Heatmap: Cluster_92 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
- - - - - -4.41 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - -4.74 - - 2.8
- - - - - - 2.81
Als_g35593 (GEK1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g38414 (SUS4)
- - - - - - 2.81
-8.91 -7.23 -2.65 - -3.58 -4.59 2.75
- - - - - - 2.81
Als_g38784 (UGT88A1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g38863 (HTA10)
- - - -3.5 - - 2.79
-2.1 - - - - - 2.76
Als_g39577 (SKIP)
- - - - - - 2.81
Als_g39667 (UBQ11)
-3.9 -4.68 - -1.41 -4.91 - 2.7
- - - -1.36 - - 2.72
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -4.28 - - - - 2.8
-3.0 - - -1.4 - - 2.7
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g41120 (CPN10)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g41690 (RKP)
- - - - - - 2.81
- - - -2.35 - - 2.77
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -4.29 - -4.37 - - 2.79
- - - - - - 2.81
- -2.44 - - - - 2.77
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g42613 (PIP1C)
- -5.1 - - -3.66 - 2.78
Als_g42628 (TCTP)
- - - - - - 2.81
Als_g42698 (LSH6)
- - - - - - 2.81
-3.28 - - - -3.16 - 2.76
Als_g42863 (RAN2)
-2.93 - - - - - 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g43060 (ACT11)
- - - -3.6 - - 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -4.3 - -2.61 -3.79 - 2.75
-2.98 - - -2.85 - - 2.75
- - - - - - 2.81
Als_g44075 (ckl7)
- - - - - - 2.81
Als_g44077 (VAMP725)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g44781 (PPOX)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -5.77 - -5.28 - - 2.8
Als_g45416 (PIP2B)
- - -3.34 - - - 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g46140 (TCTP)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - -3.13 - - 2.78
- - -4.34 -1.32 - - 2.71
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g46856 (RAB1C)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-5.39 -5.49 - - - - 2.8
- - - - - - 2.81
Als_g47356 (CAL)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g47939 (ADF7)
- - - - - - 2.81
- -2.43 -4.08 - - - 2.76
- - - - - - 2.81
Als_g48738 (ARA3)
-2.87 -4.64 - - - - 2.77
- - - - - - 2.81
- -4.08 - -2.57 - - 2.76
Als_g49248 (ADH)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g50655 (ACT11)
-3.32 -2.48 - - - - 2.75
Als_g50656 (ACT11)
-5.0 -4.73 - -4.03 - - 2.78
- - - - - - 2.81
- -3.3 - - - - 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g51384 (CCD8)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g52408 (CBL10)
- - - - - - 2.81
-5.44 - - -4.29 - - 2.79
- -4.03 - - - - 2.79
- - - - - - 2.81
- - -3.23 -1.74 - - 2.72

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.