Heatmap: Cluster_196 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g140060.3.1 (Solyc00g140060.3)
-0.45 0.4 -0.17 0.8 -0.63 -0.34 0.16 0.41 0.16 0.38 0.14 -0.19 0.84 0.39 0.13 -0.41 -0.07 -5.67 -4.1 -0.35 0.38 0.18 -0.05 0.2 -0.1 -0.0 0.25 0.35 0.16 0.24 0.14 0.23 -2.54 -0.76
Solyc01g008480.3.1 (Solyc01g008480.3)
-0.29 0.06 -0.78 -0.63 -0.62 0.07 0.36 -0.19 0.04 0.78 0.06 -0.83 0.76 -0.21 0.91 0.59 0.61 -8.12 -8.0 -0.29 0.33 -0.24 -0.26 -0.08 -0.25 1.22 -0.03 -0.01 -0.06 -0.24 -0.05 0.35 -3.1 0.27
Solyc01g009070.3.1 (Solyc01g009070.3)
-0.8 -0.83 -1.39 -1.81 -0.36 -0.8 0.08 -0.81 0.71 0.76 0.63 -1.23 2.06 0.94 0.95 1.02 0.64 -7.06 -8.38 -1.5 0.39 -0.51 -1.12 -0.87 -0.92 1.05 -0.06 -0.16 -0.36 -0.57 -0.24 -0.12 -3.93 0.21
Solyc01g067570.3.1 (Solyc01g067570.3)
0.41 -1.93 -1.21 -2.33 0.53 -0.24 0.36 -1.11 -0.16 1.26 0.39 -0.54 0.95 -0.15 0.82 1.02 0.9 -4.78 -5.59 -0.27 0.42 0.03 -0.89 -0.61 -0.41 1.28 -0.69 -0.52 -0.49 -0.28 -0.04 0.38 -3.26 0.17
Solyc01g079385.1.1 (Solyc01g079385.1)
-0.47 -1.5 -1.44 -1.82 1.95 0.53 -1.04 -0.65 -0.12 0.51 0.1 0.07 1.26 0.66 0.54 0.23 0.17 -7.34 -6.28 -0.55 0.58 -0.3 -0.44 -0.34 -0.37 0.65 -0.2 -0.06 -0.01 -0.24 -0.2 -0.03 -3.39 0.24
Solyc01g079390.3.1 (Solyc01g079390.3)
0.01 -1.41 -1.0 -1.4 0.61 -0.1 -0.22 -0.59 0.22 0.41 0.09 -0.24 1.12 0.39 0.45 0.19 0.24 -7.18 -6.45 -0.1 0.88 0.01 -0.27 -0.12 -0.1 0.89 -0.04 0.08 0.13 0.01 0.01 0.33 -3.37 0.41
Solyc01g086810.2.1 (Solyc01g086810.2)
0.68 -6.68 -1.58 -7.01 1.36 1.25 -1.75 -0.72 -0.36 1.39 -1.07 -2.63 -3.73 -5.0 -0.05 0.28 0.05 - - 0.7 0.76 -0.06 -2.04 -0.66 -0.19 1.82 -1.44 -0.51 -0.29 0.04 -0.04 1.08 -2.48 1.63
Solyc01g087320.3.1 (Solyc01g087320.3)
0.53 0.13 0.64 -0.74 0.52 -0.2 0.62 -0.87 0.46 0.5 0.08 -0.74 0.49 -0.12 0.47 0.48 0.27 -7.17 -9.68 0.05 0.83 -0.42 -0.69 -0.61 -0.65 0.57 -0.33 -0.08 0.11 -0.6 -0.34 -0.07 -4.22 0.95
Solyc01g087380.3.1 (Solyc01g087380.3)
0.44 -0.09 0.01 -1.12 -0.0 -0.03 0.7 -0.21 0.14 0.65 0.49 -0.71 1.5 0.8 0.07 -0.2 -0.37 -6.99 -6.64 0.25 0.7 -0.7 -0.69 -0.79 -0.75 1.34 -0.29 -0.46 -0.6 -0.47 -0.37 -0.19 -3.94 0.49
Solyc01g087385.1.1 (Solyc01g087385.1)
0.33 -0.1 -0.46 -1.31 -0.23 -0.01 1.24 -0.06 -0.83 1.18 0.16 -0.85 1.26 0.61 0.39 0.18 0.08 -5.37 -5.83 0.02 0.4 -0.61 -0.77 -0.61 -0.81 1.55 -0.05 -0.4 -0.5 -0.68 -0.27 -0.07 -3.4 -0.15
