Heatmap: Cluster_77 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g088200.3.1 (Solyc01g088200.3)
2.45 - 3.02 -1.23 -0.31 -2.72 -3.08 -3.61 -3.25 -1.36 -4.68 -3.29 -1.66 -0.86 -4.29 -5.44 -4.99 -3.79 -4.54 -2.05 -1.21 0.11 -0.55 0.16 0.46 -1.57 -0.64 -0.08 0.03 0.44 -0.17 0.74 - 2.41
Solyc01g094660.3.1 (Solyc01g094660.3)
0.91 -1.76 0.43 -1.2 -0.05 0.02 0.34 -1.03 -0.46 0.19 0.43 -0.04 1.42 0.96 0.59 0.6 0.45 - - -0.31 0.09 -0.29 -0.93 -0.71 -0.64 0.73 -0.44 -0.3 -0.31 -0.14 -0.16 0.1 -3.45 0.75
Solyc01g105240.3.1 (Solyc01g105240.3)
1.14 0.14 1.06 0.25 -0.43 -0.5 0.13 -0.82 -0.02 0.38 -0.16 -0.35 0.44 -0.08 0.51 0.83 0.71 -2.96 -2.46 -0.47 -0.73 -0.41 -0.33 -0.47 -0.54 0.51 -0.18 -0.4 -0.48 -0.36 -0.3 -0.24 -1.56 1.05
Solyc01g109980.3.1 (Solyc01g109980.3)
1.48 -7.07 2.39 -1.71 0.74 -0.13 -0.34 -0.39 -0.47 -0.5 -1.17 -0.29 -0.81 -0.65 -0.46 -0.35 -0.67 - -10.61 0.11 0.68 -0.46 -0.88 -0.82 -0.53 0.76 -0.92 -1.02 -0.77 -0.62 -0.47 -0.21 -1.76 2.15
Solyc02g021680.3.1 (Solyc02g021680.3)
2.48 1.69 2.33 2.65 -0.08 -3.15 0.63 -3.87 -0.77 -0.43 -1.43 -2.8 -5.86 -7.54 -2.75 -8.39 -4.09 - -7.69 1.05 -2.97 -1.74 - -4.77 -3.53 1.47 -8.97 -5.91 -6.99 -2.64 -2.59 -0.69 - 1.47
Solyc03g033825.1.1 (Solyc03g033825.1)
0.97 -1.15 -0.46 -1.14 -0.93 -0.2 0.37 -0.65 0.2 0.4 0.54 0.12 0.79 0.43 0.05 0.72 -0.09 - -6.16 0.31 0.68 -0.2 -0.84 -0.66 -0.34 1.71 -1.36 -0.71 -0.59 -0.88 -0.79 0.47 -3.68 1.11
Solyc03g033830.2.1 (Solyc03g033830.2)
1.04 -1.52 0.07 -0.65 -0.79 -0.47 0.39 -0.86 -1.24 0.34 0.28 -0.52 0.24 -1.17 0.26 0.48 0.01 -5.25 -6.57 0.56 1.25 -0.15 -0.82 -0.73 -0.85 1.64 -1.58 -0.4 -0.47 -0.09 0.13 0.78 -4.31 1.42
Solyc03g059250.3.1 (Solyc03g059250.3)
1.12 -0.43 1.58 -0.51 0.72 -0.17 0.31 -0.85 0.05 -0.36 0.1 -0.64 0.51 -0.01 -1.06 -1.69 -1.55 - - -1.09 0.0 0.04 0.07 0.05 -0.24 -0.53 -0.06 -0.08 -0.36 0.17 0.18 0.19 -2.39 1.85
Solyc03g098430.3.1 (Solyc03g098430.3)
-1.19 0.22 2.75 0.3 1.05 -0.71 1.09 -0.95 -0.4 -0.07 1.02 0.14 1.26 0.58 -0.85 -0.71 -0.8 - -8.33 -1.95 -0.23 -0.67 -0.74 -0.99 -1.28 -1.08 -0.44 -0.62 -0.77 -0.72 -0.55 -0.84 -4.76 0.09
Solyc03g116060.3.1 (Solyc03g116060.3)
