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Heatmap: Cluster_173 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-2.49 0.2 1.24 -1.09 0.1 -0.7 -0.88 -0.59 -2.09 0.58 -0.69 -0.65 0.42 0.24 0.35 -1.34 0.02 0.17 0.03 0.43 0.19 1.18 -1.12 -0.65 0.5 -0.11 0.16 -0.75 -1.0 -0.12 -0.15 -1.09 -0.0 0.04 -1.28 -1.54 -0.24 0.81 -0.52 0.59 0.61 0.78 0.68 0.15 0.01 0.82 -0.39 -0.23
-2.76 -0.83 -2.14 -2.92 1.23 0.95 0.72 1.39 -0.47 1.08 -1.62 -2.02 1.19 1.51 0.58 -0.38 0.59 -0.95 0.3 0.96 1.22 1.43 -1.21 -1.66 0.56 -0.29 -0.45 -4.18 -3.49 -2.06 -0.61 -2.89 -2.82 -4.5 -6.58 -3.8 -4.18 0.21 -2.5 -0.7 1.3 1.53 0.33 -0.49 -2.36 0.26 -0.89 -0.2
0.22 0.15 0.23 -1.74 0.79 0.33 0.05 -0.04 -0.41 0.04 -1.04 -0.83 0.34 0.6 0.09 -0.17 0.55 0.03 0.54 0.47 0.55 0.46 -0.92 -0.79 0.33 -0.33 -0.1 -0.2 -0.67 -0.2 -0.36 -0.25 -0.27 0.04 0.09 -0.3 -0.24 0.24 -0.16 -0.11 0.13 -0.04 0.07 -0.12 -0.06 0.24 -0.31 -0.17
- -1.45 -4.34 0.96 2.26 0.1 -0.7 -0.57 -6.19 1.05 -3.56 -3.91 -0.98 -1.81 1.33 - -0.88 -4.3 -0.93 0.17 -0.59 -1.87 -3.95 -3.56 -2.81 -3.84 -1.66 -0.8 -0.9 0.58 1.23 -1.79 0.38 0.54 -2.52 -2.26 0.02 1.48 -0.86 1.54 1.0 0.87 1.18 0.4 -0.18 1.5 0.38 0.01
-0.48 -1.11 -0.46 -2.48 1.6 -0.03 -0.67 -0.55 -1.07 0.12 -0.72 -1.16 -0.33 -0.7 0.4 -0.93 0.01 0.7 0.07 0.72 0.31 0.71 -1.89 1.64 0.96 0.42 0.07 -0.78 -1.34 -0.22 -0.61 -0.25 -0.3 -0.17 -1.64 -1.51 -0.27 0.16 -0.28 0.2 0.56 0.57 0.33 0.33 -0.24 0.04 0.04 -0.29
-0.72 -0.17 -0.13 -2.26 0.03 0.06 -0.73 -0.36 -0.53 -0.08 -0.98 -0.85 -0.93 -0.56 0.14 -0.18 0.06 -1.02 0.7 1.14 0.95 0.34 1.08 -0.44 -0.53 -1.16 -0.75 -0.03 -1.32 0.46 -0.57 -0.51 0.67 0.12 -1.93 -0.2 -0.71 0.16 -0.43 0.76 0.39 0.32 0.93 0.59 0.65 0.1 0.26 0.02
-0.21 -0.32 0.49 -0.55 -0.37 -0.15 -0.6 -0.31 0.2 0.56 0.2 0.23 1.2 1.01 0.24 -1.83 -0.67 -0.71 -0.09 0.42 0.57 0.5 -1.75 -1.57 0.46 0.07 1.07 -0.92 -1.62 -0.65 -0.15 -0.05 -0.21 -0.41 -0.41 -1.03 -0.15 0.1 -0.46 0.22 0.52 0.28 0.43 0.09 -0.3 0.12 0.05 -0.44
-1.21 -0.77 -0.47 -1.72 1.43 -1.03 -1.09 -1.31 -1.38 0.36 -0.56 -0.62 0.14 0.9 0.45 -0.44 0.59 -0.61 0.42 0.71 0.64 0.29 0.01 -0.68 -0.04 -0.74 -0.96 -1.18 -0.65 -0.29 -0.89 -0.34 0.21 -0.3 -0.92 0.04 -0.84 0.31 -0.48 0.78 1.0 1.08 0.79 0.52 0.5 0.23 -0.29 -0.92
