Heatmap: Cluster_48 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g067890.3.1 (Solyc01g067890.3)
-1.94 -2.79 -4.99 -3.72 1.02 0.25 0.4 0.26 0.49 0.57 -0.23 -0.71 -0.05 -0.56 1.04 1.03 0.76 -12.59 - 0.73 -1.28 0.07 -0.36 0.05 -0.17 1.04 0.05 0.17 -0.08 0.37 0.13 0.1 0.13 -1.27
Solyc01g080210.3.1 (Solyc01g080210.3)
0.29 -3.38 -0.04 -1.17 0.6 1.37 -0.67 1.56 -0.58 0.22 -0.83 -1.74 -0.72 -1.72 0.89 0.92 0.8 -4.29 -3.32 1.11 -0.72 -0.87 -1.14 -1.15 -1.42 1.98 -0.61 -0.81 -0.94 -0.93 -0.85 -1.88 0.95 -0.36
Solyc01g094080.3.1 (Solyc01g094080.3)
-2.71 -5.56 -4.37 -5.61 1.6 1.34 -0.53 0.97 0.54 -0.16 -0.25 -1.78 -0.9 -1.31 -0.08 0.19 0.38 -10.17 - 1.68 0.86 0.23 -0.44 0.2 0.4 1.82 -1.53 -1.13 -1.22 -0.27 -0.16 -0.27 -0.15 -3.09
Solyc01g095580.3.1 (Solyc01g095580.3)
0.2 -3.35 -0.97 -3.63 0.51 1.25 0.09 0.3 0.01 0.46 0.53 0.33 1.33 -0.08 -3.49 -4.64 -4.25 - - 0.98 0.21 -0.29 -0.32 -0.39 -0.49 1.43 -0.54 -0.19 -0.33 -0.26 -0.3 -0.04 0.08 1.23
Solyc01g095900.3.1 (Solyc01g095900.3)
-2.18 -1.34 -2.63 -2.55 1.17 1.86 -0.45 2.07 0.44 -0.46 -1.13 -1.99 -0.53 -0.97 -1.28 -1.6 -1.71 -4.91 -5.07 1.78 -1.04 -0.02 -0.06 -0.04 -0.3 1.35 0.71 0.17 -0.25 -0.25 -0.14 -0.62 -0.53 -2.09
Solyc01g095903.1.1 (Solyc01g095903.1)
-3.24 0.42 -1.13 -1.56 0.28 2.58 -2.47 3.17 -1.17 0.0 -3.82 -3.0 -2.06 -2.45 -0.22 - -1.14 - - 1.1 -3.09 -0.53 -0.43 -0.39 -0.78 -0.06 0.13 -0.36 -0.86 -0.18 -0.82 -1.96 0.71 -1.97
Solyc01g099690.3.1 (Solyc01g099690.3)
-0.24 -0.87 -1.07 -1.11 1.32 0.96 0.02 0.45 -0.01 -0.51 -0.61 -0.98 -0.5 -0.73 -0.54 -0.62 -0.58 -5.71 -5.66 1.15 -0.45 0.28 0.03 0.21 0.32 0.87 0.29 0.41 0.3 0.3 0.18 0.28 0.22 -0.54
Solyc01g105340.3.1 (Solyc01g105340.3)
-1.25 -1.12 -1.55 -2.21 0.08 0.4 -0.34 0.6 -0.37 0.18 0.62 -0.24 0.62 -0.03 -0.92 -1.13 -1.11 -5.69 -5.84 1.37 0.94 0.23 -0.39 0.09 0.32 1.39 -0.22 0.14 0.16 0.11 -0.02 0.56 0.25 -1.28
Solyc01g106820.3.1 (Solyc01g106820.3)
-2.01 -3.12 -5.2 -6.69 2.05 -0.59 0.73 -2.86 -0.08 0.35 -2.6 -1.47 -1.08 -1.4 -2.35 -2.39 -2.05 -9.2 -9.43 1.97 1.26 -1.15 -1.12 -0.56 -0.85 2.81 0.26 1.04 0.75 -0.68 -1.56 -1.5 -0.63 -1.37
Solyc01g109300.3.1 (Solyc01g109300.3)
-1.05 -3.59 -3.35 -4.33 0.34 1.33 -1.16 0.39 0.43 0.62 -0.26 0.11 0.18 -0.19 -0.17 -0.05 -0.08 -6.86 -6.0 0.29 0.05 0.09 0.62 0.2 0.06 1.14 0.84 0.56 0.08 0.31 0.28 0.02 -0.76 -1.06
