Heatmap: Cluster_24 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Vegetative Sporophyte	Adult Sporophyte	Leaf (0 mg/L NH4NO3)	Leaf (30 mg/L NH4NO3)	Leaf (90 mg/L NH4NO3)	Sporophyte; w/o NH4NO3, w/o cyanobacteria	Sporophyte; w/o NH4NO3, w cyanobacteria	Sporophyte; w NH4NO3, w cyanobacteria	Sporophyte; w NH4NO3, w/o cyanobacteria	Root Tip, D-3 6h mock treated	Root Tip, D-3 6h 0.1 uM IAA treated	Root Tip, D-3 6h 0.5 uM trans-zeatin treated	Microsporocarp
Azfi_s0001.g000153	0.15	0.15	0.06	0.01	0.04	0.28	0.26	0.24	0.2	0.0	0.0	0.0	1.0
Azfi_s0001.g000679	0.42	0.16	0.21	0.26	0.23	0.28	0.29	0.28	0.3	0.07	0.04	0.06	1.0
Azfi_s0001.g000919	0.24	0.05	0.13	0.21	0.16	0.18	0.21	0.22	0.22	0.13	0.14	0.12	1.0
Azfi_s0002.g001163	0.4	0.02	0.28	0.39	0.32	0.27	0.31	0.3	0.26	0.34	0.33	0.32	1.0
Azfi_s0002.g001561	0.39	0.13	0.06	0.05	0.04	0.29	0.26	0.43	0.28	0.02	0.01	0.01	1.0
Azfi_s0003.g007744	0.19	0.04	0.1	0.13	0.11	0.16	0.21	0.2	0.23	0.05	0.06	0.07	1.0
Azfi_s0003.g008050	0.42	0.06	0.23	0.33	0.31	0.35	0.27	0.32	0.2	0.18	0.12	0.21	1.0
Azfi_s0004.g008359	0.2	0.03	0.13	0.14	0.13	0.28	0.22	0.24	0.25	0.03	0.03	0.03	1.0
Azfi_s0004.g008538	0.21	0.02	0.01	0.0	0.0	0.24	0.21	0.23	0.18	0.05	0.05	0.09	1.0
Azfi_s0004.g008547 (NAP8)	0.46	0.04	0.2	0.15	0.18	0.31	0.37	0.37	0.39	0.27	0.27	0.29	1.0
Azfi_s0005.g009239 (OSU1)	0.84	0.35	0.44	0.46	0.52	0.51	0.58	0.66	0.64	0.37	0.32	0.37	1.0
Azfi_s0005.g009309	0.16	0.12	0.05	0.06	0.02	0.12	0.16	0.12	0.17	0.11	0.08	0.1	1.0
Azfi_s0006.g009536	0.21	0.01	0.1	0.16	0.12	0.18	0.29	0.31	0.3	0.06	0.06	0.04	1.0
Azfi_s0006.g009910 (EMB2758)	0.34	0.27	0.08	0.04	0.06	0.31	0.46	0.53	0.61	0.02	0.01	0.02	1.0
Azfi_s0006.g010040	0.16	0.03	0.04	0.06	0.06	0.17	0.2	0.21	0.25	0.09	0.08	0.1	1.0
Azfi_s0006.g010169	0.18	0.28	0.22	0.02	0.16	0.41	0.27	0.18	0.19	0.0	0.0	0.0	1.0
Azfi_s0006.g010495 (ALMT12)	0.32	0.17	0.0	0.03	0.04	0.29	0.19	0.14	0.4	0.11	0.06	0.12	1.0
Azfi_s0007.g010576 (GPX6)	0.66	0.13	0.39	0.21	0.31	0.37	0.4	0.48	0.38	0.13	0.12	0.13	1.0
Azfi_s0007.g010969	0.47	0.03	0.27	0.12	0.17	0.32	0.31	0.33	0.31	0.06	0.05	0.05	1.0
Azfi_s0008.g011330	0.28	0.07	0.24	0.29	0.23	0.38	0.32	0.33	0.26	0.0	0.01	0.02	1.0