0.24 0.39 0.51 0.44 -0.92 -0.11 -0.77 -0.74 0.15 0.17 -0.05 0.0 0.65 0.85 0.28 0.68 0.74 0.15 0.18 -0.08 -0.07 0.2 0.22 0.41 -0.39 0.42 -0.7 -0.86 -0.26 -0.28 -0.59 -0.82 -0.35 -0.28 -0.9 -0.9 -0.58 -0.04 -0.58 0.27 0.28 0.43 0.4 -0.18 -0.4 -0.06 -0.51 -0.49
-1.04 -1.01 -0.65 -1.06 0.9 -0.68 -0.15 -0.16 0.19 0.94 -0.18 -0.17 0.11 -0.22 0.72 -1.3 0.38 -0.42 0.18 0.68 0.73 0.87 -1.36 -1.21 -0.16 -0.51 -1.13 -0.44 -0.8 0.24 0.22 -0.69 0.33 -0.22 -1.66 -1.25 -0.08 0.68 -1.33 0.48 0.45 0.26 0.78 0.21 -0.08 0.77 0.08 0.07
-0.89 -0.17 0.32 -0.74 0.94 0.63 0.26 0.31 0.19 0.16 -0.57 -0.73 0.55 0.79 0.07 -0.98 -1.07 -0.71 0.76 0.75 0.49 0.68 -0.74 -1.05 0.57 -0.69 0.81 -0.64 -0.67 -0.53 -0.4 -0.4 -0.41 -0.33 -0.44 -0.84 -0.13 -0.09 -0.35 0.03 0.71 0.37 0.36 -0.25 -0.58 -0.05 -0.45 -0.48
0.11 -1.03 -2.52 -3.43 1.15 -0.89 -0.76 -0.92 -0.88 0.28 -2.93 -3.15 0.04 0.29 -0.01 0.06 0.08 0.36 0.52 1.02 1.2 1.15 -2.58 0.84 0.72 -0.27 -1.04 -0.03 -0.09 -0.29 -0.23 -0.44 0.34 0.37 -1.26 0.06 0.4 0.27 -0.19 0.06 -0.06 0.03 0.15 0.13 0.3 0.27 -0.43 -0.71
-0.01 -1.36 -1.73 -5.93 1.46 -0.44 -1.18 -1.34 -0.87 0.27 -0.62 -0.67 0.41 1.05 0.5 -0.28 0.57 -1.49 0.78 1.19 1.13 0.82 1.36 -2.27 0.59 -0.62 0.43 -2.05 -2.26 -1.0 -0.33 -0.65 -0.49 -1.57 -1.34 -1.32 -0.41 -0.04 -0.7 0.12 0.89 0.73 0.48 0.11 -0.53 0.0 -0.5 0.24
-1.02 -1.22 -0.92 -2.44 1.24 -0.39 -1.42 -1.49 -2.38 0.93 -1.6 -1.55 0.64 0.93 0.55 -1.03 0.49 -0.19 0.11 0.71 0.8 1.06 -3.86 -0.87 0.2 -1.33 -0.6 -0.69 -1.35 -0.46 0.1 -0.83 0.21 0.0 -1.82 -0.2 -0.25 0.38 0.11 0.97 0.95 0.7 0.96 0.34 0.29 0.3 -0.16 -0.48
-1.36 -0.41 -0.52 -2.3 1.45 0.17 -0.8 -0.76 -1.69 -0.14 -2.31 -2.26 0.12 1.24 0.16 -1.05 0.27 -0.49 0.55 0.54 1.01 0.83 -1.22 -0.34 -0.09 -0.05 -0.59 -0.61 -1.16 -0.53 -0.34 -0.73 0.05 -0.23 -1.22 -0.39 -0.12 0.15 0.1 0.73 1.02 0.97 0.8 0.14 0.15 0.27 -0.55 -0.01
-1.34 -2.96 -3.06 -3.07 -1.36 0.19 -0.04 0.07 -1.44 1.5 -0.8 -1.08 0.91 -0.62 1.29 -3.15 -0.56 -1.13 0.77 0.89 1.31 1.04 -3.14 -3.15 -0.15 -0.68 -0.95 -2.29 -2.57 -0.26 1.16 -0.92 0.25 -0.4 -1.82 0.36 0.63 0.74 -1.67 0.71 0.5 0.03 0.71 0.05 -0.67 0.72 0.18 0.73