Solyc01g112290.3.1 (Solyc01g112290.3)
-0.64 -0.15 -1.19 -0.89 0.05 0.71 -0.21 1.22 -0.48 -0.17 -0.15 -0.58 0.22 -0.12 -0.38 -0.67 -0.61 -3.72 -4.5 0.29 0.05 0.32 -0.31 -0.04 0.17 1.23 0.14 0.19 0.12 0.44 0.3 0.49 0.42 -0.39
Solyc02g021050.3.1 (Solyc02g021050.3)
-1.41 -0.59 -0.11 -1.46 1.03 1.18 -0.74 1.21 -0.36 -0.17 -1.35 -1.35 -0.6 -0.87 -0.72 -0.81 -1.13 -4.71 -5.22 0.15 -1.19 0.43 0.22 0.25 0.21 0.73 0.88 0.69 0.58 0.6 0.44 0.42 -0.17 -0.02
Solyc02g065280.3.1 (Solyc02g065280.3)
0.87 -4.7 -0.72 -1.36 -3.05 1.39 -5.98 1.17 1.32 1.64 -1.51 -2.28 -1.12 -2.42 -4.15 -5.4 -3.95 - - -0.07 -3.59 0.54 1.86 1.37 1.05 1.98 -1.07 -1.02 -0.66 -1.82 -0.66 -2.39 0.38 -1.2
Solyc02g070490.3.1 (Solyc02g070490.3)
-1.35 -4.08 -4.1 -5.05 -0.6 0.5 -0.45 0.69 0.03 -0.73 -0.95 -1.32 -1.06 -1.14 -1.27 -1.97 -1.79 - - 1.73 -0.14 0.32 -0.16 0.33 0.55 2.54 -0.15 0.3 0.42 0.2 0.12 0.35 1.11 -0.79
Solyc02g071280.3.1 (Solyc02g071280.3)
-0.79 -1.7 -2.16 -2.27 0.01 1.85 -1.13 1.7 -0.91 0.02 -1.87 -1.3 -0.63 -0.49 -0.22 0.11 0.1 - - 1.03 -0.55 0.19 -0.69 -0.42 -0.21 1.32 0.19 0.37 0.41 0.28 0.32 0.21 0.44 -1.21
Solyc02g076870.3.1 (Solyc02g076870.3)
0.09 -0.29 0.31 -0.11 -0.04 -0.04 -0.58 -0.47 0.1 0.23 -1.05 -1.12 -0.61 -0.77 0.29 0.35 0.26 -0.4 0.22 1.36 -0.12 -0.35 -0.79 -0.41 -0.18 1.66 -0.11 -0.06 -0.2 -0.16 -0.4 -0.03 -1.18 0.12
Solyc02g082520.2.1 (Solyc02g082520.2)
-0.84 - 0.77 -2.78 -0.45 0.53 -1.11 -2.13 1.85 1.05 -1.64 -0.76 0.54 0.49 -2.49 -2.23 -1.1 - -4.48 3.18 -1.55 -4.04 -4.14 -1.95 -3.07 2.45 -4.09 -4.79 -1.44 - 0.35 -2.54 - 0.19
Solyc02g092140.1.1 (Solyc02g092140.1)
1.3 -2.52 -1.41 -3.02 1.93 1.13 -1.81 0.74 -1.15 0.38 -0.59 -1.17 -1.57 -1.79 0.94 1.06 1.31 - - 1.29 -1.24 -5.48 -6.09 -5.22 -4.59 2.33 -8.73 -6.11 -6.05 -7.79 -7.95 -6.03 1.45 1.12
Solyc02g092145.1.1 (Solyc02g092145.1)
-0.83 -3.27 -2.0 -2.58 1.65 0.81 -0.11 -1.97 0.43 1.89 -0.23 0.41 1.07 0.39 0.36 0.51 1.13 -2.87 -1.74 1.33 -0.6 -2.21 -0.93 -1.58 -1.89 1.87 -1.57 -2.16 -1.74 -2.52 -2.11 -2.66 -1.57 -0.09
Solyc03g005030.3.1 (Solyc03g005030.3)
0.52 -3.53 -1.5 -1.33 0.92 0.61 0.12 0.77 1.3 0.42 0.62 0.08 -0.73 -2.32 -0.34 -0.47 -0.12 -8.58 -10.58 1.95 -0.05 -1.96 -1.75 -1.7 -1.98 2.8 -3.63 -3.27 -2.93 -2.94 -1.99 -2.6 -0.07 0.19
Solyc03g083090.3.1 (Solyc03g083090.3)
