Heatmap: Cluster_229 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g006480.3.1 (Solyc01g006480.3)
-0.47 0.76 0.18 0.1 -0.87 -0.54 0.83 -0.19 0.19 0.21 0.5 0.23 0.62 0.52 0.08 0.04 -0.27 -5.4 -6.23 -0.15 -0.18 0.03 0.18 0.04 -0.08 -0.29 0.43 0.15 -0.01 0.07 0.22 -0.14 -1.66 0.08
Solyc01g010820.3.1 (Solyc01g010820.3)
-0.25 0.0 -0.4 -0.39 0.26 0.06 0.87 -0.26 -0.31 0.06 0.12 -0.27 0.57 0.17 0.15 0.09 0.01 -3.1 -2.58 -0.31 0.04 0.06 0.22 0.08 -0.14 0.34 0.39 0.24 0.18 0.13 0.22 -0.01 -0.86 0.28
Solyc01g056625.1.1 (Solyc01g056625.1)
0.55 -0.33 -1.4 -1.2 -0.38 -0.63 1.03 -0.61 0.16 0.01 0.66 0.13 0.91 0.5 -0.01 -0.09 -0.16 -9.3 -9.09 -0.03 0.28 0.32 0.06 0.13 -0.0 0.34 -0.07 0.04 0.01 0.27 0.33 0.4 -3.11 0.22
Solyc01g073940.3.1 (Solyc01g073940.3)
-0.65 -0.98 -1.61 0.07 -0.7 -0.54 1.68 -0.48 0.08 -0.16 -0.56 -0.89 0.42 -0.25 -0.07 -0.07 -0.38 -4.25 -2.65 0.16 -0.11 0.57 0.14 0.39 0.41 0.61 0.18 0.49 0.46 0.74 0.58 0.4 -2.1 -0.75
Solyc01g080880.3.1 (Solyc01g080880.3)
0.0 1.01 -1.55 0.41 -0.35 -0.15 1.38 -0.64 0.48 -0.19 -0.17 -0.71 0.13 -0.41 -0.29 -1.21 -0.81 -8.92 -11.62 -0.5 -0.4 0.31 -0.05 0.11 0.2 0.4 0.37 0.36 0.4 0.36 0.31 0.56 -1.06 0.45
Solyc01g088240.3.1 (Solyc01g088240.3)
-0.29 -0.54 -0.12 -0.63 -1.16 -0.09 1.6 -0.54 0.17 0.91 -0.35 -0.86 0.35 -0.14 0.45 0.22 0.02 -6.14 -5.81 0.62 -0.02 -0.17 -0.46 -0.29 -0.13 1.29 0.09 0.23 0.04 -0.03 -0.1 0.07 -1.21 -0.46
Solyc01g088245.1.1 (Solyc01g088245.1)
-0.5 -1.15 -0.35 -1.03 -0.98 -0.46 1.63 -0.59 -0.27 0.3 -0.4 -1.12 0.41 -0.43 0.29 -0.05 -0.06 -7.0 -6.79 0.68 0.51 -0.02 -0.18 -0.13 0.05 1.23 0.5 0.53 0.61 0.17 0.12 0.15 -1.58 -0.25
Solyc01g090290.3.1 (Solyc01g090290.3)
-0.23 0.82 0.26 0.33 0.73 -0.35 0.49 -0.32 -0.08 -0.14 0.02 0.07 0.46 0.35 0.14 -0.08 0.03 -4.97 -5.67 -0.06 -0.49 -0.08 -0.02 -0.1 -0.16 0.42 0.14 0.05 0.02 -0.04 0.07 -0.28 -1.6 0.58
Solyc01g091120.3.1 (Solyc01g091120.3)
0.03 -0.14 0.24 -0.32 -0.12 -0.46 1.12 -0.28 0.13 0.12 -0.06 -0.3 0.17 -0.28 0.31 0.29 0.32 -3.83 -4.34 -0.4 -0.61 0.27 0.27 0.13 -0.04 0.09 0.02 0.02 -0.09 0.29 0.33 0.19 -0.4 0.51
Solyc01g097190.3.1 (Solyc01g097190.3)
-0.8 0.99 0.06 -0.46 0.98 -0.85 1.31 -0.74 -0.39 -0.36 0.4 0.33 0.58 0.77 -0.64 -0.3 -0.43 -5.84 -6.43 0.64 0.64 -0.42 -0.02 -0.09 -0.25 0.94 0.06 -0.13 -0.31 -0.4 -0.45 -0.53 -3.82 -0.07
Solyc01g098830.3.1 (Solyc01g098830.3)