Solyc01g087400.3.1 (Solyc01g087400.3)
0.12 -0.55 -0.65 -2.11 0.71 -0.24 0.76 -1.14 -0.27 0.65 0.8 0.17 1.53 0.8 -0.48 -0.92 -0.78 -8.44 -7.66 0.11 1.13 -0.45 -0.83 -0.77 -0.73 1.53 -0.54 -0.47 -0.39 -0.61 -0.36 0.07 -4.05 0.73
Solyc01g087410.3.1 (Solyc01g087410.3)
-0.02 -0.59 -1.01 -2.68 0.6 -0.34 1.13 -0.85 0.2 0.21 0.38 -0.48 1.15 0.43 -0.91 -0.63 -0.49 - - 0.39 1.27 -0.37 -1.14 -0.5 -0.44 1.44 -0.39 -0.13 0.24 0.05 -0.19 0.2 -3.66 0.82
Solyc01g087415.1.1 (Solyc01g087415.1)
0.24 0.38 -0.49 -1.98 -0.04 -0.44 1.76 -0.33 -0.33 1.57 -0.31 -0.63 0.87 -0.23 -0.23 -0.08 -0.65 - -7.01 -0.37 0.4 -0.72 -0.52 -0.61 -0.68 1.69 -0.29 0.05 0.04 -0.34 -0.76 0.19 -4.94 -0.07
Solyc01g091720.3.1 (Solyc01g091720.3)
0.57 -0.44 0.05 -1.06 0.09 -0.27 -0.39 -0.89 0.02 0.37 0.48 -0.2 0.43 0.12 0.34 0.46 0.32 -8.78 -9.69 0.08 0.06 -0.19 -0.6 -0.26 -0.25 1.3 -0.17 -0.03 -0.08 0.1 0.18 0.55 -2.11 0.74
Solyc01g094150.3.1 (Solyc01g094150.3)
-0.11 -0.45 -0.1 -0.19 0.56 0.07 0.19 -0.51 0.02 0.81 -0.27 -0.62 0.38 0.21 0.92 0.77 0.81 -5.69 -4.81 -0.0 -0.07 -0.08 -0.27 -0.16 -0.16 0.47 -0.01 -0.1 -0.03 -0.15 -0.14 0.01 -2.0 0.23
Solyc01g096550.3.1 (Solyc01g096550.3)
0.35 -0.05 -0.55 -0.49 -0.62 -0.67 0.86 -1.05 0.31 0.23 -0.09 -0.47 -0.03 -0.4 0.62 0.81 0.65 -5.01 -5.51 -0.2 -0.42 0.33 -0.16 0.12 0.3 0.14 -0.18 0.1 0.29 0.28 0.26 0.62 -1.13 0.37
Solyc01g096710.3.1 (Solyc01g096710.3)
-0.11 -0.0 -0.42 -0.13 0.19 -0.13 0.62 -0.62 0.34 0.68 0.52 -0.03 0.53 0.23 0.52 0.35 0.34 -6.74 -6.83 -0.29 -0.6 -0.07 -0.13 -0.07 -0.28 0.42 0.03 -0.0 -0.12 0.02 0.11 0.17 -1.52 0.39
Solyc01g098460.3.1 (Solyc01g098460.3)
0.31 -0.05 -1.06 -0.94 -0.12 0.28 1.0 0.05 0.32 0.75 -0.04 -0.44 0.74 0.2 0.54 0.51 0.51 -2.29 -2.3 -0.51 -0.67 0.09 -0.15 -0.2 -0.46 0.66 0.04 -0.05 -0.24 -0.03 0.08 0.05 -1.35 -0.52
Solyc01g099710.3.1 (Solyc01g099710.3)
0.14 0.19 -0.27 0.11 -0.08 -0.38 0.71 -0.67 0.43 0.22 -0.51 -0.75 -0.16 -0.61 0.56 0.54 0.53 -3.01 -1.56 -0.24 -0.7 0.21 0.01 0.12 0.11 0.48 0.07 0.23 0.22 0.18 0.23 0.27 -1.49 0.29
Solyc01g103020.3.1 (Solyc01g103020.3)
-0.14 0.4 0.25 0.12 -0.1 0.04 0.41 -0.24 0.18 0.41 0.08 -0.08 0.86 0.51 0.65 0.61 0.64 -3.16 -3.1 -1.16 -0.83 -0.04 -0.25 -0.27 -0.44 0.18 -0.22 -0.21 -0.37 -0.1 0.02 -0.02 -1.62 0.58
