Heatmap: Cluster_12 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- - - - 1.26 2.99 - 4.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.74 - - - - - - -
- - 1.64 - - - 5.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.33 - 2.51 - 0.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.82 0.09 -0.55 0.47 -0.13 3.64 - 0.6 - -2.5 -0.42 -0.41 0.33 1.83 1.45 0.76 - -1.08 -0.95 - - -0.19 -0.52 -0.01 -0.72 -2.07 -0.14 -0.22 -1.46 -1.44 -0.0 -0.81 -2.52 -1.04 - -0.01 - 0.88 -0.25 0.56 -0.92 -0.56 -2.59 -0.36 - -0.28
-2.15 - 1.38 - - 2.16 -1.01 3.31 - -2.21 - - -2.58 - -4.12 - -1.8 -1.43 2.07 -0.85 - - 1.66 0.85 -0.32 0.6 0.8 0.73 0.39 -0.28 -0.99 - -0.43 -0.13 - -1.17 -1.57 1.0 -0.45 -0.39 -1.76 -1.94 -0.8 0.46 -1.05 0.68 - -0.89
- - - 2.59 -0.31 2.81 2.7 3.87 - - - - - - -3.28 - - 2.97 - - - - 0.15 -0.76 -0.68 - - -0.61 - -4.06 - - - - - - - - - -0.98 - - 0.58 - - - - -
- - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.48 1.03 0.15 -0.61 1.0 2.24 1.73 2.3 1.66 -2.77 -4.89 -4.18 -2.58 - -2.16 2.99 1.09 -0.69 -0.77 0.4 0.13 0.54 2.46 -1.28 -0.53 -0.2 -1.38 -4.75 -4.25 -4.27 -4.74 - -5.95 - - - -4.75 -2.73 - -3.32 - -3.68 -2.27 -3.02 - -5.05 -3.24 -6.87
-3.61 0.39 0.38 1.65 0.46 3.02 2.46 2.1 -4.95 0.07 - - -2.81 -5.03 -0.93 3.07 1.24 -1.7 1.02 0.84 1.01 -0.12 -0.55 -0.67 -0.71 -1.84 -3.3 - -5.37 -7.83 - - - - - - - -5.32 - - - - -4.82 -1.42 - -3.19 -1.38 -
- - - - -0.18 2.67 3.63 2.82 - - - - - - - - - - 3.06 - 1.24 - - - 0.42 - - - 0.38 - 1.08 - - - - 1.37 - - - - - - - 0.52 0.9 - - -
- - - - 0.51 3.11 3.99 1.89 - 0.92 - - -0.38 - - - - - - - - - - - - - -0.33 - 1.36 -0.98 -1.07 -0.09 -1.93 -0.29 - - 0.63 1.04 - 0.45 - 0.11 - - - 0.94 0.43 -
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.08 3.76 - 3.98 - - - 0.17 -0.03 - -4.58 - - 0.58 - - - - 1.04 1.66 -0.21 1.63 - - - -1.42 - - - -0.73 -0.68 - - - - - - - 0.72 - - - - -1.16
- - - - 3.68 2.04 2.43 4.27 - - - - - 1.75 -3.2 - - - - - - - - - - - 0.9 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.69 2.53 1.24 2.19 4.05 - - - - - - - - - - - - 1.47 1.65 1.33 - - 1.41 - 0.93 - 1.97 -2.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -1.46 2.73 1.11 2.04 2.46 4.18 - - - - - -2.43 -5.69 0.91 -3.6 0.3 - - - - -0.26 2.48 - -0.95 -2.54 - - -5.78 - - -4.58 - -2.92 - - - - - -2.2 -2.54 - - - - - -4.31
- - - - -0.18 1.04 3.09 3.75 - - - -0.87 -1.03 0.66 - - - - - - -0.27 - - -0.46 1.75 -0.4 2.68 - -0.77 -0.31 0.43 - -1.6 - - -0.73 -0.02 -0.72 - - - - -0.29 - - 0.85 - -1.07
- - - - 1.48 1.84 2.19 3.94 - - 1.63 -0.19 0.44 - -2.15 - - -0.61 - - - 0.48 - 1.4 0.91 - 0.69 - 2.02 - - -0.06 - - 0.77 - - - - - - - - - - -0.06 - -1.66
- - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.79 - - 0.14 1.62 2.17 0.55 4.83 - - - - - - - - 1.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.69 - - -0.82 4.35 - 4.49 - 0.33 - - - - -3.75 - - - - - - - - - - - - - - -2.98 - - -1.6 - - - - - - - - - - - - 0.25 - -
