Heatmap: Cluster_100 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g34524 (COX1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g38054 (ATAF1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g39573 (HTB4)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g39770 (MMZ3)
- - - - - - 2.81
Als_g40038 (ATAF1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g40628 (CEN2)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g41942 (PCK1)
- -7.18 - -6.96 - - 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - -4.06 - - 2.79
- - - - - - 2.81
Als_g43414 (NQR)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g44037 (MTO3)
- - - - - - 2.81
Als_g44302 (TRX2)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g44552 (CIPK22)
- - - - - - 2.81
Als_g44663 (UBC7)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g44934 (EP3)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g45124 (PDK)
- - - - - - 2.81
Als_g45775 (HHP3)
- - - - - - 2.81
Als_g45798 (SAR2)
- - - - - - 2.81
Als_g46051 (mMDH1)
-4.74 -4.88 - -6.65 - - 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g46239 (AGB1)
- - - - - - 2.81
Als_g46331 (RABA1e)
-4.33 - - - - - 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g49287 (XTR6)
- - - - - - 2.81
Als_g50034 (KAB1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Als_g52567 (PHT3;1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.