Heatmap: Cluster_77 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g088200.3.1 (Solyc01g088200.3)
0.67 0.0 1.0 0.05 0.1 0.02 0.01 0.01 0.01 0.05 0.0 0.01 0.04 0.07 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.05 0.13 0.08 0.14 0.17 0.04 0.08 0.12 0.13 0.17 0.11 0.21 0.0 0.65
Solyc01g094660.3.1 (Solyc01g094660.3)
0.7 0.11 0.5 0.16 0.36 0.38 0.47 0.18 0.27 0.42 0.5 0.36 1.0 0.73 0.56 0.56 0.51 0.0 0.0 0.3 0.4 0.3 0.2 0.23 0.24 0.62 0.27 0.3 0.3 0.34 0.33 0.4 0.03 0.63
Solyc01g105240.3.1 (Solyc01g105240.3)
1.0 0.5 0.95 0.54 0.34 0.32 0.49 0.26 0.45 0.59 0.4 0.36 0.62 0.43 0.65 0.8 0.74 0.06 0.08 0.33 0.27 0.34 0.36 0.33 0.31 0.65 0.4 0.34 0.33 0.35 0.37 0.38 0.15 0.94
Solyc01g109980.3.1 (Solyc01g109980.3)
0.53 0.0 1.0 0.06 0.32 0.17 0.15 0.15 0.14 0.13 0.08 0.16 0.11 0.12 0.14 0.15 0.12 0.0 0.0 0.21 0.31 0.14 0.1 0.11 0.13 0.32 0.1 0.09 0.11 0.12 0.14 0.16 0.06 0.85
Solyc02g021680.3.1 (Solyc02g021680.3)
0.89 0.51 0.8 1.0 0.15 0.02 0.25 0.01 0.09 0.12 0.06 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.33 0.02 0.05 0.0 0.01 0.01 0.44 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.1 0.0 0.44
Solyc03g033825.1.1 (Solyc03g033825.1)
0.6 0.14 0.22 0.14 0.16 0.27 0.39 0.19 0.35 0.4 0.44 0.33 0.53 0.41 0.32 0.5 0.29 0.0 0.0 0.38 0.49 0.27 0.17 0.19 0.24 1.0 0.12 0.19 0.2 0.17 0.18 0.42 0.02 0.66
Solyc03g033830.2.1 (Solyc03g033830.2)
0.66 0.11 0.34 0.21 0.19 0.23 0.42 0.18 0.14 0.41 0.39 0.22 0.38 0.14 0.39 0.45 0.32 0.01 0.0 0.47 0.76 0.29 0.18 0.19 0.18 1.0 0.11 0.24 0.23 0.3 0.35 0.55 0.02 0.86
Solyc03g059250.3.1 (Solyc03g059250.3)
0.61 0.21 0.83 0.2 0.46 0.25 0.34 0.15 0.29 0.22 0.3 0.18 0.39 0.28 0.13 0.09 0.09 0.0 0.0 0.13 0.28 0.29 0.29 0.29 0.24 0.19 0.27 0.26 0.22 0.31 0.32 0.32 0.05 1.0
Solyc03g098430.3.1 (Solyc03g098430.3)
0.07 0.17 1.0 0.18 0.31 0.09 0.32 0.08 0.11 0.14 0.3 0.16 0.36 0.22 0.08 0.09 0.09 0.0 0.0 0.04 0.13 0.09 0.09 0.07 0.06 0.07 0.11 0.1 0.09 0.09 0.1 0.08 0.01 0.16
Solyc03g116060.3.1 (Solyc03g116060.3)
0.69 0.35 0.73 0.35 0.48 0.34 0.59 0.38 0.35 0.34 0.19 0.17 0.07 0.11 0.15 0.06 0.08 0.0 0.0 0.35 0.4 0.52 0.52 0.51 0.49 0.34 0.24 0.2 0.24 0.38 0.46 0.39 0.17 1.0
Solyc04g007610.3.1 (Solyc04g007610.3)
0.57 0.54 1.0 0.77 0.55 0.36 0.44 0.32 0.49 0.65 0.44 0.43 0.55 0.49 0.81 0.85 0.75 0.17 0.4 0.37 0.3 0.36 0.46 0.41 0.33 0.6 0.45 0.43 0.38 0.36 0.38 0.34 0.2 0.76
Solyc04g009150.1.1 (Solyc04g009150.1)
0.29 0.12 0.83 0.27 0.9 0.26 0.19 0.29 0.18 0.36 0.17 0.18 0.14 0.06 0.12 0.06 0.06 0.0 0.0 0.33 0.58 0.53 0.17 0.29 0.33 0.06 0.27 0.3 0.36 0.59 0.45 0.82 0.01 1.0