1.01 0.05 1.09 0.03 0.49 -0.03 0.8 0.15 0.04 -0.01 -0.82 -0.98 -2.23 -1.66 -1.15 -2.43 -2.08 -8.14 -9.11 0.01 0.21 0.61 0.59 0.57 0.53 -0.0 -0.54 -0.81 -0.53 0.15 0.42 0.18 -1.02 1.55
Solyc04g007610.3.1 (Solyc04g007610.3)
0.22 0.13 1.03 0.65 0.15 -0.47 -0.16 -0.61 -0.01 0.4 -0.16 -0.21 0.17 0.01 0.72 0.79 0.6 -1.51 -0.31 -0.42 -0.7 -0.45 -0.11 -0.26 -0.55 0.3 -0.11 -0.19 -0.37 -0.44 -0.39 -0.52 -1.27 0.63
Solyc04g009150.1.1 (Solyc04g009150.1)
-0.11 -1.34 1.41 -0.23 1.54 -0.26 -0.75 -0.1 -0.81 0.23 -0.84 -0.8 -1.16 -2.27 -1.33 -2.28 -2.32 - - 0.09 0.9 0.76 -0.84 -0.09 0.08 -2.37 -0.2 -0.05 0.22 0.91 0.53 1.39 -5.14 1.68
Solyc04g025170.3.1 (Solyc04g025170.3)
0.9 -0.12 2.16 1.29 -0.37 -0.67 1.01 -1.13 -0.21 -0.48 -0.15 -0.47 0.09 -0.37 -0.57 -0.94 -0.72 - -9.47 -0.61 0.08 -0.27 -0.32 -0.41 -0.43 0.83 -0.44 -0.49 -0.5 -0.32 -0.22 0.11 -4.46 1.02
Solyc04g025180.3.1 (Solyc04g025180.3)
0.98 0.03 1.59 1.09 -1.17 -0.98 0.83 -0.99 -0.05 -0.31 0.1 -0.09 0.55 -0.16 -0.54 -0.91 -0.7 - - -0.16 0.3 -0.09 -0.16 -0.18 -0.38 1.17 -0.33 -0.23 -0.41 -0.25 -0.18 0.11 -4.5 0.63
Solyc04g025210.3.1 (Solyc04g025210.3)
1.63 -0.66 1.59 0.17 0.15 -0.38 -0.18 -0.37 -0.33 0.13 -0.36 -0.51 -0.42 -0.73 -0.8 -0.93 -0.9 -9.1 -9.85 0.34 -0.01 -0.05 -0.47 -0.25 -0.28 0.75 -0.27 -0.2 -0.3 -0.11 0.0 0.25 -3.47 1.69
Solyc04g076030.2.1 (Solyc04g076030.2)
1.37 -1.87 0.03 -2.14 0.18 -0.03 0.43 -0.53 0.33 0.22 -0.05 -0.8 0.89 0.27 -1.06 -1.63 -1.4 -12.39 - -0.21 -0.2 0.08 -0.44 -0.15 -0.18 0.64 -0.34 -0.26 -0.25 0.21 0.39 0.44 -1.84 2.04
Solyc04g079710.3.1 (Solyc04g079710.3)
1.82 -6.25 2.4 -0.19 0.7 0.05 -2.96 -0.24 0.02 0.38 0.32 -0.2 -2.56 -1.79 -1.45 -0.97 -1.47 - - -2.0 -1.12 0.06 0.85 0.25 -0.35 -1.87 -1.09 -1.33 -1.97 -0.31 0.14 -0.83 -2.31 2.3
Solyc04g081440.3.1 (Solyc04g081440.3)
1.19 0.09 0.72 0.31 0.31 -0.18 -0.06 -1.28 -0.51 -0.44 -0.19 -0.16 -0.37 -0.52 -0.29 -0.98 -0.82 -12.58 -11.97 0.01 0.52 -0.05 -0.11 0.03 0.26 0.81 -0.31 -0.04 0.29 -0.1 -0.17 0.21 -1.36 1.61
Solyc04g082600.3.1 (Solyc04g082600.3)
0.95 -1.1 1.66 0.57 -0.02 -0.57 -0.11 -0.88 0.43 0.06 0.2 0.04 0.0 -0.19 -0.85 -1.65 -1.31 -3.57 -3.19 -0.35 -0.03 -0.1 -0.22 -0.16 -0.25 0.33 -0.24 -0.45 -0.42 -0.09 -0.01 0.06 -0.53 1.75
Solyc05g014160.3.1 (Solyc05g014160.3)
