.88 -2.21 -2.06 -0.69 -0.61 -0.68 -0.2 -0.73 -2.75 -2.76 -2.29 1.46 -2.64 -0.4 -1.15 -1.04 0.27 0.32 -1.14 1.41 -1.2 -2.44
-0.12 0.29 0.85 -0.96 0.23 -0.43 -0.68 -0.8 -0.13 -0.21 -1.02 -0.91 -0.71 -0.74 -0.14 0.03 1.03 0.42 0.61 0.99 0.8 0.83 1.08 -0.56 0.17 -0.15 0.27 -0.29 -0.69 -0.17 -0.54 -0.36 0.13 -0.16 -0.95 -0.59 -0.45 0.06 -0.56 0.12 -0.34 -0.29 0.29 -0.09 0.02 0.07 -0.23 -0.24
-0.27 -0.11 0.68 -1.14 -1.1 -0.05 -0.31 -0.28 -0.42 -0.04 -0.94 -1.11 -0.13 -0.25 -0.16 0.55 0.86 -0.03 0.93 0.71 1.03 0.77 0.2 -0.31 0.25 -0.93 0.32 -0.66 -0.0 -0.28 -0.28 -0.18 -0.05 0.23 0.33 0.07 -0.84 -0.07 -0.45 0.22 -0.14 -0.14 0.08 -0.0 -0.02 -0.08 -0.45 -0.4
0.0 0.11 0.9 -1.27 -1.23 -0.05 0.29 0.24 -0.49 0.1 -1.36 -1.44 0.08 -0.11 -0.44 -0.22 0.9 0.74 0.47 0.59 0.51 0.35 0.66 -0.38 -0.27 -0.33 -1.05 -0.08 -0.95 0.28 -0.12 -0.27 0.09 0.23 -1.16 -0.21 -0.32 0.46 -0.47 -0.07 -0.4 0.04 0.27 0.08 -0.24 0.35 0.03 0.18
-0.09 -0.18 1.2 -2.8 -1.82 -1.69 -0.98 -0.93 -0.38 -0.23 -1.63 -1.7 0.02 -0.01 -0.05 -0.81 0.71 0.21 0.95 0.8 0.59 0.37 0.9 -0.31 -0.52 -0.6 -1.05 -0.02 -0.62 0.35 -0.2 -0.6 0.05 0.44 -0.13 0.16 -0.33 0.52 -0.3 0.25 0.17 0.4 0.27 0.13 -0.21 0.5 0.13 0.39
0.15 0.56 0.72 -1.18 -0.96 -1.23 -0.95 -1.22 0.07 -0.23 -2.04 -1.88 -0.58 -0.65 -0.18 0.7 0.93 0.6 1.02 1.11 0.77 0.73 1.01 -0.73 -0.07 -0.77 -0.53 -0.13 -0.17 -0.07 -0.25 -0.69 -0.12 0.07 -0.37 -0.45 -0.37 0.15 -0.49 0.05 -0.11 0.1 0.12 0.03 -0.35 0.19 -0.0 0.07
-0.09 0.48 0.94 -1.44 0.75 0.31 0.21 -0.15 -0.15 -0.53 -3.39 -2.95 -0.75 -1.05 -0.13 -0.44 0.99 0.72 0.73 1.16 0.88 0.93 0.8 0.38 -0.41 -0.37 -1.2 0.17 -0.8 -0.09 -0.44 -0.76 -0.28 0.19 -1.24 -0.15 -0.37 -0.44 -0.03 0.06 -0.84 -0.86 0.09 0.01 -0.37 -0.38 0.14 -0.06
-0.26 0.48 0.95 -0.58 0.75 0.11 0.32 -0.09 0.14 -0.08 -0.78 -0.72 -0.19 0.05 0.18 0.87 0.78 0.39 0.8 0.64 0.48 0.78 0.52 -0.19 -0.14 -0.11 -0.73 -0.32 -1.3 -0.27 -0.79 -0.3 -0.5 -0.35 -1.11 -0.77 -0.7 -0.13 -0.3 -0.3 -0.24 -0.28 -0.19 -0.29 -0.37 -0.08 -0.44 0.0
-0.87 0.16 0.55 -1.78 0.04 -1.79 -2.03 -1.97 -0.16 -0.1 -0.51 -0.32 0.3 0.58 -0.37 0.36 0.84 0.21 0.44 0.45 0.34 0.25 1.04 -1.32 -0.35 -0.36 -0.64 -0.28 0.07 0.01 -0.34 -0.33 0.03 0.2 -0.5 -0.52 -0.24 0.28 -0.03 0.35 0.17 0.53 0.41 0.41 0.24 0.28 0.02 -0.27