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.53 2.57 - 2.04 - 4.23 - - - - - - -1.94 - 3.2 1.07 - - - - - - - 2.11 - - - -1.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.96 - 1.81 - 2.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.8 - - - - - - 2.47 - - - - - - - - - -
- 0.06 1.41 -1.66 - 1.45 2.31 2.49 - -0.05 - - -0.11 -1.0 -0.51 3.31 0.58 1.31 - -0.44 - -2.08 -0.67 -0.05 -1.21 -1.12 -2.04 0.19 -0.53 -0.75 -1.63 -0.31 -2.11 -0.58 -0.83 0.19 - -1.11 - -2.31 -1.16 - - -0.43 - -2.21 -0.23 -0.11
- - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.25 3.07 0.3 2.46 2.93 3.95 - - - - - - - - 1.72 2.46 - - - - - - - - - - - -2.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.09 - 0.38 - 1.43 2.58 4.39 - 0.43 - - - -0.19 -2.29 - - -0.91 - - - - - - -0.12 - - - - -2.73 - -0.5 - -0.38 - - - -0.14 - - 0.17 1.48 -0.33 - 0.77 -0.35 - 0.39
- - - - - 1.98 3.07 4.95 - - 1.36 - - - -2.32 - - - - - - - - - - - 0.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.26 0.97 2.82 2.99 4.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.7 2.68 2.19 -1.22 1.98 -1.46 3.98 1.24 - - - -2.03 - -5.45 - -1.25 2.82 - -1.15 - - - -1.46 -0.42 -0.09 -1.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.62 - - -
- - 1.04 - -0.61 1.35 - 4.82 - - - - - - - - 2.53 - - - - - - 1.49 -0.01 1.38 - - 1.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -1.12 3.03 3.72 3.46 - -1.63 -1.59 - - - - - - - - - - - - - - - -0.25 -1.45 -0.95 -3.28 -1.74 -1.9 -0.3 -0.95 -1.43 -1.52 -1.03 1.31 -0.78 0.76 0.08 -0.46 0.21 - -0.79 -0.14 -1.24 -
- - -0.25 - -0.75 - 1.68 4.71 - - - - - - - - 1.45 0.35 - - - - 2.89 - - 2.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.09 - 0.27 - - 3.94 - - - 1.1 - - - - 2.26 1.41 - - - - - - - - - 1.8 - -0.27 - - - - - - 1.3 1.8 - - - 1.61 - - - - - -
- - -0.0 -0.94 -0.47 1.59 2.56 4.37 - -1.5 -0.17 0.3 -1.32 - -2.45 - 2.15 - - - - -0.65 - 0.86 1.38 0.35 0.84 - - -3.71 - - - - - - - - - - -1.28 - - - - - - -
- - - - - - 3.4 4.84 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -1.19 1.83 -0.63 1.9 0.66 4.03 - -1.66 - - -0.91 - -3.86 1.7 2.13 - - - - - - - 0.87 -0.59 1.85 1.21 0.18 -0.4 - -0.77 - -0.65 - - - - - - - - - 0.02 - -0.6 - -
- - - - - - - 4.75 - - - - - - - - 4.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 3.47 1.76 3.71 - - - 1.86 1.44 1.13 - - 2.01 - - - - - - - - - - 1.08 - -0.38 - - -0.36 - - - - - - - - - 1.04 - 1.11 - - -
- - - - - - 4.08 4.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.67 - 1.38 2.87 4.18 2.85 - -1.25 - - - - - - 1.52 - 0.61 - - - - - -0.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.64 - -2.27
- - - - 1.15 3.9 3.99 3.75 - - - - - - - - -0.44 - - - - - - - - - - - - -2.0 -0.92 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.04 1.89 3.24 1.03 - 0.54 - - 0.15 -0.4 -0.25 - -0.98 0.44 1.86 1.31 1.05 0.15 - - 1.47 - -0.01 - -0.2 -0.09 0.55 -1.15 -0.86 - - - 0.8 - -0.04 - - - 0.29 0.26 0.78 -0.5 -0.78 -1.51
- - - -3.25 - 3.98 3.47 3.48 2.27 - - -8.48 - - -3.48 1.71 -4.24 -1.77 - - - - - -0.62 - - - - - -0.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.91 - - - - - - - - 1.84 - - - - - - - - - - - - - 1.26 - - - - - - 2.28 - - - - - - - 1.71 1.94 -
