View as: (view raw or zlog-transformed)
View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)
(Values are normalized against highest expression of the row)
Gene | Vegetative Sporophyte | Adult Sporophyte | Leaf (0 mg/L NH4NO3) | Leaf (30 mg/L NH4NO3) | Leaf (90 mg/L NH4NO3) | Sporophyte; w/o NH4NO3, w/o cyanobacteria | Sporophyte; w/o NH4NO3, w cyanobacteria | Sporophyte; w NH4NO3, w cyanobacteria | Sporophyte; w NH4NO3, w/o cyanobacteria | Root Tip, D-3 6h mock treated | Root Tip, D-3 6h 0.1 uM IAA treated | Root Tip, D-3 6h 0.5 uM trans-zeatin treated | Microsporocarp |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Azfi_s0001.g000195 (RPOB) | 1.0 | 0.83 | 0.12 | 0.37 | 0.1 | 0.23 | 0.07 | 0.06 | 0.2 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.13 |
Azfi_s0001.g000218 (LOF1) | 1.0 | 0.57 | 0.13 | 0.11 | 0.1 | 0.2 | 0.13 | 0.08 | 0.17 | 0.48 | 0.43 | 0.33 | 0.35 |
Azfi_s0001.g000331 (TT7) | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.38 |
Azfi_s0001.g000812 (SAR1) | 1.0 | 0.03 | 0.2 | 0.24 | 0.22 | 0.3 | 0.26 | 0.26 | 0.25 | 0.36 | 0.36 | 0.35 | 0.57 |
1.0 | 0.01 | 0.2 | 0.39 | 0.25 | 0.29 | 0.39 | 0.43 | 0.32 | 0.25 | 0.26 | 0.24 | 0.1 | |
1.0 | 0.41 | 0.25 | 0.27 | 0.2 | 0.65 | 0.8 | 0.83 | 0.76 | 0.19 | 0.21 | 0.22 | 0.23 | |
Azfi_s0003.g007457 (PHR1) | 1.0 | 0.45 | 0.14 | 0.11 | 0.14 | 0.42 | 0.39 | 0.37 | 0.58 | 0.08 | 0.08 | 0.09 | 0.16 |
1.0 | 0.49 | 0.52 | 0.57 | 0.78 | 0.65 | 0.67 | 0.7 | 0.83 | 0.58 | 0.54 | 0.56 | 0.13 | |
1.0 | 0.18 | 0.51 | 0.49 | 0.52 | 0.27 | 0.25 | 0.24 | 0.29 | 0.14 | 0.12 | 0.11 | 0.35 | |
Azfi_s0005.g009119 (MYB50) | 1.0 | 0.08 | 0.11 | 0.1 | 0.25 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.66 | 0.51 | 0.69 | 0.04 |
1.0 | 0.11 | 0.1 | 0.14 | 0.14 | 0.18 | 0.23 | 0.27 | 0.29 | 0.19 | 0.19 | 0.2 | 0.04 | |
Azfi_s0007.g010932 (REME1) | 1.0 | 0.01 | 0.14 | 0.18 | 0.32 | 0.03 | 0.04 | 0.04 | 0.06 | 0.06 | 0.03 | 0.01 | 0.06 |
Azfi_s0008.g011642 (GSR 1) | 1.0 | 0.08 | 0.88 | 0.85 | 0.54 | 0.01 | 0.09 | 0.14 | 0.24 | 0.09 | 0.09 | 0.11 | 0.06 |
Azfi_s0009.g011773 (ATY53) | 1.0 | 0.74 | 0.06 | 0.04 | 0.09 | 0.31 | 0.18 | 0.13 | 0.21 | 0.2 | 0.19 | 0.21 | 0.09 |
1.0 | 0.28 | 0.37 | 0.55 | 0.56 | 0.22 | 0.19 | 0.19 | 0.2 | 0.79 | 0.71 | 0.79 | 0.33 | |
1.0 | 0.1 | 0.44 | 0.5 | 0.57 | 0.45 | 0.38 | 0.34 | 0.44 | 0.52 | 0.53 | 0.52 | 0.36 | |
