Heatmap: Cluster_14 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene	Vegetative Sporophyte	Adult Sporophyte	Leaf (0 mg/L NH4NO3)	Leaf (30 mg/L NH4NO3)	Leaf (90 mg/L NH4NO3)	Sporophyte; w/o NH4NO3, w/o cyanobacteria	Sporophyte; w/o NH4NO3, w cyanobacteria	Sporophyte; w NH4NO3, w cyanobacteria	Sporophyte; w NH4NO3, w/o cyanobacteria	Root Tip, D-3 6h mock treated	Root Tip, D-3 6h 0.1 uM IAA treated	Root Tip, D-3 6h 0.5 uM trans-zeatin treated	Microsporocarp
Azfi_s0001.g000097	92.6	947.54	74.03	28.54	23.32	138.23	98.03	81.66	113.53	183.35	161.02	151.41	97.4
Azfi_s0001.g000468	20.51	138.9	31.67	32.76	28.48	21.5	17.96	20.98	20.77	36.15	34.38	35.34	4.11
Azfi_s0002.g001716	0.01	0.74	0.09	0.0	0.0	0.09	0.03	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g001980 (GLT1)	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g001983 (GLT1)	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g002026	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g002388 (IPMI1)	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g002644 (SDH1-2)	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g002873 (NAP10)	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g003095	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g003255	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g003847	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g003857 (PNP)	0.0	0.19	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g004077	0.02	1.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g004094	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g004131	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g004334 (ACN1)	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g004461	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g004949	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g005158	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g005449	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g005787 (MAB1)	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g005996 (SERAT3;2)	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g006003	0.01	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g006314 (CAT1)	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g006399 (HDH)	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g006711	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g006830	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g007101	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g007128 (ATHM2)	0.0	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g007219	0.0	0.64	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g007226	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0002.g007240	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0015.g013938	7.88	61.01	0.0	0.0	0.0	6.52	12.09	12.95	15.94	2.87	2.3	2.34	7.2
Azfi_s0015.g014016 (NAM)	1.85	34.75	1.37	0.81	2.96	0.53	0.43	0.85	0.96	3.45	1.49	1.18	2.44
Azfi_s0023.g016265 (GLT1)	0.0	2.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g016296	0.01	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g016343	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g016390 (HER1)	0.0	0.98	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g016557 (CARB)	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g016702	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g016763	0.0	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g016811	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g016924 (DHS1)	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g017051 (DRH1)	0.0	0.11	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g017057	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g017062 (emb2768)	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g017231	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g017440	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g017454 (V157)	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g017567 (RPS2)	0.0	0.9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g017585 (CGS)	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g017768 (SCO1)	0.01	1.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g017769 (RPS7)	0.0	3.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g017779 (PRPL11)	0.0	1.04	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g017875 (CI51)	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g017897 (CLPX)	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Azfi_s0023.g017913 (emb1473)	0.0	1.79	0.0	0.0	0.0	0.2	0.08	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g017915	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g018072 (ASE1)	0.0	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g018131	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g018220	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g018281	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g018398	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g018431 (PRH)	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g018501	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g018506	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g018513	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g018552 (CLA)	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g018976 (HDH)	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g019152	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g019430	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g019579 (ADT1)	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g019605 (PNP)	0.0	0.57	0.0	0.1	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g019715	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g019778	0.0	1.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g019787 (BIOF)	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g019807	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g019848 (SDH2-1)	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g019893	0.03	1.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g019924	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g020014	0.01	0.89	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g020136	0.0	1.02	0.09	0.0	0.0	0.09	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g020185	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0023.g020215	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0053.g031998 (SCO1)	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0110.g045547	1.29	9.43	1.39	1.72	2.24	1.24	1.38	0.65	1.42	2.98	2.63	2.13	1.43
Azfi_s0122.g047158	0.0	0.86	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0122.g047476	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0122.g047511 (mtLPD2)	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0122.g047517	0.0	1.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0122.g047771 (ASP1)	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0122.g047814	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0135.g050005	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0169.g054832 (GAPA)	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0169.g054848	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0169.g054936	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0169.g055114	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0169.g055140	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0169.g055161	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0169.g055216	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0169.g055372	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0169.g055443	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0268.g061121	0.32	7.49	0.86	2.01	2.56	0.0	0.54	0.57	0.89	0.45	0.19	0.8	0.0
Azfi_s0434.g069801 (TGD3)	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0507.g074200	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s1689.g105788 (GLN1.3)	0.0	0.52	0.0	0.06	0.0	0.1	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s2663.g112543 (KINESIN-13A)	3.7	60.4	6.86	5.57	7.63	2.46	3.23	2.99	4.07	11.31	9.7	9.26	2.7
Azfi_s2690.g112658	5.83	153.77	3.2	8.05	11.65	33.92	23.39	28.33	43.76	8.61	12.86	6.31	0.24
Azfi_s2732.g112826	0.01	1.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s3038.g114236	0.0	3.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s3110.g114582	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s3841.g117133 (HUA2)	4.44	37.31	6.72	4.97	5.89	9.9	9.69	9.4	11.67	3.04	2.92	2.64	1.28
Azfi_s4122.g118060 (AHG3)	3.09	137.46	22.01	15.45	9.27	23.55	10.03	8.28	11.42	0.13	0.07	0.0	0.0
Azfi_s4316.g118721	0.0	13.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.17	0.0	0.0	0.13	0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)