0.12 -0.35 -0.44 -0.9 -0.31 -0.37 0.34 -0.73 0.38 0.23 0.49 0.4 1.1 0.81 0.41 0.57 0.46 -3.35 -2.58 0.01 -0.04 -0.21 0.03 -0.31 -0.37 0.69 -0.02 -0.1 -0.17 -0.21 0.02 -0.22 -1.71 -0.07
Solyc01g102750.3.1 (Solyc01g102750.3)
-0.28 -0.19 -0.47 -0.96 1.09 0.28 0.87 -0.11 0.54 0.01 -0.17 -0.33 -0.0 -0.21 -0.41 -0.37 -0.42 - -11.34 0.16 -0.38 0.37 0.29 0.21 0.1 0.16 0.37 0.24 0.1 0.34 0.39 0.17 -0.33 -0.11
Solyc01g105570.3.1 (Solyc01g105570.3)
0.25 0.33 -0.24 -0.88 -1.06 -0.52 0.51 -0.34 0.31 0.38 -0.28 -0.68 0.44 -0.04 0.15 0.17 0.08 - -8.65 -0.56 -0.45 0.33 0.17 0.11 0.18 1.33 0.44 0.37 0.4 0.23 0.38 0.38 -2.48 -0.43
Solyc01g106030.3.1 (Solyc01g106030.3)
0.33 0.19 -0.72 -0.17 -0.06 -0.25 1.35 -0.64 0.03 -0.07 0.11 -0.08 0.71 0.5 0.63 0.46 0.5 -7.83 -7.73 0.26 0.09 -0.22 -0.3 -0.32 -0.34 0.86 -0.23 -0.22 -0.27 -0.17 -0.17 -0.18 -1.67 -0.21
Solyc01g106190.3.1 (Solyc01g106190.3)
-0.29 0.32 -0.72 -0.65 -0.88 -0.28 0.74 -0.16 0.15 0.21 0.03 -0.48 0.7 0.29 0.53 0.02 0.16 -3.79 -1.39 -0.19 -0.18 0.17 0.04 0.17 0.05 0.72 0.24 0.38 0.22 0.31 0.18 0.29 -2.03 -0.54
Solyc01g110020.3.1 (Solyc01g110020.3)
0.24 -2.04 -1.24 -2.48 0.14 -0.47 1.59 -0.71 0.28 0.17 0.33 0.38 0.81 0.64 -1.0 -0.87 -0.83 -8.66 -8.51 -0.02 -0.02 0.39 0.07 0.18 0.18 0.06 0.21 0.31 0.18 0.44 0.49 0.58 -1.01 -0.33
Solyc01g112180.3.1 (Solyc01g112180.3)
0.06 -0.38 -0.28 -0.3 0.18 -0.56 0.96 -0.58 0.39 0.25 -0.14 -0.41 0.35 0.02 0.81 0.79 0.75 -1.18 -0.45 -0.16 -0.73 -0.07 -0.4 -0.4 -0.47 0.38 -0.14 -0.15 -0.17 0.04 0.01 0.01 -0.76 0.01
Solyc02g030450.3.1 (Solyc02g030450.3)
-1.13 -2.06 -1.32 -3.35 0.02 -1.02 1.28 -1.01 0.32 0.74 -0.65 -1.06 1.02 0.7 0.39 0.3 0.35 -9.55 - 0.85 0.5 -0.32 -0.68 -0.62 -0.77 2.13 0.19 0.16 -0.09 -0.2 -0.17 0.15 -4.79 -0.95
Solyc02g038760.3.1 (Solyc02g038760.3)
-3.28 -6.52 -10.53 -9.04 -1.18 -0.49 2.17 -0.37 0.17 -0.21 0.34 0.24 0.56 0.34 -0.07 -0.45 -0.29 -5.26 -4.65 0.1 0.32 0.43 0.28 0.26 0.25 -0.14 0.49 0.55 0.88 0.46 0.48 0.47 -1.15 -2.18
Solyc02g061790.3.1 (Solyc02g061790.3)
-0.46 0.98 -0.84 -0.98 -1.33 -1.17 1.64 -0.17 0.16 -0.41 0.34 0.85 0.5 1.11 -0.58 -0.87 -1.1 -5.74 -7.22 0.33 0.75 0.01 -0.01 -0.15 -0.01 -0.9 0.46 0.23 0.44 0.1 0.05 -0.0 -1.3 -1.34
Solyc02g063290.3.1 (Solyc02g063290.3)
0.35 0.75 -0.17 0.05 1.05 -0.04 1.24 -0.35 0.96 0.71 -0.1 0.25 -0.59 -1.59 -2.35 -2.49 -2.13 -5.7 -4.92 0.05 -0.39 0.27 0.56 0.35 0.45 -0.28 0.19 0.06 0.23 0.12 0.17 0.22 -1.66 -0.76
Solyc02g064580.3.1 (Solyc02g064580.3)