Azfi_s0008.g011352 (LINC3)	0.25	0.11	0.11	0.12	0.13	0.35	0.35	0.3	0.44	0.12	0.12	0.13	1.0
Azfi_s0008.g011385	0.23	0.08	0.14	0.19	0.19	0.16	0.14	0.13	0.13	0.11	0.11	0.11	1.0
Azfi_s0008.g011632 (NSI)	0.18	0.06	0.1	0.09	0.1	0.19	0.2	0.2	0.2	0.04	0.04	0.04	1.0
Azfi_s0010.g012159 (ZDS)	0.85	0.1	0.42	0.28	0.35	0.49	0.52	0.55	0.54	0.17	0.17	0.18	1.0
Azfi_s0010.g012286	0.32	0.03	0.21	0.1	0.41	0.23	0.18	0.15	0.14	0.19	0.19	0.18	1.0
Azfi_s0011.g012553 (RHS14)	0.24	0.08	0.0	0.0	0.02	0.08	0.06	0.07	0.02	0.0	0.0	0.0	1.0
Azfi_s0013.g013287 (TIC110)	0.84	0.24	0.56	0.48	0.52	0.47	0.48	0.5	0.56	0.24	0.2	0.23	1.0
Azfi_s0015.g014163	0.58	0.0	0.37	0.31	0.29	0.29	0.37	0.39	0.4	0.1	0.09	0.08	1.0
Azfi_s0019.g015287	0.43	0.09	0.28	0.44	0.27	0.49	0.31	0.28	0.3	0.21	0.21	0.23	1.0
Azfi_s0020.g015570 (OTP86)	0.65	0.17	0.41	0.31	0.42	0.44	0.45	0.48	0.64	0.17	0.16	0.16	1.0
Azfi_s0022.g015996	0.44	0.25	0.29	0.43	0.38	0.38	0.42	0.43	0.44	0.21	0.19	0.21	1.0
Azfi_s0022.g016180 (LPD1)	0.6	0.36	0.4	0.31	0.46	0.36	0.37	0.41	0.42	0.37	0.36	0.35	1.0
Azfi_s0022.g016231 (CLH2)	0.19	0.14	0.09	0.09	0.08	0.26	0.3	0.3	0.31	0.04	0.05	0.04	1.0
Azfi_s0024.g020363	0.13	0.04	0.03	0.03	0.04	0.1	0.09	0.09	0.17	0.05	0.1	0.08	1.0
Azfi_s0027.g023706 (FDH)	0.26	0.09	0.09	0.06	0.08	0.33	0.23	0.21	0.19	0.0	0.0	0.0	1.0
Azfi_s0030.g024254 (CCB4)	0.41	0.06	0.19	0.22	0.16	0.33	0.33	0.36	0.37	0.14	0.16	0.15	1.0
Azfi_s0033.g025018	0.47	0.07	0.19	0.13	0.15	0.35	0.4	0.4	0.48	0.14	0.13	0.15	1.0
Azfi_s0038.g026245	0.21	0.05	0.11	0.23	0.15	0.27	0.25	0.26	0.31	0.15	0.1	0.13	1.0
Azfi_s0040.g026592	0.3	0.17	0.14	0.22	0.21	0.39	0.45	0.44	0.56	0.35	0.31	0.33	1.0
Azfi_s0042.g026853	0.2	0.03	0.0	0.0	0.0	0.03	0.08	0.04	0.06	0.01	0.01	0.01	1.0
Azfi_s0042.g026929	0.41	0.05	0.32	0.16	0.26	0.45	0.27	0.23	0.25	0.09	0.08	0.08	1.0
Azfi_s0045.g029939	0.39	0.04	0.22	0.16	0.22	0.48	0.44	0.43	0.56	0.27	0.26	0.27	1.0
Azfi_s0046.g030122	0.43	0.12	0.18	0.42	0.35	0.34	0.31	0.31	0.4	0.11	0.14	0.13	1.0
Azfi_s0046.g030192	0.25	0.03	0.11	0.14	0.14	0.31	0.31	0.33	0.38	0.24	0.25	0.26	1.0
Azfi_s0048.g030540	0.19	0.02	0.06	0.06	0.05	0.18	0.16	0.17	0.19	0.05	0.04	0.04	1.0
