1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_18 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
0.07 0.06 0.04 0.02 1.0 0.03 0.11
0.11 0.0 0.0 0.0 1.0 0.1 0.05
0.07 0.01 0.0 0.0 1.0 0.09 0.08
0.1 0.05 0.06 0.02 1.0 0.09 0.13
Aop_g00647 (IQD6)
 0.12 0.02 0.0 0.0 1.0 0.03 0.1
Aop_g00724 (POLA2)
 0.11 0.03 0.01 0.01 1.0 0.02 0.09
0.12 0.05 0.09 0.09 1.0 0.06 0.05
0.06 0.02 0.0 0.0 1.0 0.05 0.11
0.08 0.02 0.01 0.0 1.0 0.03 0.11
0.12 0.05 0.0 0.0 1.0 0.06 0.07
0.03 0.03 0.0 0.02 1.0 0.03 0.03
0.14 0.13 0.1 0.13 1.0 0.08 0.13
0.11 0.01 0.0 0.0 1.0 0.03 0.02
0.12 0.03 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.17 0.01 0.0 0.0 1.0 0.05 0.0
Aop_g04158 (TOR2)
 0.11 0.0 0.01 0.0 1.0 0.08 0.1
0.17 0.13 0.15 0.16 1.0 0.17 0.17
0.05 0.02 0.01 0.0 1.0 0.0 0.01
Aop_g04657 (CDC45)
 0.11 0.02 0.0 0.01 1.0 0.06 0.16
Aop_g04659 (BAM1)
 0.12 0.02 0.01 0.01 1.0 0.11 0.06
Aop_g04986 (RAB)
 0.06 0.01 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0
Aop_g05080 (GSTU25)
 0.08 0.02 0.06 0.04 1.0 0.1 0.07
Aop_g05102 (SOS5)
 0.16 0.01 0.0 0.0 1.0 0.11 0.05
Aop_g05123 (TSO2)
 0.17 0.03 0.01 0.01 1.0 0.03 0.08
Aop_g05226 (CHR5)
 0.16 0.04 0.01 0.0 1.0 0.03 0.08
0.14 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.07
Aop_g05243 (CDT1)
 0.1 0.07 0.01 0.0 1.0 0.01 0.03
0.05 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.09
0.11 0.12 0.09 0.09 1.0 0.1 0.22
0.21 0.09 0.03 0.03 1.0 0.05 0.11
Aop_g05571 (UGT85A5)
 0.15 0.06 0.0 0.01 1.0 0.03 0.01
Aop_g05698 (MSI1)
 0.05 0.04 0.0 0.0 1.0 0.01 0.11
Aop_g05749 (TSK)
 0.13 0.06 0.01 0.01 1.0 0.03 0.11
Aop_g05834 (EXP10)
 0.12 0.01 0.0 0.0 1.0 0.07 0.05
Aop_g05996 (GONST3)
 0.1 0.03 0.02 0.03 1.0 0.05 0.09
Aop_g06249 (ETG1)
 0.17 0.13 0.11 0.14 1.0 0.05 0.11
0.07 0.0 0.0 0.0 1.0 0.08 0.15
0.12 0.01 0.02 0.02 1.0 0.08 0.06
Aop_g06660 (CYL2)
 0.13 0.04 0.04 0.04 1.0 0.03 0.08
0.08 0.01 0.01 0.03 1.0 0.03 0.05
Aop_g06825 (ENODL14)
 0.09 0.04 0.01 0.0 1.0 0.06 0.1
0.05 0.01 0.0 0.0 1.0 0.01 0.06
Aop_g06909 (PDR12)
 0.12 0.0 0.0 0.0 1.0 0.07 0.0
0.15 0.07 0.0 0.02 1.0 0.01 0.0
Aop_g07414 (NF-YC13)
 0.07 0.04 0.0 0.01 1.0 0.06 0.15
Aop_g07596 (SOL1)
 0.12 0.02 0.0 0.01 1.0 0.07 0.09
Aop_g07894 (TUBG1)
 0.19 0.13 0.19 0.2 1.0 0.22 0.27
0.17 0.05 0.04 0.03 1.0 0.07 0.06
0.12 0.04 0.01 0.01 1.0 0.13 0.07
Aop_g08357 (MCM3)
 0.08 0.02 0.0 0.0 1.0 0.03 0.1
0.22 0.11 0.14 0.14 1.0 0.18 0.16
Aop_g08685 (ATMND1)
 0.11 0.06 0.01 0.02 1.0 0.03 0.13
Aop_g08705 (EXO)
 0.08 0.01 0.0 0.0 1.0 0.03 0.01
Aop_g08732 (BRCA1)
