Heatmap: Cluster_298 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g005370.3.1 (Solyc01g005370.3)
-0.58 -1.41 2.01 1.0 1.31 -1.8 -3.02 -4.4 -0.52 -0.07 -0.26 1.0 -0.62 -0.45 -0.89 -0.77 -0.85 -4.61 -4.88 1.88 0.81 -1.05 -1.17 -1.31 -1.22 2.54 -2.4 -1.44 -0.75 -1.26 -1.31 -0.8 -2.89 -0.58
Solyc01g086995.1.1 (Solyc01g086995.1)
0.73 -0.7 0.99 0.69 0.08 -1.23 0.05 -1.35 1.28 0.14 -0.55 -0.98 0.23 -1.23 0.5 0.39 0.16 -3.46 -1.26 -0.52 -0.03 -0.13 -0.85 -0.53 -0.57 0.2 -0.43 -0.18 -0.19 -0.31 0.22 0.27 -5.51 1.69
Solyc01g087000.3.1 (Solyc01g087000.3)
1.4 -0.66 1.68 1.15 -1.04 -1.67 0.37 -1.23 0.86 -0.37 -0.31 -1.52 0.09 -1.4 0.42 0.5 -0.16 -3.5 -1.79 -0.25 0.43 -0.29 -1.01 -1.29 -0.46 -0.08 -0.97 -0.33 -0.15 -0.01 -0.16 0.5 -4.9 1.3
Solyc01g096350.3.1 (Solyc01g096350.3)
0.89 -0.54 1.31 0.01 -0.39 -0.75 0.5 -1.24 -0.35 -0.08 -0.34 -0.67 0.35 0.16 -0.41 -0.61 -0.46 -8.66 -9.56 0.81 0.21 -0.18 0.07 0.16 -0.09 1.12 0.29 0.29 -0.05 -0.01 -0.09 -0.25 -2.63 0.74
Solyc01g100050.3.1 (Solyc01g100050.3)
0.39 -0.85 -1.33 -1.41 -0.97 -0.29 -0.15 -1.26 -0.1 0.5 -0.29 -0.92 0.75 0.16 0.47 0.49 0.42 -5.62 -8.6 0.27 -0.33 0.06 -0.29 0.1 -0.1 1.9 0.35 0.55 0.32 0.21 0.04 0.15 -2.4 0.01
Solyc01g104240.3.1 (Solyc01g104240.3)
1.35 -0.4 0.25 -0.08 -0.66 -0.79 -0.03 -1.08 -0.22 0.25 -0.76 -0.8 0.09 0.52 0.14 0.52 0.19 -7.44 -8.09 0.28 -0.13 -0.31 -0.51 -0.33 -0.51 0.73 -0.47 -0.21 -0.18 -0.32 -0.27 0.08 -2.59 2.14
Solyc01g105940.3.1 (Solyc01g105940.3)
1.58 -2.94 -0.59 -2.38 0.23 -0.34 -0.38 -1.75 -0.83 0.15 -0.79 -1.11 0.21 -1.04 0.7 1.25 1.13 -0.51 -0.73 0.14 0.12 -0.17 -1.1 -0.51 -0.05 -1.17 -0.93 -0.62 -0.25 -0.15 -0.2 0.74 -2.05 1.92
Solyc01g106080.3.1 (Solyc01g106080.3)
0.76 -0.09 0.76 1.09 0.2 -0.58 -0.26 -1.02 -0.13 0.05 -0.35 -0.9 0.28 -0.41 0.48 0.65 0.56 -7.2 -7.71 0.43 -0.14 -0.18 -0.45 -0.24 -0.23 0.96 -0.03 -0.0 -0.13 -0.17 -0.16 -0.17 -2.22 0.5
Solyc02g085640.3.1 (Solyc02g085640.3)
0.85 0.74 1.17 1.0 -0.32 -0.42 0.58 -1.2 -0.56 0.4 -0.33 -0.96 0.23 -0.51 0.34 0.5 0.48 -4.65 -4.67 -0.76 -0.94 -0.03 -0.36 -0.37 -0.14 -0.09 -0.02 -0.12 0.05 -0.01 0.11 0.28 -3.06 0.7