Azfi_s0051.g031483	0.28	0.02	0.12	0.15	0.12	0.33	0.36	0.34	0.46	0.05	0.04	0.06	1.0
Azfi_s0052.g031587	0.63	0.1	0.24	0.19	0.18	0.36	0.43	0.46	0.54	0.18	0.2	0.2	1.0
Azfi_s0054.g033623 (MEE18)	0.46	0.33	0.24	0.36	0.32	0.47	0.47	0.53	0.59	0.3	0.3	0.31	1.0
Azfi_s0054.g033633	0.34	0.22	0.0	0.02	0.0	0.38	0.31	0.24	0.24	0.0	0.0	0.0	1.0
Azfi_s0054.g033672 (CH42)	0.19	0.01	0.13	0.08	0.1	0.15	0.16	0.18	0.17	0.02	0.02	0.03	1.0
Azfi_s0055.g033899	0.37	0.05	0.2	0.36	0.25	0.44	0.38	0.36	0.42	0.37	0.34	0.33	1.0
Azfi_s0057.g034325	0.88	0.16	0.5	0.21	0.28	0.49	0.54	0.65	0.6	0.33	0.3	0.29	1.0
Azfi_s0059.g034660	0.75	0.3	0.41	0.31	0.39	0.42	0.48	0.48	0.55	0.33	0.32	0.33	1.0
Azfi_s0059.g034681 (IAA4)	0.35	0.01	0.02	0.02	0.03	0.15	0.16	0.19	0.13	0.04	0.03	0.03	1.0
Azfi_s0061.g034958	0.86	0.19	0.52	0.29	0.42	0.72	0.67	0.61	0.61	0.19	0.19	0.19	1.0
Azfi_s0064.g035465 (PUM23)	0.46	0.05	0.3	0.43	0.36	0.3	0.29	0.31	0.33	0.29	0.26	0.31	1.0
Azfi_s0064.g035609	0.76	0.09	0.45	0.31	0.29	0.51	0.58	0.56	0.62	0.15	0.14	0.14	1.0
Azfi_s0068.g036359	0.13	0.04	0.06	0.08	0.08	0.18	0.17	0.17	0.16	0.07	0.07	0.07	1.0
Azfi_s0072.g036887 (EMB2758)	0.27	0.1	0.16	0.19	0.19	0.24	0.19	0.18	0.35	0.11	0.09	0.11	1.0
Azfi_s0073.g037092	0.14	0.01	0.06	0.04	0.07	0.04	0.1	0.18	0.16	0.0	0.0	0.01	1.0
Azfi_s0074.g037385 (OTP84)	0.75	0.06	0.3	0.31	0.29	0.41	0.54	0.53	0.57	0.11	0.11	0.1	1.0
Azfi_s0075.g037541	0.5	0.42	0.3	0.15	0.24	0.32	0.28	0.26	0.32	0.04	0.04	0.04	1.0
Azfi_s0076.g037854 (OK1)	0.48	0.05	0.2	0.19	0.21	0.24	0.34	0.34	0.46	0.28	0.29	0.29	1.0
Azfi_s0077.g038014	0.4	0.16	0.22	0.32	0.33	0.33	0.29	0.28	0.31	0.26	0.26	0.28	1.0
Azfi_s0083.g038840	0.64	0.18	0.51	0.13	0.3	0.53	0.51	0.53	0.42	0.02	0.02	0.02	1.0
Azfi_s0083.g038882	0.45	0.12	0.13	0.33	0.22	0.24	0.32	0.37	0.26	0.05	0.03	0.06	1.0
Azfi_s0085.g039110 (emb2004)	0.47	0.1	0.24	0.29	0.27	0.31	0.27	0.27	0.3	0.12	0.1	0.11	1.0
Azfi_s0085.g039113	0.49	0.22	0.28	0.6	0.49	0.36	0.37	0.42	0.4	0.28	0.26	0.23	1.0
Azfi_s0092.g043135 (GLN1;4)	0.22	0.11	0.2	0.1	0.14	0.16	0.15	0.17	0.15	0.04	0.04	0.04	1.0
Azfi_s0093.g043195	0.18	0.06	0.07	0.02	0.06	0.17	0.06	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	1.0
