Heatmap: Cluster_228 (HCCA cluster)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g006850.2.1 (Solyc00g006850.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g058900.2.1 (Solyc00g058900.2)
- - - - - -1.19 - - 5.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g141565.1.1 (Solyc00g141565.1)
- - - - - -1.52 - - 5.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g231680.2.1 (Solyc00g231680.2)
- - - - 0.23 4.05 - - - - - - - - - - - - - 2.63 1.47 - - - - 2.2 - 0.88 -0.29 - - - - -
Solyc01g011237.1.1 (Solyc01g011237.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g017290.1.1 (Solyc01g017290.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.56 - - - - - - - - - 3.39 - - - - -
Solyc01g060350.1.1 (Solyc01g060350.1)
4.35 - - - -1.01 3.09 - - - - - - - - - - - - - 0.29 -0.49 -2.45 - - - -1.35 - -1.44 -1.63 - - -0.8 - -0.29
Solyc01g067408.1.1 (Solyc01g067408.1)
- - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g079615.1.1 (Solyc01g079615.1)
- - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g110090.1.1 (Solyc01g110090.1)
2.09 -0.73 - -0.67 -2.04 -4.17 - - 3.2 0.79 -0.34 -0.39 2.69 1.86 - - - - - - 1.23 - -1.35 -0.54 - - -1.57 -0.28 -0.25 - - -1.88 - -
Solyc02g014545.1.1 (Solyc02g014545.1)
- - - - - 4.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.34 - - - - - - - -
Solyc02g021366.1.1 (Solyc02g021366.1)
- - - - - - - - 4.82 - - - - - - - - - - - - - - 2.53 - - - - - - - - - -
Solyc02g032050.1.1 (Solyc02g032050.1)
- - - - - 2.4 - - 4.65 0.74 - - - - - - - - 0.91 - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g032270.1.1 (Solyc02g032270.1)
0.47 - - 0.61 - 0.7 - 1.77 3.38 - - - - 1.16 0.33 - - - - -0.35 - 2.08 - -0.15 -0.14 - - -0.25 1.3 - -0.25 0.26 - -
Solyc02g032570.1.1 (Solyc02g032570.1)
3.23 - - - - - - - 4.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g061870.1.1 (Solyc02g061870.1)
2.58 - -1.11 - - -3.65 - - 3.89 2.92 -1.44 -2.03 - - -0.97 -2.21 -1.68 - - - 1.19 - - -4.49 -2.05 - - -2.39 -4.48 - -2.26 -3.05 - -1.98
Solyc02g078310.1.1 (Solyc02g078310.1)
- - 1.32 - - -0.41 - - 3.6 - - - -0.12 -0.17 - 1.57 3.23 - - - - - - -1.58 0.43 - 1.05 - -0.49 - - - - -
Solyc03g093720.2.1 (Solyc03g093720.2)
- - - - - - - - 2.43 - - - - - - 4.27 2.14 - - - - - - - - - - 0.98 1.57 - - - - -
Solyc03g093730.1.1 (Solyc03g093730.1)
- - - - - - - - 3.23 4.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g111040.2.1 (Solyc03g111040.2)
-4.37 -6.55 -6.05 - -5.53 -8.92 -2.86 - 2.25 2.66 -3.7 -7.69 -1.92 -4.06 1.96 3.11 3.27 - - - -6.52 - -6.97 -7.97 - - -4.31 -6.26 -8.01 - -6.59 - -6.2 -5.42
Solyc03g111215.1.1 (Solyc03g111215.1)
2.41 - - - - 3.95 - - - - - - - - - - - - - - - 0.22 0.39 - - - 1.73 -0.62 2.11 - - - - 1.31
Solyc03g115090.1.1 (Solyc03g115090.1)
- - -0.26 -0.35 - -0.33 - - 3.77 2.71 -0.46 0.52 -0.45 - 0.09 - - -1.23 -1.19 - -0.47 -0.94 -1.29 - -2.2 0.43 - - -2.32 - - -0.76 - 1.37
Solyc04g014885.1.1 (Solyc04g014885.1)