Azfi_s0013.g013277 (ZFN1) | 0.97 | 0.58 | 0.72 | 0.61 | 0.86 | 1.0 | 0.77 | 0.66 | 0.88 | 0.63 | 0.66 | 0.66 | 0.36 |
0.94 | 0.06 | 0.56 | 1.0 | 0.62 | 0.29 | 0.31 | 0.37 | 0.32 | 0.69 | 0.67 | 0.68 | 0.16 | |
1.0 | 0.09 | 0.51 | 0.19 | 0.2 | 0.14 | 0.16 | 0.13 | 0.12 | 0.04 | 0.01 | 0.0 | 0.03 | |
Azfi_s0019.g015298 (SEU) | 1.0 | 0.95 | 0.26 | 0.28 | 0.29 | 0.41 | 0.38 | 0.36 | 0.45 | 0.34 | 0.33 | 0.35 | 0.48 |
Azfi_s0024.g020421 (TGA2) | 1.0 | 0.27 | 0.13 | 0.14 | 0.21 | 0.39 | 0.42 | 0.42 | 0.57 | 0.48 | 0.56 | 0.56 | 0.23 |
Azfi_s0027.g023506 (EIF5A) | 1.0 | 0.26 | 0.15 | 0.18 | 0.16 | 0.24 | 0.23 | 0.25 | 0.24 | 0.28 | 0.27 | 0.26 | 0.04 |
Azfi_s0028.g023780 (CA4) | 1.0 | 0.04 | 0.07 | 0.12 | 0.13 | 0.89 | 0.04 | 0.01 | 0.43 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.0 |
Azfi_s0040.g026638 (MBAC1) | 1.0 | 0.04 | 0.43 | 0.48 | 0.46 | 0.16 | 0.16 | 0.15 | 0.19 | 0.21 | 0.21 | 0.21 | 0.17 |
Azfi_s0049.g030694 (ATB BETA) | 1.0 | 0.05 | 0.37 | 0.45 | 0.57 | 0.66 | 0.61 | 0.58 | 0.67 | 0.58 | 0.52 | 0.61 | 0.21 |
1.0 | 0.21 | 0.04 | 0.04 | 0.04 | 0.09 | 0.08 | 0.07 | 0.09 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.04 | |
Azfi_s0051.g031243 (MINE1) | 1.0 | 0.05 | 0.14 | 0.15 | 0.12 | 0.42 | 0.53 | 0.57 | 0.54 | 0.13 | 0.12 | 0.13 | 0.13 |
1.0 | 0.04 | 0.08 | 0.14 | 0.11 | 0.29 | 0.31 | 0.3 | 0.26 | 0.07 | 0.06 | 0.06 | 0.06 | |
1.0 | 0.17 | 0.09 | 0.09 | 0.15 | 0.21 | 0.23 | 0.23 | 0.29 | 0.31 | 0.28 | 0.3 | 0.15 | |
1.0 | 0.11 | 0.04 | 0.04 | 0.06 | 0.05 | 0.04 | 0.04 | 0.03 | 0.15 | 0.15 | 0.14 | 0.0 | |
1.0 | 0.22 | 0.31 | 0.53 | 0.35 | 0.53 | 0.53 | 0.59 | 0.63 | 0.04 | 0.04 | 0.05 | 0.04 | |
1.0 | 0.03 | 0.02 | 0.05 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | |
1.0 | 0.09 | 0.26 | 0.56 | 0.41 | 0.18 | 0.29 | 0.3 | 0.19 | 0.32 | 0.37 | 0.33 | 0.23 | |
Azfi_s0085.g039102 (RPB2) | 1.0 | 0.21 | 0.52 | 0.55 | 0.71 | 0.38 | 0.39 | 0.39 | 0.48 | 0.43 | 0.4 | 0.45 | 0.17 |
1.0 | 0.09 | 0.55 | 0.53 | 0.58 | 0.28 | 0.34 | 0.38 | 0.36 | 0.45 | 0.44 | 0.45 | 0.21 | |
1.0 | 0.16 | 0.06 | 0.07 | 0.07 | 0.21 | 0.24 | 0.24 | 0.23 | 0.18 | 0.19 | 0.22 | 0.11 | |
1.0 | 0.05 | 0.0 | 0.08 | 0.0 | 0.04 | 0.04 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.06 | 0.05 | 0.0 | |
1.0 | 0.07 | 0.72 | 0.76 | 0.78 | 0.44 | 0.49 | 0.51 | 0.59 | 0.62 | 0.61 | 0.68 | 0.63 | |
