Heatmap: Cluster_46 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Vegetative Sporophyte
Adult Sporophyte
Leaf (0 mg/L NH4NO3)
Leaf (30 mg/L NH4NO3)
Leaf (90 mg/L NH4NO3)
Sporophyte; w/o NH4NO3, w/o cyanobacteria
Sporophyte; w/o NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w/o cyanobacteria
Root Tip, D-3 6h mock treated
Root Tip, D-3 6h 0.1 uM IAA treated
Root Tip, D-3 6h 0.5 uM trans-zeatin treated
Microsporocarp
1.0 0.83 0.12 0.37 0.1 0.23 0.07 0.06 0.2 0.0 0.01 0.01 0.13
1.0 0.57 0.13 0.11 0.1 0.2 0.13 0.08 0.17 0.48 0.43 0.33 0.35
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38
1.0 0.03 0.2 0.24 0.22 0.3 0.26 0.26 0.25 0.36 0.36 0.35 0.57
1.0 0.01 0.2 0.39 0.25 0.29 0.39 0.43 0.32 0.25 0.26 0.24 0.1
1.0 0.41 0.25 0.27 0.2 0.65 0.8 0.83 0.76 0.19 0.21 0.22 0.23
1.0 0.45 0.14 0.11 0.14 0.42 0.39 0.37 0.58 0.08 0.08 0.09 0.16
1.0 0.49 0.52 0.57 0.78 0.65 0.67 0.7 0.83 0.58 0.54 0.56 0.13
1.0 0.18 0.51 0.49 0.52 0.27 0.25 0.24 0.29 0.14 0.12 0.11 0.35
1.0 0.08 0.11 0.1 0.25 0.01 0.01 0.0 0.0 0.66 0.51 0.69 0.04
1.0 0.11 0.1 0.14 0.14 0.18 0.23 0.27 0.29 0.19 0.19 0.2 0.04
1.0 0.01 0.14 0.18 0.32 0.03 0.04 0.04 0.06 0.06 0.03 0.01 0.06
1.0 0.08 0.88 0.85 0.54 0.01 0.09 0.14 0.24 0.09 0.09 0.11 0.06
1.0 0.74 0.06 0.04 0.09 0.31 0.18 0.13 0.21 0.2 0.19 0.21 0.09
1.0 0.28 0.37 0.55 0.56 0.22 0.19 0.19 0.2 0.79 0.71 0.79 0.33
1.0 0.1 0.44 0.5 0.57 0.45 0.38 0.34 0.44 0.52 0.53 0.52 0.36
0.97 0.58 0.72 0.61 0.86 1.0 0.77 0.66 0.88 0.63 0.66 0.66 0.36
0.94 0.06 0.56 1.0 0.62 0.29 0.31 0.37 0.32 0.69 0.67 0.68 0.16
1.0 0.09 0.51 0.19 0.2 0.14 0.16 0.13 0.12 0.04 0.01 0.0 0.03
1.0 0.95 0.26 0.28 0.29 0.41 0.38 0.36 0.45 0.34 0.33 0.35 0.48
1.0 0.27 0.13 0.14 0.21 0.39 0.42 0.42 0.57 0.48 0.56 0.56 0.23
1.0 0.26 0.15 0.18 0.16 0.24 0.23 0.25 0.24 0.28 0.27 0.26 0.04
1.0 0.04 0.07 0.12 0.13 0.89 0.04 0.01 0.43 0.03 0.03 0.03 0.0
1.0 0.04 0.43 0.48 0.46 0.16 0.16 0.15 0.19 0.21 0.21 0.21 0.17
Azfi_s0049.g030694 (ATB BETA)
1.0 0.05 0.37 0.45 0.57 0.66 0.61 0.58 0.67 0.58 0.52 0.61 0.21
1.0 0.21 0.04 0.04 0.04 0.09 0.08 0.07 0.09 0.03 0.03 0.03 0.04
1.0 0.05 0.14 0.15 0.12 0.42 0.53 0.57 0.54 0.13 0.12 0.13 0.13
1.0 0.04 0.08 0.14 0.11 0.29 0.31 0.3 0.26 0.07 0.06 0.06 0.06
1.0 0.17 0.09 0.09 0.15 0.21 0.23 0.23 0.29 0.31 0.28 0.3 0.15
1.0 0.11 0.04 0.04 0.06 0.05 0.04 0.04 0.03 0.15 0.15 0.14 0.0
1.0 0.22 0.31 0.53 0.35 0.53 0.53 0.59 0.63 0.04 0.04 0.05 0.04
1.0 0.03 0.02 0.05 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01
1.0 0.09 0.26 0.56 0.41 0.18 0.29 0.3 0.19 0.32 0.37 0.33 0.23
1.0 0.21 0.52 0.55 0.71 0.38 0.39 0.39 0.48 0.43 0.4 0.45 0.17
1.0 0.09 0.55 0.53 0.58 0.28 0.34 0.38 0.36 0.45 0.44 0.45 0.21
1.0 0.16 0.06 0.07 0.07 0.21 0.24 0.24 0.23 0.18 0.19 0.22 0.11