0.24 0.5 -0.88 -0.78 -0.4 -0.13 1.44 -0.18 0.23 0.26 -0.3 -0.6 0.15 -0.02 0.17 0.03 0.09 -6.97 -7.8 -0.42 -0.83 0.17 0.12 0.05 -0.24 0.64 0.58 0.38 0.19 0.27 0.43 0.09 -2.02 0.09
Solyc02g067900.3.1 (Solyc02g067900.3)
-0.53 0.48 0.4 -0.12 -0.32 -0.21 0.67 -0.2 0.5 1.08 -0.17 -0.35 0.13 -0.01 0.4 0.18 0.48 -4.32 -3.81 -0.57 -0.2 -0.1 0.09 0.01 -0.29 0.63 0.24 0.12 -0.08 -0.04 0.18 0.03 -3.28 -0.08
Solyc02g068230.3.1 (Solyc02g068230.3)
-0.28 0.07 0.05 0.14 -0.34 -0.26 0.34 -0.24 0.13 0.14 0.68 0.8 0.7 0.69 0.34 0.29 0.29 -8.84 -9.33 -0.07 -0.06 -0.12 -0.37 -0.16 -0.07 -0.21 -0.32 -0.25 -0.26 -0.04 -0.0 0.02 -0.68 0.42
Solyc02g069120.3.1 (Solyc02g069120.3)
-0.51 1.8 -0.23 -0.22 0.6 -0.58 1.36 0.06 -0.1 -1.13 0.33 0.24 -0.51 0.01 -1.11 -1.81 -1.53 - -10.4 0.32 -0.26 0.12 0.53 0.34 -0.08 0.68 0.44 0.2 -0.04 0.06 0.27 -0.41 -2.53 -0.74
Solyc02g079110.3.1 (Solyc02g079110.3)
0.6 1.29 -0.37 -0.58 -1.17 -0.47 1.41 -0.2 0.35 -0.45 0.28 -0.52 1.41 0.96 0.34 0.13 -0.11 -10.01 -9.29 -0.58 -0.37 -0.48 -0.28 -0.54 -0.6 0.11 0.05 -0.04 -0.19 -0.41 -0.05 -0.56 -2.5 0.29
Solyc02g080140.3.1 (Solyc02g080140.3)
0.63 0.02 0.04 -0.42 -0.28 -0.22 1.02 -0.74 0.35 -0.15 0.81 0.69 1.02 0.98 0.44 0.42 0.59 -3.13 -4.04 -0.18 -0.14 -0.68 -0.69 -0.8 -0.8 -0.07 -0.29 -0.43 -0.25 -0.59 -0.43 -0.39 -1.39 0.42
Solyc02g080430.3.1 (Solyc02g080430.3)
0.54 0.38 -0.63 -0.87 -0.43 -0.33 0.68 -0.23 0.57 0.16 0.13 0.16 0.37 0.46 0.57 0.72 0.45 -1.89 -1.24 -0.24 -1.08 -0.04 -0.07 -0.24 -0.27 0.07 0.11 -0.0 -0.05 0.01 0.17 0.02 -0.9 -0.5
Solyc02g083710.3.1 (Solyc02g083710.3)
-0.17 0.42 0.29 0.55 -0.86 -0.63 0.65 -0.38 -0.46 -0.41 0.41 0.56 0.55 0.77 0.37 0.16 0.3 -5.41 -5.8 0.36 0.19 -0.17 -0.11 -0.1 -0.2 0.39 0.09 0.04 -0.16 -0.12 -0.05 -0.32 -1.6 0.05
Solyc02g084000.3.1 (Solyc02g084000.3)
0.03 -1.57 -1.32 -2.04 -2.58 -1.12 0.9 -0.79 0.79 0.27 0.24 -0.98 0.58 0.14 1.25 1.35 1.28 -3.25 -2.65 -0.01 -0.24 -0.4 -0.2 -0.3 -0.49 0.71 0.3 0.36 0.1 -0.06 -0.01 -0.67 -1.28 -0.15
Solyc02g086670.3.1 (Solyc02g086670.3)
0.44 -1.42 -1.36 -2.49 0.25 -0.26 1.5 -1.39 0.17 0.0 0.59 0.4 0.93 0.73 1.25 1.29 1.06 -7.41 -7.28 0.66 -0.42 -0.92 -0.99 -0.86 -0.97 0.5 -0.48 -0.58 -0.49 -0.86 -0.7 -0.77 -1.67 0.08
Solyc02g087730.3.1 (Solyc02g087730.3)
-0.0 0.36 -0.85 -1.31 -0.06 -0.38 0.89 -0.45 -0.03 0.41 0.4 -0.01 0.87 0.71 0.28 0.37 0.37 -3.62 -5.35 0.68 -0.11 -0.33 -0.28 -0.38 -0.57 0.48 0.12 0.03 -0.17 -0.26 -0.09 -0.16 -2.34 0.68