Solyc01g103335.1.1 (Solyc01g103335.1)
-0.16 -1.36 -1.22 -0.7 0.63 -0.18 -0.49 -0.49 -0.25 1.21 -0.29 -1.12 0.61 0.15 0.97 1.15 0.92 -7.87 -6.91 -0.86 -0.35 0.06 0.06 -0.28 -0.37 1.57 0.17 -0.07 -0.2 -0.11 0.18 0.16 -3.88 -1.04
Solyc01g103340.3.1 (Solyc01g103340.3)
-0.44 -1.6 -3.02 -1.03 0.55 -0.29 0.08 -0.53 -0.16 0.89 0.24 -0.15 1.01 0.02 0.95 1.62 0.97 -6.51 -6.24 -0.57 0.03 -0.56 -0.61 -0.62 -1.14 2.18 -0.81 -0.54 -0.67 -0.29 -0.33 -0.2 -4.6 -1.47
Solyc01g104410.3.1 (Solyc01g104410.3)
0.59 -0.57 -0.27 -1.35 -0.14 0.14 0.57 0.17 0.13 0.65 0.18 -0.36 0.78 0.17 0.65 0.43 0.43 -3.69 -5.04 -0.47 0.01 0.15 -0.07 -0.22 -0.37 0.67 -0.13 -0.07 -0.09 0.16 0.28 0.16 -3.18 -0.3
Solyc01g105827.1.1 (Solyc01g105827.1)
-0.43 -0.35 -0.37 -0.98 -0.11 -0.17 0.09 -0.56 -0.14 0.56 -0.35 -0.97 0.57 0.05 1.06 1.0 1.03 -1.17 -2.39 -0.16 -0.02 -0.27 -0.46 -0.39 -0.49 1.44 -0.14 -0.05 0.08 -0.27 -0.08 0.21 -4.11 0.21
Solyc01g107510.3.1 (Solyc01g107510.3)
-0.2 -1.1 -0.82 -1.72 -0.6 -0.08 0.63 -0.04 0.33 0.74 0.08 -0.17 0.87 0.95 1.17 0.97 1.05 -7.62 -8.67 0.07 0.12 -0.37 -0.83 -0.63 -0.86 1.04 -0.58 -0.37 -0.5 -0.29 -0.16 0.03 -3.16 0.09
Solyc01g107930.3.1 (Solyc01g107930.3)
0.23 -1.41 0.42 -0.66 -0.75 -0.5 0.52 -0.81 0.34 0.39 -0.54 -0.57 0.32 -0.13 0.76 0.89 0.87 -3.98 -4.96 -0.01 0.15 0.17 -0.3 -0.15 -0.19 0.42 0.1 0.16 0.29 0.11 0.18 0.22 -2.86 0.6
Solyc02g021470.3.1 (Solyc02g021470.3)
0.21 0.01 0.32 -0.31 -0.02 -0.15 0.28 -0.39 -0.09 0.05 -0.08 -0.32 0.55 0.2 0.58 0.48 0.49 -5.42 -5.37 0.07 -0.23 -0.03 -0.04 -0.04 -0.15 0.83 0.16 0.05 -0.1 0.06 0.13 0.12 -2.2 0.28
Solyc02g063075.1.1 (Solyc02g063075.1)
-0.53 0.29 0.11 0.37 0.93 0.09 0.63 -0.29 -0.44 0.57 0.15 0.07 0.54 0.49 0.85 1.05 0.97 -2.77 -3.52 -0.04 -0.04 -0.58 -0.55 -0.65 -0.77 0.47 -0.62 -0.52 -0.71 -0.49 -0.77 -0.58 -1.03 -0.39
Solyc02g064740.3.1 (Solyc02g064740.3)
-0.34 -2.67 -0.54 -1.19 -0.36 -0.06 -0.25 -0.15 0.32 0.84 -0.59 -1.04 0.81 0.22 0.79 0.88 0.75 -6.71 -7.97 -0.71 0.5 0.16 -0.06 -0.04 -0.22 0.86 0.23 0.45 0.37 0.24 0.23 0.45 -2.9 -0.59
Solyc02g066830.3.1 (Solyc02g066830.3)
