Heatmap: Cluster_202 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g042143.1.1 (Solyc00g042143.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g112600.1.1 (Solyc00g112600.1)
- - - - - - - - - - 3.71 - - - - - - - - - 4.39 - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g009307.1.1 (Solyc01g009307.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g010083.1.1 (Solyc01g010083.1)
- - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g010315.1.1 (Solyc01g010315.1)
- - - - - 3.59 3.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.76 - - - - - - -
Solyc01g014310.1.1 (Solyc01g014310.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g014920.2.1 (Solyc01g014920.2)
- - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g059886.1.1 (Solyc01g059886.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.95 - - 4.21 - - - -
Solyc01g066330.1.1 (Solyc01g066330.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g067413.1.1 (Solyc01g067413.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g081455.1.1 (Solyc01g081455.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g030340.1.1 (Solyc02g030340.1)
- - - - - 2.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.86
Solyc02g031810.1.1 (Solyc02g031810.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g038725.1.1 (Solyc02g038725.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g031495.1.1 (Solyc03g031495.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g042522.1.1 (Solyc03g042522.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g059395.1.1 (Solyc03g059395.1)
- - - - 4.96 1.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g063530.1.1 (Solyc03g063530.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - -
Solyc03g111240.1.1 (Solyc03g111240.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g025775.1.1 (Solyc04g025775.1)
- - - - 4.37 - - - - - 3.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g025993.1.1 (Solyc04g025993.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.82 - - - 3.04 3.09 2.43 - - - - - 2.25 - - -
Solyc04g045670.1.1 (Solyc04g045670.1)
- - - - 3.82 3.05 - - - - 3.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g049200.2.1 (Solyc04g049200.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g021240.1.1 (Solyc05g021240.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g024456.1.1 (Solyc05g024456.1)
- - - - 4.72 2.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g039970.1.1 (Solyc05g039970.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g034067.1.1 (Solyc06g034067.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g036450.1.1 (Solyc06g036450.1)
- - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g036807.1.1 (Solyc06g036807.1)
- - - - - - - - - - 3.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.64 - - - - -
Solyc06g060423.1.1 (Solyc06g060423.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g018007.1.1 (Solyc07g018007.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g026580.1.1 (Solyc07g026580.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g032650.1.1 (Solyc07g032650.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc07g032796.1.1 (Solyc07g032796.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc07g043203.1.1 (Solyc07g043203.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g014065.1.1 (Solyc08g014065.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc08g015873.1.1 (Solyc08g015873.1)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g029225.1.1 (Solyc08g029225.1)
- - - - 4.77 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g041663.1.1 (Solyc08g041663.1)
- - - - 4.58 2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.55 - - - -
Solyc08g062705.1.1 (Solyc08g062705.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.96 - - - 4.71 - - - - -
Solyc08g065385.1.1 (Solyc08g065385.1)
4.28 - - - 3.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g074655.1.1 (Solyc08g074655.1)
0.67 - - - - 3.69 - - 1.01 - 2.01 2.98 - 0.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.12 -
Solyc08g080600.1.1 (Solyc08g080600.1)
- - - - - - - - 4.18 - 3.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g018255.1.1 (Solyc09g018255.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g037133.1.1 (Solyc09g037133.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g042330.1.1 (Solyc09g042330.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g042570.1.1 (Solyc09g042570.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g042600.1.1 (Solyc09g042600.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g065335.1.1 (Solyc09g065335.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc10g019223.1.1 (Solyc10g019223.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g036620.2.1 (Solyc10g036620.2)
- - - - - - - - - - 4.47 - - 3.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g036710.2.1 (Solyc10g036710.2)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g044620.1.1 (Solyc10g044620.1)
- - - - 3.08 2.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.39 - - - - - - -
Solyc10g047065.1.1 (Solyc10g047065.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g047730.1.1 (Solyc10g047730.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.52 - 4.51 - 2.12 1.98 - -
Solyc10g048130.2.1 (Solyc10g048130.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g050113.1.1 (Solyc10g050113.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g013815.1.1 (Solyc11g013815.1)
- - - - - - - - - 4.04 4.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g017020.1.1 (Solyc11g017020.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g017472.1.1 (Solyc11g017472.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g020580.1.1 (Solyc11g020580.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g027897.1.1 (Solyc11g027897.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g028340.2.1 (Solyc11g028340.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g030470.1.1 (Solyc11g030470.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g039730.1.1 (Solyc11g039730.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g051020.2.1 (Solyc11g051020.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g061950.1.1 (Solyc11g061950.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g062155.1.1 (Solyc11g062155.1)
3.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.85 4.15 - - - - -
Solyc12g019240.2.1 (Solyc12g019240.2)
- - - - - - - - - - 4.68 3.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g027815.1.1 (Solyc12g027815.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g037990.1.1 (Solyc12g037990.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g042510.1.1 (Solyc12g042510.1)
- - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g044830.1.1 (Solyc12g044830.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g077542.1.1 (Solyc12g077542.1)
- - - - - 1.44 - - - - 3.98 - - 3.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.