-1.37 0.07 0.36 -1.17 1.13 0.56 0.38 0.72 -0.85 0.19 -2.36 -2.11 -0.1 0.17 0.05 0.71 0.83 0.47 0.04 0.62 0.63 0.45 -0.28 -0.64 0.19 -0.12 0.19 -0.47 -0.97 -0.37 0.28 0.0 -0.15 -0.11 -1.88 -1.07 0.13 0.14 -0.75 0.16 0.14 0.09 -0.04 -0.4 -0.46 0.01 -0.44 -0.01
-6.37 -0.66 -1.44 -2.72 -0.11 -1.39 -2.54 -2.03 -1.17 0.89 -0.83 -1.61 0.4 0.93 0.55 -2.16 1.0 -0.69 1.24 1.68 1.62 0.89 0.01 -3.08 -0.02 -0.64 -0.8 0.02 0.94 -1.26 0.85 -1.9 -0.86 -1.26 -3.23 -1.95 -0.51 0.51 -0.85 0.59 0.3 0.58 0.99 -0.15 -1.09 0.68 -0.1 0.02
-0.73 -0.69 -0.72 -1.75 1.51 -0.79 -1.32 -0.86 -0.98 0.21 -1.5 -1.88 0.21 -0.1 -0.02 -0.49 0.54 -0.54 1.25 1.34 0.85 0.31 -0.72 0.42 0.1 -0.67 0.14 -0.63 -0.4 -0.21 -0.3 -0.21 -0.02 -0.1 -0.99 -0.77 -0.02 0.45 -0.91 0.25 0.88 0.77 0.17 0.13 -0.04 0.53 -0.41 -0.7
-0.71 -0.99 -0.94 -2.87 0.92 -0.74 -1.24 -1.2 -0.91 0.18 -0.96 -0.81 0.25 0.55 0.63 -2.01 -1.0 -0.93 0.48 0.42 0.48 0.22 0.89 0.42 0.52 -1.37 0.48 -0.41 -0.86 -0.12 -0.27 -0.02 0.08 -0.4 -1.54 -0.22 0.05 -0.17 -0.47 0.73 1.19 1.02 0.9 0.42 0.3 -0.19 -0.3 0.22
-1.24 -1.0 -1.81 -2.91 1.29 0.18 -0.18 -0.15 -0.62 0.63 0.35 0.33 0.29 -0.69 0.46 -0.19 -0.03 -1.74 -0.26 1.1 0.66 0.43 -3.07 -2.66 -0.01 -0.01 -0.48 -0.27 -0.25 -0.29 0.15 0.72 0.06 -0.26 -1.88 -0.82 0.41 0.24 -0.69 -0.1 0.31 0.51 0.5 0.23 0.2 0.23 0.05 0.75
0.83 0.99 -0.37 0.24 0.95 1.62 1.25 1.3 1.33 0.52 -4.2 -4.22 1.15 0.45 0.07 0.43 0.17 -1.4 0.1 -0.37 -0.55 -0.34 -0.65 -2.16 -0.44 -1.37 -1.73 -1.34 -0.31 -0.61 -0.74 -1.87 -0.86 -0.99 -2.59 -1.69 -0.77 0.55 -1.59 -0.78 0.31 0.61 -0.03 -0.57 -1.15 0.47 -0.66 0.25
-0.99 -3.16 -4.45 -5.29 2.2 2.07 2.31 1.4 -1.38 1.32 -1.41 -2.06 1.61 0.72 0.86 -0.56 1.03 -4.0 1.76 1.91 0.43 -1.49 -3.61 -4.8 -3.04 -3.12 -2.54 -3.16 -6.67 -2.12 -2.76 -4.57 -4.93 -6.32 -4.99 -3.54 -5.88 0.65 -4.65 -2.09 0.05 0.72 -1.91 -3.59 -5.48 0.73 -3.24 0.49
-0.16 -0.05 -0.26 -2.06 1.29 -0.88 -0.81 -0.95 -0.14 0.13 0.07 0.05 0.46 0.98 0.04 0.74 0.45 -0.35 0.45 0.48 0.69 0.43 -1.22 -1.14 -0.06 -0.26 0.25 -0.86 -0.67 -0.4 -0.52 -0.13 -0.13 -0.52 -0.93 -0.66 -0.43 -0.13 -0.32 0.34 0.6 0.5 0.54 0.15 0.14 -0.07 -0.45 -0.36
