Heatmap: Cluster_230 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.89 -0.98 -0.92 -0.53 0.82 -1.18 -1.05 -1.0 -1.47 0.14 -1.96 -2.14 0.14 0.01 -0.56 -1.3 -0.64 -1.21 -0.52 -0.51 -0.48 -0.4 -1.42 -1.75 -0.65 -1.06 -0.62 0.33 1.18 0.32 0.98 0.34 0.82 0.63 -0.66 -0.19 0.78 0.85 0.0 0.81 0.74 0.9 0.71 0.11 0.65 0.88 0.39 -0.09
-1.01 -1.68 -0.63 -1.86 0.64 -0.32 -0.33 -1.22 -1.57 0.18 -1.83 -1.68 -0.39 -1.57 -0.01 -0.72 -0.6 -2.33 -0.66 0.28 0.59 -0.2 -0.7 -2.87 -0.06 -1.75 0.57 0.73 0.03 0.29 0.48 0.77 0.67 0.51 -1.21 0.21 0.52 0.19 -0.05 0.56 0.73 0.5 0.55 1.27 0.62 -0.02 0.98 0.37
- - -6.47 -7.24 -4.85 -3.81 -3.01 -2.98 -5.7 0.58 -0.63 -0.86 0.05 0.06 0.8 -6.92 -3.55 -3.88 -3.7 -2.34 -0.97 -1.24 -4.59 -4.65 -2.34 -4.2 -1.05 -1.21 0.2 1.06 0.54 -0.06 0.98 1.04 1.3 0.16 0.92 0.23 -0.34 1.87 1.92 1.56 1.3 1.52 1.11 0.16 -0.08 0.52
-8.49 - -4.69 -6.64 -1.23 -3.9 -3.99 -4.74 - 1.19 -3.39 -3.72 1.77 1.71 0.77 -4.98 -3.03 -3.38 -7.3 -3.1 -2.71 -2.61 -6.69 -4.36 -3.1 -2.61 -3.86 -0.13 0.48 0.76 0.39 -1.99 1.37 1.2 -2.15 0.01 0.95 0.97 0.75 2.08 0.21 1.37 1.39 0.64 1.02 1.02 -0.25 0.12
-1.7 -1.23 -1.51 -1.84 0.1 -0.6 -0.32 -0.31 -2.43 0.23 -0.98 -1.31 -0.23 -0.24 -0.3 -1.14 -0.53 -1.29 -0.12 -0.2 -0.0 -0.04 -2.01 -1.74 0.56 -1.07 0.52 0.88 1.14 0.16 0.7 -0.21 0.76 0.77 0.45 1.0 0.73 0.21 0.2 0.06 0.52 0.55 0.22 0.17 0.24 0.1 0.43 0.08
-5.53 -1.83 -1.12 0.68 0.28 -0.04 -0.52 -0.52 -1.26 1.06 -1.82 -2.58 0.73 0.56 0.6 -0.47 -1.53 -1.36 -1.11 -2.22 -2.02 -1.6 -5.93 -1.71 -1.4 -1.37 -1.64 0.18 0.71 0.59 0.67 0.14 1.25 0.78 -1.88 0.17 0.99 0.66 0.34 0.55 0.18 0.41 0.34 0.47 1.3 0.73 0.63 -0.38
-1.72 -1.92 -0.89 -1.28 0.92 0.56 0.21 0.37 -1.12 0.77 -0.96 -1.23 0.45 -0.3 0.74 -1.22 0.06 -0.25 -0.18 0.26 -0.0 -0.05 -3.97 -0.75 0.54 0.6 0.45 0.58 -0.33 0.02 0.64 0.67 0.27 -0.05 -0.78 0.48 0.88 0.35 -0.94 -0.26 -0.51 -0.8 -0.23 0.17 -0.34 0.24 0.09 0.0
