Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
0.01 1.0 0.17 0.26 0.21 0.05 0.43
0.15 1.0 0.01 0.02 0.03 0.17 0.65
0.08 1.0 0.12 0.24 0.14 0.11 0.77
Als_g07302 (ATPT2)
0.28 1.0 0.13 0.21 0.15 0.06 0.45
Als_g08097 (UBQ11)
0.3 1.0 0.36 0.4 0.42 0.16 0.44
Als_g10070 (WNK8)
0.04 1.0 0.14 0.11 0.09 0.02 0.43
Als_g12018 (ADT5)
0.13 1.0 0.03 0.12 0.01 0.04 0.46
Als_g13613 (EXO70D1)
0.23 1.0 0.3 0.45 0.32 0.21 0.65
0.05 1.0 0.15 0.23 0.1 0.02 0.47
Als_g16374 (TINY2)
0.02 1.0 0.07 0.17 0.06 0.06 0.35
0.05 1.0 0.04 0.23 0.12 0.03 0.26
Als_g19278 (EXO70A1)
0.04 1.0 0.07 0.25 0.07 0.02 0.4
Als_g19822 (LOX4)
0.22 1.0 0.02 0.06 0.0 0.04 0.36
0.2 1.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.58
0.08 1.0 0.09 0.14 0.08 0.02 0.5
0.26 1.0 0.02 0.1 0.01 0.05 0.47
0.19 1.0 0.01 0.1 0.03 0.01 0.44
0.34 1.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.72
0.12 1.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.21
0.16 1.0 0.05 0.2 0.04 0.01 0.1
0.15 1.0 0.04 0.16 0.03 0.02 0.66
0.21 1.0 0.13 0.37 0.22 0.04 0.38
0.09 1.0 0.02 0.07 0.02 0.01 0.27
0.01 1.0 0.09 0.08 0.13 0.01 0.65
0.16 1.0 0.02 0.06 0.02 0.01 0.32
0.17 1.0 0.09 0.13 0.07 0.07 0.52
0.02 1.0 0.02 0.06 0.01 0.01 0.58
0.13 1.0 0.13 0.26 0.15 0.02 0.71
0.11 1.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.27
Als_g25436 (PHT3;2)
0.09 1.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.36
0.28 1.0 0.09 0.18 0.16 0.16 0.79
0.01 1.0 0.06 0.08 0.09 0.02 0.29
0.17 1.0 0.01 0.07 0.04 0.15 0.38
0.07 1.0 0.04 0.18 0.08 0.02 0.39
0.02 1.0 0.09 0.14 0.04 0.04 0.37
0.11 1.0 0.04 0.15 0.03 0.01 0.53
0.04 1.0 0.14 0.13 0.16 0.03 0.43
0.01 1.0 0.08 0.13 0.05 0.0 0.55
0.05 1.0 0.15 0.31 0.15 0.01 0.44
0.55 1.0 0.46 0.62 0.5 0.46 0.8
0.01 1.0 0.1 0.32 0.09 0.03 0.6
0.0 1.0 0.14 0.13 0.08 0.02 0.33
Als_g32875 (CP1)
0.08 1.0 0.16 0.1 0.11 0.12 0.78
0.06 1.0 0.1 0.25 0.2 0.01 0.71
0.08 1.0 0.11 0.23 0.11 0.12 0.66
0.04 1.0 0.04 0.03 0.0 0.01 0.45
0.15 1.0 0.11 0.23 0.19 0.21 0.55
0.13 1.0 0.12 0.21 0.16 0.01 0.54
0.01 1.0 0.05 0.11 0.09 0.01 0.33
Als_g37958 (DEAR2)
0.0 1.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.58
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48
0.0 1.0 0.03 0.06 0.04 0.0 0.24
0.25 1.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.93
0.21 1.0 0.02 0.46 0.16 0.06 0.53
0.21 1.0 0.07 0.08 0.11 0.03 0.34
0.01 1.0 0.09 0.25 0.11 0.06 0.47
0.03 1.0 0.13 0.18 0.08 0.01 0.44
Als_g52498 (HCT)
0.01 1.0 0.04 0.09 0.03 0.0 0.45
0.04 1.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.38
0.0 1.0 0.13 0.12 0.13 0.02 0.61
0.33 1.0 0.0 0.12 0.02 0.0 0.28
0.04 1.0 0.06 0.26 0.0 0.12 0.41
Als_g54275 (UBQ11)
0.04 1.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.29
0.34 1.0 0.0 0.11 0.0 0.06 0.28
Als_g54498 (NDPK1)
0.2 1.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.29
0.31 1.0 0.01 0.13 0.0 0.0 0.35
Als_g54655 (HSP83)
0.02 1.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.25
Als_g54698 (RPS6B)
0.24 1.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.39
0.1 1.0 0.0 0.13 0.02 0.0 0.64
Als_g55013 (HSP83)
0.1 1.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.25
0.08 1.0 0.03 0.15 0.03 0.01 0.47
Als_g55064 (HSP70)
0.1 1.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.64
Als_g55115 (Hsp81.4)
0.03 1.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.34
0.02 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.23
Als_g55193 (EIF4A-III)
0.06 1.0 0.01 0.19 0.0 0.0 0.39
Als_g55689 (UBQ11)
0.15 1.0 0.0 0.21 0.02 0.0 0.45
0.03 1.0 0.0 0.11 0.0 0.01 0.63
0.13 1.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.16
0.25 1.0 0.0 0.14 0.03 0.0 0.41
0.1 1.0 0.0 0.13 0.05 0.01 0.15
0.4 1.0 0.0 0.1 0.01 0.01 0.31
Als_g56457 (HTB4)
0.18 1.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.29
0.06 1.0 0.09 0.22 0.21 0.01 0.51
Als_g56827 (UBQ11)
0.01 1.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.36
0.04 1.0 0.15 0.29 0.23 0.05 0.47
0.22 1.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.2
0.12 1.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.27
Als_g57761 (RH4)
0.07 1.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.34
0.15 1.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.4
0.12 1.0 0.0 0.13 0.02 0.04 0.4
0.07 1.0 0.01 0.1 0.0 0.0 0.42
0.06 1.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.36
0.04 1.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.3
0.1 1.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.54
Als_g58520 (UBQ11)
0.16 1.0 0.28 0.25 0.32 0.03 0.45
0.17 1.0 0.01 0.1 0.0 0.01 0.39
Als_g59386 (FEI1)
0.11 1.0 0.0 0.03 0.01 0.02 0.34
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18
Als_g59605 (ENO2)
0.27 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.26
0.11 1.0 0.01 0.28 0.02 0.0 0.72
Als_g60870 (ERD2)
0.06 1.0 0.0 0.1 0.02 0.0 0.26
Als_g60948 (UBC29)
0.15 1.0 0.06 0.23 0.08 0.02 0.55
Als_g62270 (EDL2)
0.01 1.0 0.09 0.19 0.27 0.03 0.43
0.15 1.0 0.02 0.26 0.0 0.09 0.25
0.13 1.0 0.01 0.28 0.0 0.04 0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)