Heatmap: Cluster_96 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Aop_g14889 (TRX1)
- - 0.21 0.39 -3.38 0.08 1.76
- - 0.01 -0.41 - -0.27 2.14
Aop_g22991 (ATP5)
- - 0.9 0.08 - -0.27 1.7
Aop_g22997 (CBL10)
- - 0.26 -0.64 -6.29 0.13 2.02
Aop_g23010 (TUF)
- - 0.89 -0.12 - -0.36 1.79
- - 0.5 -0.02 - 0.51 1.67
- -6.71 0.78 -0.24 -5.79 0.17 1.71
- - 0.58 0.3 -5.73 -0.41 1.81
- - 0.42 -0.14 - -0.03 1.91
- - 0.36 -0.34 - 0.32 1.88
- - 0.53 -0.32 - 0.29 1.82
Aop_g24087 (ARPC1)
-7.02 - 0.51 -0.57 -5.14 0.26 1.87
- -6.46 0.66 -0.57 -5.95 0.12 1.86
- -6.08 0.43 0.2 -5.16 0.18 1.73
Aop_g24136 (NAP4)
- - 0.13 0.2 - 0.29 1.82
- - 0.06 -0.29 - 0.62 1.85
- - 0.75 -0.19 -6.92 0.01 1.77
- - 0.73 -0.59 -6.5 0.38 1.75
- - 0.17 -0.41 - 0.02 2.04
Aop_g24186 (RPT6A)
- -5.09 0.97 -0.37 - -0.08 1.72
Aop_g24198 (ATH4)
- - 0.44 -0.93 - 0.54 1.87
- - 0.26 0.23 - 0.13 1.82
Aop_g24237 (CAM3)
- - 0.64 -0.35 - 0.21 1.81
- - 0.86 0.02 - 0.06 1.64
Aop_g24284 (IMPA-2)
- - 0.4 -0.92 - 0.27 1.98
- - -0.15 0.36 - -0.51 2.04
Aop_g24296 (ATFX)
- - 0.43 -0.15 - 0.32 1.81
- - 0.45 0.26 -4.73 0.19 1.7
- - 0.61 -0.27 - 0.39 1.74
- - 0.59 -0.56 - 0.21 1.87
Aop_g24414 (EMB1401)
- - 0.2 -0.5 -3.65 0.28 1.94
Aop_g24415 (PPa6)
-4.21 -3.2 0.17 0.65 - -0.13 1.69
- - 0.72 -0.9 - 0.2 1.87
Aop_g24424 (GMD1)
- -7.56 0.24 -0.64 -7.65 0.63 1.86
Aop_g24425 (Y14)
- - 0.84 -0.51 -5.83 0.33 1.69
Aop_g24471 (MAB1)
- -6.77 0.75 -0.41 - 0.17 1.78
Aop_g24505 (VAMP725)
- - 0.49 -0.51 - -0.11 1.99
- - 0.25 -0.42 -5.93 0.23 1.96
Aop_g24533 (MBAC1)
- - 0.02 -0.17 - 0.43 1.91
- - 0.54 -0.28 -5.16 0.31 1.79
- -5.24 0.79 -0.77 - -0.08 1.89
- -6.38 0.93 -0.28 -4.88 -0.12 1.73
- - 0.68 -0.66 -5.33 0.25 1.83
- - 0.86 -0.59 -4.92 0.0 1.8
- -6.81 0.56 -0.83 -6.89 0.27 1.9
- - 0.53 -0.38 - 0.1 1.89
Aop_g24580 (UGP2)
-5.76 -5.58 -0.02 0.07 -7.5 0.3 1.88
- -6.82 0.95 -0.14 - -0.16 1.7
Aop_g24631 (MPK2)
- - -0.05 0.03 -5.18 0.44 1.86
- -9.06 0.37 -0.96 -7.56 0.44 1.94
- - 0.65 -0.89 - 0.41 1.84
- - 0.37 0.03 -5.65 0.32 1.77
Aop_g24706 (ASNAP)
- -6.92 0.86 -0.2 - 0.02 1.72
- - -0.42 -0.28 - -0.06 2.16
Aop_g24731 (MPK4)
- -4.87 0.88 -0.59 -6.96 0.09 1.76
- - 0.78 -0.15 - -0.04 1.77
Aop_g24738 (SFH3)
- -6.47 0.65 -0.83 - 0.02 1.94
Aop_g24764 (E1 ALPHA)
- - 0.51 -0.35 -5.7 0.3 1.83
- -9.37 0.77 -0.2 -6.28 -0.13 1.81
Aop_g24823 (HIRA)
- - -1.21 0.25 - -0.64 2.24
- - 0.84 -0.95 - 0.23 1.81
Aop_g24839 (NAD9)
- -4.43 0.1 -0.09 - 0.45 1.84
- - 0.22 0.18 -6.47 -0.02 1.89
- - 0.94 -0.27 - 0.13 1.66
- - 0.64 -0.42 - -0.07 1.9
- - 0.17 -0.78 -5.29 0.11 2.06
- - 0.23 -0.41 -5.96 0.76 1.75
- - 0.66 -1.03 -6.03 0.25 1.9
- - 0.71 -0.21 - 0.2 1.75
Aop_g25029 (NEV)
- - -0.07 -0.25 - 0.2 2.02
Aop_g25053 (IDH-V)
- -6.35 0.49 -0.39 -6.44 0.38 1.81
- - 0.47 -0.41 -3.96 0.31 1.83
- - 0.67 -0.75 - 0.42 1.8
- -5.68 0.46 0.08 -6.22 0.36 1.7
Aop_g25948 (LOS1)
-4.51 -3.38 0.26 -0.09 -6.44 0.22 1.83
