1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_192 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
4.23 40.82 0.34 2.55 0.43 0.0 0.43
3.96 44.92 0.04 2.21 0.24 0.0 1.87
1.03 11.28 0.32 0.94 0.05 0.0 0.16
0.67 7.75 0.09 0.32 0.16 0.04 0.17
4.42 57.41 0.59 4.14 0.94 0.0 0.59
0.33 4.69 0.01 0.34 0.02 0.0 0.14
0.81 6.03 0.0 0.21 0.15 0.0 0.24
0.24 1.88 0.0 0.2 0.0 0.0 0.02
0.61 5.87 0.11 0.25 0.05 0.0 0.08
0.29 3.39 0.02 0.25 0.07 0.0 0.06
Als_g19660 (RAB11c)
 0.3 3.05 0.0 0.18 0.0 0.0 0.18
3.89 43.67 0.41 2.01 0.25 0.0 0.68
Als_g19692 (MBF1B)
 0.37 4.09 0.0 0.25 0.12 0.0 0.0
1.02 7.83 0.0 0.23 0.0 0.0 0.13
Als_g20972 (RAB1C)
 0.26 5.38 0.02 0.22 0.12 0.0 0.14
0.75 15.44 0.05 0.71 0.0 0.0 0.19
Als_g22776 (ATP1)
 0.83 5.17 0.0 0.16 0.23 0.0 0.0
0.29 2.45 0.03 0.26 0.02 0.0 0.02
0.32 4.96 0.08 0.09 0.0 0.0 0.21
1.53 19.85 0.06 0.97 0.0 0.0 0.39
0.33 5.38 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.43 6.52 0.1 0.51 0.26 0.0 0.14
0.21 4.08 0.01 0.25 0.09 0.0 0.03
0.43 6.66 0.11 0.26 0.13 0.04 0.01
0.51 7.36 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0
0.13 1.97 0.0 0.05 0.0 0.0 0.09
Als_g24396 (scpl48)
 0.39 4.7 0.01 0.27 0.07 0.01 0.05
0.68 7.8 0.13 0.4 0.0 0.0 0.21
0.78 8.49 0.0 0.3 0.03 0.0 0.18
0.71 4.7 0.09 0.25 0.0 0.0 0.08
Als_g24588 (CAD2)
 0.38 3.84 0.04 0.37 0.02 0.0 0.05
1.2 10.86 0.14 0.67 0.17 0.0 0.12
0.64 7.39 0.12 0.6 0.11 0.0 0.0
0.7 5.9 0.05 0.47 0.01 0.01 0.05
4.32 77.67 0.72 3.94 0.41 0.0 1.38
6.12 57.13 0.27 3.63 0.0 0.0 0.8
0.57 5.53 0.0 0.18 0.0 0.0 0.33
1.78 17.18 0.09 1.0 0.0 0.0 0.58
Als_g53529 (ACBP)
 1.62 19.01 0.21 1.26 0.06 0.0 0.68
0.11 2.33 0.0 0.14 0.07 0.0 0.0
0.0 4.1 0.0 0.08 0.0 0.0 0.05
0.22 3.48 0.07 0.34 0.07 0.0 0.04
0.43 2.39 0.0 0.14 0.0 0.0 0.03
0.27 6.51 0.03 0.38 0.02 0.0 0.07
Als_g53639 (ARPC3)
 0.16 2.45 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05
0.18 6.39 0.04 0.37 0.1 0.0 0.05
0.16 1.9 0.08 0.04 0.04 0.0 0.0
0.14 3.22 0.02 0.21 0.05 0.0 0.14
0.09 1.93 0.02 0.07 0.05 0.01 0.02
0.0 2.86 0.0 0.21 0.15 0.0 0.0
0.13 1.74 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.14 3.76 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0
0.23 3.36 0.0 0.18 0.0 0.0 0.03
Als_g53680 (RD20)
 0.45 4.52 0.04 0.33 0.05 0.0 0.11
0.12 6.87 0.02 0.25 0.02 0.0 0.21
0.23 2.23 0.03 0.18 0.0 0.0 0.01
0.0 1.81 0.02 0.12 0.0 0.0 0.07
0.46 6.12 0.1 0.4 0.05 0.0 0.3
Als_g53851 (ATG8F)
 0.39 8.55 0.2 0.15 0.0 0.0 0.07
Als_g53865 (VAMP725)