-2.4 -0.77 -2.16 -1.56 0.9 1.49 -1.46 1.33 -0.86 -0.96 0.07 -0.15 0.14 0.19 -1.3 -2.25 -1.76 -3.73 -5.03 2.16 0.19 0.31 -0.83 0.01 0.41 1.09 -0.48 0.09 -0.02 0.39 0.21 0.13 -1.85 -1.45
Solyc03g083095.1.1 (Solyc03g083095.1)
-2.19 -0.74 -2.84 -1.62 -0.71 0.79 -0.79 1.37 -0.9 -0.51 -1.19 -1.5 -0.96 -1.48 -1.39 -2.52 -1.81 -8.22 -8.25 1.73 -0.07 1.06 -0.21 0.67 1.0 0.91 0.16 0.78 0.62 1.05 1.06 0.86 -2.12 -2.25
Solyc03g113990.3.1 (Solyc03g113990.3)
0.62 -2.28 -0.71 -2.07 1.66 1.03 -1.51 -0.55 0.44 0.51 -1.7 -1.01 -0.82 -1.1 0.29 1.17 0.68 -3.42 -2.31 1.93 -0.18 -0.71 -0.35 0.02 0.34 0.32 -0.55 -0.13 0.12 -1.2 -1.17 -0.83 -0.52 -0.44
Solyc03g117440.3.1 (Solyc03g117440.3)
-0.25 -0.26 -1.29 -1.47 0.36 1.15 0.22 0.95 -0.23 0.24 -0.26 -0.47 0.51 0.15 -0.52 -0.82 -0.71 -4.76 -4.83 0.36 -0.77 0.32 -0.25 -0.05 -0.09 1.29 0.26 0.32 0.09 0.46 0.39 0.23 -0.69 -0.78
Solyc03g118340.3.1 (Solyc03g118340.3)
-0.61 0.49 -0.46 -0.6 -0.28 0.77 0.41 1.01 -0.38 0.08 0.18 -0.04 0.25 0.04 -0.14 -0.17 0.52 -9.1 -7.88 1.0 -0.54 -0.23 -0.14 -0.25 -0.54 1.54 -0.25 -0.25 -0.32 -0.25 -0.14 -0.45 -0.64 -0.31
Solyc03g118860.3.1 (Solyc03g118860.3)
-0.65 0.95 -2.12 -0.88 -0.27 -0.34 0.34 -0.09 0.18 -0.32 -0.58 -0.3 -0.23 -0.52 -0.06 -0.58 -0.45 -1.54 -1.21 0.59 0.45 0.53 0.11 0.41 0.64 0.71 0.19 0.36 0.0 0.56 0.4 0.58 -1.35 -0.47
Solyc04g005630.3.1 (Solyc04g005630.3)
-0.5 -0.44 -0.44 -1.97 0.34 1.11 -0.19 1.34 -0.18 -0.75 -0.36 -0.6 -0.62 -0.88 -1.71 -1.72 -1.65 -9.21 -8.96 1.14 -0.65 0.2 0.09 0.11 0.16 1.43 0.38 0.28 0.2 0.33 0.36 0.16 0.59 -0.12
Solyc04g072400.3.1 (Solyc04g072400.3)
-1.19 -1.01 -1.73 -2.96 0.03 0.86 -0.71 1.02 0.07 -0.39 -0.63 -0.7 -0.46 -0.47 -0.78 -1.1 -0.93 -10.86 -10.1 1.26 -0.23 0.52 0.11 0.31 0.34 1.47 0.71 0.69 0.45 0.67 0.45 0.39 -0.55 -1.14
Solyc04g079000.3.1 (Solyc04g079000.3)
-0.58 0.49 -0.26 -0.63 -0.56 0.6 0.94 1.18 -0.41 0.01 0.06 -0.14 0.45 0.25 0.04 -0.22 -0.18 -4.03 -3.34 0.35 -0.25 0.07 -0.23 -0.15 -0.04 0.42 0.15 0.12 -0.03 0.15 0.08 -0.04 -0.54 -0.63
Solyc06g048540.3.1 (Solyc06g048540.3)
-0.68 -0.94 -1.4 -1.03 -0.23 0.99 -0.81 1.14 -0.2 -0.51 -0.9 -0.9 -0.99 -1.23 -0.34 -0.59 -0.75 -6.84 -8.15 1.05 -0.46 0.51 0.17 0.35 0.45 0.88 0.56 0.58 0.35 0.63 0.44 0.42 0.69 -0.33
Solyc06g074120.3.1 (Solyc06g074120.3)
-0.97 - -5.86 - 0.1 1.25 -3.97 0.36 1.11 0.96 -2.33 -2.16 -7.3 -10.66 -1.24 -1.46 -1.39 - - 2.14 1.93 -0.18 -0.57 0.02 0.31 2.68 -1.72 -1.14 -0.84 -1.22 -0.98 0.24 -1.42 -0.45
