Heatmap: Cluster_110 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
Als_g20451 (JAI3)
-4.71 -4.08 -4.47 -4.1 -5.5 -7.47 2.76
-5.04 -1.83 -2.98 -3.61 -3.74 -4.51 2.67
- -4.19 -3.57 -4.0 - -2.96 2.74
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g35142 (sks4)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - -4.08 - - 2.8
Als_g35739 (RPL23AB)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -3.16 -2.57 -1.54 -4.35 -3.57 2.64
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - -3.72 -2.64 - 2.76
- - - - - - 2.81
Als_g37460 (EXP16)
-7.34 - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g37693 (ATB2)
- - - - - - 2.81
-9.56 - - - - - 2.81
- -4.88 -4.8 - - - 2.79
-3.51 -3.17 -3.73 -4.77 -3.7 -3.04 2.7
- - - - - - 2.81
- - - - - -2.84 2.78
-4.95 -2.91 -6.79 -7.51 -7.35 -3.03 2.74
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - -2.84 - - -3.52 2.76
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.14 2.78
Als_g39646 (ATG8E)
-3.09 -1.51 - -2.96 - - 2.68
Als_g39779 (TUB8)
- - - - - - 2.81
Als_g39810 (YSL6)
-4.07 - - - - - 2.8
Als_g40438 (ERO2)
-4.55 -2.58 -2.42 -2.7 -2.01 -5.6 2.63
- - - - - - 2.81
Als_g40480 (mtACP2)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -2.83 - - - - 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g41699 (TOR2)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g43251 (PRF5)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g43890 (AGD11)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g44364 (ADF8)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - -4.26 - - -2.88 2.77
Als_g44763 (LUG)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g44953 (CAC2)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g46168 (VPS60.1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g46703 (SD2-5)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g48105 (CHIA)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g48868 (SRC2)
- - - - - - 2.81
Als_g48964 (SSL5)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g49221 (mtHsc70-1)
-5.09 -4.26 - - - - 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - -1.39 2.73
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-1.63 -1.47 -2.41 -1.77 -4.96 -2.47 2.49
-7.53 - - - - -4.23 2.8
- - - - - - 2.81
Als_g50966 (SCPL34)
- - - - - - 2.81
Als_g50969 (XSP1)
- - - - - - 2.81
Als_g51164 (RSH2)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -5.73 - - - - 2.8
- -7.45 -6.15 -5.63 -4.36 -2.46 2.75
Als_g52377 (XTR2)
- -4.81 -6.95 - - -2.31 2.76
Als_g52415 (NQR)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -4.69 - -5.77 - - 2.8

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.