Heatmap: Cluster_54 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Vegetative Sporophyte
Adult Sporophyte
Leaf (0 mg/L NH4NO3)
Leaf (30 mg/L NH4NO3)
Leaf (90 mg/L NH4NO3)
Sporophyte; w/o NH4NO3, w/o cyanobacteria
Sporophyte; w/o NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w/o cyanobacteria
Root Tip, D-3 6h mock treated
Root Tip, D-3 6h 0.1 uM IAA treated
Root Tip, D-3 6h 0.5 uM trans-zeatin treated
Microsporocarp
0.5 -2.66 0.05 0.72 0.29 -0.52 -0.25 -0.24 -0.57 0.51 0.47 0.42 -1.65
0.17 -2.84 0.11 0.45 0.4 -0.03 0.04 -0.11 -0.09 0.43 0.37 0.32 -2.31
0.46 -4.55 0.11 0.74 0.33 -0.04 0.26 0.25 -0.26 0.15 0.05 -0.02 -1.95
0.25 -3.67 0.32 1.19 0.83 -0.34 -0.25 -0.22 -0.64 0.03 -0.15 -0.06 -1.27
-0.22 -3.26 0.64 1.62 1.08 -0.43 -0.09 -0.11 -0.11 -1.16 -1.4 -1.05 -1.16
0.33 -4.62 0.51 1.22 0.78 -0.48 0.06 0.08 -0.3 -0.27 -0.33 -0.23 -2.88
0.09 -1.85 -0.11 0.75 0.27 -0.42 0.07 0.12 -0.33 0.41 0.28 0.33 -1.42
0.05 -4.6 0.74 1.63 1.19 -0.66 -0.02 -0.22 -0.68 -0.83 -1.28 -0.76 -2.23
0.08 -9.83 -0.08 1.46 0.88 -0.37 -0.75 -0.93 -1.29 0.21 -0.02 -0.09 0.04
0.4 -7.3 0.26 1.07 0.5 -0.13 0.09 0.2 -0.26 -0.08 -0.2 -0.23 -1.58
0.03 -1.93 -0.63 0.08 0.11 -0.15 0.28 0.56 -0.38 0.56 0.33 0.82 -3.72
0.07 -3.04 0.02 0.69 0.55 -0.71 -0.28 -0.08 -0.58 0.66 0.28 0.64 -1.61
0.02 -1.37 0.19 0.89 0.35 -0.4 -0.03 -0.1 -0.43 0.33 0.23 0.23 -1.64
-0.65 -2.09 -0.07 0.91 0.64 -0.4 -0.36 -0.36 -0.6 0.47 0.21 0.52 -0.36
0.03 -5.75 0.28 1.04 0.55 -0.87 -0.79 -0.76 -1.06 0.73 0.41 0.49 -0.61
0.31 -3.14 0.09 1.09 0.8 -0.32 0.05 0.27 -0.45 -0.19 -0.42 -0.33 -0.94
0.1 -2.78 -0.15 0.97 0.74 -0.36 0.02 0.18 -0.71 -0.02 -0.04 0.39 -1.21
0.42 -2.51 0.18 1.19 0.69 -0.69 -0.1 -0.18 -0.74 -0.01 0.04 0.17 -1.91
0.04 -6.66 0.54 1.61 1.06 -0.07 0.24 0.05 0.24 -1.89 -1.6 -1.99 -2.49
-0.39 -6.05 0.45 1.32 0.97 -0.73 -0.8 -1.19 -1.33 0.5 0.14 0.3 -0.61
0.27 -3.8 0.12 0.59 0.2 0.05 0.29 0.2 0.03 0.14 0.06 0.0 -1.24
0.15 -1.99 0.34 1.01 0.5 -0.15 0.24 0.3 -0.31 0.09 -0.21 -0.15 -