Solyc06g084270.3.1 (Solyc06g084270.3)
-0.96 -1.37 -1.99 -2.9 0.33 1.65 0.11 1.57 -0.12 0.22 -0.47 -0.91 -0.1 -0.32 -0.24 -0.25 0.08 -10.06 -11.5 0.56 -0.67 0.14 -0.54 -0.35 -0.27 1.51 0.09 0.22 0.09 0.27 0.25 0.23 -0.46 -1.04
Solyc07g005550.3.1 (Solyc07g005550.3)
-0.53 -0.51 -0.52 -1.5 1.56 1.43 -0.5 0.76 -0.23 0.3 -1.03 -1.25 -0.56 -1.11 0.39 0.47 0.36 -7.59 -12.68 -0.11 -0.88 -0.01 -0.16 0.04 0.07 0.86 0.23 0.35 0.16 0.18 -0.01 -0.03 -0.39 -0.49
Solyc07g061990.3.1 (Solyc07g061990.3)
-1.66 -2.14 -2.14 -2.9 1.26 1.65 -1.99 0.79 0.13 0.09 -0.76 -0.63 -1.17 -1.08 -0.11 1.32 0.42 -11.42 -9.77 1.78 -0.25 -0.14 -0.01 0.43 0.22 0.48 -0.41 -0.01 0.07 -0.59 -0.51 -0.3 0.15 -1.46
Solyc07g062060.3.1 (Solyc07g062060.3)
-1.98 -4.29 -4.24 -4.8 1.21 1.01 -1.43 0.47 0.01 0.33 -2.15 -2.19 -1.48 -1.71 -0.27 0.64 0.16 -4.35 -4.5 1.83 -0.53 0.26 -0.04 0.22 0.3 1.73 0.14 0.31 0.02 0.13 0.01 -0.28 0.88 -1.77
Solyc08g005860.3.1 (Solyc08g005860.3)
-1.07 -0.37 -1.54 -1.76 0.33 1.22 0.58 1.29 0.35 0.37 -0.61 -1.15 -0.73 -0.72 0.31 -0.02 0.3 - - -0.19 -1.56 0.28 0.13 0.13 0.06 0.7 0.58 0.46 0.24 0.41 0.44 0.09 -0.73 -0.84
Solyc08g061140.3.1 (Solyc08g061140.3)
-0.07 -0.82 -1.1 -2.55 0.2 1.08 -0.48 0.9 -0.23 0.11 0.07 -0.02 0.25 -0.01 -0.01 -0.0 0.28 -8.76 - 0.73 0.09 0.12 -0.33 -0.17 -0.1 0.92 0.0 -0.04 0.05 0.16 0.16 0.32 -0.38 0.07
Solyc08g063040.3.1 (Solyc08g063040.3)
0.89 -0.97 -1.55 -0.86 -0.04 1.99 -2.25 0.94 0.56 0.1 1.21 0.84 -0.2 0.1 -4.55 -4.49 -5.04 - - 1.7 -1.28 -0.94 -1.04 -1.27 -3.04 2.33 -1.61 -1.12 -1.37 -1.26 -0.85 -0.78 0.05 -0.04
Solyc08g063045.1.1 (Solyc08g063045.1)
0.84 -1.61 -1.51 -1.57 -0.02 1.79 -1.79 0.45 1.0 -0.7 1.37 0.63 -0.31 0.09 -6.49 -8.26 -6.09 - - 2.2 -0.34 -1.06 -1.0 -1.16 -2.64 2.08 -1.54 -1.11 -1.23 -1.13 -0.43 -0.57 -0.44 0.47
Solyc08g075020.3.1 (Solyc08g075020.3)
-1.79 -0.98 -0.17 -1.89 -0.36 1.34 -0.71 0.24 1.14 2.31 -1.83 -2.79 -3.55 -5.1 1.1 0.37 0.16 -2.8 -3.4 2.25 -1.34 -1.72 -1.91 -1.05 -1.26 2.48 -4.74 -3.52 -3.42 -2.64 -2.38 -2.22 -1.3 0.11
Solyc08g076090.3.1 (Solyc08g076090.3)
-1.69 -0.82 -2.47 -2.67 0.06 1.12 -1.19 1.31 1.35 -0.07 -0.3 -0.79 0.32 -0.1 0.3 0.63 0.6 -7.25 -6.27 0.87 0.09 -0.41 -0.79 -0.69 -0.8 1.15 0.28 0.25 -0.13 0.02 -0.12 -0.41 0.37 -1.6
Solyc09g064720.3.1 (Solyc09g064720.3)