Solyc02g088300.3.1 (Solyc02g088300.3)
1.09 -0.24 0.57 0.04 -0.83 -0.95 0.14 -0.84 0.25 0.31 -0.27 -1.01 0.11 -0.58 -0.17 -0.37 -0.28 -6.88 -6.81 -0.14 -0.39 0.36 0.2 0.19 0.03 0.95 0.16 0.25 0.26 0.41 0.42 0.57 -3.36 0.86
Solyc03g046203.1.1 (Solyc03g046203.1)
1.29 -1.42 0.8 0.58 -1.41 -1.62 -1.1 -2.88 0.6 1.04 -0.53 -0.76 0.35 -0.5 0.39 0.94 0.61 -6.92 -6.74 -0.23 -0.1 0.2 -0.72 -0.34 -0.14 0.83 -0.34 -0.04 -0.06 0.06 0.14 0.59 -3.94 0.66
Solyc03g063880.3.1 (Solyc03g063880.3)
0.65 -0.02 0.25 0.88 -0.01 -0.59 0.87 -0.6 -0.24 -0.2 -0.61 -0.82 -0.39 -0.42 0.56 0.34 0.43 -3.21 -4.23 -0.13 -0.46 -0.06 0.08 0.08 0.0 0.25 0.14 0.09 0.09 0.06 0.06 0.07 -0.99 0.83
Solyc03g080140.3.1 (Solyc03g080140.3)
1.1 -1.59 0.11 -1.18 -0.05 -0.57 0.2 -1.52 0.02 0.68 -0.1 -0.59 0.27 -0.64 0.26 0.35 0.35 -10.53 -11.18 0.08 0.55 0.02 -0.54 -0.22 -0.13 1.33 -0.11 0.17 -0.01 0.03 -0.0 0.46 -2.71 0.99
Solyc03g083330.3.1 (Solyc03g083330.3)
0.74 -0.04 1.01 0.83 0.17 -0.16 -0.19 -0.97 0.28 0.15 -0.15 -0.29 0.2 -0.61 -0.31 -0.29 0.06 -3.58 -3.4 0.5 0.52 -0.29 -0.19 -0.23 -0.26 1.08 -0.9 -0.88 -0.79 -0.56 -0.43 -0.1 -1.91 1.5
Solyc03g095450.3.1 (Solyc03g095450.3)
1.0 0.35 1.35 0.19 -1.01 -0.34 -0.01 -0.13 0.21 0.36 -0.26 -0.04 -0.05 0.11 0.09 -0.17 0.01 -5.74 -7.74 0.27 0.29 -0.53 -0.7 -0.5 -0.67 0.28 -0.01 0.19 0.42 -0.34 -0.35 -0.5 -0.86 0.98
Solyc03g116750.3.1 (Solyc03g116750.3)
0.75 -0.73 0.37 0.6 -0.75 -1.42 0.75 -1.82 -0.04 -0.03 -0.62 -0.86 0.51 0.15 0.78 0.75 0.77 -5.33 -5.27 -0.02 0.15 -0.39 -0.92 -0.59 -0.36 0.89 0.02 0.21 0.46 -0.07 -0.23 0.38 -4.21 0.78
Solyc03g119720.3.1 (Solyc03g119720.3)
0.29 -1.53 0.43 -0.11 0.58 -0.59 -0.11 -1.48 -0.71 0.05 -1.52 0.42 -0.65 -0.12 -0.44 -0.55 -0.36 -0.67 -1.27 0.17 -0.43 0.34 -0.2 -0.06 0.01 1.31 0.67 0.52 0.65 0.36 0.17 0.64 -1.78 0.35
Solyc03g119920.1.1 (Solyc03g119920.1)
1.2 0.09 0.89 1.09 0.63 -0.55 0.35 -1.0 -0.84 -0.1 -0.41 -1.01 -0.17 -0.85 -1.42 -2.29 -2.02 - -7.08 -0.48 0.15 0.35 0.11 0.25 0.31 -0.2 0.37 0.57 0.56 0.38 0.21 0.21 -1.14 0.87