0.46 -0.62 -1.41 -0.86 -0.06 -0.64 -0.49 -0.3 -0.12 0.51 -4.12 -3.39 1.08 0.97 0.61 0.57 0.78 0.58 0.31 0.02 -0.07 0.73 -2.18 -0.63 0.15 0.76 -0.46 -0.36 -1.45 -0.44 -0.64 -2.29 -0.19 -0.81 -1.55 -1.11 0.27 0.83 -0.74 0.25 0.42 0.53 1.11 0.11 0.14 0.78 -0.81 -0.51
-0.63 -0.79 -0.16 -2.64 1.29 0.31 0.28 0.33 -0.47 0.21 -1.27 -1.38 0.43 0.45 0.4 -0.91 -0.78 -0.84 0.5 0.72 0.61 0.49 -1.02 0.44 0.26 -1.03 0.39 -0.21 -0.54 -0.14 -0.07 -0.25 0.03 -0.26 -0.66 -0.37 0.14 0.11 -0.61 0.25 0.75 0.36 0.3 -0.03 -0.03 0.01 -0.48 -0.11
-1.44 -0.51 -0.18 -3.26 0.84 -0.58 -0.91 -0.99 -0.09 0.2 -1.94 -2.42 0.25 0.33 0.23 -0.02 0.05 0.03 0.65 0.83 0.62 0.54 0.47 0.58 0.2 -0.22 -0.03 -0.04 -0.31 -0.24 0.04 -0.23 0.28 0.2 -0.62 -0.16 0.36 0.13 0.15 0.26 -0.21 -0.59 0.39 0.27 0.35 0.12 -0.22 -0.56
-0.69 -0.01 -0.13 -3.24 1.06 -0.68 -0.49 -0.55 -0.48 0.28 -1.26 -1.6 -0.19 0.2 0.14 -0.4 0.16 -0.58 0.29 0.07 -0.08 0.02 0.05 0.91 -0.19 -1.02 0.23 -0.18 -0.29 -0.27 -0.14 -0.34 0.2 0.14 -0.06 -0.97 -0.09 0.4 0.55 0.64 0.53 0.4 0.62 0.57 0.2 0.36 0.12 -0.49
-0.41 -0.55 -0.29 -2.36 0.99 -0.47 -0.55 -0.4 -0.93 0.16 0.05 -0.02 0.13 0.51 0.22 -1.2 -0.37 -0.8 0.01 0.46 0.62 0.32 -0.23 -1.22 0.25 -0.96 -0.39 -0.38 -0.05 -0.01 -0.03 -0.44 0.24 -0.11 -0.69 -1.04 -0.05 0.52 -0.54 0.63 0.9 0.88 0.75 0.29 0.15 0.53 -0.2 0.01
-0.65 -0.87 -0.4 -2.44 0.8 -0.75 -0.24 -0.45 -1.06 0.18 0.44 0.33 0.06 0.37 0.06 -1.44 -0.58 -0.99 0.32 0.57 0.66 0.36 -0.95 -0.91 -0.26 -1.21 -0.73 0.09 0.29 0.03 -0.01 0.35 0.38 0.14 -0.33 -0.75 0.12 0.45 -0.47 0.51 0.66 0.63 0.62 0.23 0.25 0.47 -0.08 -0.05
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-0.61 -0.78 -0.07 -1.35 0.62 -0.79 -0.06 0.05 -0.64 0.3 -0.83 -0.8 0.11 0.63 0.44 -1.42 -0.81 -0.58 0.69 0.78 0.77 0.52 -0.4 0.63 0.5 -0.53 0.06 -0.48 -0.5 -0.02 -0.27 -0.67 -0.08 -0.21 -1.31 -0.62 -0.17 0.3 -0.42 0.37 0.64 0.85 0.46 0.02 -0.04 0.34 -0.36 0.14
-1.9 -1.34 -0.48 -2.5 1.32 -0.8 -0.63 -0.66 -1.61 0.42 0.43 0.36 -0.01 -0.09 0.54 -1.31 -0.71 -0.68 0.29 0.83 1.03 0.8 -0.74 1.24 0.61 -0.47 0.37 -1.1 -1.49 -0.25 -0.49 -0.45 0.1 -0.32 -2.13 -1.5 -0.17 0.35 -0.85 0.55 0.77 0.76 0.49 -0.01 -0.03 0.31 -0.35 -0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.