Heatmap: Cluster_263 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g222060.1.1 (Solyc00g222060.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g304030.2.1 (Solyc00g304030.2)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g044277.1.1 (Solyc01g044277.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g022835.1.1 (Solyc02g022835.1)
- - - - - - - - - 3.52 - - - - - - 3.03 - - 3.85 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g044007.1.1 (Solyc02g044007.1)
- - - - - 2.0 - - - 1.91 2.58 3.54 2.41 - - - - - - - - 1.43 - - - - - -0.63 - - - - - -
Solyc02g050243.1.1 (Solyc02g050243.1)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g061705.1.1 (Solyc02g061705.1)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g071555.1.1 (Solyc02g071555.1)
- - - - - - - - - 4.89 - - 2.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g051627.1.1 (Solyc03g051627.1)
- - - - 1.89 3.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.2 - - - - - 4.3
Solyc03g051820.1.1 (Solyc03g051820.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g051905.1.1 (Solyc03g051905.1)
- - - - - -1.29 - - - 3.6 - - - - - - - - - - 2.81 - - - - - - 1.14 2.83 - - 2.37 - -
Solyc03g058730.1.1 (Solyc03g058730.1)
- - - - 4.85 2.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g059505.1.1 (Solyc03g059505.1)
- - - - 2.92 0.12 - - - - 3.28 1.31 0.73 3.1 - - - - - - 1.58 - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g078625.1.1 (Solyc03g078625.1)
- - - - - 0.65 2.28 - - 4.21 - - - - - - - 1.91 - - - 2.42 - - - - - - - - - - - -
Solyc03g093785.1.1 (Solyc03g093785.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g054155.1.1 (Solyc04g054155.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g005325.1.1 (Solyc05g005325.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g014465.1.1 (Solyc05g014465.1)
- - - - - 0.84 - - - - - - - 2.77 - - - 2.87 - - - - 1.56 - - - - 1.22 - 3.68 - - - -
Solyc05g015093.1.1 (Solyc05g015093.1)
- - - - - 1.45 - - - - - - - - - - - 3.99 - - - - - - - - 3.1 2.31 0.89 - - - - -
Solyc05g017847.1.1 (Solyc05g017847.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g021210.1.1 (Solyc05g021210.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g025813.1.1 (Solyc05g025813.1)
- - - - 2.77 3.01 - - 4.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g016700.1.1 (Solyc06g016700.1)
- - - - 4.83 2.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g050525.1.1 (Solyc06g050525.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g050780.1.1 (Solyc06g050780.1)
- - - 2.21 - -1.21 - - - - 2.96 - 3.37 - - - - - - 3.17 - - - -0.55 - - - 0.23 - - - - - -
Solyc07g025470.1.1 (Solyc07g025470.1)
- - - - 4.94 1.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g043530.2.1 (Solyc07g043530.2)
- - - - 4.06 3.8 - - - - - - 1.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g021790.1.1 (Solyc08g021790.1)
- - - - 4.15 - - - - - 4.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g023633.1.1 (Solyc08g023633.1)
- - - - 4.28 1.86 - - - - - - - - - - - - 3.45 - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g029070.2.1 (Solyc08g029070.2)
- - - - - - - - - - 4.69 - - - - - - - - 3.04 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g041664.1.1 (Solyc08g041664.1)
- - - - - 2.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.83 - - -
Solyc08g062787.1.1 (Solyc08g062787.1)
- 1.75 - - 3.12 0.02 - - - - 0.87 - - 0.81 - - - 0.82 - 1.39 - - - - - - 2.66 2.73 - - - - - -
Solyc09g015385.1.1 (Solyc09g015385.1)
- - - - - 0.47 - - - 4.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.39 - - - - - -
Solyc09g037140.1.1 (Solyc09g037140.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g042370.1.1 (Solyc09g042370.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g098410.2.1 (Solyc09g098410.2)
- - - - - 0.83 4.58 - - - - - 3.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g008455.1.1 (Solyc10g008455.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g008530.1.1 (Solyc10g008530.1)
- - - - - 2.68 - - - - - - - - - - - - - - 4.79 - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g018025.1.1 (Solyc10g018025.1)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g036660.1.1 (Solyc10g036660.1)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g036810.1.1 (Solyc10g036810.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g076770.1.1 (Solyc10g076770.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g018640.1.1 (Solyc11g018640.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g021085.1.1 (Solyc11g021085.1)
- - - - - 1.2 - - - - - - - - - - - - - 1.47 4.85 - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g045400.1.1 (Solyc11g045400.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g050980.2.1 (Solyc11g050980.2)
- - - - 2.89 1.5 - - - - - - 2.12 3.13 - - - 0.58 -0.36 - - - - - - - - -0.83 2.97 - - - - -
Solyc12g040230.1.1 (Solyc12g040230.1)
- - - - 3.72 3.4 - - - - 3.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g040280.2.1 (Solyc12g040280.2)
- - - - 4.67 - - - - - - - - - - - - - - 1.97 - - - - - - - 0.3 1.72 - - - - -
Solyc12g049640.2.1 (Solyc12g049640.2)
- - - - - 2.11 - - - - 4.0 - - - - - 2.21 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g062345.1.1 (Solyc12g062345.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g082700.1.1 (Solyc12g082700.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.