Heatmap: Cluster_301 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
34.79 36.67 23.17 22.51 17.83 9.99 7.7
70.75 72.29 55.67 51.24 26.38 28.37 20.07
17.93 23.54 18.34 17.98 9.26 8.56 8.09
7.75 6.78 4.65 4.34 1.36 1.18 0.85
7.99 9.53 6.88 7.63 4.43 4.04 3.43
19.83 22.8 15.95 18.49 11.51 8.82 7.78
19.34 23.68 16.1 17.38 10.66 8.28 5.54
21.53 23.21 15.68 16.4 4.65 3.74 1.44
15.01 15.34 12.28 12.54 6.99 8.56 5.67
2.59 2.78 2.05 1.9 1.19 0.63 0.4
46.21 53.07 40.91 39.22 20.88 27.13 12.31
Aop_g03123 (SCL30A)
14.29 15.89 10.81 10.29 6.3 3.58 3.47
7.3 8.54 4.84 4.4 3.17 2.13 1.23
19.06 18.52 15.13 15.22 9.89 9.34 7.5
Aop_g03681 (UBC5)
73.41 72.77 58.67 60.63 33.09 27.82 21.68
Aop_g03702 (CDC20.2)
55.83 61.89 38.76 34.21 11.48 14.82 15.09
10.54 11.04 8.21 8.06 2.7 3.11 1.35
30.75 38.51 16.82 19.92 7.64 10.34 5.7
26.06 26.13 23.4 24.47 6.98 8.26 6.56
39.22 38.33 31.05 26.99 13.05 11.45 6.0
Aop_g04329 (CSK)
24.2 24.22 15.52 15.45 8.39 6.63 4.28
11.57 15.06 12.06 11.24 8.57 8.46 5.06
53.19 52.72 42.28 37.62 20.91 27.27 12.45
2.32 2.41 1.59 1.43 0.98 0.45 0.27
4.01 4.36 2.96 3.08 0.8 1.07 0.85
Aop_g05251 (emb2410)
15.9 15.7 13.29 11.55 7.54 8.48 5.13
Aop_g05342 (GDI1)
10.4 12.76 6.05 6.79 2.08 1.56 1.14
28.16 26.98 19.15 20.07 11.63 14.78 7.89
Aop_g05454 (PI3K)
12.64 16.27 12.57 12.19 6.91 6.28 3.63
9.71 9.67 5.87 6.09 2.46 1.96 1.62
8.97 9.2 6.23 6.47 4.44 4.37 2.5
Aop_g05604 (PAO)
65.28 77.73 43.35 45.08 21.31 18.05 9.79
173.33 179.91 116.21 112.43 68.41 78.14 36.63
40.86 42.64 26.99 25.65 12.91 17.14 14.97
7.14 8.33 6.7 6.29 3.56 3.56 2.66
50.63 55.61 41.02 40.49 22.47 24.39 19.42
Aop_g06018 (TDT)
53.45 66.28 49.51 54.04 38.25 39.37 23.17
Aop_g06122 (RIN13)
7.05 7.41 5.29 5.84 3.92 3.11 2.28
Aop_g06156 (LRS1)
11.61 15.16 11.13 11.96 7.72 8.45 6.3
12.46 14.72 10.18 9.65 4.7 5.54 4.55
Aop_g06348 (HAM1)
22.34 28.41 23.28 24.84 17.75 17.22 13.22
Aop_g06386 (PTR2)
51.79 59.97 39.23 45.44 31.48 24.39 18.84
Aop_g06601 (NAPRT1)
12.88 15.22 12.96 11.67 7.93 6.02 4.07
Aop_g07073 (SR1)
20.73 20.7 16.47 16.42 10.71 10.29 6.36
Aop_g07446 (PGA2)
30.84 38.19 23.23 23.5 12.15 13.41 6.04
12.71 15.24 12.36 12.11 8.58 7.83 4.81
Aop_g08109 (ORP4B)
33.61 38.01 30.39 30.86 9.28 10.02 11.54
27.13 28.05 16.26 20.17 10.44 8.27 6.19
11.38 10.52 7.91 8.24 5.34 4.36 2.91
9.95 9.5 6.74 7.04 4.3 3.77 2.54
16.38 18.04 14.89 13.9 7.66 9.13 6.39
Aop_g08481 (TAF15b)
4.13 4.47 3.57 4.02 2.19 2.35 1.83
Aop_g08659 (AL2)
53.3 54.36 33.51 34.11 16.68 18.87 13.13
Aop_g09289 (RUS1)
7.18 8.06 5.38 5.8 2.78 3.64 2.86
4.41 5.49 3.64 2.97 2.48 1.89 1.35
50.31 44.61 35.25 40.55 23.08 25.46 12.76