 0.47 11.45 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0
Als_g53887 (RAB2A)
 0.04 2.29 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03
Als_g53897 (ENO2)
 0.18 2.09 0.03 0.18 0.0 0.0 0.04
0.3 6.67 0.0 0.11 0.06 0.0 0.07
0.09 1.99 0.0 0.17 0.0 0.0 0.04
Als_g54000 (MFT)
 0.29 2.76 0.03 0.08 0.03 0.0 0.02
Als_g54006 (RAC2)
 0.26 3.01 0.07 0.23 0.18 0.0 0.05
0.07 4.98 0.0 0.04 0.03 0.0 0.13
Als_g54165 (BIP)
 0.21 3.37 0.02 0.2 0.02 0.01 0.09
0.03 1.8 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0
0.14 1.79 0.02 0.06 0.02 0.0 0.03
0.06 1.76 0.02 0.06 0.0 0.0 0.04
0.14 2.54 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.56 13.32 0.22 1.49 0.39 0.0 0.16
1.29 7.33 0.05 0.54 0.14 0.0 0.31
Als_g54545 (ATJ1)
 0.23 2.67 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.44 6.6 0.16 0.24 0.07 0.05 0.37
Als_g55392 (MS3)
 0.17 2.24 0.03 0.09 0.03 0.0 0.01
0.41 4.49 0.07 0.39 0.12 0.0 0.07
0.31 5.74 0.0 0.54 0.1 0.0 0.3
7.33 61.58 0.72 5.13 0.4 0.17 0.99
0.24 2.28 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0
0.36 5.74 0.01 0.39 0.01 0.0 0.13
0.14 3.23 0.0 0.2 0.0 0.0 0.01
Als_g55757 (4CL1)
 0.0 1.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Als_g55790 (CAT1)
 0.22 1.77 0.02 0.18 0.02 0.0 0.02
0.1 2.42 0.02 0.09 0.01 0.0 0.06
0.14 2.47 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0
0.27 3.95 0.01 0.25 0.02 0.0 0.05
0.1 2.42 0.0 0.07 0.0 0.0 0.13
0.83 5.01 0.0 0.21 0.0 0.0 0.21
Als_g56001 (B5 #4)
 0.0 2.92 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0
0.1 2.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 2.06 0.0 0.12 0.06 0.0 0.01
Als_g56092 (TIP2)
 0.07 3.54 0.02 0.11 0.0 0.0 0.04
0.17 2.05 0.02 0.1 0.04 0.0 0.02
0.14 2.0 0.01 0.07 0.02 0.0 0.0
2.95 26.93 0.11 0.97 0.08 0.0 0.31
6.41 61.25 0.68 3.6 0.66 0.09 1.07
0.7 7.09 0.03 1.12 0.15 0.0 0.08
0.1 2.44 0.0 0.11 0.09 0.0 0.0
0.53 4.8 0.01 0.27 0.02 0.0 0.02
0.78 9.21 0.06 0.44 0.0 0.0 0.14
1.09 9.24 0.14 0.33 0.11 0.0 0.31
0.27 1.75 0.02 0.21 0.0 0.0 0.05
0.29 2.99 0.0 0.3 0.0 0.0 0.09
Als_g58369 (SUM1)
 0.14 4.64 0.05 0.44 0.0 0.0 0.0
Als_g58610 (ASK2)
 0.15 2.66 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04
3.97 37.92 0.3 2.01 0.47 0.0 0.0
0.33 5.25 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0
Als_g59019 (UBC11)
 0.62 6.32 0.07 0.37 0.04 0.0 0.04
0.41 9.4 0.05 0.43 0.0 0.0 0.08
0.46 12.26 0.1 1.14 0.07 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)