Heatmap: Cluster_4 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
0.96 0.51 -0.51 -0.61 0.39 -0.8 -1.34
1.73 0.57 -2.2 -2.25 0.24 -1.54 -2.06
1.89 1.04 -1.39 -1.65 -1.64 -3.22 -3.33
1.38 1.01 -1.8 -1.94 0.56 -2.05 -3.13
1.19 0.44 -0.32 -1.06 0.68 -2.28 -1.85
Aop_g00558 (LIP1)
1.64 0.23 -3.2 -3.26 1.01 -1.44 -3.09
Aop_g00673 (FTSZ2-2)
1.18 0.69 -1.05 -1.37 0.58 -1.35 -1.42
Aop_g00679 (BRS1)
1.55 0.91 -1.15 -1.67 -1.59 -0.3 -1.84
0.99 0.61 -1.57 -2.28 1.34 -1.63 -3.31
1.0 0.25 -0.88 -1.06 0.87 -0.93 -1.22
Aop_g01073 (LHCA2)
1.84 0.86 -2.85 -3.15 0.17 -2.83 -3.38
1.72 1.11 - - 0.47 -2.59 -
2.32 -1.14 -1.04 - 0.03 -4.2 -
1.95 0.22 -6.9 -5.57 0.85 -3.1 -5.47
0.95 0.38 -0.29 -0.55 0.16 -0.6 -1.05
1.58 0.78 -1.48 -1.97 0.13 -1.19 -2.85
1.87 0.53 -4.48 -3.8 0.52 -3.11 -2.12
1.58 -0.26 -2.05 -3.98 1.12 -0.98 -2.41
2.03 0.74 -4.28 -2.95 -0.39 -2.62 -2.73
1.93 0.91 - -4.25 -0.37 -2.36 -1.74
Aop_g02771 (YLMG2)
1.54 0.89 -1.78 -1.66 0.28 -2.01 -2.66
1.53 1.26 -4.25 -4.51 0.28 -1.48 -4.15
Aop_g03240 (FRA1)
1.04 0.49 -1.26 -1.32 0.88 -1.21 -1.17
Aop_g03461 (LHB1B2)
2.27 0.75 -3.73 -4.58 -1.5 -7.57 -8.69
Aop_g03477 (RHM1)
1.14 -0.14 -1.9 -1.78 0.82 -0.08 -0.7
1.97 -0.62 -7.68 -8.55 1.26 -8.2 -6.73
1.55 1.26 -1.24 -2.94 -0.54 -1.6 -3.21
0.95 0.2 -0.42 -0.8 0.5 -0.92 -0.6
1.67 0.99 -4.26 -6.66 0.61 -2.58 -3.81
0.98 0.11 -1.81 -1.56 1.23 -0.83 -1.23
1.56 0.39 -2.38 -2.86 0.91 -1.55 -2.32
Aop_g05427 (CYP716A1)
2.08 0.67 -5.83 -7.53 0.13 -5.07 -4.91
1.44 0.96 -1.25 -1.39 -0.05 -1.53 -2.14
1.76 0.72 -4.12 -5.47 0.81 -2.91 -6.21
1.54 0.81 -2.46 -2.96 0.66 -1.76 -2.67
Aop_g05803 (XTR4)
1.69 0.69 -1.46 -1.72 0.29 -2.58 -3.38
Aop_g05895 (DREB26)
2.16 0.26 -3.16 -1.57 -1.04 -3.85 -1.57
Aop_g06028 (LysoPL2)
1.63 0.48 -3.37 -6.42 0.52 -0.22 -3.19
1.57 0.51 -3.51 -2.56 1.01 -1.84 -4.53
1.33 0.11 -1.48 -2.15 1.14 -1.29 -2.22
1.99 1.29 -5.72 -8.0 -1.21 -7.43 -3.12
Aop_g06400 (APX4)
1.87 0.83 -2.96 -3.42 0.16 -3.01 -3.06
1.7 1.81 -7.9 -7.43 -2.24 -9.07 -5.63
Aop_g07072 (YRE)
1.17 0.73 -3.68 -3.49 1.29 -1.84 -2.32
Aop_g07194 (KCS11)
1.7 1.02 -1.85 -1.99 -0.4 -1.63 -3.05
Aop_g07284 (LIP1)