14.92 17.36 13.57 13.74 6.39 7.79 4.75
Aop_g10022 (ROS3)
12.43 14.82 10.68 10.44 8.39 6.14 5.12
40.26 41.69 25.11 25.98 11.94 12.39 11.47
58.4 72.58 53.44 49.71 28.69 35.85 29.54
12.59 13.36 10.26 11.84 4.64 5.37 4.92
8.67 8.4 5.97 5.89 3.72 2.24 1.87
90.55 94.04 78.08 84.28 54.64 53.13 37.67
Aop_g10869 (XBAT35)
22.3 24.66 19.74 21.02 10.57 14.16 12.7
10.02 11.89 9.73 9.43 6.18 6.2 4.76
13.85 15.45 11.55 11.35 6.85 9.04 6.43
29.83 33.03 19.42 16.63 3.79 12.78 5.49
6.32 6.93 5.21 5.21 1.87 1.8 0.71
Aop_g11898 (NAC053)
34.35 39.85 30.69 29.37 23.39 22.17 15.43
141.07 169.8 117.08 119.72 60.51 70.93 46.09
49.37 56.64 40.86 41.15 20.16 25.22 17.06
Aop_g12631 (BMY8)
17.78 20.28 16.2 16.3 8.05 10.22 6.0
45.91 46.36 33.16 34.9 15.98 17.72 7.61
26.86 28.18 19.41 19.56 12.54 8.39 5.66
Aop_g12936 (RRP45a)
4.94 5.01 4.34 3.98 2.37 2.68 2.25
351.94 385.35 264.38 259.27 106.63 124.07 54.44
Aop_g13514 (LUX)
7.92 8.34 6.94 5.61 1.92 3.71 2.19
172.34 163.73 128.21 126.97 22.13 46.84 32.67
29.51 33.57 23.94 22.19 11.8 13.29 13.44
14.42 13.92 10.57 11.26 6.46 6.11 4.52
Aop_g13609 (KAK)
7.11 8.69 7.39 6.9 4.4 4.38 3.66
Aop_g13681 (SDG25)
11.51 11.74 7.27 6.76 4.76 3.99 2.37
5.26 5.37 5.08 5.24 2.92 3.41 2.77
19.94 24.57 12.86 14.75 8.92 9.17 7.87
7.51 7.78 5.04 5.0 1.89 2.85 2.28
18.37 21.79 18.56 17.17 3.63 5.17 3.31
32.45 31.29 24.1 25.28 12.0 15.45 7.26
7.99 9.04 7.46 7.18 3.46 4.38 3.11
14.36 14.42 10.47 6.81 0.18 0.88 0.37
11.74 9.75 7.12 8.55 1.05 2.23 0.55
12.37 14.67 10.26 9.53 8.25 6.41 5.05
3.55 3.76 2.21 2.22 1.4 1.17 0.82
Aop_g16178 (NHX2)
6.3 6.36 4.51 4.29 1.68 2.61 2.0
6.55 6.92 4.82 4.69 1.92 1.23 0.66
89.43 87.98 60.31 55.84 6.5 12.34 9.61
72.03 98.47 70.12 75.97 34.32 47.33 43.73
8.14 9.7 8.17 7.6 5.69 5.13 3.75
Aop_g17396 (ADK)
14.77 15.51 11.36 10.98 8.33 7.37 6.63
82.65 84.25 43.84 49.4 17.05 22.53 10.78
17.69 18.27 15.75 10.33 0.28 3.98 0.7
8.36 7.91 5.71 4.86 1.32 1.25 0.95
Aop_g17685 (TIC55-II)
44.87 58.12 33.22 32.63 16.95 9.44 5.1
17.94 20.3 13.17 10.9 1.96 5.6 2.53
Aop_g18064 (ATG2)
11.72 11.86 9.12 9.23 6.47 7.17 4.5
Aop_g18136 (OTP86)
3.92 4.82 3.37 3.41 1.74 2.27 1.26
Aop_g18160 (SYN4)
37.99 36.66 24.9 24.89 16.61 12.65 8.95
9.7 11.32 8.48 8.45 5.55 4.06 3.74
26.45 29.09 19.98 18.62 9.0 9.05 5.49
Aop_g19608 (DGD1)
13.79 19.16 12.18 12.48 5.6 8.49 6.44
7.53 8.6 8.07 7.37 4.66 4.6 3.13
185.97 218.81 174.75 172.93 105.46 135.13 81.36
Aop_g20730 (TGH)
11.54 12.06 9.68 9.36 6.58 6.75 4.59
9.53 11.72 7.3 9.22 4.54 4.45 3.14
Aop_g20974 (NUDT2)
45.84 56.98 38.04 43.83 23.18 21.48 14.3
178.6 182.41 135.08 99.17 12.92 39.86 48.85
4.74 6.34 5.2 4.54 2.6 2.15 1.15
Aop_g21412 (ATPRFB)