Solyc04g025170.3.1 (Solyc04g025170.3)
0.42 0.21 1.0 0.54 0.17 0.14 0.45 0.1 0.19 0.16 0.2 0.16 0.24 0.17 0.15 0.12 0.14 0.0 0.0 0.15 0.24 0.19 0.18 0.17 0.17 0.4 0.16 0.16 0.16 0.18 0.19 0.24 0.01 0.45
Solyc04g025180.3.1 (Solyc04g025180.3)
0.66 0.34 1.0 0.71 0.15 0.17 0.59 0.17 0.32 0.27 0.36 0.31 0.49 0.3 0.23 0.18 0.2 0.0 0.0 0.3 0.41 0.31 0.3 0.29 0.26 0.75 0.27 0.28 0.25 0.28 0.29 0.36 0.01 0.51
Solyc04g025210.3.1 (Solyc04g025210.3)
0.96 0.2 0.93 0.35 0.34 0.24 0.27 0.24 0.25 0.34 0.24 0.22 0.23 0.19 0.18 0.16 0.17 0.0 0.0 0.39 0.31 0.3 0.22 0.26 0.26 0.52 0.26 0.27 0.25 0.29 0.31 0.37 0.03 1.0
Solyc04g076030.2.1 (Solyc04g076030.2)
0.63 0.07 0.25 0.06 0.28 0.24 0.33 0.17 0.31 0.28 0.24 0.14 0.45 0.29 0.12 0.08 0.09 0.0 0.0 0.21 0.21 0.26 0.18 0.22 0.22 0.38 0.19 0.2 0.2 0.28 0.32 0.33 0.07 1.0
Solyc04g079710.3.1 (Solyc04g079710.3)
0.67 0.0 1.0 0.17 0.31 0.2 0.02 0.16 0.19 0.25 0.24 0.17 0.03 0.05 0.07 0.1 0.07 0.0 0.0 0.05 0.09 0.2 0.34 0.22 0.15 0.05 0.09 0.08 0.05 0.15 0.21 0.11 0.04 0.93
Solyc04g081440.3.1 (Solyc04g081440.3)
0.75 0.35 0.54 0.41 0.41 0.29 0.32 0.14 0.23 0.24 0.29 0.29 0.25 0.23 0.27 0.17 0.19 0.0 0.0 0.33 0.47 0.32 0.3 0.33 0.39 0.57 0.26 0.32 0.4 0.31 0.29 0.38 0.13 1.0
Solyc04g082600.3.1 (Solyc04g082600.3)
0.58 0.14 0.94 0.44 0.29 0.2 0.28 0.16 0.4 0.31 0.34 0.31 0.3 0.26 0.17 0.09 0.12 0.03 0.03 0.23 0.29 0.28 0.26 0.27 0.25 0.38 0.25 0.22 0.22 0.28 0.3 0.31 0.21 1.0
Solyc05g014160.3.1 (Solyc05g014160.3)
0.66 0.67 0.35 0.34 0.38 0.34 0.61 0.26 0.47 0.46 0.27 0.25 0.46 0.44 0.63 0.58 0.71 0.03 0.04 0.2 0.25 0.44 0.32 0.36 0.36 0.69 0.36 0.37 0.34 0.47 0.44 0.55 0.04 1.0
Solyc05g014163.1.1 (Solyc05g014163.1)
0.77 0.67 0.28 0.39 0.47 0.35 0.86 0.37 0.49 0.2 0.26 0.29 0.54 0.42 0.51 0.41 0.52 0.03 0.06 0.26 0.16 0.47 0.22 0.34 0.3 0.87 0.24 0.29 0.3 0.48 0.44 0.49 0.04 1.0
Solyc05g015480.3.1 (Solyc05g015480.3)
0.84 0.0 0.47 0.02 0.07 0.02 0.04 0.0 0.01 0.11 0.06 0.02 0.05 0.03 0.08 0.13 0.14 0.0 0.0 0.22 0.24 0.1 0.02 0.07 0.15 0.15 0.06 0.1 0.11 0.11 0.08 0.19 0.0 1.0
Solyc06g068560.3.1 (Solyc06g068560.3)
0.69 0.51 1.0 0.86 0.12 0.17 0.37 0.15 0.32 0.37 0.29 0.26 0.29 0.24 0.41 0.43 0.42 0.0 0.0 0.15 0.15 0.19 0.23 0.23 0.18 0.26 0.21 0.2 0.19 0.16 0.22 0.17 0.07 0.67
Solyc07g025370.3.1 (Solyc07g025370.3)
0.75 0.23 0.57 0.44 0.52 0.24 0.23 0.11 0.22 0.31 0.29 0.19 0.23 0.14 0.36 0.36 0.37 0.0 0.0 0.11 0.24 0.23 0.12 0.16 0.2 0.15 0.12 0.16 0.17 0.25 0.24 0.32 0.09 1.0