 0.14 0.04 0.02 0.02 1.0 0.04 0.05
Aop_g08840 (MCM6)
 0.12 0.01 0.0 0.0 1.0 0.01 0.07
Aop_g08885 (CHR1)
 0.12 0.03 0.0 0.0 1.0 0.04 0.14
0.03 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.17 0.05 0.0 0.01 1.0 0.1 0.03
Aop_g09004 (GSO1)
 0.19 0.16 0.03 0.02 1.0 0.08 0.07
0.21 0.16 0.05 0.05 1.0 0.06 0.14
0.07 0.01 0.0 0.0 1.0 0.04 0.06
Aop_g09318 (NFB2)
 0.11 0.04 0.04 0.05 1.0 0.05 0.15
Aop_g09325 (PSF1)
 0.09 0.06 0.1 0.11 1.0 0.06 0.17
Aop_g09442 (ATXR6)
 0.06 0.04 0.01 0.01 1.0 0.04 0.1
0.12 0.05 0.03 0.02 1.0 0.06 0.06
Aop_g09602 (MCM2)
 0.09 0.01 0.0 0.0 1.0 0.02 0.06
0.15 0.06 0.08 0.09 1.0 0.06 0.12
0.08 0.03 0.0 0.0 1.0 0.04 0.04
Aop_g09863 (PRL)
 0.09 0.03 0.0 0.0 1.0 0.0 0.05
Aop_g09992 (HTA3)
 0.1 0.03 0.0 0.0 1.0 0.04 0.09
0.14 0.01 0.0 0.0 1.0 0.1 0.03
0.15 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0
0.11 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.05
Aop_g10289 (MAP65-1)
 0.11 0.02 0.0 0.01 1.0 0.03 0.12
Aop_g10443 (ROW1)
 0.09 0.01 0.0 0.0 1.0 0.03 0.14
0.1 0.02 0.0 0.0 1.0 0.03 0.11
0.1 0.01 0.0 0.0 1.0 0.07 0.19
Aop_g10763 (KYP)
 0.11 0.06 0.1 0.09 1.0 0.12 0.24
0.13 0.05 0.0 0.0 1.0 0.01 0.13
0.1 0.02 0.0 0.0 1.0 0.02 0.06
Aop_g10921 (TTL1)
 0.08 0.01 0.0 0.0 1.0 0.09 0.07
Aop_g10939 (CMT3)
 0.07 0.01 0.0 0.0 1.0 0.02 0.05
Aop_g11004 (LOG1)
 0.25 0.1 0.04 0.03 1.0 0.06 0.05
0.11 0.04 0.0 0.0 1.0 0.07 0.1
0.13 0.04 0.01 0.02 1.0 0.08 0.05
0.22 0.19 0.13 0.14 1.0 0.08 0.17
0.21 0.12 0.04 0.04 1.0 0.07 0.12
Aop_g11550 (CH1)
 0.2 0.04 0.01 0.01 1.0 0.05 0.02
Aop_g11632 (PCNA1)
 0.17 0.17 0.2 0.2 1.0 0.13 0.12
Aop_g11795 (POLA4)
 0.22 0.2 0.19 0.21 1.0 0.13 0.17
0.13 0.08 0.11 0.09 1.0 0.1 0.09
0.12 0.01 0.0 0.0 1.0 0.03 0.02
0.14 0.07 0.05 0.07 1.0 0.04 0.14
0.15 0.08 0.05 0.07 1.0 0.04 0.17
0.1 0.04 0.05 0.04 1.0 0.06 0.07
Aop_g12966 (MYB88)
 0.11 0.03 0.01 0.03 1.0 0.03 0.15
0.08 0.05 0.01 0.01 1.0 0.07 0.08
0.13 0.07 0.03 0.03 1.0 0.02 0.16
Aop_g13135 (ERF12)
 0.12 0.04 0.04 0.04 1.0 0.11 0.08
0.15 0.07 0.03 0.01 1.0 0.02 0.13
0.28 0.18 0.22 0.22 1.0 0.17 0.14
Aop_g13293 (CHR24)
 0.23 0.13 0.04 0.02 1.0 0.1 0.09
0.15 0.02 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0
0.16 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.11
0.1 0.04 0.01 0.01 1.0 0.02 0.07
0.11 0.04 0.01 0.01 1.0 0.03 0.13
0.12 0.04 0.0 0.0 1.0 0.03 0.14
0.28 0.23 0.2 0.25 1.0 0.13 0.15
0.07 0.02 0.0 0.0 1.0 0.02 0.1
0.13 0.01 0.0 0.0 1.0 0.07 0.02
0.15 0.16 0.06 0.05 1.0 0.04 0.14
0.12 0.04 0.01 0.02 1.0 0.09 0.06
0.06 0.02 0.01 0.02 1.0 0.03 0.09
