Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
0.13 0.31 0.0 0.0 0.0 24.61 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 32.26 0.0
0.03 0.03 0.11 0.11 0.0 24.13 2.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.58 0.76
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.27 0.1
Als_g02646 (RABA5b)
0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 16.36 0.0
0.1 0.06 0.05 0.14 0.07 2.13 0.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.64 1.01
0.15 0.48 0.45 0.69 0.22 21.07 2.71
0.04 0.19 0.32 0.0 0.0 28.09 0.23
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 27.79 1.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.85 0.0
0.17 0.02 0.01 0.03 0.06 15.57 0.07
Als_g04771 (EXL7)
0.03 0.01 0.03 0.08 0.0 17.33 0.12
Als_g04938 (FT1)
0.1 0.15 0.02 0.03 0.06 3.23 0.47
0.03 0.01 0.15 0.0 0.19 51.39 0.03
0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 8.52 0.34
Als_g05300 (RNR2)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 7.49 2.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.36 0.75
2.11 2.23 1.99 2.88 1.23 39.66 9.44
Als_g05654 (SLP)
2.03 1.75 1.13 1.41 1.02 13.59 3.59
0.07 0.11 0.04 0.05 0.04 3.16 0.74
0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 115.76 2.01
0.06 0.14 0.27 0.18 0.28 25.23 1.18
0.24 0.2 0.0 0.03 0.0 16.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.17 0.08
0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 4.28 0.08
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 3.84 0.32
0.23 0.11 0.15 0.15 0.05 5.04 1.11
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 8.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.21 0.18
Als_g07510 (PGP11)
0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 4.35 0.03
Als_g07620 (RPA2)
0.63 0.03 0.52 0.33 0.85 13.51 2.22
0.11 0.11 0.01 0.03 0.0 93.93 5.08
0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 10.42 0.04
1.42 2.11 1.32 1.19 1.33 36.48 7.11
Als_g08049 (FRO6)
0.15 0.02 0.04 0.06 0.07 9.53 0.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.47 0.19
Als_g08204 (MAP65-1)
0.01 0.06 0.05 0.13 0.02 198.38 16.03
0.05 0.09 0.48 0.73 0.3 24.73 4.24
0.0 0.06 0.0 0.03 0.02 50.81 2.0
0.94 0.44 0.31 0.21 0.07 12.33 2.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 2.78 0.29
0.0 0.08 0.01 0.0 0.0 5.35 0.12
Als_g08989 (CAD9)
6.22 15.96 2.17 4.12 3.18 216.15 57.9
0.02 0.39 0.07 0.17 0.22 32.28 1.87
0.53 0.45 8.31 7.24 5.8 147.94 15.44
0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 117.88 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 5.38 0.0
Als_g10034 (PA2)
1.38 1.66 0.02 0.4 0.27 138.53 8.66
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 209.47 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 10.91 0.24
0.21 1.55 1.23 0.48 17.34 3122.3 388.99
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 2.48 0.06
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 2.54 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.84 0.14
0.11 0.0 0.62 0.21 0.13 53.17 6.12
0.25 0.2 0.0 0.27 0.06 5.68 0.5
0.22 0.43 0.0 0.0 0.0 35.31 0.11
1.03 0.75 0.5 1.2 0.26 688.08 9.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 18.83 4.37
0.0 0.0 0.14 0.18 0.0 7.84 0.9
Als_g12082 (CYCD1;1)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 11.92 0.66
0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 5.65 0.9
Als_g12357 (KT1)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 74.4 1.25
Als_g12763 (DSO)
0.01 0.0 0.04 0.03 0.04 6.32 0.04
0.12 0.05 0.0 0.0 0.0 4.34 0.63
0.71 0.8 1.06 0.83 1.44 29.08 1.96
Als_g13323 (FPF1)
0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 24.36 0.09
0.0 0.28 0.03 0.31 0.1 83.71 0.0
0.0 0.02 0.08 0.23 0.0 8.29 0.82
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.51 0.06
0.28 0.06 0.09 0.05 0.12 10.3 1.02
0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 29.94 0.05
0.31 0.33 0.32 0.15 0.56 24.54 0.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.56 0.09
Als_g14694 (AHA10)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.25 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 18.79 0.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.03 0.37
0.18 0.43 2.15 0.86 3.01 29.97 2.76
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.93 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 23.32 0.13
Als_g14984 (MPK9)
1.17 0.77 0.56 0.56 1.03 20.5 4.31
0.07 0.15 0.1 0.43 0.08 40.07 0.0
0.2 0.0 0.06 0.0 0.26 104.97 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.39 0.09
Als_g16130 (MRP6)
0.17 0.17 0.19 0.31 0.16 62.59 2.79
0.0 0.0 0.17 0.09 0.12 3.93 0.19
Als_g21898 (RLP44)
0.5 0.23 0.73 1.12 1.0 21.7 5.04
0.29 0.58 0.0 0.58 0.0 26.41 0.5
0.44 0.58 0.0 0.0 0.0 8.74 2.04
0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 18.33 0.12
0.17 0.0 0.18 0.01 0.28 10.45 1.36
0.2 0.05 0.16 0.5 0.5 6.74 0.68
Als_g31036 (CAD1)
23.74 78.92 6.25 15.96 20.27 953.54 253.89
0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 10.66 0.0
0.53 0.13 0.0 0.59 0.0 12.19 3.92
0.0 0.0 0.19 0.0 2.26 43.57 0.63
Als_g40616 (AGO1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 28.91 1.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.76 0.1
Als_g41650 (PNH)
0.0 0.0 0.08 0.07 0.0 19.38 0.24
0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 5.03 0.48
0.0 0.0 0.0 0.11 0.27 15.03 0.82
0.0 0.05 0.02 0.0 0.13 3.59 0.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 6.38 0.44
Als_g44520 (RLK4)
0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 15.64 1.65
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 43.17 2.85
0.01 0.02 0.08 0.02 0.07 27.44 1.85
0.39 0.68 0.1 0.63 0.13 27.88 1.18
Als_g52203 (EXP15)
0.0 0.19 0.0 0.04 0.0 57.13 2.07
Als_g52923 (IBO1)
0.16 0.13 0.77 0.26 0.62 71.97 13.49
0.12 0.28 0.01 0.02 0.07 10.24 0.93
0.55 0.62 1.44 1.39 0.82 59.58 7.39
0.7 0.3 2.89 3.79 0.96 39.61 3.34
0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 4.12 0.29

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)