Solyc07g047770.3.1 (Solyc07g047770.3)
0.32 0.08 1.0 0.68 0.46 0.27 0.36 0.3 0.36 0.49 0.8 0.46 0.64 0.55 0.43 0.37 0.31 0.0 0.0 0.24 0.33 0.38 0.51 0.51 0.34 0.35 0.4 0.37 0.26 0.33 0.33 0.27 0.05 0.45
Solyc07g056260.3.1 (Solyc07g056260.3)
0.44 0.15 0.75 0.31 0.68 0.45 0.69 0.44 0.58 0.85 0.32 0.2 0.16 0.12 0.49 0.32 0.32 0.0 0.0 0.38 0.44 0.46 0.3 0.38 0.31 0.61 0.39 0.36 0.27 0.52 0.47 0.76 0.02 1.0
Solyc07g063300.3.1 (Solyc07g063300.3)
0.52 0.16 1.0 0.6 0.38 0.23 0.39 0.19 0.44 0.36 0.16 0.13 0.2 0.16 0.57 0.53 0.58 0.01 0.0 0.22 0.27 0.36 0.24 0.31 0.37 0.28 0.31 0.36 0.37 0.38 0.31 0.42 0.04 0.77
Solyc07g066480.3.1 (Solyc07g066480.3)
0.58 0.13 0.46 0.29 0.77 0.32 0.49 0.21 0.61 0.88 0.56 0.67 0.67 0.48 0.77 0.75 0.69 0.25 0.13 0.3 0.78 0.4 0.6 0.41 0.28 1.0 0.57 0.45 0.45 0.39 0.48 0.39 0.03 0.59
Solyc08g007910.3.1 (Solyc08g007910.3)
0.88 0.73 0.98 0.86 0.42 0.2 0.46 0.1 0.35 0.31 0.6 0.4 0.62 0.45 0.27 0.25 0.26 0.01 0.02 0.24 0.3 0.23 0.23 0.24 0.22 0.52 0.22 0.21 0.18 0.21 0.24 0.26 0.02 1.0
Solyc08g023460.3.1 (Solyc08g023460.3)
0.54 0.39 0.72 0.71 0.23 0.23 0.29 0.19 0.5 0.53 0.34 0.2 0.43 0.41 0.75 0.68 0.68 0.04 0.03 0.43 0.32 0.33 0.33 0.37 0.35 0.76 0.43 0.43 0.46 0.36 0.35 0.42 0.06 1.0
Solyc08g065250.3.1 (Solyc08g065250.3)
0.63 0.46 0.83 1.0 0.47 0.31 0.65 0.29 0.47 0.62 0.35 0.31 0.42 0.43 0.76 0.79 0.7 0.16 0.35 0.4 0.49 0.46 0.57 0.54 0.41 0.65 0.44 0.45 0.49 0.4 0.47 0.43 0.1 0.76
Solyc08g069140.3.1 (Solyc08g069140.3)
0.43 0.37 1.0 0.49 0.1 0.07 0.36 0.05 0.14 0.09 0.13 0.08 0.3 0.21 0.15 0.11 0.11 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.06 0.04 0.03 0.01 0.08 0.07 0.06 0.04 0.05 0.03 0.01 0.25
Solyc08g077780.3.1 (Solyc08g077780.3)
0.27 0.18 1.0 0.38 0.28 0.18 0.11 0.07 0.16 0.17 0.52 0.25 0.64 0.48 0.08 0.1 0.21 0.0 0.0 0.23 0.25 0.09 0.08 0.11 0.14 0.25 0.1 0.09 0.1 0.07 0.08 0.17 0.08 0.69
Solyc08g080110.3.1 (Solyc08g080110.3)
0.49 0.2 0.63 0.4 0.19 0.23 0.24 0.16 0.39 0.35 0.35 0.35 0.52 0.48 0.51 0.53 0.49 0.06 0.07 0.36 0.31 0.24 0.21 0.24 0.23 0.51 0.26 0.26 0.26 0.24 0.25 0.29 0.1 1.0
Solyc09g055570.3.1 (Solyc09g055570.3)
0.91 0.14 0.94 0.42 0.24 0.25 0.58 0.26 0.49 0.53 0.32 0.24 0.5 0.32 0.38 0.4 0.39 0.0 0.0 0.31 0.36 0.39 0.34 0.36 0.32 0.52 0.33 0.38 0.35 0.35 0.35 0.43 0.04 1.0
Solyc09g055590.3.1 (Solyc09g055590.3)
0.85 0.56 1.0 0.99 0.39 0.33 0.72 0.27 0.3 0.5 0.68 0.64 0.93 0.82 0.54 0.5 0.52 0.07 0.07 0.39 0.66 0.44 0.36 0.4 0.44 0.79 0.34 0.4 0.4 0.41 0.4 0.46 0.17 0.69
Solyc09g065700.3.1 (Solyc09g065700.3)