-0.42 -2.25 -0.87 -1.34 0.3 -0.1 0.43 0.1 0.57 1.54 1.17 0.22 1.6 0.78 -1.46 -1.9 -1.8 -8.95 - -0.91 0.23 0.01 -0.51 -0.21 -0.3 0.86 0.12 0.01 -0.14 0.15 0.06 0.32 -5.48 -0.52
Solyc02g069203.1.1 (Solyc02g069203.1)
-0.49 -2.09 -1.23 -1.22 -1.01 -0.27 -0.09 -0.52 0.38 1.13 -0.49 -0.48 0.68 0.18 0.99 0.58 0.94 - -8.55 -0.56 1.04 -0.15 0.51 -0.41 -0.56 1.09 0.62 0.22 -0.33 0.07 0.06 0.14 -5.35 -0.23
Solyc02g078490.3.1 (Solyc02g078490.3)
-0.28 -0.92 -0.46 -0.4 -0.25 -0.41 0.29 0.14 -0.27 1.03 0.59 0.15 0.84 0.59 0.43 0.34 0.39 -2.55 -1.93 -0.38 0.12 -0.06 -0.81 -0.43 -0.43 1.48 -0.46 -0.33 -0.38 -0.23 -0.12 0.24 -4.28 0.21
Solyc02g081250.2.1 (Solyc02g081250.2)
-0.96 -0.21 -0.35 0.13 0.33 -1.85 0.34 -1.51 0.22 0.48 0.59 -1.39 -0.43 -1.13 2.52 2.68 2.31 -7.13 -8.03 -4.32 -2.98 -1.78 -1.34 -1.69 -2.15 -2.38 -1.6 -1.73 -2.03 -1.9 -1.57 -2.06 -4.98 0.53
Solyc02g082590.3.1 (Solyc02g082590.3)
0.19 0.14 -0.56 -0.97 -1.47 0.2 0.18 -0.79 0.47 1.29 -0.4 -0.86 0.66 0.07 0.92 1.31 0.99 -6.96 -5.35 -1.0 -0.79 -0.32 -0.27 -0.34 -0.53 1.31 0.23 0.05 -0.16 -0.14 -0.41 0.1 -4.43 -0.66
Solyc02g082600.3.1 (Solyc02g082600.3)
-0.15 -0.04 -0.17 -0.86 0.34 0.07 0.74 -0.89 0.59 0.92 -0.06 -1.08 0.85 0.08 1.04 1.17 0.99 -5.06 -7.25 -1.03 -0.51 -0.29 -0.47 -0.57 -0.61 0.87 0.08 -0.09 -0.26 -0.55 -0.39 -0.18 -3.93 0.03
Solyc02g083180.3.1 (Solyc02g083180.3)
-0.19 -0.08 -0.55 -1.03 -1.04 -0.18 0.03 -0.58 0.07 0.77 0.19 -0.68 0.38 -0.06 0.22 0.32 0.34 -8.24 -7.73 -0.61 -0.25 0.46 0.37 0.37 0.33 1.09 0.19 0.17 0.03 0.43 0.53 0.42 -1.9 -0.08
Solyc02g088395.1.1 (Solyc02g088395.1)
0.39 -2.63 -1.52 -2.48 -0.18 0.21 -0.8 0.08 -0.36 1.87 -0.57 -1.46 0.08 -0.79 0.81 0.94 0.91 -8.96 -8.02 0.08 0.91 -0.05 -0.44 -0.37 -0.08 1.63 -0.22 -0.16 -0.22 -0.18 -0.38 0.37 -4.6 -0.7
Solyc02g093365.1.1 (Solyc02g093365.1)
-0.22 -0.95 -1.0 -0.94 0.77 0.36 -0.16 -0.64 -0.01 0.32 0.15 -0.65 0.83 0.45 1.07 0.85 0.88 -4.83 -4.29 0.13 0.75 -0.23 -0.57 -0.26 -0.16 0.73 -0.6 -0.32 -0.27 -0.33 -0.43 0.0 -0.89 0.07
Solyc02g094430.3.1 (Solyc02g094430.3)
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Solyc06g060810.3.1 (Solyc06g060810.3)
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Solyc06g065945.1.1 (Solyc06g065945.1)
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Solyc06g066460.3.1 (Solyc06g066460.3)