21.35 20.62 17.03 16.82 7.84 8.15 5.16
4.93 6.04 2.75 2.91 1.4 1.57 0.56
Aop_g22434 (DCA1)
29.5 27.63 20.61 20.68 6.31 9.36 4.44
Aop_g22484 (CLC-C)
8.43 9.35 7.08 6.55 1.26 3.32 2.97
3.45 3.34 2.63 2.54 1.21 0.78 0.35
3.57 3.45 1.61 2.31 0.61 0.09 0.17
7.26 8.08 4.81 4.23 1.48 3.59 0.67
27.12 32.96 27.04 27.38 15.94 19.58 13.04
Aop_g25603 (PAP3)
19.97 22.07 12.6 11.06 0.53 2.24 4.97
17.34 22.5 12.98 11.94 8.15 7.81 3.89
Aop_g26476 (UVR1)
7.82 8.77 6.34 6.09 4.66 4.83 3.25
16.18 18.49 11.11 12.75 5.28 6.63 4.28
29.38 39.56 29.24 28.45 9.04 19.56 10.41
Aop_g27924 (IGPD)
47.31 53.7 37.53 36.78 26.5 28.15 19.03
18.66 21.88 15.67 12.07 0.09 5.56 2.68
7.58 9.41 5.44 4.49 2.19 1.07 0.4
27.39 36.77 26.42 28.31 14.04 12.87 10.26
Aop_g29350 (UPF3)
10.33 11.12 7.68 9.13 4.51 6.02 3.94
11.15 10.72 8.55 8.92 3.75 4.22 2.7
Aop_g29692 (PHR1)
3.49 3.5 2.47 2.15 0.57 0.46 0.76
68.23 81.57 64.08 70.12 37.2 44.67 36.57
17.55 19.35 12.92 15.48 6.89 10.24 7.2
Aop_g29895 (STA1)
13.01 14.66 9.94 9.06 7.31 7.98 5.7
Aop_g30052 (TOPP4)
22.4 24.13 17.21 16.4 11.37 13.12 7.89
22.29 22.56 15.63 15.97 7.11 6.98 4.43
21.64 24.75 20.17 20.88 11.2 13.58 13.98
9.02 9.38 6.78 6.15 2.96 3.77 1.47
13.77 15.12 11.49 12.17 5.06 5.83 6.59
3.34 3.7 2.24 2.29 1.02 0.71 0.35
35.49 35.9 21.97 22.4 2.15 3.85 2.73
Aop_g31414 (XK2)
14.83 17.57 14.02 12.82 9.58 5.96 4.75
93.8 101.51 65.22 68.21 4.29 10.81 8.52
13.72 18.03 15.22 11.67 8.36 8.02 4.93
20.43 22.5 14.3 16.4 6.05 7.57 5.52
17.33 18.07 13.18 11.45 1.68 2.73 1.67
Aop_g36059 (REV3)
4.7 5.1 3.78 3.84 2.1 1.89 1.5
19.2 18.64 13.0 16.21 1.92 4.91 2.74
15.72 16.71 10.5 12.04 3.04 8.31 3.31
Aop_g37425 (ILR3)
53.04 52.29 39.1 42.65 5.07 12.65 20.29
Aop_g37933 (ACD31.2)
52.92 62.69 42.28 37.67 4.72 27.1 12.83
Aop_g39227 (PRD1)
5.02 6.26 4.15 3.44 1.3 2.63 0.41
28.24 31.48 20.24 21.84 15.02 9.96 10.15
11.57 11.93 7.88 7.96 5.72 3.88 3.26
18.38 20.0 12.61 13.77 9.35 8.59 6.8
9.17 10.02 7.64 6.32 3.19 4.24 2.88
9.7 8.57 3.76 3.71 0.39 0.87 0.68
4.65 4.63 3.37 3.02 1.8 2.02 1.23
Aop_g61919 (DET1)
26.87 23.95 19.56 18.62 10.5 9.13 5.03
18.21 18.12 12.78 14.03 7.23 3.8 3.7
7.35 8.11 5.71 5.78 2.88 3.55 2.93
10.07 10.84 5.17 6.12 2.57 1.95 1.57
46.55 41.63 19.95 22.73 9.63 8.19 5.98
Aop_g68436 (CP31)
19.17 19.95 14.74 13.89 6.78 7.5 3.31
15.25 17.36 14.13 11.82 5.83 7.01 3.73
Aop_g69423 (UGT85A7)
24.91 25.53 14.35 13.35 0.77 8.56 1.65
5.95 7.17 3.94 4.95 2.32 2.13 0.97
47.88 57.19 38.59 40.15 20.55 27.49 17.4
Aop_g69986 (TPS1)
15.05 14.92 11.38 10.57 6.63 5.2 2.99
84.42 74.36 67.95 61.13 25.62 42.7 18.28

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)