1.0 | 0.32 | 0.18 | 0.33 | 0.29 | 0.14 | 0.16 | 0.19 | 0.14 | 0.59 | 0.48 | 0.56 | 0.09 | |
1.0 | 0.14 | 0.21 | 0.22 | 0.15 | 0.11 | 0.08 | 0.08 | 0.14 | 0.12 | 0.11 | 0.12 | 0.14 | |
1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | |
1.0 | 0.96 | 0.29 | 0.2 | 0.24 | 0.58 | 0.37 | 0.32 | 0.37 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.1 | |
Azfi_s0170.g055593 (SAM2) | 1.0 | 0.04 | 0.15 | 0.11 | 0.25 | 0.06 | 0.04 | 0.04 | 0.05 | 0.41 | 0.37 | 0.39 | 0.11 |
1.0 | 0.03 | 0.14 | 0.44 | 0.12 | 0.13 | 0.08 | 0.05 | 0.14 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.18 | |
Azfi_s0173.g055767 (SPL3) | 1.0 | 0.58 | 0.22 | 0.23 | 0.24 | 0.31 | 0.35 | 0.4 | 0.33 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.32 |
1.0 | 0.01 | 0.35 | 0.54 | 0.32 | 0.38 | 0.42 | 0.41 | 0.33 | 0.32 | 0.33 | 0.31 | 0.41 | |
1.0 | 0.07 | 0.04 | 0.04 | 0.03 | 0.06 | 0.1 | 0.14 | 0.07 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.1 | |
Azfi_s0200.g057525 (SK13) | 1.0 | 0.24 | 0.1 | 0.08 | 0.1 | 0.18 | 0.2 | 0.21 | 0.27 | 0.2 | 0.21 | 0.21 | 0.05 |
1.0 | 0.01 | 0.07 | 0.03 | 0.04 | 0.05 | 0.05 | 0.05 | 0.05 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.11 | |
1.0 | 0.02 | 0.18 | 0.17 | 0.28 | 0.03 | 0.05 | 0.05 | 0.04 | 0.08 | 0.06 | 0.1 | 0.09 | |
1.0 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.05 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.04 | 0.04 | 0.03 | 0.04 | 0.01 | |
Azfi_s0241.g059726 (P44) | 1.0 | 0.09 | 0.15 | 0.23 | 0.2 | 0.16 | 0.31 | 0.31 | 0.37 | 0.27 | 0.28 | 0.29 | 0.15 |
Azfi_s0264.g060934 (BRN2) | 1.0 | 0.39 | 0.31 | 0.36 | 0.32 | 0.26 | 0.29 | 0.33 | 0.23 | 0.12 | 0.21 | 0.15 | 0.19 |
Azfi_s0296.g063538 (DSO) | 1.0 | 0.12 | 0.35 | 0.14 | 0.25 | 0.14 | 0.16 | 0.17 | 0.15 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.03 |
Azfi_s0336.g065538 (SK13) | 1.0 | 0.06 | 0.02 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.03 | 0.01 | 0.03 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.0 |
Azfi_s0366.g066969 (emb2411) | 1.0 | 0.18 | 0.09 | 0.11 | 0.13 | 0.05 | 0.05 | 0.05 | 0.06 | 0.12 | 0.09 | 0.12 | 0.44 |
Azfi_s0371.g067133 (CPK28) | 1.0 | 0.0 | 0.4 | 0.5 | 0.5 | 0.3 | 0.26 | 0.25 | 0.33 | 0.4 | 0.42 | 0.43 | 0.19 |