Aop_g25991 (CAM6)
-6.31 -5.64 0.26 0.43 -8.01 0.04 1.76
- - 0.38 -0.93 - 0.36 1.96
Aop_g26416 (UBC11)
- - 0.46 -0.17 -5.67 0.25 1.82
- - 0.4 0.02 - 0.13 1.84
- - 0.25 -0.38 -2.99 0.36 1.86
- - 0.18 -0.16 - 0.59 1.8
-5.14 - 0.26 -0.75 - 0.5 1.91
- -5.93 0.3 -0.37 -7.04 0.21 1.93
- -6.48 0.86 -0.44 - 0.1 1.75
- - 0.9 -0.52 - 0.07 1.76
Aop_g27227 (ACT11)
-5.56 -6.12 0.59 -0.17 -5.72 0.09 1.8
- - 0.61 -0.12 - 0.32 1.73
- - 0.41 -0.45 -5.38 0.4 1.84
- - 0.95 -0.33 -3.34 -0.17 1.72
- - 0.19 -0.54 -5.58 0.45 1.92
Aop_g27502 (ADK1)
-5.65 -5.41 0.84 -0.53 -7.08 0.06 1.78
- - 0.34 -0.04 - 0.45 1.76
Aop_g27563 (WRM)
- - 0.67 -0.3 -6.39 0.15 1.8
Aop_g27576 (MAC3B)
- - 0.5 -0.57 - 0.24 1.9
- - 0.61 -0.27 -5.01 0.24 1.78
- - 0.85 -0.24 -6.46 0.18 1.68
Aop_g27805 (SGP1)
- -6.76 0.38 -0.85 -5.84 0.45 1.91
- - 0.91 -0.22 - 0.16 1.65
- - 0.74 -0.49 - 0.34 1.75
Aop_g27927 (GPA1)
- -7.28 0.36 -0.6 -7.36 0.27 1.94
Aop_g28071 (ARA5)
-6.45 - 0.91 -0.54 -6.61 0.05 1.75
Aop_g28077 (TUB7)
-7.73 -5.88 0.55 -1.1 -7.16 0.33 1.92
-4.21 -4.06 0.45 -0.74 -5.31 0.25 1.89
-3.37 -2.74 0.22 0.36 -6.48 -0.14 1.76
- -5.64 0.58 -0.75 - 0.02 1.95
- - 0.72 -0.79 -5.96 0.22 1.84
- - 0.57 -0.45 - 0.2 1.86
- - 0.26 -0.05 - -0.58 2.06
Aop_g29193 (VPS60.1)
- - 0.32 -0.06 - 0.48 1.77
- -6.63 0.1 0.09 -6.15 0.19 1.89
Aop_g29606 (TOPP3)
- - 0.59 -0.55 - 0.13 1.89
Aop_g29872 (UCP5)
- - 0.43 -1.06 -6.41 0.58 1.87
- - 0.6 -0.83 - 0.44 1.84
- - 0.59 -0.25 - 0.12 1.84
- - 0.76 -0.05 - -0.1 1.77
Aop_g30507 (NFD5)
- - 0.52 0.4 -5.05 -0.21 1.74
Aop_g31571 (NAP1;1)
- -6.02 0.74 -0.65 -6.11 -0.0 1.88
- - 0.38 -0.61 - -0.03 2.02
-4.43 - 0.89 -0.55 - 0.04 1.76
- - 0.24 -0.39 -4.7 0.17 1.96
- -6.41 0.22 -0.3 - 0.46 1.86
-5.41 -6.24 0.16 -0.39 -8.15 0.0 2.03
- -7.44 0.26 -0.42 -7.52 -0.02 2.02
-2.14 -3.23 -0.63 0.13 -4.8 -0.19 2.01
- - 0.14 0.03 -7.24 0.19 1.9
- - 0.51 0.13 - 0.24 1.72
- - 0.37 -0.55 - 0.06 1.99
Aop_g32724 (TOPP4)
- - 0.25 -0.43 - 0.07 2.01
Aop_g33614 (ALDH2B)
- - -0.05 -0.58 -4.22 0.22 2.05
- - 0.79 0.22 - 0.12 1.59
- -5.04 0.29 -0.83 - 0.8 1.78
- -6.27 -0.18 -0.44 -5.35 0.37 2.02
- - 0.39 -0.03 - 0.25 1.82
- - 0.58 -0.72 - 0.18 1.91
- - 0.8 -0.86 - 0.03 1.88
-7.34 -4.8 0.22 -0.06 -6.53 -0.02 1.94
Aop_g39938 (RANBP1)
- - 0.22 0.14 -5.85 0.26 1.82
- - 0.63 -0.3 - -0.04 1.87
- - 0.03 0.01 - 0.17 1.94
- - 0.73 -0.7 - 0.24 1.82
Aop_g41897 (ROP1)
-4.8 - 0.51 -0.55 - 0.21 1.89
-5.77 -4.62 0.68 -1.12 - 0.4 1.83
- - 0.51 0.12 -6.4 0.34 1.68
Aop_g46624 (CBL2)
-6.2 - 0.54 0.06 - -0.12 1.84
- -6.32 0.48 -0.15 - 0.12 1.85
- - -0.59 -0.11 - -1.13 2.31
- -6.03 0.51 -0.91 - 0.04 2.0
-4.79 -3.55 0.74 -0.21 -3.69 0.3 1.6
- - 0.21 0.23 - 0.2 1.82
Aop_g51636 (HSP70)
- - 0.27 0.27 -4.75 0.13 1.79
- - -0.36 0.01 - 0.62 1.88
- - 0.54 0.0 - -0.51 1.94
- - -0.89 -0.27 - 0.6 2.04
Aop_g61142 (SEC15B)
- - -0.36 -0.24 - 0.61 1.94

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.