Heatmap: Cluster_105 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -6.81 - - - - 2.81
Als_g35016 (INT1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g35251 (LSU2)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g35387 (ATG8F)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g35600 (GSTL3)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g36141 (PFK3)
- - - -8.52 - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g36526 (TPPJ)
- - - - - - 2.81
Als_g36614 (VTC2)
- - - - - - 2.81
Als_g36636 (SCL13)
- - -5.72 -6.21 -6.13 - 2.8
- - - - - - 2.81
Als_g36776 (FD3)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g36873 (ARL)
- - - - - - 2.81
Als_g37026 (PRR1)
- - - - - - 2.81
Als_g37185 (GS2)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g37393 (HB1)
- - - - - - 2.81
Als_g37471 (Rap2.6L)
- - - - - - 2.81
Als_g37593 (PFK3)
- - - -4.94 -4.15 - 2.79
Als_g37679 (RBP47C')
- - - - -3.34 - 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g38000 (BME3)
- -4.76 - - - - 2.8
Als_g38078 (GSR 1)
- - - - - - 2.81
Als_g38361 (CML41)
- - - - - - 2.81
Als_g38400 (ATGP4)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g39101 (EBP)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g39402 (CHMP1A)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g39421 (EIN3)
- - - - - - 2.81
- - - - - -4.85 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g40275 (INT1)
- - - - - - 2.81
Als_g40280 (alpha-ADR)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g40521 (PNH)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g41253 (ARPN)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g41516 (NUDT4)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g42284 (MSRB5)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g42541 (CML39)
- - - - - - 2.81
Als_g42635 (DECR)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g43650 (PME1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g43728 (CBF1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g44633 (CYSC1)
- - - - - - 2.81
Als_g44862 (WRKY29)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g45571 (HSP17.4)
- - - - - - 2.81
Als_g45578 (MKP2)
- - - - - - 2.81
Als_g45625 (WI12)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g45887 (NTRB)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - -4.5 - 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g46117 (CHS)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g46154 (NF-YB8)
- - - -4.09 - - 2.8
- - - - - - 2.81
Als_g46350 (PRF5)
- - - - - - 2.81
Als_g46366 (LBD41)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g46410 (PBP1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g47062 (ACT12)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g48186 (PGK)
- - -7.45 - -7.13 -5.14 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g48331 (NIMIN-2)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g48859 (UBC10)
-5.29 -3.59 -5.5 -5.84 -3.4 - 2.76
- - - - - - 2.81
Als_g49367 (ARGOS)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g49857 (NUDT2)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g50674 (GSTU25)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g50913 (ASP3)
- -4.74 - - - - 2.8
- - - - - - 2.81
Als_g51061 (CYP707A3)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - -4.4 - - 2.8
Als_g51837 (EXPL1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g51994 (RBOHD)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g52295 (BAG5)
- - - - - - 2.81
Als_g52418 (CBF4)
- - - - - - 2.81
Als_g52502 (TRE1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g52817 (AlaAT1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g52874 (RBOHD)
- - - - - - 2.81
Als_g53079 (SIS)
- - - - - - 2.81
- -3.41 - - -3.88 - 2.77
- - - - - - 2.81
Als_g53270 (TRX1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.