- - 1.2 - -0.66 2.2 2.27 1.63 - - - - - - - - - - -2.11 - - 1.9 - -0.88 - -0.64 - 0.88 - -0.34 3.43 - - -
Solyc04g052930.2.1 (Solyc04g052930.2)
3.26 - - - - 3.2 - - 3.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g078080.1.1 (Solyc04g078080.1)
- - 0.66 - - -2.72 - -1.99 0.88 - -1.63 - - - 2.76 2.02 3.83 - - - 0.6 - -2.84 -3.56 - 1.5 - - - - - - - -2.04
Solyc05g010392.1.1 (Solyc05g010392.1)
- - - - - 2.56 - - 4.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g046220.2.1 (Solyc05g046220.2)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g047700.2.1 (Solyc05g047700.2)
1.78 - -1.12 -2.01 0.54 2.09 -4.21 -0.08 -0.49 0.13 -1.87 -1.89 - - 1.13 1.75 0.8 - - 0.44 -1.4 0.32 -1.45 -0.55 0.58 -0.55 -2.92 -0.56 -0.51 -0.68 -0.47 0.14 -2.78 1.67
Solyc06g009430.2.1 (Solyc06g009430.2)
3.52 - - - - 1.56 - - - - - 1.46 0.51 - - - - 3.45 - - - - - - - - - - - - - - - 2.18
Solyc06g009480.2.1 (Solyc06g009480.2)
3.6 -0.27 - - - 3.45 - - - - 0.66 -0.51 - - - - - 2.23 - - - 0.18 - -0.51 - - - - - 0.03 - - - -1.88
Solyc06g048577.1.1 (Solyc06g048577.1)
-0.78 -0.71 -2.29 - -1.78 -1.04 1.4 1.05 1.17 0.32 0.81 0.69 2.56 2.16 0.05 -0.84 -1.78 0.9 -3.19 -2.18 -0.57 -1.04 -1.07 -3.35 -2.66 -3.61 -0.88 -0.39 -1.4 - -0.79 -0.93 - 0.05
Solyc06g072200.1.1 (Solyc06g072200.1)
- - - 2.64 - - 2.36 - 3.45 - 0.87 - - - - 2.38 2.24 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g072450.1.1 (Solyc06g072450.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g005587.1.1 (Solyc07g005587.1)
- - - - 1.36 2.81 2.29 - - - - - - - - 2.31 - - - - - - - - - - - - - 2.49 - - - 3.16
Solyc07g014750.1.1 (Solyc07g014750.1)
- - - - -0.56 2.29 -0.85 - - - - - - - - - - 1.37 4.39 - 0.76 - - - - - - - -1.52 - -0.1 - - 0.5
Solyc07g016055.1.1 (Solyc07g016055.1)
- - - - - - - - 4.03 - - - 2.43 - - 3.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g016095.1.1 (Solyc07g016095.1)
- - - - - - - - 5.08 - - - - - - - - - - - - - -2.81 - - - - -2.8 - - - - - -
Solyc07g021463.1.1 (Solyc07g021463.1)
- - - - 2.24 3.6 - - - 2.12 - - - 2.18 - - - - - 1.18 - - - - - - - - - - - - - 2.58
Solyc08g005180.1.1 (Solyc08g005180.1)
- - - - -0.26 - - 0.47 4.22 3.15 0.34 - - - - - - 0.81 - -0.51 - - - - - - - -2.0 -1.42 - - - - -
Solyc08g016448.1.1 (Solyc08g016448.1)
- - - - - - - - 4.1 3.76 - - - - 1.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g044470.1.1 (Solyc08g044470.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g065695.1.1 (Solyc08g065695.1)
-0.06 - - - - -2.0 1.35 0.4 -0.05 0.31 1.24 -0.72 2.26 2.97 0.86 - -0.51 2.26 - - - - - - - - - 0.39 -1.39 - - - - 1.09
Solyc08g074840.1.1 (Solyc08g074840.1)
- - - - - 3.96 - - - - - - - - - - - - - - - 1.99 - - - - 2.16 0.52 2.43 - 1.66 - - -
Solyc08g081880.2.1 (Solyc08g081880.2)
- 0.63 - 0.37 0.65 4.09 0.44 1.92 1.24 - - - - - - - - - -2.41 - - - - -2.73 - - - -0.59 0.23 0.03 -2.4 - -1.77 0.4
Solyc08g083000.2.1 (Solyc08g083000.2)
- - 1.63 2.47 - 1.68 - 3.09 - - - - 0.19 - - - - - - - - - - - - - 3.09 -1.26 - - 1.32 - 0.13 -