-0.97 0.07 1.25 -1.84 -0.66 -0.72 -0.97 -0.49 -0.44 -0.53 -3.64 -3.8 -0.47 -0.25 -0.34 0.11 1.2 -0.04 1.49 1.23 1.51 1.29 1.13 -1.36 -0.16 -1.31 -1.0 -0.42 -1.31 0.2 -0.78 -1.92 -0.23 0.15 -1.61 -0.87 -1.15 0.34 -0.71 0.13 -0.13 0.44 0.49 0.19 0.13 0.16 -0.28 -0.04
-0.13 -0.05 0.7 -2.21 -1.83 -1.91 -0.47 -1.33 -0.32 -0.12 -0.71 -0.86 -0.14 -0.53 -0.15 -0.18 0.27 -0.03 0.57 0.63 0.21 0.27 1.35 -1.87 -0.4 -0.46 -0.32 0.25 -0.05 0.17 -0.1 0.28 -0.02 0.39 0.53 0.69 -0.24 0.47 0.04 0.0 -0.39 -0.1 -0.04 0.33 -0.19 0.56 0.22 0.24
-0.78 0.58 1.13 -1.37 -0.05 -0.3 -0.13 -0.44 -0.58 -0.05 -3.0 -3.14 -0.35 -0.26 -0.03 -0.3 1.28 0.37 1.06 1.22 1.16 1.02 1.39 -0.53 -0.52 -0.92 -1.13 0.1 -0.16 -0.11 -0.72 -0.22 -0.48 -0.44 -1.06 -0.28 -1.04 0.04 -0.98 -0.06 -0.69 -0.6 0.2 0.16 -0.15 -0.08 -0.28 -0.12
-0.75 0.61 1.27 -0.2 -0.23 -0.22 -0.52 -0.42 -0.48 -0.11 -3.71 -3.55 -0.75 -2.3 -0.63 -0.57 1.13 0.93 1.11 0.76 0.74 0.61 -0.35 0.4 -0.72 -0.92 -1.58 0.29 -0.38 0.37 0.22 -0.7 0.34 0.31 -0.72 -0.39 0.27 0.77 -0.86 -0.22 -1.69 -1.67 0.05 0.13 0.11 0.87 0.18 -0.46
0.34 0.91 1.08 -1.44 -0.6 -0.05 0.31 0.4 0.89 -0.18 -1.9 -1.8 0.15 0.57 0.18 0.51 1.21 0.12 0.8 0.54 0.19 -0.01 1.07 -0.93 -0.29 0.7 -0.17 -0.66 -1.04 -0.32 -0.69 -0.92 -0.86 -0.98 -1.02 -1.47 -1.08 0.06 -0.85 -0.17 0.23 0.04 -0.07 -0.22 -0.63 0.14 -0.99 -0.24
0.82 0.12 0.5 -1.13 -2.77 -1.48 -2.42 -2.37 0.2 -0.64 -1.52 -1.31 0.08 0.59 -0.67 0.37 0.95 0.68 0.45 0.86 0.28 0.28 1.49 -0.11 -0.3 -0.11 -0.33 -0.51 -0.33 -0.22 -0.5 -0.98 -0.41 -0.27 -0.56 -0.77 -0.65 0.24 0.03 0.49 0.6 0.87 0.37 0.07 -0.06 0.25 -0.46 -0.44
-0.14 0.42 0.68 -0.47 -1.13 -0.2 -0.38 -0.42 0.55 0.14 -0.27 -0.34 0.19 -0.36 -0.03 -0.4 0.6 0.2 0.44 0.42 0.17 0.01 -0.79 -2.05 -0.59 -0.43 -0.83 0.21 0.13 0.15 -0.17 0.37 0.06 0.42 -0.01 0.04 0.05 0.43 -0.41 0.08 -0.36 -0.17 -0.05 0.29 -0.2 0.45 0.38 -0.11
1.0 1.32 1.29 -0.74 -1.86 -1.08 -1.34 -1.28 1.49 -1.19 -0.86 -1.02 -0.88 -1.03 -1.47 1.55 2.4 -1.09 0.79 1.15 0.8 -0.53 0.32 -3.0 -1.42 -0.71 -0.58 -1.42 -1.82 -0.74 -0.86 0.53 -0.17 -0.66 -1.12 -1.7 -0.92 -0.15 -1.11 -0.45 -0.39 -0.22 0.36 -1.11 0.63 -0.14 -1.38 -0.39