0.66 0.68 -0.26 -0.28 -0.12 -0.31 0.56 -0.67 0.17 0.16 -0.65 -0.73 0.13 0.08 0.61 0.49 0.77 -3.74 -3.31 -1.03 -0.71 0.07 -0.4 -0.2 -0.22 0.73 -0.19 -0.15 -0.29 0.17 0.09 0.4 -3.23 1.26
Solyc05g014163.1.1 (Solyc05g014163.1)
0.93 0.72 -0.55 -0.06 0.21 -0.2 1.09 -0.12 0.27 -1.01 -0.66 -0.47 0.4 0.05 0.33 0.01 0.36 -3.73 -2.66 -0.66 -1.37 0.2 -0.86 -0.24 -0.42 1.1 -0.76 -0.46 -0.44 0.25 0.12 0.26 -3.41 1.3
Solyc05g015480.3.1 (Solyc05g015480.3)
2.6 -6.54 1.77 -2.61 -1.02 -2.68 -1.63 - -3.34 -0.3 -1.13 -2.91 -1.44 -2.27 -0.86 -0.14 0.06 - - 0.68 0.8 -0.53 -3.1 -1.02 0.16 0.13 -1.15 -0.46 -0.34 -0.37 -0.82 0.43 -7.43 2.86
Solyc06g068560.3.1 (Solyc06g068560.3)
1.21 0.78 1.74 1.52 -1.26 -0.79 0.31 -0.99 0.08 0.3 -0.05 -0.2 -0.04 -0.33 0.45 0.51 0.48 -9.55 -9.99 -0.97 -1.03 -0.66 -0.37 -0.36 -0.75 -0.2 -0.5 -0.57 -0.68 -0.92 -0.48 -0.82 -2.07 1.16
Solyc07g025370.3.1 (Solyc07g025370.3)
1.49 -0.19 1.1 0.71 0.95 -0.17 -0.2 -1.25 -0.3 0.22 0.11 -0.5 -0.22 -0.92 0.44 0.42 0.45 -8.36 -8.9 -1.34 -0.18 -0.23 -1.13 -0.77 -0.45 -0.87 -1.21 -0.77 -0.69 -0.09 -0.15 0.27 -1.54 1.9
Solyc07g047770.3.1 (Solyc07g047770.3)
-0.26 -2.34 1.39 0.83 0.27 -0.48 -0.08 -0.36 -0.09 0.35 1.08 0.26 0.74 0.52 0.19 -0.04 -0.32 - -8.2 -0.68 -0.21 -0.02 0.41 0.42 -0.17 -0.13 0.06 -0.06 -0.56 -0.19 -0.21 -0.51 -2.87 0.23
Solyc07g056260.3.1 (Solyc07g056260.3)
0.12 -1.44 0.88 -0.42 0.72 0.12 0.76 0.11 0.5 1.06 -0.38 -1.04 -1.32 -1.76 0.26 -0.36 -0.34 -10.17 - -0.1 0.11 0.16 -0.45 -0.12 -0.41 0.57 -0.09 -0.2 -0.62 0.34 0.19 0.89 -4.69 1.29
Solyc07g063300.3.1 (Solyc07g063300.3)
0.62 -1.1 1.55 0.8 0.14 -0.55 0.18 -0.87 0.38 0.08 -1.06 -1.35 -0.79 -1.14 0.73 0.65 0.75 -6.1 -6.22 -0.66 -0.35 0.08 -0.5 -0.12 0.11 -0.3 -0.16 0.09 0.13 0.14 -0.15 0.3 -2.99 1.18
Solyc07g066480.3.1 (Solyc07g066480.3)
0.24 -1.92 -0.1 -0.77 0.63 -0.64 -0.01 -1.25 0.3 0.83 0.17 0.45 0.43 -0.04 0.63 0.6 0.48 -1.01 -1.9 -0.74 0.66 -0.32 0.27 -0.28 -0.81 1.02 0.21 -0.12 -0.14 -0.34 -0.06 -0.33 -4.15 0.26
Solyc08g007910.3.1 (Solyc08g007910.3)
1.26 1.0 1.41 1.23 0.18 -0.88 0.32 -1.89 -0.07 -0.23 0.7 0.12 0.75 0.28 -0.43 -0.57 -0.51 -5.95 -4.06 -0.64 -0.28 -0.67 -0.68 -0.58 -0.73 0.51 -0.73 -0.83 -1.05 -0.82 -0.59 -0.52 -4.08 1.45