0.72 0.31 0.56 0.55 0.22 0.21 1.0 0.19 0.32 0.55 0.28 0.21 0.6 0.34 0.32 0.29 0.31 0.23 0.16 0.28 0.43 0.33 0.45 0.45 0.32 0.72 0.45 0.47 0.37 0.34 0.35 0.34 0.04 0.58
Solyc09g066280.3.1 (Solyc09g066280.3)
0.27 0.09 0.25 0.07 0.97 0.2 0.39 0.21 0.23 0.27 0.22 0.07 0.21 0.12 0.26 0.23 0.21 0.0 0.0 0.22 0.46 0.31 0.17 0.24 0.25 0.33 0.23 0.28 0.25 0.37 0.33 0.63 0.02 1.0
Solyc09g091850.3.1 (Solyc09g091850.3)
0.31 0.15 0.92 0.46 0.53 0.23 0.5 0.19 0.33 0.45 0.27 0.17 0.38 0.29 0.49 0.44 0.41 0.01 0.01 0.23 0.41 0.39 0.35 0.38 0.36 0.58 0.35 0.38 0.37 0.39 0.39 0.49 0.03 1.0
Solyc10g081200.1.1 (Solyc10g081200.1)
0.6 0.12 0.53 0.73 1.0 0.34 0.44 0.22 0.33 0.35 0.27 0.18 0.41 0.24 0.23 0.18 0.21 0.0 0.0 0.4 0.77 0.42 0.44 0.51 0.39 0.71 0.42 0.55 0.42 0.47 0.42 0.45 0.04 0.91
Solyc11g017190.2.1 (Solyc11g017190.2)
0.59 0.34 1.0 0.99 0.5 0.34 0.48 0.28 0.45 0.8 0.46 0.39 0.76 0.47 0.77 0.94 0.91 0.01 0.0 0.56 0.5 0.43 0.51 0.49 0.41 0.92 0.47 0.48 0.45 0.43 0.42 0.47 0.04 0.83
Solyc11g069530.2.1 (Solyc11g069530.2)
0.37 0.2 0.59 0.41 0.29 0.19 0.29 0.15 0.31 0.36 0.27 0.23 0.53 0.42 0.84 0.6 1.0 0.07 0.23 0.32 0.28 0.22 0.2 0.21 0.2 0.47 0.32 0.29 0.31 0.26 0.27 0.29 0.02 0.53
Solyc12g005590.2.1 (Solyc12g005590.2)
0.99 0.19 0.67 0.31 0.58 0.29 0.27 0.16 0.38 0.47 0.38 0.25 0.69 0.41 0.82 0.92 0.82 0.17 0.05 0.56 0.62 0.4 0.29 0.38 0.48 0.72 0.32 0.42 0.48 0.37 0.38 0.52 0.03 1.0
Solyc12g008990.2.1 (Solyc12g008990.2)
0.23 0.33 1.0 0.1 0.08 0.08 0.38 0.08 0.11 0.04 0.14 0.13 0.41 0.42 0.06 0.04 0.04 0.01 0.01 0.06 0.12 0.06 0.1 0.07 0.05 0.18 0.23 0.18 0.17 0.07 0.1 0.06 0.01 0.08
Solyc12g017910.2.1 (Solyc12g017910.2)
0.89 0.17 0.71 0.38 0.31 0.28 0.34 0.17 0.36 0.32 0.32 0.21 0.34 0.27 0.23 0.17 0.19 0.01 0.01 0.25 0.3 0.4 0.37 0.38 0.36 0.36 0.44 0.4 0.38 0.44 0.42 0.41 0.12 1.0
Solyc12g017915.1.1 (Solyc12g017915.1)
0.95 0.12 0.46 0.25 0.02 0.16 0.2 0.1 0.11 0.15 0.14 0.12 0.1 0.09 0.17 0.12 0.14 0.0 0.0 0.14 0.02 0.26 0.19 0.25 0.28 0.02 0.19 0.27 0.26 0.28 0.23 0.34 0.09 1.0
Solyc12g089130.2.1 (Solyc12g089130.2)
1.0 0.01 0.14 0.09 0.07 0.04 0.0 0.0 0.13 0.23 0.01 0.01 0.05 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.01 0.17 0.11 0.03 0.04 0.05 0.09 0.15 0.07 0.08 0.11 0.03 0.04 0.11 0.0 0.76
Solyc12g095880.2.1 (Solyc12g095880.2)
0.65 0.58 0.87 1.0 0.24 0.19 0.34 0.17 0.43 0.32 0.29 0.28 0.27 0.24 0.6 0.53 0.55 0.02 0.0 0.46 0.23 0.38 0.32 0.34 0.34 0.56 0.37 0.41 0.39 0.41 0.4 0.45 0.04 0.8

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)