Solyc03g121210.3.1 (Solyc03g121210.3)
1.02 0.16 0.57 0.4 -1.12 -1.26 0.01 -1.29 -0.17 -0.45 -0.38 -0.18 0.44 0.48 0.27 0.46 0.37 -6.83 -6.88 0.28 -0.16 -0.02 0.14 0.07 -0.08 0.77 0.2 0.01 0.0 0.03 0.08 0.12 -2.56 0.52
Solyc03g121700.3.1 (Solyc03g121700.3)
0.27 0.02 -0.18 -0.75 1.2 -0.25 0.46 -0.84 0.12 -0.85 0.25 -0.24 0.49 0.3 -1.0 -1.13 -1.11 -2.16 -3.3 0.55 0.61 0.05 -0.08 0.11 0.19 0.87 0.03 0.21 0.12 0.01 0.06 0.02 -1.71 0.61
Solyc03g122240.3.1 (Solyc03g122240.3)
0.9 0.49 0.09 0.66 0.15 -0.52 0.23 -1.39 -0.36 -0.47 -0.2 -0.32 -0.21 -0.45 0.03 0.3 0.18 -6.71 -7.61 0.1 -0.45 0.09 -0.03 0.07 -0.06 0.77 -0.26 -0.07 0.05 0.05 0.08 0.13 -1.71 1.41
Solyc04g007460.3.1 (Solyc04g007460.3)
2.05 -3.23 1.35 -0.16 -0.19 -0.78 -1.73 -1.9 -1.22 -0.09 -0.69 -1.11 0.76 -0.22 -0.38 -0.01 -0.33 -1.15 -0.73 0.26 0.84 -0.46 -1.02 -0.22 0.1 0.46 -1.09 -0.68 -0.47 -0.6 -0.61 -0.12 -1.54 1.91
Solyc04g049010.3.1 (Solyc04g049010.3)
0.38 -0.93 -1.07 -1.05 -0.26 -0.61 -0.1 -1.06 0.18 0.4 0.23 -0.5 1.07 0.19 0.25 0.22 0.14 -1.84 -0.26 0.58 0.61 -0.16 -0.4 -0.28 -0.29 1.66 -0.33 -0.17 -0.22 -0.15 -0.17 0.28 -3.1 0.04
Solyc04g071440.3.1 (Solyc04g071440.3)
0.8 -1.37 0.57 -0.99 -1.01 -0.91 0.57 -1.1 -0.22 -0.42 -0.02 -0.47 0.57 0.26 0.48 0.87 0.33 -6.04 -6.07 -0.83 -0.56 0.26 0.43 0.49 0.45 -0.25 0.21 0.22 0.06 0.2 0.29 -0.11 -1.31 0.95
Solyc04g077925.1.1 (Solyc04g077925.1)
-0.22 -0.34 -1.18 -0.59 -1.99 -0.63 0.09 -0.62 -0.02 -0.04 -0.59 -1.07 0.38 -0.44 0.58 0.01 0.41 -3.28 -3.31 -0.23 0.34 -0.14 0.27 0.29 -0.05 2.22 0.41 0.46 0.42 -0.12 -0.11 0.3 -2.26 0.09
Solyc04g077930.3.1 (Solyc04g077930.3)
-0.37 -0.41 -1.42 -0.61 -1.55 -0.66 0.04 -0.63 -0.11 0.05 0.26 -0.01 0.9 0.79 -0.27 -0.19 0.14 -5.93 -5.28 0.27 0.76 -0.2 -0.04 0.04 -0.21 2.01 0.23 0.28 0.33 -0.3 -0.38 0.19 -2.69 0.03
Solyc04g080250.3.1 (Solyc04g080250.3)
1.96 -5.3 1.03 -3.07 -1.15 -4.43 -8.9 -3.38 -6.02 -3.79 - -7.17 -6.88 -6.54 -7.26 - - - - 2.47 -4.39 -5.23 -6.62 -5.59 -5.05 3.89 -5.79 -4.59 -3.55 -4.52 -5.09 -5.77 -7.6 2.69