0.0 0.17 0.81 -0.74 -0.61 0.64 0.19 0.32 0.08 -0.32 -0.41 -0.45 0.05 -1.18 -0.39 -0.01 0.2 0.32 0.98 0.72 0.6 0.43 0.35 -0.66 -0.27 -0.99 -0.3 0.04 -0.02 0.16 -0.13 0.27 -0.35 -0.04 -0.01 -0.24 -0.09 0.24 -1.04 -0.27 -0.84 -0.7 -0.02 0.09 -0.38 0.25 -0.18 0.07
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0.91 -0.49 1.92 -1.68 -1.6 0.39 1.31 0.21 0.7 -0.15 -5.89 - -0.69 -2.93 -0.27 - 2.17 -1.57 0.54 1.27 0.58 -0.86 1.39 -3.05 -2.73 -0.7 -1.99 -0.1 -0.61 0.39 -0.49 -2.52 -0.93 -0.0 -1.78 -2.3 -0.21 0.4 -1.58 0.17 0.62 -0.17 -0.52 -0.14 -0.29 0.36 -0.43 0.13
-0.65 0.36 0.38 -1.72 -1.38 -1.27 -1.02 -1.09 -0.28 -0.71 -0.98 -0.87 -0.24 0.06 -0.52 0.38 1.0 0.66 0.62 1.04 0.74 0.46 1.25 -0.32 -0.16 0.52 -0.03 0.08 -1.01 0.23 -0.94 -0.76 -0.51 -0.12 -0.63 -0.65 -0.61 0.47 -0.11 0.35 0.07 0.27 0.2 0.33 -0.12 0.48 -0.37 -0.16
0.27 0.69 0.76 -1.47 -0.53 -0.96 -1.09 -0.79 0.49 -0.34 -0.63 -0.53 0.32 0.67 -0.4 0.74 1.08 0.24 0.62 0.55 0.56 0.61 0.98 -0.26 -0.07 0.19 -0.51 -0.65 -0.46 -0.51 -0.79 -0.1 -0.43 -0.28 -0.55 -0.74 -0.83 -0.07 -0.36 0.07 -0.05 0.27 0.14 -0.32 -0.35 -0.06 -0.43 -0.32
-0.02 0.35 0.97 -1.15 0.26 -0.27 -0.66 -0.17 0.54 0.32 -1.46 -1.4 -1.12 -2.25 -1.31 -1.5 0.78 0.72 0.76 0.65 0.84 0.81 -2.13 1.12 0.07 -1.14 -0.66 0.53 -0.18 0.27 0.11 0.21 -0.02 -0.04 -0.02 -0.6 -0.26 1.37 -1.31 -0.71 -2.42 -2.27 -0.62 -0.02 -1.15 1.42 -0.34 -1.19
0.4 0.63 1.24 -0.55 -0.88 -0.2 -1.04 -0.62 -0.75 -0.61 -2.26 -2.12 -0.35 -0.26 -0.62 0.42 1.39 0.89 0.61 0.76 0.61 0.51 1.19 0.43 -0.29 -0.26 -0.83 -0.39 -0.34 -0.16 -0.7 -0.63 -0.25 -0.24 -0.4 -0.48 -0.64 0.11 -0.48 0.09 -0.06 0.08 0.02 -0.3 -0.33 0.27 -0.67 -0.15
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0.74 0.49 1.14 -0.42 0.32 -0.41 -0.08 -0.23 -0.04 -0.02 -1.58 -1.49 -0.37 -0.52 -0.12 -0.39 0.93 0.12 0.65 0.67 0.89 0.81 0.48 -0.87 -0.04 -0.79 -0.56 -0.29 -0.45 0.05 -0.57 -0.47 -0.22 0.08 0.06 0.2 -0.97 -0.14 -0.46 0.09 -0.75 -0.51 0.13 0.13 -0.23 -0.16 0.02 -0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.