2.07 0.52 -3.99 -5.76 0.32 -5.18 -6.35
1.08 0.51 -0.93 -1.31 0.74 -0.81 -1.79
Aop_g07528 (PSBX)
1.79 0.79 -3.46 -3.9 0.56 -3.18 -4.0
2.22 0.29 -4.93 -4.78 -0.54 -2.27 -2.6
Aop_g07849 (KCS4)
1.79 0.21 -2.18 -2.38 0.31 -1.34 -1.55
Aop_g08296 (SPL8)
1.83 1.55 -6.12 -7.91 -1.05 -8.87 -8.59
Aop_g08517 (DRB3)
1.27 0.81 -2.19 -2.21 0.78 -1.36 -1.8
Aop_g08720 (LHCA1)
1.38 0.75 -1.09 -1.41 0.54 -1.7 -3.17
Aop_g09355 (PSAE-2)
1.52 0.61 -1.72 -1.86 0.65 -1.62 -2.91
Aop_g09836 (ORP4A)
1.35 0.34 -2.16 -1.8 0.7 -0.7 -1.19
2.36 0.51 -3.32 - -1.58 - -
1.68 1.09 -1.19 -1.57 -1.08 -2.54 -2.02
1.42 1.06 -2.08 -1.9 0.33 -1.67 -2.68
1.47 0.79 -2.92 -2.39 0.8 -1.8 -2.75
1.05 0.46 -0.59 -0.37 -0.05 -0.69 -0.9
Aop_g11432 (FRU)
1.06 0.15 -1.94 -2.37 1.28 -1.2 -1.01
1.83 0.38 -1.18 -2.07 0.54 -7.25 -
Aop_g11657 (FATB)
1.06 0.5 -1.89 -2.64 1.36 -1.63 -2.51
1.54 1.09 -2.39 -2.42 0.2 -2.45 -2.02
Aop_g12337 (CYP90D1)
1.52 0.86 -1.15 -2.86 0.0 -2.02 -1.08
Aop_g12432 (FDH)
1.42 0.85 -2.72 -3.24 1.04 -2.32 -6.95
Aop_g12494 (DSO)
1.53 0.45 -6.58 -8.16 1.32 -2.26 -5.08
1.51 0.91 -2.0 -2.37 0.42 -1.9 -2.16
Aop_g12769 (DSO)
1.58 0.47 -7.99 -6.49 1.24 -2.07 -6.07
1.49 -0.2 -4.71 -5.36 1.19 -0.5 -1.96
2.42 -0.25 - - -1.06 -1.64 -
Aop_g13321 (KCS11)
1.69 0.74 -2.06 -1.14 -0.82 -1.68 -0.93
1.21 0.48 -5.19 -5.69 1.5 -1.36 -5.24
1.58 0.3 -1.38 -2.0 0.87 -1.93 -4.1
1.35 0.84 -1.02 -0.66 -0.9 -0.94 -1.11
Aop_g14003 (PGP2)
1.53 1.34 -1.29 -2.07 -0.37 -3.06 -4.77
1.83 1.39 -1.64 -3.31 -1.96 -4.79 -3.17
1.44 0.48 -1.26 -1.78 1.03 -3.03 -5.27
Aop_g14496 (PGR1)
2.18 -0.2 -7.37 -5.46 0.46 -3.55 -3.36
2.02 1.25 - - -0.83 - -
1.34 0.36 -0.95 -1.34 0.55 -1.02 -1.63
1.84 1.31 -1.03 -1.43 -3.92 - -
2.23 1.05 -3.03 - -3.03 - -
1.96 0.51 -4.08 -3.98 0.45 -4.26 -2.78
1.37 0.76 -3.94 -4.47 1.16 -1.51 -6.21
1.8 0.48 -2.03 -1.04 -0.43 -2.29 -1.18
1.64 0.9 -1.54 -1.84 -0.84 -0.84 -1.81
1.72 1.81 -3.61 - -4.5 -6.38 -3.78
2.17 1.13 - - -1.66 - -
1.5 0.63 -3.93 -4.3 1.12 -2.1 -3.37
1.71 0.13 -2.47 -1.13 -0.3 -0.16 -1.77
2.27 0.58 - - -0.53 - -
2.4 0.6 -6.86 -8.64 -2.75 -4.68 -8.44
Aop_g16136 (WRKY71)
1.92 1.39 - -5.87 -4.03 -1.86 -2.11