Azfi_s0093.g043238	0.33	0.08	0.3	0.23	0.24	0.21	0.27	0.33	0.24	0.05	0.05	0.05	1.0
Azfi_s0095.g043641 (NRAMP3)	0.23	0.08	0.11	0.09	0.08	0.29	0.25	0.24	0.24	0.07	0.08	0.07	1.0
Azfi_s0099.g044137 (CPH)	0.28	0.05	0.14	0.13	0.21	0.35	0.35	0.32	0.27	0.22	0.18	0.21	1.0
Azfi_s0102.g044565 (CRR22)	0.11	0.0	0.08	0.15	0.09	0.13	0.13	0.13	0.11	0.01	0.01	0.03	1.0
Azfi_s0107.g045098	0.31	0.09	0.15	0.13	0.12	0.2	0.22	0.26	0.27	0.1	0.09	0.09	1.0
Azfi_s0109.g045324	0.32	0.15	0.13	0.17	0.15	0.48	0.39	0.32	0.24	0.03	0.04	0.03	1.0
Azfi_s0109.g045371 (emb2726)	0.65	0.03	0.59	0.35	0.44	0.34	0.35	0.4	0.37	0.09	0.08	0.08	1.0
Azfi_s0116.g046314	0.39	0.25	0.28	0.2	0.25	0.49	0.42	0.35	0.52	0.35	0.34	0.38	1.0
Azfi_s0116.g046423 (EDA3)	0.28	0.05	0.11	0.08	0.08	0.27	0.3	0.32	0.28	0.02	0.01	0.01	1.0
Azfi_s0117.g046586	0.24	0.04	0.16	0.17	0.19	0.34	0.3	0.31	0.32	0.19	0.21	0.22	1.0
Azfi_s0123.g048421	0.36	0.09	0.2	0.3	0.38	0.24	0.27	0.27	0.29	0.23	0.21	0.22	1.0
Azfi_s0132.g049193	0.17	0.01	0.15	0.05	0.09	0.08	0.09	0.1	0.08	0.02	0.02	0.01	1.0
Azfi_s0133.g049322	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.1	0.1	0.21	0.0	0.0	0.0	1.0
Azfi_s0140.g051226 (ISPE)	0.31	0.06	0.22	0.16	0.18	0.27	0.25	0.24	0.29	0.13	0.13	0.14	1.0
Azfi_s0141.g051359 (CHA18)	0.37	0.08	0.17	0.33	0.28	0.46	0.46	0.41	0.51	0.49	0.4	0.48	1.0
Azfi_s0149.g053240 (RPE)	0.2	0.02	0.12	0.04	0.07	0.14	0.13	0.14	0.14	0.02	0.02	0.02	1.0
Azfi_s0159.g053959	0.26	0.01	0.19	0.2	0.17	0.19	0.2	0.23	0.18	0.01	0.01	0.01	1.0
Azfi_s0183.g056487	0.12	0.03	0.06	0.06	0.05	0.21	0.19	0.19	0.26	0.05	0.05	0.05	1.0
Azfi_s0185.g056654 (CYP38)	0.29	0.04	0.09	0.05	0.07	0.18	0.2	0.21	0.23	0.03	0.03	0.03	1.0
Azfi_s0187.g056718	0.35	0.31	0.14	0.08	0.09	0.37	0.36	0.31	0.35	0.07	0.08	0.07	1.0
Azfi_s0191.g056990	0.47	0.15	0.19	0.13	0.08	0.62	0.58	0.5	0.54	0.18	0.17	0.2	1.0
Azfi_s0196.g057279	0.3	0.05	0.11	0.09	0.11	0.14	0.17	0.19	0.19	0.03	0.03	0.03	1.0
Azfi_s0225.g058965	0.54	0.15	0.25	0.3	0.29	0.35	0.39	0.35	0.47	0.18	0.15	0.15	1.0
Azfi_s0228.g059051	0.32	0.06	0.0	0.0	0.0	0.13	0.28	0.19	0.36	0.21	0.26	0.24	1.0
Azfi_s0230.g059154 (PGP16)	0.19	0.07	0.04	0.01	0.0	0.09	0.07	0.06	0.12	0.0	0.0	0.0	1.0