0.45 -5.88 0.03 0.96 0.4 -0.29 0.13 0.15 -0.28 0.16 0.12 0.03 -1.94
-0.09 -2.09 0.95 1.83 1.26 -0.82 -0.52 -0.28 -0.76 -1.48 -1.57 -1.83 -1.84
-0.43 -2.66 0.14 0.99 1.12 -1.04 -1.1 -1.51 -0.85 0.55 0.24 0.84 -0.91
-0.02 -4.08 0.61 1.43 0.88 -0.98 -0.7 -0.62 -1.13 0.3 0.14 0.14 -2.09
-0.2 -2.99 0.94 2.11 1.59 -1.14 -0.44 -0.86 -1.62 -1.93 -2.53 -1.85 -
0.33 -1.21 0.02 0.85 0.63 -0.69 -0.36 -0.24 -0.8 0.41 0.13 0.44 -1.55
0.47 -1.41 -0.19 0.52 0.09 0.05 0.23 0.25 0.05 0.14 0.11 0.06 -2.23
0.58 -2.53 0.14 1.06 0.5 -0.93 -0.49 -0.54 -1.15 0.43 0.32 0.36 -1.05
0.09 -2.52 -0.37 1.19 0.56 -0.46 -0.38 -0.83 -1.14 0.51 0.39 0.59 -1.08
-0.06 -3.22 0.59 1.31 1.02 -0.19 -0.07 -0.06 -0.18 -1.07 -0.93 -1.07 -0.37
0.2 -3.48 0.17 0.45 0.61 -0.58 -0.35 -0.36 -0.66 0.63 0.46 0.7 -1.6
0.64 -6.92 -0.05 0.75 0.18 -0.76 -0.36 -0.25 -0.89 0.65 0.57 0.57 -1.44
0.09 -2.59 0.15 0.87 0.71 -0.9 -0.22 -0.07 -0.66 0.58 0.16 0.45 -2.06
0.08 -4.34 0.22 1.36 1.14 -0.52 -0.18 -0.21 -0.3 -0.52 -0.37 -0.49 -0.98
0.27 -2.34 0.06 0.55 0.48 -0.4 0.05 0.2 -0.16 0.31 0.22 0.2 -1.67
0.13 -1.77 0.34 0.91 0.44 -0.52 -0.07 0.11 -0.21 0.07 0.28 0.21 -3.39
-0.12 -1.85 -0.21 0.84 0.4 -0.71 -0.54 -0.42 -0.55 0.67 0.31 0.84 -1.06
-0.1 -2.16 0.69 1.54 0.58 -0.08 0.18 0.2 -0.02 -1.2 -1.07 -1.01 -2.23
0.15 -2.92 -0.2 0.38 0.29 -0.2 0.11 0.08 -0.05 0.39 0.26 0.28 -0.55
0.49 -5.14 0.41 1.32 0.69 -0.84 -0.59 -0.72 -1.21 0.25 0.13 0.18 -1.16
0.29 -4.43 0.41 1.25 0.67 -0.06 -0.02 -0.09 -0.47 -0.46 -0.61 -0.44 -0.49
0.47 -3.41 0.12 0.65 0.37 -0.54 -0.44 -0.28 -0.24 0.57 0.32 0.36 -1.15
0.37 -3.27 0.07 0.82 0.74 -0.34 0.06 0.2 -0.61 0.19 0.14 0.11 -2.62
0.57 -5.1 -0.23 0.42 0.09 -0.31 0.08 0.09 -0.44 0.56 0.52 0.46 -1.87
0.62 -3.71 -0.18 0.36 0.12 -0.31 0.12 0.27 -0.47 0.46 0.29 0.34 -1.15
0.6 -1.75 -0.17 0.72 0.46 -0.1 -0.05 -0.2 -0.61 0.27 0.05 0.15 -0.98
0.21 -1.63 -0.09 0.63 0.42 0.05 -0.04 -0.09 -0.3 0.37 0.23 0.41 -2.88
0.6 -5.36 0.1 1.02 0.17 -0.09 0.05 0.06 -0.36 0.12 -0.01 -0.01 -1.39
0.25 -5.59 0.01 1.13 0.4 -0.08 0.0 -0.06 -0.25 0.24 0.12 0.11 -2.48