-1.05 -1.12 -1.92 -4.3 -0.58 0.53 0.64 0.78 -1.75 0.8 -1.93 -2.18 0.4 -0.24 0.72 -2.07 -1.25 -1.26 -0.82 -0.33 -0.27 -0.41 -2.06 -2.96 0.58 -0.42 0.91 0.76 -0.33 0.27 0.73 0.38 0.48 0.61 0.36 1.18 0.85 0.36 0.12 -0.21 -0.68 -0.97 -0.1 0.18 -0.09 0.44 0.63 0.38
-0.98 -1.45 -1.03 -0.65 -2.37 -0.51 -0.09 -0.21 -0.52 0.43 0.23 0.27 0.69 0.5 0.23 -1.3 -1.53 -0.41 -0.87 -0.72 -0.75 -0.49 -1.85 -0.04 0.59 -0.94 0.38 0.09 0.02 0.15 0.11 0.04 0.2 0.27 0.24 0.38 0.19 0.57 0.31 0.37 0.85 0.73 0.45 0.41 0.18 0.57 0.12 0.0
-0.82 -1.47 -3.0 -2.29 -0.05 -4.22 -3.22 -3.9 -2.43 -0.09 -0.7 -1.17 0.88 0.68 -0.39 -1.34 -0.42 -0.61 -1.77 -0.5 -0.56 0.18 - -1.86 0.29 0.16 0.07 0.6 0.55 0.57 0.66 -0.42 0.7 0.68 1.27 0.64 1.08 0.14 0.76 0.29 0.68 0.33 0.68 0.36 0.71 0.26 0.1 0.14
-0.9 -1.12 -1.57 -3.31 0.14 -0.29 -0.78 -0.79 -0.97 0.15 0.81 0.89 0.67 1.11 0.18 -0.41 -0.63 -1.1 -0.78 -0.4 -0.26 -0.48 -2.12 -1.8 0.28 -0.49 0.41 -0.5 0.67 0.09 -0.11 0.01 0.05 -0.29 0.29 -0.72 0.05 -0.06 -0.04 0.56 1.15 0.96 0.65 0.44 0.33 -0.07 -0.15 0.31
- - -10.96 - -2.53 -2.26 -3.77 -2.97 - 1.16 -3.07 -2.54 1.4 1.17 0.88 -6.89 -2.91 -5.75 -1.98 -0.78 -1.9 -3.43 -6.45 -3.05 -3.61 -6.45 -4.69 -0.16 -0.84 0.25 1.14 0.76 0.87 0.35 -0.81 -0.4 1.27 1.45 0.74 1.48 1.27 0.84 1.5 0.8 0.52 1.54 0.48 0.54
-7.74 -6.11 -5.09 -8.39 -2.6 -3.58 -3.13 -3.77 - 0.82 0.33 0.17 1.36 1.93 0.63 -6.7 -4.76 -7.62 -3.83 -4.47 -4.86 -4.96 -4.94 0.43 -5.52 -3.26 -5.39 0.85 -0.41 0.48 0.66 1.22 1.35 0.84 -0.07 0.27 1.78 0.86 0.44 0.58 -0.03 -0.2 0.6 0.89 0.74 0.79 0.58 0.17
-0.96 -1.42 -0.95 -3.67 0.61 -0.57 -0.56 -0.52 -1.38 0.63 -0.94 -1.27 0.64 0.24 0.5 -1.01 -0.24 -0.55 -0.17 0.08 0.24 0.14 -2.14 -0.89 0.47 -0.14 0.21 0.58 -0.1 0.0 0.47 0.28 0.42 0.48 -0.24 0.96 0.66 0.31 0.4 -0.08 0.06 -0.16 0.06 0.04 0.18 0.34 0.37 0.16
-2.24 -1.67 -1.49 -1.44 0.4 -0.29 -1.17 -1.14 -2.64 0.72 -1.0 -1.46 0.77 0.52 0.21 -1.52 -0.03 -0.52 -0.42 -0.06 -0.16 0.26 -3.9 -0.47 0.43 -0.22 -0.02 0.21 0.03 0.09 0.63 0.78 0.62 0.46 -0.0 0.79 0.62 0.22 -0.15 0.15 0.71 0.64 0.15 0.18 0.27 0.12 0.38 0.07