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.61 2.46 4.02 3.8 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - 1.25 - -0.23 0.58 - - 0.03 - - - - - - - - 1.28 0.55 - - - - - - -
- - - - - - 4.34 4.48 - 2.29 - - - - -0.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.1 1.11 1.3 0.4 4.22 - -1.86 - - - - -2.68 - -0.87 2.65 -0.62 - - - - 1.08 2.4 -0.67 -2.15 - -1.1 -2.97 -0.85 -1.9 -2.2 - - - - - - -1.37 - - - -1.26 - -0.9 1.13 -
-0.64 1.6 2.5 0.36 0.61 2.36 2.19 3.84 0.87 -0.04 - - -1.13 - -2.03 - -0.16 1.04 - - 1.07 -0.1 - -0.24 -0.39 - - - - -3.3 - - - -1.47 - - - - - - - - - - - - -1.62 -
- - - - 1.04 - 4.81 2.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.32 - - - 0.81 - - - 0.66 - - 0.97 - 0.97 1.09 - 0.44 - -0.85
- - - - 1.04 - 4.81 2.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.32 - - - 0.81 - - - 0.66 - - 0.97 - 0.97 1.09 - 0.44 - -0.85
- 1.02 - -1.8 3.23 2.65 2.11 3.21 - - - - - - - - - -1.56 - 2.5 1.05 0.87 1.56 - - 1.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.22 - - -2.9
- -2.09 1.54 -1.2 - 2.81 2.11 4.01 - -2.33 - - - - -2.04 - 0.64 1.02 - - - - - -2.24 - -0.1 - 0.6 0.09 -1.0 -1.59 -1.8 -0.81 -0.17 -1.13 0.62 -1.58 -2.37 -1.01 -0.38 -2.86 -3.01 - -0.91 -0.51 -2.38 -1.58 -0.28
- 4.04 - - - - 4.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 3.77 4.36 3.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 5.26 - - - - - - -1.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.08 - - - - - - - - - - - 2.31 - -
- - 1.17 - -0.22 - - 4.83 - - - - - - -3.46 - 2.23 0.18 - - - - - - - 0.77 - - 1.53 - - - - - - - - - - - - 0.93 1.26 - - 0.76 - -
1.03 1.05 -0.37 1.86 -0.07 1.82 1.02 0.55 1.28 -1.84 -1.46 -1.79 -1.06 -1.43 -1.17 3.03 0.56 0.19 0.92 0.61 0.46 -0.13 1.49 -2.06 -1.24 0.04 -0.81 -3.3 -2.11 -2.59 -5.85 -1.49 -4.09 -3.48 -4.04 -2.8 -3.13 -1.0 - -2.24 -0.3 -0.18 -2.0 -2.42 -2.68 -0.96 -2.01 -2.33
-3.54 - -1.25 -3.81 -0.58 1.79 1.87 3.89 -3.29 -0.47 -2.61 -2.99 -0.26 -0.27 -0.85 - -0.78 -4.24 -2.4 -0.66 -0.98 -1.21 - -3.54 -2.66 -2.48 -0.97 -1.34 -2.24 -0.78 1.49 0.79 0.06 -0.12 - 0.42 1.23 -0.48 -0.35 0.07 -3.15 - -1.43 -1.22 0.26 -1.53 -0.31 -0.04
- - - - - - 3.71 4.78 - - - - - - - - 2.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.19 - 1.64 3.89 - 0.09 - - - 0.08 -4.42 - 0.8 2.75 - - - - - - - - - - - -0.91 -0.21 - -1.13 - - -0.21 - 0.99 - - 2.46 1.15 1.57 - 1.38 - - -0.93
- 1.13 -0.73 -0.47 - 3.03 1.19 3.68 - - - - - - - 3.74 1.77 -0.14 - - - - 1.4 - - -0.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.81 2.66 3.73 2.78 - - - 2.19 - - - - 2.95 - - - - - - - - 2.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.14 1.5 - - - 4.83 - - - - - - - - 3.12 - - - - - - - 1.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.61 - 2.26 3.92 4.27 - - - - - - - 0.44 - 0.73 - - - 1.06 - - - -0.07 - -0.55 - - -3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.13
- - - - 3.1 3.25 - 4.1 - 1.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.59 - - - - - - - 1.47 - -
- - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.