-0.39 -1.16 -1.69 -2.31 0.96 1.28 -1.37 1.6 0.35 0.76 -1.68 -2.94 -1.29 -1.48 1.2 0.96 1.24 -7.72 -10.03 1.31 0.37 -1.66 -1.21 -0.67 -0.43 1.25 -0.65 -0.33 -0.09 -1.45 -1.39 -1.63 0.35 -0.5
Solyc10g081650.2.1 (Solyc10g081650.2)
-0.58 -2.6 -0.51 -2.68 0.45 0.85 -1.32 0.83 0.18 0.92 -0.1 -0.99 0.42 -0.01 0.2 0.67 0.41 -6.28 -7.52 1.67 -0.58 -0.57 -0.84 -0.74 -0.88 2.21 -0.62 -0.42 -0.59 -0.56 -0.53 -0.47 -1.42 -0.47
Solyc10g081900.2.1 (Solyc10g081900.2)
-0.74 -1.67 -1.61 -1.9 0.21 -0.02 -0.15 -0.86 -0.11 0.51 0.12 -0.05 0.4 0.46 0.43 0.65 0.96 -3.99 -3.61 1.07 0.55 -0.26 -0.65 -0.32 -0.27 1.57 -0.35 0.01 -0.04 -0.08 -0.24 0.24 -1.76 0.14
Solyc10g083650.1.1 (Solyc10g083650.1)
-1.42 0.05 -0.98 0.15 -0.72 1.23 -1.82 1.51 0.02 -0.9 -0.51 -0.32 -0.77 -0.85 -0.69 -1.06 -1.07 -3.97 -4.26 1.25 -1.01 0.3 0.44 0.44 0.41 0.05 0.46 0.23 0.11 0.19 0.24 -0.5 1.47 -1.29
Solyc11g007680.2.1 (Solyc11g007680.2)
-0.18 -0.22 -0.48 -1.36 -0.71 0.61 -0.61 1.31 0.18 -0.1 -0.56 -0.26 0.03 0.13 0.86 0.8 0.36 -6.38 -7.91 0.79 0.17 -0.49 -0.56 -0.56 -0.44 0.96 0.11 -0.2 -0.36 -0.27 -0.44 -0.57 1.1 -0.73
Solyc11g013060.1.1 (Solyc11g013060.1)
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Solyc11g067160.2.1 (Solyc11g067160.2)
-1.51 -1.83 -1.81 -2.77 1.96 1.97 0.01 1.11 0.17 -0.35 -1.62 -0.68 -1.1 -0.66 -1.33 -0.62 -0.99 - - 1.33 0.1 -0.11 -0.01 -0.04 0.04 1.72 -0.22 -0.17 -0.51 -0.3 -0.41 -0.51 -0.55 -2.0
Solyc12g019010.2.1 (Solyc12g019010.2)
-1.96 -2.4 -1.32 -3.03 0.45 0.98 -0.37 1.05 -0.17 -0.0 0.4 0.21 -0.02 0.2 0.63 0.38 0.29 -4.29 -2.14 1.12 -0.6 -0.1 -0.22 -0.22 -0.08 1.15 0.22 0.03 -0.14 -0.06 -0.08 -0.09 0.24 -2.19
Solyc12g037970.2.1 (Solyc12g037970.2)
0.08 -0.19 -0.83 -1.69 -1.47 -0.08 -0.41 0.34 0.01 0.13 -0.34 -0.2 0.61 0.15 0.55 0.48 0.44 -0.32 0.22 1.13 -0.01 -0.12 -0.51 -0.14 -0.08 0.72 -0.17 0.06 -0.04 -0.13 -0.08 -0.02 -0.71 -0.63
Solyc12g056620.2.1 (Solyc12g056620.2)
-2.0 - -4.27 -4.84 1.33 1.89 -0.37 0.72 0.09 -0.05 -1.66 -2.47 -1.7 -3.85 -2.65 -0.88 -1.1 - -7.67 0.9 -2.44 0.16 1.17 1.02 0.96 -3.0 0.92 1.05 0.76 -1.0 -0.95 -2.68 2.16 -2.9
Solyc12g089210.2.1 (Solyc12g089210.2)
-1.0 0.56 -1.87 -1.51 0.41 0.98 0.02 1.18 -0.04 -0.82 -0.32 0.17 -0.36 -0.22 -0.83 -1.57 -1.08 -6.97 -8.78 -0.36 -0.85 0.56 0.38 0.38 0.3 -0.97 0.82 0.7 0.55 0.87 0.67 0.08 0.63 -1.67

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.