Heatmap: Cluster_191 (HCCA cluster)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g201060.1.1 (Solyc00g201060.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g020510.1.1 (Solyc01g020510.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g034170.1.1 (Solyc01g034170.1)
- - - - - - - - - - - - - - 4.04 - - - - 3.35 - - - - - - - - - - - - 2.87 -
Solyc01g056640.1.1 (Solyc01g056640.1)
- - - - - 1.3 - - - - - - - - - - - - - - 3.64 - - 0.84 - - - 2.65 2.36 - - 2.55 - -
Solyc01g057117.1.1 (Solyc01g057117.1)
- - - - - 0.07 3.57 - - - - - 3.04 - - - - - - - - - - - - 3.68 - - - - - - - -
Solyc01g058700.1.1 (Solyc01g058700.1)
- - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g066205.1.1 (Solyc01g066205.1)
- - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g066350.1.1 (Solyc01g066350.1)
4.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.84 - - - - - - - - -
Solyc01g086897.1.1 (Solyc01g086897.1)
- - - - - -0.5 - - - - - - 3.74 0.83 - - - - - - - - - -0.58 3.18 - 1.14 1.39 0.29 - - 1.26 - -
Solyc01g098660.2.1 (Solyc01g098660.2)
- - - - 1.84 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.81 - - 2.8 - - 2.51 1.41 3.19 - 1.28 - -
Solyc02g014610.1.1 (Solyc02g014610.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g021362.1.1 (Solyc02g021362.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g030490.2.1 (Solyc02g030490.2)
- - - - - - 0.44 - - - 2.84 - - - - - - - - - - 1.23 2.64 1.86 - - 1.73 0.65 0.83 - 2.73 - - -
Solyc02g055443.1.1 (Solyc02g055443.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc02g090877.1.1 (Solyc02g090877.1)
- - 2.87 2.52 - -0.1 - - 3.17 - - - - - - - 1.92 - - - - - - 0.69 - - - - - - - - - 2.48
Solyc03g007930.3.1 (Solyc03g007930.3)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - -
Solyc03g026377.1.1 (Solyc03g026377.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.98 - - 1.75 - 1.61 1.06 - - - 2.98 3.97 -
Solyc03g043790.1.1 (Solyc03g043790.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.77 - - - 4.12 3.29 - - - - -
Solyc03g046205.1.1 (Solyc03g046205.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.85 3.42 - - - - - 4.01
Solyc03g096110.2.1 (Solyc03g096110.2)
3.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.48 - 3.07 - - - - -
Solyc04g007040.2.1 (Solyc04g007040.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g026170.2.1 (Solyc04g026170.2)
- - - - - - - 4.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.85 - - - - - 3.48
Solyc04g049000.2.1 (Solyc04g049000.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g049003.1.1 (Solyc04g049003.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g056735.1.1 (Solyc04g056735.1)
4.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.52 - - - - - - - 1.54 - - - - -
Solyc04g071133.1.1 (Solyc04g071133.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g071200.2.1 (Solyc04g071200.2)
- - - - - -1.61 - 1.6 - - - - 2.0 1.48 3.39 - 1.96 - - - - - - - - - - 0.55 3.0 - - - - -
Solyc05g013465.1.1 (Solyc05g013465.1)
0.31 4.3 - 2.59 - - -0.97 - - - - - - - - - - 1.63 - - - - - - - - - -1.31 -1.02 - - - - 1.32
Solyc05g015864.1.1 (Solyc05g015864.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g016420.1.1 (Solyc05g016420.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g026313.1.1 (Solyc05g026313.1)
- - - - - - - - - - 3.09 - - - - - - - - - - - - 0.09 - - 1.06 2.73 3.98 - - - - -
Solyc05g032780.1.1 (Solyc05g032780.1)
3.03 - - - - - - - - - - - 4.13 - - - - - - - - - - - 1.45 - - 0.96 1.87 - - - - -
Solyc05g045920.1.1 (Solyc05g045920.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g055585.1.1 (Solyc05g055585.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g009570.1.1 (Solyc06g009570.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc06g009930.1.1 (Solyc06g009930.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.7 - - 2.64 - 1.6 2.06 3.03 2.56 - - - -
Solyc06g010110.1.1 (Solyc06g010110.1)
- - - - - - 4.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.65 - - - - - -
Solyc06g011297.1.1 (Solyc06g011297.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g024200.1.1 (Solyc06g024200.1)
- -0.55 - - -1.18 -2.26 - - 2.04 - - - - - -0.77 - - - - 3.81 -0.65 -0.28 0.59 -0.57 -0.91 - 1.24 -1.32 0.2 - -0.51 2.09 - -0.12
Solyc06g031665.1.1 (Solyc06g031665.1)
- - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g033786.1.1 (Solyc06g033786.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc06g036673.1.1 (Solyc06g036673.1)