1.0 0.05 0.0 0.08 0.0 0.04 0.04 0.02 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0
1.0 0.07 0.72 0.76 0.78 0.44 0.49 0.51 0.59 0.62 0.61 0.68 0.63
1.0 0.32 0.18 0.33 0.29 0.14 0.16 0.19 0.14 0.59 0.48 0.56 0.09
1.0 0.14 0.21 0.22 0.15 0.11 0.08 0.08 0.14 0.12 0.11 0.12 0.14
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.96 0.29 0.2 0.24 0.58 0.37 0.32 0.37 0.01 0.02 0.02 0.1
1.0 0.04 0.15 0.11 0.25 0.06 0.04 0.04 0.05 0.41 0.37 0.39 0.11
1.0 0.03 0.14 0.44 0.12 0.13 0.08 0.05 0.14 0.01 0.01 0.01 0.18
1.0 0.58 0.22 0.23 0.24 0.31 0.35 0.4 0.33 0.0 0.0 0.0 0.32
1.0 0.01 0.35 0.54 0.32 0.38 0.42 0.41 0.33 0.32 0.33 0.31 0.41
1.0 0.07 0.04 0.04 0.03 0.06 0.1 0.14 0.07 0.03 0.03 0.03 0.1
1.0 0.24 0.1 0.08 0.1 0.18 0.2 0.21 0.27 0.2 0.21 0.21 0.05
1.0 0.01 0.07 0.03 0.04 0.05 0.05 0.05 0.05 0.01 0.01 0.01 0.11
1.0 0.02 0.18 0.17 0.28 0.03 0.05 0.05 0.04 0.08 0.06 0.1 0.09
1.0 0.01 0.02 0.03 0.05 0.03 0.03 0.03 0.04 0.04 0.03 0.04 0.01
1.0 0.09 0.15 0.23 0.2 0.16 0.31 0.31 0.37 0.27 0.28 0.29 0.15
1.0 0.39 0.31 0.36 0.32 0.26 0.29 0.33 0.23 0.12 0.21 0.15 0.19
1.0 0.12 0.35 0.14 0.25 0.14 0.16 0.17 0.15 0.0 0.0 0.01 0.03
1.0 0.06 0.02 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.03 0.0 0.01 0.02 0.0
1.0 0.18 0.09 0.11 0.13 0.05 0.05 0.05 0.06 0.12 0.09 0.12 0.44
1.0 0.0 0.4 0.5 0.5 0.3 0.26 0.25 0.33 0.4 0.42 0.43 0.19
1.0 0.05 0.05 0.15 0.05 0.03 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.09
1.0 0.24 0.42 0.56 0.59 0.49 0.45 0.44 0.44 0.35 0.31 0.33 0.29
1.0 0.04 0.16 0.23 0.19 0.2 0.23 0.25 0.23 0.28 0.27 0.25 0.07
1.0 0.01 0.03 0.03 0.03 0.05 0.05 0.06 0.05 0.03 0.03 0.03 0.01
1.0 0.08 0.44 0.53 0.57 0.28 0.22 0.21 0.25 0.34 0.4 0.39 0.81
1.0 0.03 0.02 0.05 0.03 0.05 0.05 0.06 0.04 0.08 0.07 0.07 0.12
1.0 0.64 0.18 0.23 0.34 0.27 0.27 0.29 0.43 0.44 0.45 0.44 0.03
1.0 0.05 0.24 0.2 0.27 0.25 0.21 0.18 0.19 0.48 0.48 0.49 0.24
1.0 0.08 0.4 0.36 0.47 0.24 0.44 0.42 0.4 0.53 0.48 0.5 0.2
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0
1.0 0.13 0.01 0.01 0.01 0.09 0.09 0.09 0.09 0.0 0.0 0.0 0.09
1.0 0.48 0.73 0.52 0.56 0.36 0.6 0.76 0.94 0.08 0.04 0.07 0.13
1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.29 0.77 0.77 0.97 0.34 0.55 0.59 0.42 0.19 0.2 0.19 0.23
0.72 0.01 1.0 0.79 0.59 0.02 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03
0.99 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 1.0
1.0 0.2 0.1 0.1 0.11 0.64 0.68 0.71 0.94 0.41 0.33 0.38 0.83
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0
1.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.06 0.06 0.06 0.0
1.0 0.18 0.36 0.37 0.43 0.37 0.34 0.32 0.4 0.62 0.54 0.6 0.33
0.91 0.02 1.0 0.98 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.04 0.04 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)