Solyc05g012260.3.1 (Solyc05g012260.3)
1.03 0.24 0.84 0.58 -0.27 -0.95 -0.23 -0.77 -0.41 -0.53 -0.09 -0.59 0.17 -0.16 0.03 0.18 0.18 -1.61 -3.75 -0.59 0.39 0.13 -0.37 -0.08 0.01 -0.45 0.12 0.31 0.37 0.21 0.13 0.39 -1.76 0.96
Solyc05g015860.3.1 (Solyc05g015860.3)
1.13 -1.03 -0.43 -0.11 -0.62 -1.71 -0.1 -2.05 0.07 0.46 0.21 -0.24 0.46 0.37 -0.11 0.02 0.38 -5.54 -5.99 0.82 0.33 -0.04 -0.24 0.02 -0.03 1.09 0.11 0.24 0.37 -0.05 0.02 -0.03 -3.97 0.68
Solyc05g015861.1.1 (Solyc05g015861.1)
0.46 -0.71 0.28 0.32 -0.86 -1.43 0.2 -1.65 -0.03 0.81 -0.43 -0.76 -0.25 -0.26 0.49 0.56 0.94 -4.61 -5.52 0.32 -0.05 -0.01 -0.09 -0.05 0.0 1.32 0.22 0.22 0.35 0.03 0.04 0.12 -3.85 0.19
Solyc05g024415.1.1 (Solyc05g024415.1)
-0.71 -0.39 0.44 0.09 -1.03 -1.64 -0.76 -2.44 -1.52 -1.46 -0.69 -1.06 -2.38 -2.56 -0.5 -1.26 -0.91 -11.76 - 1.63 0.69 0.45 -0.77 0.28 0.62 1.51 0.17 1.19 1.4 0.62 0.32 0.64 -1.97 0.92
Solyc06g005080.3.1 (Solyc06g005080.3)
0.77 -0.48 0.1 -0.19 -0.37 -0.76 0.35 -0.62 -0.85 0.21 -0.19 -0.61 0.34 -0.09 0.27 0.14 0.14 -2.59 -2.28 0.02 -0.04 -0.05 -0.02 0.01 -0.12 1.73 0.09 0.1 -0.16 0.03 0.03 0.27 -2.59 0.56
Solyc06g036250.1.1 (Solyc06g036250.1)
- - - - 4.14 1.77 - - -7.01 -3.53 - -7.62 -4.29 -4.98 -6.34 -5.9 -4.94 -6.96 -6.03 2.21 0.22 -7.15 - -7.45 -4.64 2.62 -7.8 -3.22 -1.47 -5.13 -6.66 -3.31 - -
Solyc06g073970.2.1 (Solyc06g073970.2)
0.91 -1.55 0.81 -1.18 -0.68 -1.52 -0.41 -1.21 -0.26 -0.07 -0.68 -0.77 -1.17 -1.21 0.4 0.42 0.35 -10.25 -10.85 -0.06 0.62 0.73 0.62 0.83 0.75 0.59 -0.16 0.14 0.18 0.19 0.33 0.71 -0.81 0.31
Solyc07g042550.3.1 (Solyc07g042550.3)
2.89 0.71 0.91 -1.15 0.33 -1.26 -3.3 -5.06 -3.22 -1.38 0.64 1.46 -0.44 0.33 -2.4 -1.91 -2.03 -10.43 -9.08 -0.66 -0.88 0.12 -2.47 -1.02 -0.23 0.13 -3.53 -1.29 -1.12 0.24 -0.24 0.94 -4.42 1.8
Solyc07g054440.3.1 (Solyc07g054440.3)
0.24 0.36 1.04 0.61 -0.99 -0.8 0.66 -0.91 -0.68 0.04 -0.45 -0.77 0.15 0.27 0.32 0.67 0.49 -9.19 -10.87 -0.2 -0.6 -0.11 0.01 0.05 -0.22 1.02 -0.14 -0.18 -0.07 -0.18 -0.04 -0.09 -2.74 1.12