Solyc08g023460.3.1 (Solyc08g023460.3)
0.37 -0.12 0.78 0.76 -0.89 -0.85 -0.54 -1.14 0.24 0.35 -0.31 -1.06 0.03 -0.02 0.84 0.69 0.7 -3.54 -3.99 0.04 -0.41 -0.37 -0.34 -0.18 -0.28 0.86 0.03 0.03 0.14 -0.21 -0.26 -0.02 -2.88 1.25
Solyc08g065250.3.1 (Solyc08g065250.3)
0.33 -0.11 0.73 0.99 -0.1 -0.69 0.36 -0.81 -0.1 0.31 -0.51 -0.68 -0.26 -0.22 0.59 0.65 0.48 -1.68 -0.51 -0.32 -0.03 -0.12 0.18 0.11 -0.29 0.37 -0.19 -0.16 -0.03 -0.32 -0.1 -0.21 -2.32 0.6
Solyc08g069140.3.1 (Solyc08g069140.3)
1.56 1.34 2.76 1.74 -0.58 -1.11 1.29 -1.43 -0.09 -0.71 -0.18 -0.85 1.02 0.51 -0.01 -0.36 -0.45 -9.59 - -5.33 -2.17 -2.01 -1.39 -1.86 -2.27 -3.61 -0.8 -1.07 -1.4 -1.8 -1.55 -2.31 -3.45 0.78
Solyc08g077780.3.1 (Solyc08g077780.3)
0.25 -0.33 2.16 0.76 0.32 -0.3 -1.07 -1.7 -0.51 -0.42 1.21 0.16 1.52 1.11 -1.55 -1.2 -0.12 - -11.61 0.07 0.16 -1.29 -1.42 -1.0 -0.7 0.15 -1.18 -1.25 -1.09 -1.68 -1.4 -0.38 -1.52 1.62
Solyc08g080110.3.1 (Solyc08g080110.3)
0.54 -0.75 0.92 0.25 -0.81 -0.52 -0.5 -1.08 0.21 0.06 0.05 0.08 0.64 0.51 0.61 0.66 0.56 -2.48 -2.25 0.1 -0.11 -0.51 -0.67 -0.47 -0.56 0.6 -0.37 -0.36 -0.34 -0.47 -0.45 -0.23 -1.72 1.58
Solyc09g055570.3.1 (Solyc09g055570.3)
1.24 -1.46 1.28 0.1 -0.71 -0.63 0.58 -0.55 0.35 0.46 -0.28 -0.69 0.37 -0.27 -0.02 0.06 0.01 -7.42 -7.95 -0.32 -0.09 0.01 -0.18 -0.12 -0.27 0.43 -0.22 -0.01 -0.17 -0.16 -0.13 0.15 -3.41 1.37
Solyc09g055590.3.1 (Solyc09g055590.3)
0.73 0.11 0.96 0.95 -0.41 -0.63 0.5 -0.9 -0.79 -0.03 0.41 0.33 0.86 0.68 0.06 -0.03 0.01 -2.81 -2.83 -0.39 0.35 -0.22 -0.5 -0.36 -0.23 0.62 -0.59 -0.37 -0.37 -0.32 -0.36 -0.15 -1.56 0.43
Solyc09g065700.3.1 (Solyc09g065700.3)
0.88 -0.34 0.51 0.49 -0.83 -0.9 1.35 -1.02 -0.27 0.48 -0.48 -0.87 0.62 -0.22 -0.3 -0.43 -0.34 -0.75 -1.28 -0.49 0.13 -0.23 0.21 0.2 -0.31 0.88 0.22 0.27 -0.06 -0.2 -0.18 -0.21 -3.26 0.56
Solyc09g066280.3.1 (Solyc09g066280.3)
-0.01 -1.69 -0.15 -2.0 1.82 -0.47 0.51 -0.37 -0.23 -0.01 -0.34 -1.9 -0.37 -1.24 -0.08 -0.27 -0.36 - - -0.34 0.76 0.19 -0.72 -0.23 -0.15 0.24 -0.25 0.05 -0.17 0.41 0.25 1.19 -3.96 1.86
Solyc09g091850.3.1 (Solyc09g091850.3)