Solyc09g005365.1.1 (Solyc09g005365.1)
- 0.57 1.28 1.52 -0.82 -1.56 -0.07 -1.36 2.65 - - - - - 1.13 1.89 2.54 0.82 -2.19 -1.21 - -1.18 -0.71 -2.68 -1.13 - - -1.53 0.08 - -2.55 - - 0.38
Solyc09g059107.1.1 (Solyc09g059107.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g059120.1.1 (Solyc09g059120.1)
- - - - - -0.05 - - 4.75 1.77 - - - - - - - - - 1.41 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g097940.1.1 (Solyc09g097940.1)
0.23 - - - - - - - 5.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g012290.1.1 (Solyc10g012290.1)
- - - - - 4.1 - - 3.39 - - - - - - - - - - 1.58 - - - - - - - - 1.75 - - - - -
Solyc10g017985.1.1 (Solyc10g017985.1)
- - - - 2.1 4.29 - - - - 1.81 - 1.67 1.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g047175.1.1 (Solyc10g047175.1)
- - - - - - - - 3.94 3.97 - - - - - - - - 1.54 - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g047480.1.1 (Solyc10g047480.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.0 - - -0.28 - 3.43 3.56 2.81 - 1.13 -0.12 - -
Solyc10g052670.1.1 (Solyc10g052670.1)
- - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g074827.1.1 (Solyc10g074827.1)
- - - - - -0.2 -1.76 - 3.38 2.76 - - - - - - - - - - -0.82 2.09 - -0.75 0.09 - - 0.31 -0.34 0.18 1.56 1.61 - -
Solyc11g011877.1.1 (Solyc11g011877.1)
2.42 - 2.96 1.44 - 2.81 - - - - - - 0.03 -0.04 - - 1.89 - - - - - - - -0.64 - 1.11 -0.31 - 0.86 - - - -
Solyc11g020080.2.1 (Solyc11g020080.2)
- 2.42 - - - 3.02 2.23 2.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.53 0.55 - - - - 2.88
Solyc11g028040.2.1 (Solyc11g028040.2)
-3.48 - - - - - -5.35 - 5.01 0.27 - - - - - - - - - -5.1 - -3.9 - -3.01 -4.57 - - -4.78 -4.18 -3.24 -4.26 -4.87 -6.3 -
Solyc11g028070.2.1 (Solyc11g028070.2)
- - - - -8.3 -6.3 -6.52 - 5.03 -1.65 - - - - - - - - - - - -2.98 - -4.47 -3.99 - - -4.04 -2.87 -2.94 -2.66 -2.39 - -4.21
Solyc11g032105.1.1 (Solyc11g032105.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.77 - 2.74 - - - - 3.77
Solyc11g039807.1.1 (Solyc11g039807.1)
- - - - - 2.7 - - - - - - - - - - - - - - 3.14 - - 1.18 - - - - - - 3.09 2.98 - -
Solyc11g042730.2.1 (Solyc11g042730.2)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g043000.1.1 (Solyc11g043000.1)
2.08 0.06 2.06 - 3.27 2.65 -0.21 - - - - -1.08 0.99 -0.85 0.82 -0.19 - - - -0.41 - - - - - - - - - 0.44 - - - -
Solyc11g061930.1.1 (Solyc11g061930.1)
- - - - - - - - 3.77 - 3.67 - - - - - - - - - - - - -0.24 - - 1.67 - 1.87 - - - - -
Solyc12g010560.2.1 (Solyc12g010560.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g010780.1.1 (Solyc12g010780.1)
- - - - - 0.65 - - 0.96 - - - -0.19 3.05 1.69 - 1.16 -0.06 - 3.25 - - - 0.08 -0.63 - - - - 0.7 - 0.57 - -0.74
Solyc12g038990.1.1 (Solyc12g038990.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g042967.1.1 (Solyc12g042967.1)
- - - - 4.23 1.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.96 -0.77 1.29 - - 0.33 2.42 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.