0.18 -2.05 -0.92 -2.84 0.18 0.41 0.32 0.23 -0.75 0.62 -4.86 -5.51 -0.47 -2.1 1.0 -1.74 -0.37 -1.01 -0.03 0.78 0.6 0.72 -1.38 -0.85 0.85 0.0 -0.04 0.76 -0.6 -0.16 1.04 -1.31 0.78 0.66 -1.28 0.67 1.15 0.08 -0.66 -0.16 -0.36 -0.61 -0.09 -0.01 0.11 -0.04 0.58 0.08
-1.21 -1.9 -1.58 -3.6 -0.46 -1.47 -1.51 -2.44 -2.41 0.8 0.36 -0.02 0.54 -0.61 0.27 - -0.72 -1.76 -0.39 -0.69 -0.61 -0.24 -8.27 -1.38 0.01 -1.49 0.22 0.82 0.26 0.37 0.9 0.88 1.08 1.04 -0.3 1.23 1.02 0.32 0.3 0.16 -0.23 -0.4 0.19 0.58 0.47 0.38 0.92 0.37
-0.95 -0.85 -0.9 -2.71 0.36 0.3 0.25 0.26 -0.71 0.6 -1.19 -1.02 0.66 0.18 0.69 -0.82 -0.85 -0.58 -0.07 -0.06 -0.34 -0.21 -3.44 -0.75 0.39 -0.36 0.48 0.56 -0.52 0.03 0.72 0.36 0.37 0.26 -0.9 0.9 0.62 0.12 -0.34 0.1 0.28 0.02 0.05 0.26 -0.03 0.06 0.47 0.08
-2.77 -1.86 -1.59 -1.58 -0.92 -0.68 -0.86 -0.85 -2.21 0.68 -4.35 -4.39 0.6 -0.58 0.09 -2.49 -0.57 -0.86 -1.14 -0.69 -0.46 -0.25 -1.43 -1.98 0.31 -0.53 0.54 0.67 0.08 0.41 0.85 0.4 1.03 0.84 -0.73 0.78 1.16 0.83 0.27 0.77 -0.01 -0.21 0.74 0.88 0.47 0.74 0.82 0.1
-0.84 -0.88 -1.31 -0.68 -0.15 0.72 0.44 0.56 -0.94 0.96 -2.37 -2.64 0.66 -0.24 0.87 -2.17 -1.86 -1.05 -1.86 -0.91 -1.1 -0.64 -4.91 -0.81 0.76 0.07 0.33 -0.09 0.58 0.47 1.06 0.28 0.64 0.31 0.22 0.67 1.03 0.01 -0.78 0.07 0.39 0.16 0.13 -0.04 -0.3 -0.14 0.32 0.11
-6.26 -2.61 -4.24 -2.35 0.68 -0.35 -0.56 -0.6 -3.74 0.97 -0.38 -0.37 1.6 1.57 0.73 -6.73 -3.91 -3.7 -2.58 -1.57 -2.65 -2.33 -4.0 -4.4 -1.86 -2.4 -0.59 -1.25 -0.99 0.29 -0.02 0.73 0.84 -0.03 -1.26 0.0 0.68 1.05 0.18 0.51 2.03 1.57 0.62 0.06 0.67 1.12 -0.18 -0.19
-3.24 -1.23 -0.32 -3.02 0.93 -0.17 -0.17 -0.28 -1.8 0.29 -2.19 -2.03 0.24 0.15 0.77 -1.51 -1.9 -2.44 -0.77 -0.1 0.34 0.55 -2.64 -3.0 -0.39 -1.53 -0.99 0.81 -0.08 0.31 0.73 -0.38 0.95 0.47 0.12 0.71 0.9 0.42 0.09 0.52 0.59 0.2 0.37 0.38 0.69 0.38 0.45 0.57
-0.72 -1.0 -0.4 -0.63 0.12 0.28 0.54 0.3 -0.45 0.33 -3.27 -3.65 -0.65 -1.75 -0.09 -1.65 -0.92 -1.47 -0.11 -0.73 -0.99 -1.02 -2.32 -2.35 0.5 -1.69 -0.07 0.4 1.22 0.5 1.56 -0.35 0.64 0.99 -0.33 0.62 0.93 0.12 0.06 0.1 0.11 0.4 0.02 0.25 0.29 0.13 0.85 0.16