Solyc02g091330.3.1 (Solyc02g091330.3)
-0.17 0.34 -0.77 -0.99 0.19 -0.29 1.13 -0.54 0.01 0.31 -0.41 -0.85 0.66 0.26 0.69 0.59 0.34 -1.98 -2.31 0.52 -0.09 -0.31 -0.26 -0.36 -0.47 1.37 0.03 -0.17 -0.22 -0.17 -0.16 -0.02 -1.72 -0.31
Solyc02g093390.3.1 (Solyc02g093390.3)
-0.01 0.88 -0.39 -0.08 -0.49 -0.45 0.36 -0.17 0.2 0.16 0.75 0.3 0.85 0.69 0.33 0.51 0.35 -10.2 -10.52 0.03 0.01 -0.45 0.01 -0.27 -0.57 0.49 0.27 -0.01 -0.22 -0.33 -0.17 -0.52 -2.21 -0.05
Solyc03g006460.3.1 (Solyc03g006460.3)
-0.26 0.78 0.33 0.62 -0.06 0.03 0.75 -0.14 0.35 -0.09 -0.32 -0.28 0.01 0.03 0.2 -0.23 -0.18 -5.92 -5.6 -0.25 -0.2 0.19 0.33 0.21 0.13 -0.46 0.37 0.18 0.04 0.13 0.22 0.04 -1.28 0.11
Solyc03g007500.3.1 (Solyc03g007500.3)
0.33 0.52 0.71 0.35 0.63 -0.22 1.06 -0.04 0.55 0.01 0.25 -0.31 -0.07 -0.51 -2.95 -3.79 -3.4 -1.33 -0.37 -0.04 -1.01 0.06 0.37 0.28 0.21 0.33 0.18 0.15 0.11 0.06 0.05 0.01 -1.09 0.07
Solyc03g026350.3.1 (Solyc03g026350.3)
-0.59 -0.09 -0.15 -0.22 -0.3 -0.29 0.93 -0.65 0.08 0.14 0.04 0.21 0.61 0.49 0.17 -0.01 0.14 -3.91 -2.91 -0.31 -0.01 0.13 0.34 0.23 0.09 0.19 0.39 0.33 0.22 0.09 0.1 -0.03 -1.74 0.15
Solyc03g044140.3.1 (Solyc03g044140.3)
-0.16 -0.17 -0.73 -0.48 0.29 -0.32 0.84 -0.3 0.17 -0.16 -0.33 -0.68 -0.48 -0.69 0.1 -0.05 -0.06 -6.9 -6.74 0.07 -0.37 0.49 0.31 0.38 0.31 0.37 0.57 0.5 0.41 0.53 0.49 0.47 -1.03 0.29
Solyc03g051950.3.1 (Solyc03g051950.3)
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Solyc03g063340.3.1 (Solyc03g063340.3)
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Solyc03g082910.3.1 (Solyc03g082910.3)
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Solyc03g114400.3.1 (Solyc03g114400.3)
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Solyc03g118380.2.1 (Solyc03g118380.2)
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Solyc03g119290.3.1 (Solyc03g119290.3)
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Solyc03g120130.3.1 (Solyc03g120130.3)
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Solyc04g051710.2.1 (Solyc04g051710.2)
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Solyc05g008610.3.1 (Solyc05g008610.3)
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Solyc05g053470.3.1 (Solyc05g053470.3)
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Solyc06g009055.1.1 (Solyc06g009055.1)
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Solyc06g053470.3.1 (Solyc06g053470.3)
