Heatmap: Cluster_135 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.82
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.89
Als_g34364 (GCL1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.79
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 14.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.7
Als_g35062 (SFD4)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 20.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.08
Als_g36332 (ADF1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.37
Als_g36907 (MEE59)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15.91
Als_g37313 (TRX2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.61
Als_g37657 (ETR2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.3
0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 2.79
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.75
Als_g38605 (COX1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.45
Als_g38685 (SR1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.94
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.58
Als_g39178 (HSP70)
0.01 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 2.9
Als_g39323 (PA2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.96
Als_g39349 (ATJ)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.38
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 19.72
Als_g40143 (CNX1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.73
Als_g40506 (RPS15)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 20.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.62
Als_g41171 (PRF5)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.81
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.29
Als_g42368 (MLP31)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 39.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.58
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 3.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.14
Als_g42955 (MSD1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.73
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 265.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.66
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.97
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.24
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 2.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.41
Als_g44692 (ZPR1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.97
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.58
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.88
Als_g45463 (ATRAB)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.2
Als_g46204 (MBF1A)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.01
Als_g47084 (ATG8F)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.92
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.73
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.58
Als_g48265 (Hsp70b)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.85
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.93
Als_g49284 (XTR6)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.4
Als_g49286 (TCH4)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.73
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 22.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.51
Als_g50614 (OPR2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.74
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.87
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.61
Als_g51715 (JAR1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 32.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 6.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.25
Als_g53064 (ACT11)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.78
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 2.76
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.88

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)