Aop_g14370 (MCM5)
 0.1 0.02 0.01 0.01 1.0 0.02 0.08
0.13 0.05 0.0 0.01 1.0 0.03 0.04
Aop_g14567 (ORC6)
 0.09 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03
Aop_g14647 (TSO2)
 0.15 0.03 0.0 0.0 1.0 0.03 0.09
0.18 0.07 0.04 0.05 1.0 0.11 0.02
0.13 0.03 0.01 0.0 1.0 0.11 0.07
0.15 0.01 0.0 0.0 1.0 0.08 0.08
Aop_g15639 (HVA22K)
 0.17 0.16 0.12 0.14 1.0 0.16 0.21
0.12 0.01 0.09 0.09 1.0 0.09 0.01
Aop_g17461 (MPK19)
 0.14 0.03 0.01 0.01 1.0 0.11 0.06
Aop_g18205 (ATB BETA)
 0.3 0.19 0.19 0.18 1.0 0.2 0.13
Aop_g18592 (AGO9)
 0.21 0.15 0.07 0.08 1.0 0.15 0.1
Aop_g18668 (CYCD1;1)
 0.2 0.05 0.02 0.02 1.0 0.07 0.09
0.17 0.06 0.02 0.03 1.0 0.1 0.1
Aop_g18954 (SSN1)
 0.24 0.2 0.06 0.04 1.0 0.07 0.11
0.12 0.03 0.01 0.0 1.0 0.04 0.15
Aop_g21130 (NPC2)
 0.1 0.04 0.02 0.02 1.0 0.1 0.02
Aop_g21131 (RPA70B)
 0.07 0.05 0.0 0.0 1.0 0.02 0.05
Aop_g21238 (LRX2)
 0.1 0.01 0.0 0.0 1.0 0.09 0.04
Aop_g21978 (SYN4)
 0.14 0.05 0.05 0.07 1.0 0.06 0.12
0.17 0.07 0.01 0.04 1.0 0.04 0.06
Aop_g22138 (MDR1)
 0.1 0.02 0.06 0.06 1.0 0.08 0.11
0.13 0.01 0.0 0.01 1.0 0.09 0.01
0.08 0.01 0.02 0.03 1.0 0.04 0.05
Aop_g23244 (MCM4)
 0.12 0.04 0.09 0.12 1.0 0.1 0.18
0.29 0.18 0.22 0.18 1.0 0.21 0.12
0.1 0.01 0.01 0.03 1.0 0.01 0.15
0.15 0.03 0.02 0.01 1.0 0.04 0.12
Aop_g25152 (SKU5)
 0.11 0.02 0.02 0.02 1.0 0.14 0.14
Aop_g25833 (AtkdsA1)
 0.14 0.08 0.07 0.07 1.0 0.15 0.14
Aop_g26095 (IBO1)
 0.18 0.04 0.04 0.03 1.0 0.08 0.17
Aop_g28305 (TOR2)
 0.05 0.01 0.01 0.01 1.0 0.05 0.05
Aop_g29415 (EME1B)
 0.27 0.24 0.27 0.25 1.0 0.22 0.24
Aop_g29965 (CHAL)
 0.08 0.01 0.09 0.1 1.0 0.13 0.02
0.12 0.03 0.03 0.03 1.0 0.11 0.12
0.15 0.07 0.01 0.01 1.0 0.06 0.08
0.26 0.27 0.23 0.19 1.0 0.19 0.24
Aop_g35995 (CYCD1;1)
 0.08 0.05 0.0 0.01 1.0 0.09 0.11
0.11 0.01 0.07 0.06 1.0 0.1 0.02
Aop_g38086 (VLN4)
 0.16 0.04 0.01 0.01 1.0 0.12 0.05
Aop_g38218 (HMGB6)
 0.08 0.04 0.0 0.0 1.0 0.02 0.05
0.11 0.02 0.02 0.02 1.0 0.14 0.09
Aop_g38719 (NFB1)
 0.14 0.1 0.16 0.15 1.0 0.11 0.15
Aop_g38948 (ORC6)
 0.12 0.09 0.07 0.08 1.0 0.14 0.17
0.08 0.04 0.0 0.0 1.0 0.02 0.06
Aop_g48668 (NFD3)
 0.08 0.01 0.0 0.0 1.0 0.02 0.14
Aop_g53977 (RALFL19)
 0.21 0.07 0.1 0.06 1.0 0.06 0.06
0.13 0.1 0.06 0.09 1.0 0.14 0.18
0.17 0.09 0.11 0.13 1.0 0.07 0.15
0.12 0.01 0.0 0.0 1.0 0.06 0.11
0.12 0.02 0.0 0.0 1.0 0.02 0.11
0.13 0.01 0.0 0.0 1.0 0.08 0.02
Aop_g67854 (GSTU25)
 0.09 0.04 0.01 0.01 1.0 0.05 0.02
0.23 0.16 0.06 0.07 1.0 0.13 0.24
0.15 0.16 0.09 0.07 1.0 0.07 0.12
0.07 0.01 0.05 0.05 1.0 0.06 0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)