Azfi_s0252.g060321	0.77	0.16	0.36	0.19	0.42	0.62	0.62	0.65	0.63	0.14	0.12	0.15	1.0
Azfi_s0261.g060744 (HY1)	0.29	0.21	0.0	0.0	0.0	0.23	0.35	0.46	0.26	0.01	0.02	0.01	1.0
Azfi_s0292.g063375 (RABE1b)	0.74	0.14	0.68	0.3	0.51	0.58	0.52	0.55	0.51	0.08	0.07	0.06	1.0
Azfi_s0305.g063929 (CPFTSZ)	0.42	0.06	0.34	0.29	0.32	0.27	0.31	0.33	0.26	0.12	0.11	0.11	1.0
Azfi_s0306.g063951	0.45	0.28	0.22	0.25	0.25	0.41	0.43	0.45	0.51	0.41	0.35	0.37	1.0
Azfi_s0309.g064088	0.34	0.06	0.11	0.07	0.08	0.24	0.23	0.32	0.34	0.03	0.01	0.0	1.0
Azfi_s0309.g064091	0.26	0.15	0.12	0.2	0.11	0.13	0.38	0.46	0.19	0.01	0.01	0.0	1.0
Azfi_s0315.g064269 (SPDS1)	0.42	0.01	0.3	0.39	0.37	0.21	0.23	0.23	0.23	0.24	0.23	0.22	1.0
Azfi_s0324.g064566 (PRORP1)	0.16	0.05	0.15	0.16	0.16	0.15	0.15	0.15	0.17	0.09	0.08	0.1	1.0
Azfi_s0327.g065265	0.34	0.13	0.15	0.25	0.2	0.34	0.31	0.34	0.5	0.2	0.18	0.2	1.0
Azfi_s0327.g065272 (KT1)	0.41	0.29	0.16	0.18	0.2	0.48	0.54	0.5	0.71	0.04	0.03	0.03	1.0
Azfi_s0344.g065755	0.33	0.05	0.2	0.25	0.26	0.4	0.39	0.31	0.41	0.41	0.38	0.43	1.0
Azfi_s0367.g066986	0.24	0.08	0.12	0.14	0.14	0.14	0.15	0.15	0.15	0.1	0.11	0.11	1.0
Azfi_s0402.g068303 (DUR3)	0.16	0.02	0.07	0.1	0.07	0.14	0.21	0.26	0.32	0.06	0.05	0.06	1.0
Azfi_s0402.g068332	0.89	0.21	0.43	0.44	0.38	0.49	0.52	0.49	0.45	0.18	0.16	0.17	1.0
Azfi_s0448.g070698	0.26	0.16	0.09	0.05	0.14	0.32	0.26	0.22	0.29	0.06	0.03	0.06	1.0
Azfi_s0458.g071802 (NAP6)	0.22	0.03	0.19	0.14	0.16	0.21	0.22	0.23	0.24	0.11	0.11	0.1	1.0
Azfi_s0485.g073411	0.51	0.11	0.41	0.31	0.39	0.35	0.41	0.47	0.47	0.11	0.09	0.1	1.0
Azfi_s0506.g073971	0.17	0.02	0.03	0.04	0.06	0.13	0.12	0.14	0.14	0.04	0.03	0.03	1.0
Azfi_s0509.g074716 (AGY1)	0.37	0.03	0.19	0.13	0.17	0.23	0.2	0.2	0.25	0.12	0.12	0.13	1.0
Azfi_s0515.g074953	0.41	0.11	0.05	0.08	0.11	0.42	0.39	0.39	0.39	0.24	0.22	0.25	1.0
Azfi_s0557.g076879 (RNR1)	0.2	0.04	0.08	0.12	0.1	0.12	0.14	0.12	0.15	0.03	0.03	0.04	1.0
Azfi_s1531.g104152	0.44	0.37	0.11	0.23	0.25	0.37	0.37	0.29	0.34	0.17	0.16	0.19	1.0
Azfi_s2290.g110222 (GGT1)	0.35	0.28	0.0	0.0	0.0	0.5	0.43	0.33	0.37	0.02	0.03	0.03	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)