Solyc07g062450.3.1 (Solyc07g062450.3)
0.42 0.46 0.92 1.47 -1.71 -1.25 0.49 -0.64 -0.25 -0.12 -0.58 -0.55 0.12 0.12 0.57 0.45 0.37 -4.22 -3.51 -0.3 -0.11 0.03 -0.02 0.02 0.07 -0.44 0.19 0.06 0.03 0.03 0.12 0.1 -2.26 0.23
Solyc07g066440.3.1 (Solyc07g066440.3)
0.75 -0.31 0.2 -1.22 0.38 -0.73 0.74 -0.72 -0.39 -0.34 -0.87 -1.12 -0.42 -0.73 -0.29 -0.59 -0.53 -3.31 -2.95 -0.33 -0.28 0.49 0.41 0.47 0.55 0.51 0.36 0.31 0.47 0.35 0.25 0.38 -1.89 1.52
Solyc08g014120.3.1 (Solyc08g014120.3)
2.26 -2.5 1.65 -2.21 -0.34 -1.07 -0.32 -1.2 0.29 -0.19 -0.32 0.42 -0.67 0.19 -1.17 -0.91 -1.24 - -10.92 0.57 0.81 -0.41 -0.12 -0.25 -0.55 0.41 0.05 0.18 -0.06 0.01 0.08 0.17 -2.53 0.6
Solyc08g014420.3.1 (Solyc08g014420.3)
0.88 -0.62 -0.28 0.23 -0.54 -0.44 0.2 -0.23 0.08 -0.17 -0.62 -0.85 -0.71 -0.7 0.39 0.2 0.29 -2.91 -2.65 -0.21 -0.81 0.3 0.14 0.24 0.39 0.67 0.12 0.28 0.25 0.35 0.35 0.39 -0.36 0.8
Solyc08g068810.3.1 (Solyc08g068810.3)
0.56 -1.03 0.75 1.1 0.87 -0.26 0.37 -0.85 -0.53 0.32 -0.24 -0.52 -0.12 -0.76 0.77 0.68 0.34 -6.5 -6.1 -0.36 -0.18 -0.16 -0.78 -0.48 -0.3 0.12 -0.53 -0.27 -0.03 -0.07 -0.26 0.19 -2.0 1.42
Solyc08g079670.3.1 (Solyc08g079670.3)
0.4 -0.68 0.88 0.35 0.36 0.09 -0.28 -0.29 0.18 0.79 -0.14 -0.4 0.3 0.19 0.14 0.24 0.2 -3.01 -0.36 -0.11 -0.1 -0.48 -0.86 -0.59 -0.59 0.2 -0.17 -0.2 -0.21 -0.25 -0.19 -0.09 -1.03 1.23
Solyc09g009260.3.1 (Solyc09g009260.3)
1.26 -0.03 0.34 0.5 -1.95 -2.96 -1.55 -2.68 -0.79 -0.97 0.47 0.8 0.08 0.61 -0.64 -1.05 -0.78 -3.67 -4.9 1.54 0.0 0.14 0.28 0.38 0.73 0.45 0.09 0.04 0.33 -0.09 0.02 0.13 -4.55 0.54
Solyc09g010560.2.1 (Solyc09g010560.2)
0.28 -0.96 -0.43 -0.37 0.38 -0.27 0.14 -1.06 -0.7 -0.57 -0.73 -0.65 0.07 -0.34 -0.54 -0.57 -0.66 -8.73 -10.83 0.45 0.44 0.55 0.17 0.37 0.37 0.62 0.47 0.56 0.52 0.53 0.56 0.7 -1.65 1.07
Solyc09g018070.2.1 (Solyc09g018070.2)
0.42 0.2 1.68 2.24 - - - - - - - -4.98 -1.41 -4.99 - - - - - 2.55 2.15 - - - - 3.53 - - -6.45 - - - - 0.33
Solyc09g075280.2.1 (Solyc09g075280.2)
