Heatmap: Cluster_68 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
6.7 1.26 1.81 0.0 0.0 0.0 0.0
2.98 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0
2.86 1.04 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
9.69 4.68 3.96 0.57 0.0 0.0 0.0
3.55 1.22 1.64 0.15 0.0 0.0 0.0
3.05 0.49 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0
2.61 0.55 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0
6.98 1.19 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0
3.34 0.45 0.51 0.08 0.0 0.0 0.0
8.24 2.38 2.26 0.13 0.0 0.0 0.0
5.39 0.73 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g15329 (TH9)
4.58 1.99 1.28 0.11 0.0 0.0 0.0
22.75 7.01 6.07 0.23 0.0 0.0 0.0
3.91 0.53 1.5 0.0 0.0 0.0 0.0
2.95 1.41 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0
3.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0
9.59 2.8 2.4 0.25 0.0 0.0 0.0
5.6 3.78 2.21 0.1 0.0 0.0 0.06
9.36 2.96 2.17 0.32 0.0 0.0 0.0
6.69 1.21 1.48 0.0 0.0 0.0 0.0
4.24 1.04 0.64 0.1 0.0 0.0 0.0
8.41 0.99 3.39 0.0 0.0 0.0 0.0
4.07 1.29 1.06 0.0 0.0 0.0 0.0
20.72 3.77 4.41 0.26 0.0 0.0 0.0
8.84 1.75 2.51 0.0 0.0 0.0 0.0
14.32 3.92 2.45 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g16200 (PGK)
9.93 1.41 1.5 0.11 0.0 0.0 0.0
42.1 8.34 8.12 0.09 0.0 0.0 0.0
4.18 3.92 3.02 0.09 0.0 0.0 0.0
11.14 3.0 2.38 0.05 0.0 0.0 0.05
6.8 2.22 2.13 0.29 0.0 0.04 0.06
2.55 0.31 1.34 0.27 0.0 0.0 0.0
2.68 0.3 1.61 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g17042 (FD1)
2.7 0.06 0.67 0.14 0.0 0.0 0.0
2.53 0.52 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0
7.27 2.42 3.03 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g17958 (PHS2)
3.63 0.58 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0
2.97 0.62 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0
8.96 2.25 3.51 0.22 0.0 0.41 0.0
7.05 1.03 2.44 0.18 0.0 0.0 0.0
5.63 0.77 1.57 0.0 0.0 0.0 0.0
5.81 2.49 2.5 0.21 0.0 0.0 0.11
2.99 1.84 1.11 0.1 0.0 0.0 0.0
11.98 6.38 6.2 0.36 0.0 0.12 0.43
4.04 0.88 0.78 0.08 0.0 0.0 0.0
2.46 1.5 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0
2.22 0.38 0.72 0.22 0.0 0.0 0.0
2.12 0.35 0.58 0.05 0.0 0.0 0.0
14.21 3.48 2.66 0.95 0.0 0.0 0.0
3.51 0.3 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0
2.68 0.7 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g19064 (ERD8)
3.41 0.95 1.1 0.13 0.0 0.0 0.0
4.01 0.18 1.4 0.0 0.0 0.0 0.0
4.59 0.34 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0
2.13 0.42 1.47 0.0 0.0 0.0 0.0
3.92 2.33 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.27 0.61 0.71 0.07 0.0 0.0 0.0
2.47 0.66 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0
2.76 0.23 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0
7.01 2.37 3.16 0.47 0.0 0.0 0.0
3.0 1.26 1.59 0.0 0.0 0.0 0.0
