Heatmap: Cluster_98 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Rhizome
Root
7.64 10.65 0.07 0.0 0.0
2.99 2.35 0.0 0.0 0.0
3.72 3.7 0.0 0.0 0.0
2.9 3.84 0.39 0.0 0.0
Ala_g00742 (ARA5)
2.01 1.78 0.18 0.06 0.02
Ala_g02907 (VAMP725)
2.98 2.88 0.1 0.0 0.33
3.47 3.31 0.21 0.53 0.4
1.83 1.96 0.0 0.0 0.17
8.77 8.25 1.87 0.28 0.53
6.67 6.56 2.0 0.56 0.33
2.19 1.44 0.0 0.0 0.11
Ala_g04955 (ARFA1F)
5.05 5.36 0.72 0.05 0.05
9.96 12.98 3.09 0.71 0.2
11.42 11.16 3.51 1.71 0.53
14.86 14.96 6.39 5.33 4.1
6.04 4.46 0.22 0.0 0.02
19.15 21.7 6.5 0.83 0.39
Ala_g05523 (CYTC-2)
5.68 6.21 2.42 0.16 0.73
5.1 4.75 0.7 0.04 0.21
1.85 2.66 0.0 0.0 0.1
2.68 3.28 0.95 0.1 0.08
5.91 6.67 0.92 0.0 0.18
4.63 5.58 0.43 0.0 0.05
2.47 2.2 0.0 0.0 0.04
Ala_g07399 (IVD)
2.0 1.5 0.06 0.0 0.03
6.93 8.5 2.83 1.33 0.96
2.59 1.81 0.13 0.0 0.03
4.12 4.26 0.55 0.06 0.13
3.09 3.49 0.22 0.01 0.0
7.22 7.46 2.32 0.03 0.45
6.88 7.07 1.1 0.04 0.14
21.09 22.58 8.02 0.76 1.9
Ala_g08816 (TRX2)
3.79 3.33 0.18 0.0 0.03
Ala_g09009 (PCK1)
5.39 4.38 0.87 0.14 0.12
Ala_g09409 (CYTC-1)
6.12 6.17 1.07 0.25 0.07
1.93 1.91 0.0 0.0 0.17
3.86 3.88 0.87 0.05 0.25
3.11 3.43 0.81 0.0 0.12
6.5 6.24 0.0 0.0 0.0
2.49 3.31 0.0 0.0 0.0
10.13 8.08 1.99 0.08 0.29
6.06 5.55 1.45 1.37 0.94
2.84 3.75 1.08 0.7 0.24
Ala_g10302 (STV1)
5.42 4.71 1.02 0.03 0.13
3.94 4.17 0.35 0.17 0.09
1.77 1.39 0.0 0.0 0.0
Ala_g10508 (ELI3)
1.75 1.93 0.04 0.0 0.01
Ala_g10615 (Hsp70b)
13.66 17.3 0.75 1.43 1.53
7.57 7.77 1.69 0.65 0.24
88.8 82.47 20.01 17.92 9.64
1.74 2.11 0.08 0.0 0.0
2.34 3.23 0.17 0.1 0.03
2.13 2.04 0.26 0.05 0.02
10.45 9.09 2.88 0.0 0.19
Ala_g12672 (MLS)
4.52 3.6 0.11 0.0 0.02
3.94 2.79 0.26 0.0 0.07
4.07 4.94 0.6 0.08 0.38
5.24 5.84 1.44 0.09 0.28
7.09 7.0 1.21 0.42 0.26
2.37 1.93 0.23 0.03 0.04
5.76 6.25 1.63 0.16 0.18
51.43 58.72 6.09 0.0 0.44
10.65 15.04 4.11 0.03 0.13
9.75 8.13 0.24 0.0 0.1
2.85 2.29 0.0 0.32 0.0
22.63 27.86 15.1 11.62 12.85
3.84 5.03 1.32 0.16 0.52
3.02 3.18 0.68 0.02 0.07
3.61 4.32 0.04 0.0 0.04
2.94 3.0 0.77 0.0 0.1
2.1 1.33 0.02 0.0 0.0
4.23 4.41 1.09 0.05 0.12
Ala_g14942 (MSRB2)
2.94 2.09 0.17 0.0 0.02
Ala_g15041 (HMG)
2.45 2.98 0.22 0.11 0.1
3.51 4.83 1.15 0.0 0.11
25.14 21.5 5.66 0.42 1.43
2.25 1.64 0.3 0.0 0.0
4.95 5.69 1.03 0.35 0.59
7.66 10.16 2.29 0.29 0.14
3.58 3.99 0.83 0.05 0.13
3.19 5.21 0.9 0.0 0.0
Ala_g19543 (LPA66)
13.31 12.58 6.92 5.16 4.61
2.49 2.79 0.25 0.6 0.38
8.51 7.61 1.88 1.16 0.78
4.83 5.59 0.9 0.67 0.35
Ala_g20904 (KAT2)
2.57 2.93 0.58 0.05 0.04
6.03 5.1 0.67 0.03 0.05
6.82 6.28 1.81 0.0 0.0
4.17 5.42 1.12 1.06 0.51
6.62 7.44 0.77 1.2 1.9
5.67 5.85 2.11 0.46 0.35
4.28 5.21 0.39 0.82 0.17
3.59 5.67 0.11 0.12 0.56
Ala_g35496 (CYTC-1)
4.67 3.53 0.29 0.0 0.17
4.0 2.43 0.0 0.0 0.0
12.66 15.58 4.72 5.3 4.63
Ala_g35622 (PCK1)
2.44 2.55 0.15 0.01 0.09
3.46 4.15 0.17 0.0 0.0
3.4 3.03 0.0 0.08 0.32
7.36 8.71 4.97 4.3 3.63
2.59 2.26 0.36 0.32 0.3
4.67 4.6 2.15 2.09 1.44
2.1 3.75 0.6 0.0 0.06
3.95 3.44 0.23 0.0 0.0
4.45 3.76 0.12 0.0 0.0
3.73 4.18 0.21 0.05 0.14
Ala_g37441 (GEX1)
3.01 2.89 1.29 1.44 0.98
5.77 6.73 1.63 1.23 1.61
3.92 5.23 0.92 0.5 0.41
3.37 2.64 0.23 0.0 0.11
16.68 15.97 3.59 1.14 1.9
3.92 4.3 0.18 0.34 0.21
Ala_g38216 (CB5-A)
3.48 3.6 0.97 0.13 0.12
8.12 10.94 1.98 0.14 0.2
18.41 19.09 3.68 3.71 5.38
3.2 2.34 0.8 0.1 0.1
4.37 4.46 0.17 0.0 0.0
1.51 2.11 0.09 0.0 0.0
2.53 1.82 0.0 0.0 0.0
13.98 12.02 2.29 0.22 1.53
2.64 3.71 0.62 0.0 0.1
10.22 6.86 0.34 0.0 0.0
15.5 16.24 6.04 5.51 5.46
2.11 2.49 0.02 0.0 0.05
3.59 4.6 1.36 0.0 0.07
7.53 7.09 0.13 0.0 0.05
1.99 1.7 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)