0.88 -0.38 0.46 0.89 -0.11 -0.42 0.31 -0.57 -0.25 -0.46 -0.35 -0.71 -0.03 0.05 0.64 0.53 0.44 - - -0.26 -0.31 -0.38 -0.21 -0.18 -0.35 0.31 0.29 0.2 -0.04 -0.01 -0.06 -0.47 -0.17 1.1
Solyc10g044915.1.1 (Solyc10g044915.1)
0.66 -0.15 1.19 0.23 -1.78 -1.01 0.2 -1.81 0.45 0.54 0.11 -0.02 0.6 0.12 0.64 0.34 0.36 -6.11 -4.74 -0.15 0.07 -0.23 -0.79 -0.76 -0.83 1.19 -0.36 -0.25 -0.2 -0.88 -0.08 -0.08 -4.47 1.26
Solyc10g079050.2.1 (Solyc10g079050.2)
1.39 2.03 1.75 2.32 0.45 -0.42 -2.2 -0.99 -1.19 -0.09 -1.65 -2.23 0.3 -0.52 -0.25 -0.3 -0.01 -9.33 -7.53 0.7 -2.43 -2.71 -3.88 -3.24 -2.84 0.87 -2.43 -1.24 -0.25 -1.81 -2.53 -1.4 -2.27 1.58
Solyc11g011390.2.1 (Solyc11g011390.2)
0.84 -1.67 1.15 0.85 -0.68 -1.31 0.12 -2.54 -0.39 -1.61 0.37 -0.44 0.39 -0.37 -0.98 -1.01 -0.81 -11.81 -12.67 0.8 -0.36 -0.66 1.08 1.13 0.92 1.66 0.41 0.26 -0.52 -1.04 -0.53 -2.3 -2.82 0.64
Solyc11g072880.2.1 (Solyc11g072880.2)
0.12 -0.37 -0.35 0.98 0.25 -0.46 0.41 -0.61 0.21 0.24 -0.36 -0.49 0.3 0.36 0.11 -0.16 -0.15 -4.9 -3.42 -0.07 -0.17 0.06 0.34 0.31 -0.08 0.44 0.47 0.41 0.13 0.1 0.06 -0.09 -1.88 0.39
Solyc11g072890.1.1 (Solyc11g072890.1)
0.32 -1.57 1.82 -0.21 0.96 -1.21 -9.85 -1.46 -1.68 -2.15 -2.54 -3.17 -1.48 -2.84 -3.22 -3.55 -4.38 - - 2.71 1.45 -1.58 -2.25 -1.37 -0.18 2.03 -2.26 -1.74 -0.84 -1.85 -1.87 0.01 -1.59 2.49
Solyc12g094410.2.1 (Solyc12g094410.2)
2.02 -3.25 -0.2 -3.17 0.38 -0.72 0.78 -1.63 -0.28 0.44 -0.14 -0.85 0.22 -0.47 -0.73 -0.24 -0.24 - - 0.92 1.03 -0.45 -1.87 -1.04 -0.88 1.62 -0.96 -0.56 -0.49 -0.36 -0.31 0.33 -4.01 1.7
Solyc12g098580.1.1 (Solyc12g098580.1)
2.42 -5.31 -2.7 -3.11 1.81 -1.28 -1.16 -6.15 -2.35 -1.79 -3.71 -4.72 -5.24 -1.16 -1.33 -1.06 -0.31 -2.21 -2.48 1.96 1.25 -2.67 -3.33 -2.44 -1.86 3.04 -0.89 0.09 0.65 -2.03 -2.06 -1.02 -1.77 0.27
Solyc12g098980.2.1 (Solyc12g098980.2)
1.37 -0.62 0.75 1.09 -0.62 -0.64 0.28 -0.58 0.09 -0.63 -0.6 -0.75 -0.9 -0.58 0.37 0.13 0.13 -12.3 - 0.31 -0.23 -0.03 -0.21 -0.08 -0.1 0.65 0.17 0.21 0.18 0.07 0.11 0.19 -1.48 0.77

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.