4.38 3.84 1.91 0.0 0.0 0.0 0.0
6.05 2.68 2.36 0.0 0.0 0.0 0.0
5.3 0.79 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0
2.31 0.13 0.8 0.11 0.0 0.0 0.0
Aop_g20942 (AAc1)
4.11 0.97 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g21082 (TCP-1)
2.32 0.12 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0
5.97 1.18 3.51 0.63 0.0 0.0 0.0
4.46 3.43 3.18 0.17 0.0 0.0 0.0
Aop_g21125 (RP1)
5.34 1.58 1.17 0.0 0.0 0.0 0.0
2.68 0.54 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0
4.91 2.91 2.82 0.46 0.0 0.0 0.0
Aop_g21416 (CYTC-2)
8.2 4.22 4.92 0.1 0.0 0.0 0.0
2.32 0.29 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0
5.47 0.79 1.87 0.0 0.0 0.0 0.0
4.73 1.61 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g21958 (PDI1)
5.15 1.3 1.51 0.2 0.0 0.09 0.0
39.23 14.0 21.11 1.98 0.0 0.0 0.0
2.13 0.31 1.48 0.0 0.0 0.0 0.0
2.25 0.15 0.72 0.13 0.0 0.0 0.23
2.76 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0
25.03 6.19 6.65 0.39 0.0 0.0 0.0
Aop_g24892 (FDH)
12.34 10.58 4.7 1.35 0.0 0.0 0.0
10.08 1.95 2.56 0.13 0.0 0.0 0.08
3.08 0.77 2.94 0.0 0.0 0.0 0.0
10.44 1.99 2.9 0.26 0.0 0.0 0.0
6.04 2.46 2.3 0.0 0.0 0.0 0.0
2.15 0.91 1.04 0.17 0.0 0.0 0.0
4.29 1.04 2.07 0.09 0.0 0.0 0.07
81.75 73.1 59.89 3.46 0.0 0.0 0.0
13.54 6.93 4.52 0.0 0.0 0.0 0.0
2.21 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0
185.08 38.34 48.05 2.05 0.08 0.0 0.0
7.24 0.0 1.28 0.0 0.0 0.0 0.0
4.88 0.79 1.34 0.0 0.0 0.0 0.0
2.71 1.77 1.14 0.0 0.0 0.0 0.0
6.04 1.32 1.32 0.0 0.0 0.0 0.0
3.56 0.09 1.25 0.0 0.0 0.0 0.0
2.44 1.77 1.11 0.0 0.0 0.0 0.0
3.25 0.15 1.2 0.5 0.0 0.0 0.0
15.78 5.3 5.07 0.0 0.0 0.0 0.0
8.02 0.95 1.54 0.0 0.0 0.0 0.0
2.4 0.56 0.83 0.02 0.01 0.01 0.18
Aop_g31695 (RPS15)
3.72 2.08 2.04 0.23 0.0 0.0 0.0
2.92 0.44 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0
2.83 0.54 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0
5.77 0.77 1.81 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g67031 (PGR1)
5.59 1.07 1.61 0.12 0.0 0.0 0.0
80.72 9.33 24.86 0.94 0.0 0.0 0.11
Aop_g67398 (CSD2)
4.11 4.19 2.8 0.12 0.0 0.0 0.0
27.27 9.91 8.73 0.83 0.0 0.0 0.22
14.2 12.94 9.12 0.42 0.0 0.0 0.0
2.52 0.49 2.63 0.31 0.0 0.0 0.0
2.44 0.44 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0
2.68 0.35 1.52 0.0 0.0 0.0 0.19
3.9 1.01 1.07 0.0 0.0 0.0 0.0
9.98 2.22 2.23 0.1 0.0 0.0 0.0
5.88 1.19 1.29 0.0 0.0 0.0 0.0
3.54 3.43 2.62 0.21 0.0 0.0 0.0
9.53 5.29 2.85 0.0 0.0 0.0 0.0
2.71 1.19 1.04 0.0 0.0 0.0 0.0
6.09 4.26 2.51 0.06 0.0 0.0 0.0
2.22 1.45 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g69952 (HTA10)
47.59 12.41 11.87 0.35 0.0 0.0 0.11
7.12 2.11 2.08 0.08 0.0 0.0 0.0
5.63 1.09 1.48 0.0 0.0 0.0 0.0
2.6 0.84 0.79 0.35 0.0 0.0 0.0
9.82 4.58 3.62 0.45 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)