2.36 0.9 - - - - -
1.98 1.56 - -4.03 - - -4.3
1.64 0.23 -3.33 -4.89 0.77 -1.61 -0.91
2.17 0.39 -2.67 -1.79 -1.43 -2.65 -2.28
1.17 0.85 -0.5 -1.43 -0.3 -0.71 -1.16
2.48 0.3 - - - -2.52 -
0.94 0.47 -1.24 -1.64 1.26 -1.42 -2.48
Aop_g17538 (MAP65-6)
0.88 0.1 -0.62 -0.62 0.82 -0.94 -1.03
2.05 1.09 -1.09 - -1.98 - -
2.32 0.99 -6.17 -8.03 -8.11 -8.34 -7.41
1.88 -1.14 - -5.09 1.39 -2.38 -6.15
2.37 0.87 - - -5.66 - -
Aop_g18182 (BLH2)
1.48 1.05 -3.01 -2.38 0.77 -3.27 -6.58
2.2 1.22 -5.13 -5.52 - -6.06 -
Aop_g18612 (BGLU44)
1.09 -0.0 -2.96 -3.15 1.41 -0.72 -1.44
1.58 0.57 -1.06 -1.55 -1.02 -1.05 -0.43
2.27 1.05 -6.56 - -4.14 -6.95 -4.44
2.2 -0.02 -1.6 -1.71 -1.04 -2.65 -2.83
1.46 1.16 -1.23 -1.71 -0.24 -1.39 -4.41
1.73 0.93 -2.52 -3.27 0.41 -2.71 -6.35
2.2 0.68 -1.6 - - -1.08 -
1.14 -0.13 -0.55 -0.42 0.78 -1.23 -1.69
Aop_g19772 (LHB1B1)
2.08 0.66 -4.0 -4.25 0.04 -5.46 -5.54
Aop_g19783 (BGLU44)
2.42 -0.25 -4.31 -3.44 -1.42 -2.18 -3.61
Aop_g19807 (GPAT6)
1.79 0.98 -6.94 -7.09 0.39 -2.56 -3.76
2.08 0.47 - -0.87 -0.63 -2.44 -
2.12 1.26 -6.7 - -2.92 -3.48 -5.23
2.62 -0.61 - - -2.52 - -
0.98 0.16 -0.79 -1.6 1.02 -0.79 -1.32
1.84 0.78 -3.75 -4.36 0.55 -3.13 -7.82
Aop_g20456 (CH1)
1.49 0.62 -1.31 -2.14 0.91 -3.29 -4.65
1.9 0.98 -2.33 - -1.27 -0.73 -3.58
Aop_g20970 (FDH)
2.05 0.09 -9.53 -6.27 0.53 -1.64 -6.23
1.7 1.88 -6.18 -9.91 -4.92 -7.81 -10.2
Aop_g21100 (KCS4)
2.05 1.09 -3.86 -5.48 -1.78 -1.91 -3.54
1.37 0.73 -1.0 -0.96 -0.89 -0.72 -0.72
2.04 0.69 -7.15 -4.78 -2.04 -0.17 -3.54
2.29 1.0 -4.07 -6.46 -7.74 -6.68 -5.71
1.81 1.53 -5.46 -6.75 -1.26 -2.8 -8.02
1.95 1.01 -0.86 -1.85 -1.93 -5.31 -6.52
1.54 0.65 -1.26 -1.25 0.24 -1.97 -2.09
2.2 0.29 -3.19 -6.6 -0.12 -3.1 -5.05
Aop_g22505 (ASN3)
0.97 0.22 -0.45 -0.51 0.24 -0.53 -0.81
2.11 0.91 -2.77 -4.32 -1.54 -3.66 -2.38
0.82 0.04 -0.47 -0.4 0.82 -0.99 -1.12
Aop_g23782 (CYP38)
1.48 0.91 -1.67 -1.68 0.43 -2.06 -3.06
Aop_g23954 (LHB1B1)
1.98 1.2 -2.34 -3.7 -1.14 -6.53 -6.67
2.27 1.09 -4.21 - - - -
1.28 0.67 -0.93 -0.71 -0.43 -1.14 -0.62
Aop_g26631 (UPP)
1.64 0.77 -1.13 -1.74 0.24 -2.84 -3.18
Aop_g27429 (PSBY)
1.53 0.15 -3.86 -4.08 1.05 -0.92 -1.93