-0.57 -4.01 -0.13 0.83 0.71 -0.19 -0.44 -0.47 0.09 0.41 0.16 0.42 -0.43
0.2 -3.8 -0.53 0.37 0.02 0.12 0.06 0.09 -0.1 0.48 0.45 0.47 -0.98
0.08 -1.73 0.09 0.89 0.99 -0.56 -0.08 -0.18 -0.52 0.04 -0.08 0.28 -1.57
0.42 -3.38 0.45 1.08 0.68 -0.61 -0.63 -0.6 -0.99 0.45 0.28 0.25 -1.99
-0.76 -4.68 0.32 1.1 0.62 -0.29 -0.25 0.02 -0.22 0.26 0.34 0.27 -2.02
0.36 -1.02 0.1 0.5 0.49 -0.5 -0.47 -0.43 -0.52 0.51 0.28 0.46 -1.19
0.12 -1.86 0.12 1.41 0.71 -0.35 -0.52 -0.57 -1.19 0.2 -0.01 -0.21 -0.6
0.42 -3.52 0.37 1.29 0.68 -0.33 -0.5 -0.36 -1.35 0.17 -0.16 0.07 -1.05
-0.14 -4.64 0.31 0.9 0.7 -0.32 -0.25 -0.04 -0.61 0.14 -0.1 0.05 -0.03
0.16 -4.54 -0.08 0.83 0.54 -0.55 -0.26 -0.41 -0.32 0.39 0.2 0.41 -0.3
0.22 -2.99 0.02 0.57 0.45 -0.68 -0.27 -0.16 -0.4 0.66 0.46 0.51 -1.44
0.1 -2.16 -0.02 0.65 0.66 -0.72 -0.62 -0.29 -0.53 0.69 0.36 0.68 -1.75
0.23 -3.02 0.41 1.57 0.77 -0.71 -0.85 -0.66 -1.2 0.2 -0.16 -0.13 -0.93
-0.09 -2.4 0.59 1.14 1.07 -0.12 -0.4 -0.59 -0.49 -0.14 -0.35 -0.52 -0.7
-0.03 -2.61 0.29 0.86 0.77 -0.65 -0.37 -0.24 -0.34 0.25 0.12 0.19 -0.64
0.38 -5.05 0.26 1.26 0.66 -0.66 -0.38 -0.33 -0.85 0.31 0.21 0.2 -2.24
-0.15 -1.28 -0.36 0.69 0.36 -0.6 -0.51 -0.25 -0.21 0.57 0.21 0.57 -0.29
-0.27 -1.7 0.37 0.96 1.18 -0.56 -0.53 -0.7 -0.86 0.23 0.17 0.36 -2.11
0.17 -5.32 0.76 1.53 0.89 -1.25 -1.14 -1.08 -1.53 0.35 0.19 0.12 -2.13
0.55 -5.22 0.07 1.12 0.16 -0.34 -0.05 0.11 -0.44 0.27 0.09 0.05 -1.75
0.26 -3.95 0.12 1.72 0.31 -0.07 0.02 0.2 -0.17 -0.74 -0.87 -0.83 -1.32
0.1 -1.22 -0.55 0.37 -0.01 0.06 0.26 0.22 -0.24 0.54 0.18 0.46 -1.63
0.36 -1.76 0.35 0.93 0.72 -0.02 -0.05 0.06 -0.25 -0.25 -0.47 -0.4 -1.15
0.48 -3.47 -0.07 0.56 0.14 -0.21 -0.16 -0.08 -0.36 0.59 0.36 0.38 -1.26
0.14 -7.27 -0.02 0.62 0.15 0.11 0.14 0.15 -0.12 0.47 0.35 0.26 -2.39
0.39 -3.62 -0.06 0.65 0.3 -0.17 0.12 0.3 -0.16 0.32 0.2 0.19 -2.21
0.06 -3.76 -0.17 0.81 0.36 -0.08 0.13 0.14 -0.13 0.24 0.25 0.23 -1.45
-0.2 -2.23 0.42 1.27 1.22 -0.86 -0.61 -0.36 -0.16 0.04 -0.63 0.06 -1.97
0.66 -3.52 0.08 1.3 0.38 0.02 0.01 0.03 -0.27 -0.21 -0.46 -0.43 -1.65