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Solyc06g066470.3.1 (Solyc06g066470.3)
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Solyc06g066473.1.1 (Solyc06g066473.1)
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Solyc06g066477.1.1 (Solyc06g066477.1)
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Solyc07g017535.1.1 (Solyc07g017535.1)
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Solyc07g054340.1.1 (Solyc07g054340.1)
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Solyc07g054370.3.1 (Solyc07g054370.3)
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Solyc08g083100.2.1 (Solyc08g083100.2)
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Solyc09g008490.3.1 (Solyc09g008490.3)
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Solyc09g014410.3.1 (Solyc09g014410.3)
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Solyc09g061750.2.1 (Solyc09g061750.2)
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Solyc12g056995.1.1 (Solyc12g056995.1)
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0.23 -2.46 -1.33 -1.82 -2.44 -0.17 -0.86 -1.1 -1.98 2.48 1.18 1.61 1.87 1.8 0.3 0.81 0.33 -4.36 -3.61 -1.32 -1.67 -2.76 -1.46 -1.77 -1.12 0.78 -0.61 -0.48 -1.55 -2.04 -1.67 -1.93 - -0.03
Solyc12g088340.2.1 (Solyc12g088340.2)
-0.34 -0.11 0.34 0.51 -0.07 0.14 0.37 -0.06 0.55 0.06 0.21 0.37 0.1 0.24 0.58 0.3 0.24 -3.24 -2.45 -0.02 0.08 -0.21 0.16 -0.14 -0.36 0.4 -0.05 -0.17 -0.2 -0.36 -0.21 -0.27 -2.05 0.49
Solyc12g098440.2.1 (Solyc12g098440.2)
-0.36 -2.01 -0.18 -0.46 1.37 0.54 -0.05 -0.36 0.14 -0.26 0.24 -0.03 0.51 0.37 0.94 0.76 0.65 - -9.88 0.34 0.52 -0.18 -0.44 -0.14 -0.07 0.05 -0.45 -0.24 -0.18 -0.28 -0.25 -0.05 -1.33 -0.21
Solyc12g098690.2.1 (Solyc12g098690.2)
-1.02 -1.24 -0.33 -1.56 -0.32 -1.29 -0.04 -1.42 -0.32 0.16 -0.19 -0.52 0.26 0.07 2.1 1.99 2.04 -3.88 -3.77 -0.32 0.35 -0.38 -0.81 -0.54 -0.47 -0.22 -0.52 -0.38 -0.23 -0.41 -0.41 -0.21 -2.57 -0.72
Solyc12g100070.2.1 (Solyc12g100070.2)
0.32 0.33 1.22 -0.06 0.12 -0.02 0.36 -0.61 -0.86 0.69 -0.27 -0.95 -0.35 -0.62 1.17 1.09 1.18 -3.52 -3.81 -0.3 -0.85 -0.65 -0.78 -0.71 -0.64 1.11 -0.53 -0.42 -0.41 -0.47 -0.47 -0.59 -0.01 0.2

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.