-4.12 -3.33 -6.6 -5.26 -0.69 -2.44 -2.22 -2.8 -6.89 0.71 0.52 0.49 1.09 1.11 -0.33 0.14 -3.59 -6.65 -5.3 -4.51 -6.53 -4.35 -8.69 -5.74 -3.56 -2.22 -3.17 -1.98 -0.03 0.56 0.11 0.51 0.95 0.51 -1.2 -0.17 0.96 1.12 0.31 1.34 1.74 1.5 1.17 0.95 1.02 1.06 0.31 0.87
-1.25 -1.53 -1.34 -3.93 0.35 0.21 -0.18 0.03 -1.46 0.73 -1.25 -1.4 0.13 -0.64 0.27 -1.79 -1.79 -1.68 -0.87 -0.5 -0.31 -0.48 -1.69 -2.71 0.34 -1.45 -0.1 0.55 1.04 0.21 0.91 0.59 1.03 0.7 -0.37 0.59 0.93 0.33 -0.14 0.42 0.23 -0.21 0.52 0.51 0.55 0.33 0.79 0.31
-0.92 -1.94 -2.56 -4.48 -0.68 -0.65 -0.42 -0.62 -1.66 1.14 -3.51 -3.29 1.61 1.46 0.63 -1.74 -1.02 -0.57 -1.97 -1.27 -0.97 -0.87 -6.47 -2.64 -0.25 -0.52 -0.75 -0.03 0.66 0.19 0.53 -1.2 0.72 0.41 -0.68 0.51 0.88 0.56 0.45 1.13 0.87 0.32 0.99 0.43 0.65 0.55 -0.16 -0.06
-1.48 -1.83 -1.79 -4.18 -0.8 -1.0 -0.89 -1.43 -2.74 0.83 -1.35 -1.72 1.09 0.72 0.66 -3.83 -2.91 -3.56 -2.72 -3.23 -2.77 -2.4 -3.71 -4.68 -1.74 -2.91 -1.22 -0.26 -0.06 0.26 0.57 -0.55 0.88 0.84 1.46 0.45 1.41 0.41 1.04 1.8 -0.08 0.15 1.81 1.17 0.47 0.48 0.27 -0.07
-0.96 -0.35 -0.73 -1.98 0.66 -0.24 -0.23 -0.2 -1.49 0.76 -0.61 -0.92 0.01 0.06 0.64 -0.33 -0.93 -1.26 -0.75 -0.49 -0.52 -0.76 -1.52 -2.2 -0.29 -1.09 -0.57 -0.05 0.25 0.69 0.4 -0.43 0.44 0.8 -1.25 0.26 0.3 0.16 -0.6 1.1 1.05 1.04 0.52 0.89 0.76 0.06 0.02 0.17
-3.03 -2.28 -1.72 -3.2 -0.16 -0.25 0.55 0.37 -0.69 0.56 0.81 0.78 0.76 1.12 0.42 -1.55 -1.93 -1.47 -1.37 -0.65 -0.57 -0.78 -0.67 -0.03 0.25 -0.92 0.73 -0.29 -0.02 0.17 0.09 0.5 0.3 -0.1 -0.46 -0.28 0.31 0.14 -0.36 0.45 0.97 0.74 0.57 -0.02 0.01 0.13 -0.28 0.18
-1.67 -1.1 -0.73 -1.48 -0.07 -0.89 -1.14 -0.95 -1.43 0.5 -1.79 -1.93 0.72 0.84 0.15 -1.05 -1.04 -1.0 0.18 -0.39 -0.13 -0.25 -1.24 -1.86 -0.07 -1.17 0.37 0.35 -0.28 0.12 0.36 0.61 0.81 0.68 -1.56 0.58 0.68 0.19 0.68 0.46 0.3 0.36 0.63 0.8 0.85 0.13 0.7 0.23
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-1.72 -1.14 -2.77 -3.63 0.12 -0.67 -1.04 -1.08 -1.16 0.77 -0.84 -1.17 0.99 0.69 0.24 -1.54 -1.45 -2.28 -0.09 -0.0 0.09 0.02 -0.06 -2.56 0.5 -1.0 0.94 -0.09 0.13 0.12 0.99 0.12 0.84 0.11 -0.63 0.35 0.87 0.14 0.51 0.31 -0.91 -0.05 0.65 0.39 0.52 0.05 0.72 0.53