-0.27 -1.28 1.3 0.31 0.51 -0.66 0.43 -0.97 -0.18 0.29 -0.46 -1.17 0.02 -0.37 0.41 0.23 0.13 -6.12 -5.57 -0.66 0.14 0.08 -0.09 0.02 -0.04 0.63 -0.07 0.03 -0.0 0.06 0.09 0.4 -3.62 1.43
Solyc10g081200.1.1 (Solyc10g081200.1)
0.58 -1.71 0.39 0.85 1.31 -0.24 0.12 -0.87 -0.27 -0.2 -0.58 -1.17 0.02 -0.72 -0.81 -1.16 -0.95 - - -0.02 0.94 0.07 0.13 0.33 -0.05 0.81 0.06 0.44 0.05 0.22 0.07 0.15 -3.4 1.18
Solyc11g017190.2.1 (Solyc11g017190.2)
0.16 -0.63 0.93 0.91 -0.07 -0.61 -0.13 -0.91 -0.23 0.6 -0.2 -0.43 0.53 -0.16 0.56 0.84 0.79 -6.4 -6.77 0.08 -0.08 -0.3 -0.05 -0.09 -0.34 0.8 -0.16 -0.14 -0.23 -0.31 -0.34 -0.16 -3.59 0.66
Solyc11g069530.2.1 (Solyc11g069530.2)
0.13 -0.78 0.81 0.26 -0.21 -0.85 -0.22 -1.15 -0.11 0.09 -0.33 -0.57 0.64 0.32 1.3 0.82 1.56 -2.19 -0.53 -0.08 -0.27 -0.64 -0.79 -0.7 -0.79 0.47 -0.08 -0.21 -0.15 -0.39 -0.35 -0.24 -4.05 0.65
Solyc12g005590.2.1 (Solyc12g005590.2)
1.09 -1.32 0.52 -0.58 0.32 -0.68 -0.78 -1.52 -0.29 0.01 -0.28 -0.89 0.58 -0.19 0.83 0.99 0.82 -1.44 -3.33 0.28 0.41 -0.23 -0.67 -0.29 0.05 0.64 -0.55 -0.13 0.06 -0.33 -0.3 0.17 -4.01 1.11
Solyc12g008990.2.1 (Solyc12g008990.2)
0.59 1.1 2.71 -0.64 -0.9 -0.87 1.31 -1.02 -0.43 -1.79 -0.17 -0.22 1.42 1.46 -1.45 -2.11 -2.12 -3.79 -4.06 -1.37 -0.4 -1.37 -0.59 -1.15 -1.68 0.2 0.58 0.25 0.14 -1.1 -0.64 -1.45 -3.46 -1.02
Solyc12g017910.2.1 (Solyc12g017910.2)
1.37 -1.01 1.04 0.16 -0.14 -0.28 -0.02 -1.02 0.06 -0.11 -0.09 -0.72 -0.0 -0.34 -0.61 -0.98 -0.89 -5.86 -6.02 -0.45 -0.23 0.23 0.1 0.15 0.08 0.05 0.35 0.23 0.14 0.33 0.29 0.25 -1.55 1.54
Solyc12g017915.1.1 (Solyc12g017915.1)
2.16 -0.84 1.12 0.23 -3.25 -0.38 -0.11 -1.05 -0.9 -0.49 -0.62 -0.86 -1.12 -1.19 -0.31 -0.78 -0.64 -7.38 -6.25 -0.64 -3.69 0.27 -0.18 0.26 0.39 -3.43 -0.14 0.36 0.31 0.39 0.12 0.66 -1.3 2.23
Solyc12g089130.2.1 (Solyc12g089130.2)
3.17 -3.4 0.37 -0.23 -0.7 -1.51 -6.36 -5.56 0.25 1.07 -3.18 -3.81 -1.25 -2.16 -2.57 -1.98 -2.04 -2.29 -2.92 0.58 -0.0 -1.82 -1.37 -1.02 -0.33 0.44 -0.7 -0.55 -0.03 -1.68 -1.66 -0.06 -4.82 2.79
Solyc12g095880.2.1 (Solyc12g095880.2)
0.71 0.54 1.14 1.33 -0.71 -1.06 -0.21 -1.2 0.13 -0.3 -0.43 -0.49 -0.54 -0.74 0.59 0.42 0.47 -4.56 -6.38 0.21 -0.79 -0.06 -0.33 -0.22 -0.2 0.5 -0.09 0.04 -0.02 0.04 0.01 0.18 -3.43 1.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.