1.59 1.47 -0.48 -2.4 -2.27 -3.19 -
1.63 0.86 -1.41 -2.18 -0.14 -1.42 -2.26
Aop_g30342 (MLO5)
1.18 0.67 0.15 -0.83 -0.47 -0.89 -2.25
1.13 0.61 -1.13 -1.28 0.57 -0.81 -1.48
1.0 -0.31 -0.41 -0.63 1.21 -3.1 -1.46
Aop_g32141 (DDE1)
1.88 0.77 -0.82 -1.61 -1.85 -1.51 -3.57
1.46 0.45 -1.29 -1.47 0.65 -1.43 -2.53
1.93 0.91 -1.03 -1.79 -1.81 -2.01 -
Aop_g32267 (MLO8)
1.98 0.29 0.24 -2.07 -2.46 -4.22 -2.4
Aop_g32552 (CYP716A1)
1.88 -1.09 -4.53 -3.92 0.43 0.23 -2.16
2.19 -0.22 -8.45 -7.02 0.44 -2.47 -5.32
1.28 0.87 -1.83 -2.32 0.53 -0.59 -2.63
1.23 0.3 -1.31 -2.6 1.26 -1.75 -2.57
1.64 0.13 - - 1.41 -2.96 -
1.7 1.1 -2.04 -2.84 -0.4 -1.51 -3.07
1.36 0.72 -2.59 -2.83 0.57 -0.52 -1.74
1.18 0.67 -4.34 -5.06 1.45 -1.99 -3.51
1.48 0.28 -1.1 -1.62 0.51 -1.08 -1.66
1.37 0.76 -2.82 -2.42 0.33 -0.61 -1.07
1.95 0.41 -2.83 -3.64 -1.08 -0.68 -1.0
1.69 -0.45 -2.61 -2.15 0.9 -0.95 -1.9
1.43 0.63 -1.4 -2.33 0.61 -1.08 -2.45
Aop_g50917 (scpl42)
2.32 0.52 -5.43 -5.69 -2.22 -2.84 -2.56
1.88 0.06 -1.94 -1.29 0.44 -4.01 -2.38
1.49 0.57 -2.09 -0.51 -0.04 -1.75 -1.01
0.88 0.42 -0.77 -1.0 0.81 -1.1 -0.93
2.26 0.83 -4.15 -4.59 -4.65 - -1.85
1.44 0.2 -2.5 -2.75 1.36 -2.82 -3.26
2.13 0.52 -4.34 -6.43 -0.07 -3.88 -3.49
1.74 1.52 - - -0.8 -4.49 -2.52
2.33 0.47 - - -0.82 - -
1.59 1.42 -4.44 - -0.88 -1.22 -1.79
0.72 0.39 -0.46 -0.84 0.59 -0.63 -0.73
Aop_g67989 (MLO1)
1.5 0.51 -0.06 -0.94 -1.3 -1.36 -1.1
1.89 0.66 - - 0.76 - -5.46
Aop_g68102 (KCS1)
2.17 -0.14 -8.0 -5.42 0.63 -6.28 -7.18
0.78 0.51 -0.3 -0.87 0.62 -1.69 -0.62
1.29 -0.18 -3.9 -3.02 1.33 -1.02 -1.03
2.38 0.57 -6.3 -8.64 -1.8 -8.61 -7.49
2.24 1.16 -4.8 - -6.41 - -
1.42 0.95 -1.33 -1.51 0.28 -1.95 -2.57
Aop_g69481 (SD2-5)
1.48 1.55 -1.08 -1.47 -1.46 -3.59 -7.9
1.86 1.07 -3.91 -5.22 -0.71 -6.66 -0.82
2.1 1.02 -3.92 -5.32 -0.72 - -
2.05 0.1 - -7.51 0.74 -3.36 -6.94
1.38 0.5 -0.93 -1.03 0.42 -0.85 -3.65
2.34 0.82 -5.1 -6.13 -3.82 -5.13 -5.96
Aop_g70431 (NF-YB3)
1.99 1.35 -5.97 - -2.5 - -1.84
1.61 0.7 -1.48 -1.7 0.02 -1.05 -2.59
2.11 0.24 -2.38 -2.36 -0.27 -2.21 -3.91
2.16 1.34 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.