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-1.35 -0.95 -0.66 -2.5 0.6 0.37 0.27 0.31 -0.62 0.55 -0.59 -0.82 -0.0 -1.56 0.57 -1.68 -0.65 -0.81 -0.52 -0.31 -0.13 0.08 -1.36 -1.26 0.49 -0.23 1.15 0.31 -0.02 0.06 0.87 0.19 0.71 0.3 -0.32 0.96 0.82 -0.05 -0.29 0.02 -0.54 -0.89 0.26 0.27 -0.15 -0.1 0.74 0.05
-1.38 -1.02 -1.63 -2.71 -0.31 -1.19 -1.25 -1.55 -1.14 0.44 0.29 0.18 0.72 0.43 0.1 -0.97 -0.76 -1.28 -0.7 -0.59 -0.48 -0.54 -1.51 -2.51 -0.31 -0.32 -0.18 0.77 0.53 0.27 0.74 -0.33 0.71 0.64 1.05 0.27 0.9 0.33 0.52 0.07 0.41 0.22 0.41 0.25 0.16 0.52 0.35 0.53
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-2.28 -3.69 -2.98 -3.65 0.36 -0.17 0.05 -0.23 -4.33 0.34 -0.52 -0.8 0.66 0.46 -0.51 0.64 -0.97 -3.89 -2.68 -1.88 -1.97 -2.05 -6.9 -5.35 -1.07 -1.54 -1.99 -0.45 0.77 0.73 0.58 -0.16 0.73 1.23 -0.09 -0.73 0.71 0.47 -0.55 0.92 1.76 1.67 0.53 0.87 0.68 0.58 0.24 0.35
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-0.24 -1.67 -0.88 -3.02 0.56 -0.67 -0.83 -0.77 -1.5 0.21 -2.3 -2.41 -0.32 -0.48 -0.32 -1.92 -0.27 -0.61 -0.12 0.04 0.28 -0.4 -0.8 -2.31 0.7 -0.88 0.38 0.91 0.04 0.03 0.75 0.24 0.8 0.79 0.45 1.05 0.91 0.51 0.13 0.05 0.05 -0.08 0.31 0.26 0.29 0.53 0.6 0.08
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-1.61 -1.26 -1.32 -2.98 0.31 0.61 0.47 0.52 -1.09 0.74 -0.95 -1.23 0.46 -0.46 0.48 -0.71 -1.25 -1.63 -0.76 -0.47 -0.16 -0.36 -2.51 -1.56 0.41 -0.54 0.4 0.38 0.35 0.27 0.84 0.23 0.59 0.35 -0.19 0.33 0.87 0.42 -0.17 0.14 0.23 -0.12 0.33 0.24 0.25 0.54 0.54 -0.13
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-2.59 -2.51 -2.18 -2.37 -0.09 -0.61 -0.41 -0.35 -1.58 0.09 -1.73 -1.88 0.14 -0.09 -0.16 0.18 -1.28 -1.35 -1.17 -1.33 -0.07 -0.07 -3.51 -2.5 -0.04 0.05 -0.09 1.25 0.59 0.54 0.99 -0.58 0.62 1.23 0.71 0.07 0.9 -0.45 0.6 0.94 0.75 0.2 0.38 0.78 0.74 -0.45 0.28 0.34
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.