1.0 | 0.05 | 0.05 | 0.15 | 0.05 | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.03 | 0.02 | 0.09 | |
1.0 | 0.24 | 0.42 | 0.56 | 0.59 | 0.49 | 0.45 | 0.44 | 0.44 | 0.35 | 0.31 | 0.33 | 0.29 | |
1.0 | 0.04 | 0.16 | 0.23 | 0.19 | 0.2 | 0.23 | 0.25 | 0.23 | 0.28 | 0.27 | 0.25 | 0.07 | |
Azfi_s0451.g070778 (PPa6) | 1.0 | 0.01 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.05 | 0.05 | 0.06 | 0.05 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.01 |
Azfi_s0506.g073977 (WNK1) | 1.0 | 0.08 | 0.44 | 0.53 | 0.57 | 0.28 | 0.22 | 0.21 | 0.25 | 0.34 | 0.4 | 0.39 | 0.81 |
Azfi_s0678.g081838 (TUB6) | 1.0 | 0.03 | 0.02 | 0.05 | 0.03 | 0.05 | 0.05 | 0.06 | 0.04 | 0.08 | 0.07 | 0.07 | 0.12 |
Azfi_s0725.g083832 (XIK) | 1.0 | 0.64 | 0.18 | 0.23 | 0.34 | 0.27 | 0.27 | 0.29 | 0.43 | 0.44 | 0.45 | 0.44 | 0.03 |
1.0 | 0.05 | 0.24 | 0.2 | 0.27 | 0.25 | 0.21 | 0.18 | 0.19 | 0.48 | 0.48 | 0.49 | 0.24 | |
Azfi_s0743.g084789 (AK-HSDH) | 1.0 | 0.08 | 0.4 | 0.36 | 0.47 | 0.24 | 0.44 | 0.42 | 0.4 | 0.53 | 0.48 | 0.5 | 0.2 |
1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | |
Azfi_s0899.g091749 (ATS) | 1.0 | 0.13 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.09 | 0.09 | 0.09 | 0.09 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.09 |
1.0 | 0.48 | 0.73 | 0.52 | 0.56 | 0.36 | 0.6 | 0.76 | 0.94 | 0.08 | 0.04 | 0.07 | 0.13 | |
Azfi_s1327.g101580 (NSI) | 1.0 | 0.05 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.05 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
1.0 | 0.29 | 0.77 | 0.77 | 0.97 | 0.34 | 0.55 | 0.59 | 0.42 | 0.19 | 0.2 | 0.19 | 0.23 | |
0.72 | 0.01 | 1.0 | 0.79 | 0.59 | 0.02 | 0.05 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.03 | |
0.99 | 0.25 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.31 | 0.0 | 1.0 | |
Azfi_s3086.g114483 (CUTA) | 1.0 | 0.2 | 0.1 | 0.1 | 0.11 | 0.64 | 0.68 | 0.71 | 0.94 | 0.41 | 0.33 | 0.38 | 0.83 |
1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.11 | 0.0 | |
1.0 | 0.0 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.06 | 0.06 | 0.06 | 0.0 | |
Azfi_s3783.g116888 (SUS2) | 1.0 | 0.18 | 0.36 | 0.37 | 0.43 | 0.37 | 0.34 | 0.32 | 0.4 | 0.62 | 0.54 | 0.6 | 0.33 |
Azfi_s3975.g117444 (SPK1) | 0.91 | 0.02 | 1.0 | 0.98 | 0.76 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.24 | 0.04 | 0.04 | 0.0 |
Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)