0.42 -5.46 0.0 0.71 0.28 -0.32 0.05 0.04 -0.47 0.44 0.39 0.38 -2.09
0.22 -1.86 -0.31 0.4 0.04 0.13 0.17 0.35 -0.32 0.46 0.3 0.31 -1.97
0.58 -3.67 0.03 0.65 0.34 0.02 0.19 0.3 -0.14 0.06 -0.04 -0.1 -1.63
-0.0 -1.81 0.77 1.23 1.03 -0.06 -0.04 -0.16 -0.36 -0.78 -1.02 -0.99 -1.17
0.55 -1.24 0.08 0.77 0.46 -0.06 -0.38 -0.43 -0.7 0.42 0.17 0.24 -1.97
0.3 -2.81 0.22 0.58 0.67 -0.74 -0.3 -0.3 -0.68 0.58 0.2 0.63 -1.59
-0.02 - 0.47 1.2 0.78 -0.7 -0.28 -0.17 -0.58 0.34 0.31 0.14 -7.29
-0.07 -2.67 0.59 1.95 0.8 -0.29 -0.16 -0.16 -0.44 -1.35 -1.57 -1.47 -1.53
0.45 -1.15 0.12 1.35 0.07 -0.28 -0.07 -0.06 -0.41 0.04 -0.14 -0.14 -2.52
0.11 -3.13 0.09 1.13 0.46 -0.15 0.19 0.35 -0.4 0.06 -0.17 -0.19 -1.69
-0.43 -3.22 0.39 1.02 0.91 -0.67 -0.42 -0.35 -0.16 0.26 0.09 0.24 -1.21
0.1 -6.67 0.17 1.16 0.52 -0.51 -0.24 -0.2 -0.63 0.28 0.22 0.21 -0.93
0.03 -1.11 0.24 0.83 0.57 -0.45 -0.38 -0.55 -0.34 0.19 0.08 0.18 -0.39
0.33 -2.62 0.05 0.82 0.3 -0.32 0.1 0.18 -0.43 0.36 0.28 0.24 -3.0
Azfi_s0113.g045894 (RACK1C_AT)
0.43 -2.98 0.05 0.73 0.3 -0.16 -0.08 -0.1 -0.39 0.27 0.15 0.13 -0.61
0.03 -2.09 0.09 0.66 0.6 -1.13 -0.61 -0.58 -0.92 0.67 0.5 0.66 -0.52
-0.2 -2.72 0.88 1.39 1.04 -0.83 -0.68 -0.73 -1.01 -0.01 0.15 0.07 -5.46
-0.03 -1.59 0.06 1.2 0.72 -0.55 -0.25 -0.1 -0.72 0.35 0.26 -0.0 -2.58
-0.01 -0.81 0.04 0.8 0.35 -0.46 -0.48 -0.44 -0.61 0.58 0.06 0.65 -1.14
-0.0 -2.74 1.03 1.73 1.26 -0.52 -0.5 -0.49 -0.47 -1.88 -1.98 -1.77 -1.19
0.24 -4.0 0.31 1.53 1.08 -0.68 -0.23 -0.21 -0.77 -0.48 -0.6 -0.31 -1.32
0.51 -2.48 -0.02 0.52 0.27 -0.03 0.18 0.23 -0.08 0.26 0.09 0.1 -2.29
0.34 -1.99 -0.06 0.49 0.19 -0.01 0.28 0.4 -0.06 0.21 0.13 0.09 -2.41
0.43 -6.08 0.22 1.02 0.63 -0.35 -0.19 -0.31 -0.53 0.16 0.04 0.04 -0.84
0.59 -6.47 0.26 0.98 0.52 -0.32 0.01 0.08 -0.46 0.06 -0.02 -0.04 -1.8
0.07 -2.66 0.1 1.19 0.79 -0.12 0.13 0.27 -0.15 -0.28 -0.69 -0.33 -1.5
0.39 -3.15 -0.17 0.54 0.09 0.2 0.15 0.1 -0.14 0.28 0.22 0.23 -1.35
-0.13 -3.8 0.9 1.06 0.76 -0.53 -0.53 -0.28 -0.64 0.14 0.21 0.05 -2.15