- 0.13 0.49 - - 0.26 -0.79 0.12 2.3 - 1.3 1.66 1.22 0.08 - - 0.94 1.73 - - 1.85 -0.43 0.53 -0.22 - - - 0.55 -0.39 - -0.71 - - -
Solyc06g036675.1.1 (Solyc06g036675.1)
- - - - -1.31 -0.81 0.11 - 2.39 - 1.64 -0.09 1.87 2.45 - - 1.96 -0.84 - - - - -0.62 0.17 -1.5 - -0.8 0.15 -1.78 1.28 1.34 - - -
Solyc06g048375.1.1 (Solyc06g048375.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g018142.1.1 (Solyc07g018142.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - -
Solyc07g020920.1.1 (Solyc07g020920.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g021140.1.1 (Solyc07g021140.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g021152.1.1 (Solyc07g021152.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g021345.1.1 (Solyc07g021345.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g026800.1.1 (Solyc07g026800.1)
- - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - 1.67 - - - - - - - - - -
Solyc07g032497.1.1 (Solyc07g032497.1)
- - - - - - - - - - - - - - 0.54 -0.62 0.92 - - - - 2.7 - 0.62 0.86 - - 1.04 1.29 2.92 2.74 0.5 - -
Solyc07g032787.1.1 (Solyc07g032787.1)
- - - - - - - - - - 2.81 - - - 3.18 - 2.56 - - - - - - - - - - 1.52 2.24 - - 2.15 - -
Solyc07g039381.1.1 (Solyc07g039381.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g061985.1.1 (Solyc08g061985.1)
- - - - 3.18 - - - - - - 3.68 - - - - - - - - - - - - 3.1 - - 1.82 - - - - - -
Solyc08g081110.2.1 (Solyc08g081110.2)
- - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g007610.2.1 (Solyc09g007610.2)
- 1.32 -0.89 1.22 - - -1.38 - 0.29 - - - - - - - - - - -2.27 -4.58 2.19 0.72 0.97 1.75 - 0.75 1.19 0.79 2.06 1.81 0.92 - -
Solyc09g014830.2.1 (Solyc09g014830.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g031524.1.1 (Solyc09g031524.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g031655.1.1 (Solyc09g031655.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g055150.2.1 (Solyc09g055150.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - -
Solyc09g055885.1.1 (Solyc09g055885.1)
- - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g059840.1.1 (Solyc09g059840.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g066230.1.1 (Solyc09g066230.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.71 - - - - 2.61 2.24 3.07 - - 3.04 - -
Solyc09g098035.1.1 (Solyc09g098035.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g012245.1.1 (Solyc10g012245.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.42 2.42 - 4.16 - - - -
Solyc10g012257.1.1 (Solyc10g012257.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.67 3.63 - 3.15 - - -
Solyc10g012320.2.1 (Solyc10g012320.2)
- - - - - - - - 1.11 - - - - - - - - - - 4.85 - - - -1.26 - - 0.14 -0.41 -0.32 - - - - -
Solyc10g017790.1.1 (Solyc10g017790.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.09 - 2.25 3.12 - - - - - 3.59 - - -
Solyc10g026525.1.1 (Solyc10g026525.1)
- - - - - - 4.3 - 1.74 - - - - - - - - - 1.53 - - - - - - - 1.56 - 1.56 - 1.15 - - -
Solyc10g045510.1.1 (Solyc10g045510.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g046995.1.1 (Solyc10g046995.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g047100.1.1 (Solyc10g047100.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g054120.1.1 (Solyc10g054120.1)
- - - - 4.36 - - - 3.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g054975.1.1 (Solyc10g054975.1)
- - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g062000.1.1 (Solyc10g062000.1)
- - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g062050.1.1 (Solyc10g062050.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g062070.1.1 (Solyc10g062070.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g076430.1.1 (Solyc10g076430.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g008190.1.1 (Solyc11g008190.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g028103.1.1 (Solyc11g028103.1)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g061710.1.1 (Solyc11g061710.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.06 2.56 - - 0.44 - - - 2.2 3.85 - 1.82 - - -
Solyc12g015935.1.1 (Solyc12g015935.1)
- - - - - - - - - - - - - 3.89 - - - - - - - - - - - - - 2.67 - - - 3.67 - -
Solyc12g019753.1.1 (Solyc12g019753.1)
- - - - - - - - 3.31 - - - - - - - - 3.26 - - - - - - 2.52 - - 2.03 2.23 - - - - -
Solyc12g036590.1.1 (Solyc12g036590.1)
- - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g040537.1.1 (Solyc12g040537.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g088665.1.1 (Solyc12g088665.1)
1.12 1.24 2.48 - - 2.2 - - - - - - - - 1.02 2.69 3.43 - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.