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Solyc07g042180.3.1 (Solyc07g042180.3)
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Solyc07g062110.3.1 (Solyc07g062110.3)
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Solyc07g062540.3.1 (Solyc07g062540.3)
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Solyc07g062860.3.1 (Solyc07g062860.3)
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Solyc07g064090.3.1 (Solyc07g064090.3)
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Solyc07g064490.3.1 (Solyc07g064490.3)
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Solyc07g065020.3.1 (Solyc07g065020.3)
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Solyc12g014397.1.1 (Solyc12g014397.1)
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-0.85 0.39 -0.85 -1.25 -0.21 -0.54 0.9 -0.18 0.29 -0.28 -0.36 -0.75 0.35 -0.17 -0.12 -0.48 -0.3 -6.9 -7.7 0.19 -0.3 0.39 0.37 0.32 0.2 1.61 0.6 0.52 0.46 0.32 0.36 0.31 -3.56 -0.67
Solyc12g037980.2.1 (Solyc12g037980.2)
-0.43 0.7 -0.53 -0.33 -0.28 -0.4 1.24 -0.14 0.35 0.11 0.08 0.16 0.5 0.56 0.31 0.09 0.07 -8.91 -9.57 -0.24 -0.76 -0.03 0.13 -0.02 -0.36 0.48 0.46 0.25 0.01 0.06 0.22 -0.19 -1.97 -0.07
Solyc12g044860.2.1 (Solyc12g044860.2)
0.01 0.35 -0.27 -0.5 0.31 -0.03 1.28 -0.18 0.17 -0.48 -0.2 -0.12 0.2 0.4 0.37 0.23 0.16 -9.31 -10.87 0.0 -0.23 0.02 0.08 0.01 -0.11 0.34 0.17 0.16 0.15 -0.05 0.01 0.01 -0.89 -0.05
Solyc12g049330.2.1 (Solyc12g049330.2)
0.77 -0.84 0.16 -0.56 -1.31 -0.32 1.08 -0.53 0.31 -0.0 0.43 0.5 0.67 0.47 0.4 0.38 0.43 -2.7 -2.12 -0.36 0.03 -0.08 -0.02 -0.17 -0.3 -0.15 0.1 0.05 -0.09 -0.09 0.07 -0.25 -1.31 -0.0
Solyc12g049570.2.1 (Solyc12g049570.2)
-0.17 0.09 -0.38 -0.27 -0.52 -0.48 0.87 -0.21 0.28 0.2 -0.01 -0.26 0.32 0.02 0.19 -0.03 -0.02 -2.3 -2.03 -0.22 -0.0 0.2 0.16 0.2 0.12 0.6 0.36 0.35 0.21 0.26 0.28 0.18 -1.53 -0.24
Solyc12g056780.2.1 (Solyc12g056780.2)
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Solyc12g094710.2.1 (Solyc12g094710.2)
-1.27 -3.6 -4.41 -4.45 0.05 0.1 1.94 -0.37 0.71 -0.33 0.71 0.48 0.67 0.13 0.26 -0.09 -0.2 -3.94 -6.18 -0.61 -0.13 0.25 0.66 0.24 -0.16 -0.26 0.55 0.28 0.14 0.22 0.5 0.0 -1.18 -1.34
Solyc12g096450.2.1 (Solyc12g096450.2)
0.16 1.63 -0.03 -0.3 0.66 0.14 0.86 -0.15 -0.04 -0.52 0.16 -0.09 0.14 -0.04 -0.19 -0.51 -0.44 -1.7 -2.06 -0.07 -0.16 -0.35 -0.1 -0.14 -0.22 0.21 -0.09 -0.11 -0.15 -0.32 -0.17 -0.29 -0.22 0.4

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.