-0.32 -2.26 0.02 0.91 0.74 -0.28 0.04 -0.07 -0.62 0.54 0.07 0.27 -1.89
0.33 -2.98 -0.09 0.55 0.07 -0.21 0.09 0.16 -0.24 0.47 0.4 0.41 -2.08
-0.34 -3.78 0.45 0.8 0.92 -1.09 -0.71 -0.59 -1.14 0.82 0.26 0.73 -1.63
0.36 -4.31 0.0 0.64 0.22 -0.02 0.32 0.33 -0.09 0.18 0.14 0.02 -1.95
0.19 -3.09 -0.15 0.74 0.45 -0.45 -0.12 -0.06 -0.57 0.58 0.35 0.59 -1.97
0.1 -3.36 -0.0 0.51 0.43 -0.3 0.06 -0.02 -0.4 0.39 0.11 0.54 -0.68
-0.09 -2.23 0.5 1.49 0.97 -0.17 -0.08 -0.16 -0.19 -0.67 -0.95 -0.73 -1.72
0.35 -1.61 -0.09 0.5 0.67 -0.63 -0.46 -0.31 -0.83 0.63 0.38 0.62 -1.64
0.29 -2.14 0.53 1.21 1.2 -0.51 -0.2 -0.11 -0.24 -0.68 -0.68 -0.71 -1.69
0.2 -4.79 0.5 1.52 1.45 -0.81 0.0 0.23 -0.03 -1.75 -2.5 -2.72 -1.12
0.31 -4.8 -0.1 1.02 0.37 -0.29 0.1 0.19 0.07 0.14 -0.04 0.02 -1.75
0.64 -3.39 -0.04 0.51 0.28 -0.14 -0.07 -0.03 -0.22 0.39 0.24 0.15 -1.2
0.23 -2.77 -0.07 0.68 0.14 -0.19 -0.01 0.11 -0.25 0.49 0.37 0.26 -1.49
0.2 -1.44 -0.13 0.39 0.32 -0.51 -0.16 -0.04 -0.02 0.64 0.15 0.69 -2.6
0.24 -1.31 0.14 0.87 0.6 -0.29 -0.33 -0.43 -0.55 0.43 -0.06 0.5 -2.34
0.38 -7.42 0.48 1.53 0.82 -0.86 -0.46 -0.36 -0.93 -0.06 -0.14 -0.11 -1.94
0.43 -3.68 0.11 0.82 0.44 0.08 0.31 0.44 -0.1 -0.16 -0.25 -0.22 -2.54
0.28 -1.93 -0.18 0.43 0.18 -0.15 -0.03 0.07 -0.25 0.46 0.38 0.3 -1.05
-0.15 -1.71 0.68 1.32 0.83 -0.13 0.05 0.25 -0.23 -0.97 -1.34 -1.19 -0.75
0.3 -3.01 0.13 0.47 0.35 -0.28 0.01 0.01 -0.3 0.51 0.38 0.37 -2.17
0.23 -3.07 -0.09 0.86 0.06 -0.77 -0.76 -0.9 -0.86 0.73 0.65 0.71 -0.38
0.0 -1.43 0.53 1.0 0.7 -0.59 -0.32 -0.21 -0.47 0.14 0.11 -0.03 -1.55
0.18 -4.18 0.02 0.79 0.39 -0.44 -0.57 -0.79 -1.13 0.71 0.57 0.79 -1.06
0.72 -4.93 -0.13 0.66 0.09 -0.27 0.17 0.33 -0.34 0.23 0.13 0.14 -1.35
-0.4 -1.44 0.05 0.99 0.33 -0.33 -0.08 -0.03 -0.11 0.07 0.06 0.11 -0.38
0.8 -3.67 0.01 0.58 0.24 -0.41 -0.07 -0.09 -0.64 0.43 0.35 0.26 -1.33
0.81 -6.26 0.45 1.33 0.64 -0.12 -0.18 -0.2 -0.36 -0.71 -0.92 -0.9 -0.58
0.73 -5.33 0.22 1.38 0.43 -0.62 -0.45 -0.48 -0.89 0.17 0.05 -0.02 -1.27
0.4 -4.06 0.32 1.15 0.52 -0.68 -0.28 -0.23 -0.55 0.27 0.13 0.15 -1.59
0.72 -2.09 0.12 1.16 1.02 -0.37 -0.23 -0.11 -0.72 -0.05 -0.6 -0.22 -2.79
0.34 -5.26 0.59 1.41 0.61 -0.73 -0.66 -0.83 -1.28 0.28 0.09 0.11 -1.15
0.59 -2.97 0.17 1.12 0.54 0.05 -0.27 -0.16 -0.47 -0.1 -0.33 -0.27 -0.75
0.51 -4.97 0.31 1.37 0.51 -0.67 -0.43 -0.41 -0.79 0.23 0.05 0.08 -1.66
-0.59 -6.45 0.3 1.06 0.74 -0.66 -0.28 -0.26 -0.42 0.18 0.21 0.23 -0.23
0.01 -4.61 0.52 1.11 0.81 -0.46 -0.1 0.04 -0.41 0.07 -0.06 -0.1 -2.11
0.58 -4.13 -0.03 0.66 0.2 -0.27 0.17 0.21 -0.24 0.27 0.18 0.18 -1.68
-0.17 -1.51 0.66 1.03 0.8 -0.37 -0.36 -0.5 -0.49 -0.09 -0.27 -0.14 -0.43
0.84 -5.76 -0.08 0.72 0.09 -0.08 0.13 0.13 -0.14 0.18 0.1 0.07 -2.12
0.39 -5.43 0.47 1.3 0.82 -0.1 -0.22 -0.27 -0.8 -0.16 -0.36 -0.41 -1.23
0.58 -3.95 0.34 1.13 0.39 -0.41 -0.23 -0.18 -0.63 0.19 0.01 0.03 -1.44
0.43 -6.08 0.22 1.02 0.63 -0.35 -0.19 -0.31 -0.53 0.16 0.04 0.04 -0.84
0.4 -2.91 0.36 1.01 0.74 -0.64 -0.5 -0.49 -0.88 0.29 0.23 0.21 -1.22
0.31 -3.55 0.58 1.41 0.92 -0.64 -0.08 -0.12 -0.38 -0.27 -0.39 -0.4 -7.59
-0.44 -0.81 0.38 1.01 0.87 -0.93 -0.52 -0.37 -0.41 0.1 0.02 0.25 -0.94
-0.07 -2.32 0.51 0.8 0.8 -0.74 -0.62 -0.54 -0.59 0.43 0.43 0.38 -1.52
0.2 -2.79 0.33 0.93 0.75 -0.24 -0.24 -0.32 -0.63 0.14 -0.13 0.16 -0.79
-0.07 -7.65 0.32 1.62 0.62 -0.45 -0.04 0.12 -0.32 -0.31 -0.3 -0.42 -2.12
-0.02 -4.32 0.67 1.24 0.92 -1.35 -1.09 -1.06 -1.5 0.37 0.05 0.39 -0.38
0.33 -3.6 0.25 0.97 0.54 -0.72 -0.29 -0.35 -0.88 0.45 0.48 0.36 -1.97
0.4 -3.01 -0.06 0.53 0.31 -0.05 0.1 0.1 -0.09 0.35 0.27 0.25 -2.4
0.09 -2.33 0.53 1.38 1.07 -1.08 -0.62 -0.7 -0.56 0.16 -0.1 -0.0 -2.93
0.6 -4.17 -0.21 0.37 0.06 -0.18 -0.08 -0.15 -0.49 0.64 0.43 0.56 -1.26
0.15 -1.99 0.34 1.01 0.5 -0.15 0.24 0.3 -0.31 0.09 -0.21 -0.15 -
-0.13 -2.74 0.38 0.96 1.09 -0.06 -0.17 -0.04 -0.42 -0.2 0.14 -0.13 -3.18
0.05 -5.83 0.42 1.05 0.56 -0.41 -0.03 0.1 -0.39 0.12 0.08 0.0 -1.52
0.25 -1.63 0.61 1.37 0.94 -0.36 -0.59 -0.73 -0.6 -0.35 -0.27 -0.32 -1.6

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.