Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Vegetative Sporophyte
Adult Sporophyte
Leaf (0 mg/L NH4NO3)
Leaf (30 mg/L NH4NO3)
Leaf (90 mg/L NH4NO3)
Sporophyte; w/o NH4NO3, w/o cyanobacteria
Sporophyte; w/o NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w/o cyanobacteria
Root Tip, D-3 6h mock treated
Root Tip, D-3 6h 0.1 uM IAA treated
Root Tip, D-3 6h 0.5 uM trans-zeatin treated
Microsporocarp
0.45 0.25 0.86 0.78 0.82 0.41 0.36 0.29 0.39 0.99 0.98 1.0 0.47
0.22 0.06 0.41 0.35 0.57 0.13 0.11 0.11 0.11 1.0 0.98 0.97 0.35
0.47 0.13 0.67 0.75 0.79 0.52 0.52 0.46 0.55 0.96 1.0 0.97 0.19
0.41 0.12 0.65 0.7 0.65 0.41 0.4 0.49 0.59 1.0 0.93 0.95 0.21
0.29 0.18 0.5 0.52 0.7 0.3 0.25 0.21 0.27 0.95 0.9 1.0 0.24
0.32 0.04 0.67 0.67 0.74 0.36 0.31 0.29 0.36 0.93 0.91 1.0 0.37
0.17 0.08 0.52 0.58 0.72 0.11 0.11 0.12 0.16 0.93 1.0 0.98 0.29
0.26 0.15 0.67 0.63 0.88 0.29 0.24 0.23 0.28 0.95 0.89 1.0 0.17
0.36 0.21 0.78 0.57 0.54 0.34 0.31 0.28 0.26 0.93 0.97 1.0 0.15
0.46 0.31 0.52 0.53 0.71 0.45 0.42 0.39 0.49 0.9 0.99 1.0 0.28
0.18 0.01 0.42 0.41 0.34 0.21 0.16 0.15 0.19 0.83 1.0 0.89 0.19
0.25 0.18 0.72 0.74 0.81 0.34 0.29 0.28 0.3 0.88 1.0 1.0 0.25
0.33 0.11 0.51 0.46 0.67 0.26 0.28 0.29 0.32 0.97 1.0 0.97 0.22
0.34 0.08 0.48 0.46 0.72 0.24 0.24 0.22 0.31 0.96 0.97 1.0 0.1
0.29 0.03 0.4 0.58 0.68 0.36 0.26 0.21 0.19 0.87 1.0 0.89 0.2
0.3 0.19 0.48 0.47 0.68 0.32 0.23 0.18 0.29 1.0 0.97 1.0 0.26
0.22 0.09 0.45 0.4 0.58 0.25 0.23 0.17 0.3 1.0 0.9 1.0 0.2
0.49 0.03 0.61 0.66 0.89 0.4 0.39 0.34 0.4 0.92 0.96 1.0 0.3
0.18 0.03 0.56 0.5 0.67 0.22 0.15 0.1 0.24 0.96 1.0 0.99 0.1
0.26 0.1 0.38 0.48 0.6 0.25 0.22 0.2 0.2 0.93 1.0 0.98 0.22
0.29 0.02 0.56 0.55 0.61 0.26 0.25 0.25 0.28 0.97 1.0 0.99 0.34
0.25 0.17 0.64 0.51 0.62 0.2 0.18 0.14 0.17 0.94 1.0 1.0 0.11
0.32 0.19 0.69 0.73 0.9 0.26 0.24 0.25 0.28 1.0 0.96 1.0 0.27
0.28 0.17 0.38 0.47 0.55 0.25 0.21 0.2 0.24 0.97 0.95 1.0 0.23
0.29 0.12 0.54 0.71 0.75 0.35 0.28 0.27 0.31 1.0 0.95 1.0 0.35
0.19 0.08 0.3 0.36 0.53 0.14 0.13 0.09 0.09 1.0 0.94 1.0 0.19
0.29 0.19 0.4 0.49 0.58 0.26 0.28 0.3 0.35 0.98 0.94 1.0 0.18
0.34 0.07 0.84 0.94 0.98 0.37 0.41 0.39 0.46 0.97 1.0 0.98 0.28
0.26 0.05 0.77 0.65 1.0 0.36 0.25 0.17 0.23 0.9 0.9 0.98 0.25
0.35 0.09 0.59 0.59 0.72 0.25 0.24 0.21 0.3 0.98 0.9 1.0 0.2
0.34 0.06 0.55 0.48 0.75 0.3 0.3 0.27 0.28 0.94 0.95 1.0 0.15
0.16 0.0 0.42 0.5 0.73 0.03 0.03 0.02 0.04 0.88 1.0 0.94 0.0
0.26 0.04 0.46 0.51 0.67 0.21 0.21 0.21 0.26 0.93 1.0 0.99 0.13
0.32 0.11 0.59 0.52 0.74 0.26 0.25 0.21 0.25 1.0 0.93 0.98 0.19
0.31 0.04 0.56 0.59 0.69 0.27 0.22 0.19 0.27 0.94 0.97 1.0 0.31
0.23 0.04 0.81 0.58 0.88 0.19 0.16 0.17 0.19 1.0 0.96 0.99 0.12
0.34 0.1 0.6 0.71 0.55 0.29 0.38 0.37 0.35 0.9 1.0 0.95 0.27
0.27 0.07 0.42 0.42 0.6 0.18 0.16 0.16 0.22 0.95 1.0 0.99 0.18
0.48 0.07 0.76 0.72 1.0 0.3 0.31 0.27 0.37 0.93 0.96 0.99 0.2
0.33 0.21 0.53 0.52 0.78 0.26 0.25 0.23 0.35 0.94 0.87 1.0 0.19
0.42 0.01 0.61 0.55 0.59 0.26 0.16 0.12 0.13 1.0 0.99 0.99 0.27
0.26 0.02 0.56 0.49 0.59 0.21 0.23 0.23 0.22 0.97 0.92 1.0 0.09
0.16 0.07 0.38 0.4 0.6 0.12 0.12 0.1 0.12 1.0 0.93 0.98 0.2
0.32 0.07 0.49 0.5 0.85 0.36 0.32 0.28 0.38 0.95 0.91 1.0 0.25
0.18 0.03 0.4 0.44 0.68 0.05 0.06 0.06 0.05 0.85 0.91 1.0 0.08
0.34 0.06 0.68 0.78 0.76 0.35 0.41 0.46 0.5 0.98 0.99 1.0 0.24
0.4 0.05 0.63 0.66 0.85 0.31 0.33 0.38 0.46 0.99 0.99 1.0 0.25
0.37 0.02 0.6 0.69 0.88 0.36 0.3 0.25 0.26 1.0 1.0 1.0 0.08
0.14 0.02 0.8 0.67 0.53 0.08 0.1 0.11 0.09 0.92 0.99 1.0 0.09
0.35 0.04 0.62 0.57 0.78 0.31 0.28 0.29 0.3 1.0 0.94 0.97 0.26
0.43 0.14 0.61 0.71 0.9 0.37 0.32 0.24 0.37 0.96 0.92 1.0 0.3
0.33 0.14 0.38 0.42 0.4 0.21 0.2 0.17 0.2 0.83 1.0 0.99 0.12
0.36 0.1 0.69 0.67 0.81 0.36 0.37 0.41 0.5 0.93 1.0 1.0 0.26
0.28 0.22 0.69 0.57 1.0 0.19 0.15 0.15 0.17 1.0 0.93 0.96 0.19
0.22 0.04 0.42 0.44 0.72 0.16 0.19 0.21 0.22 1.0 0.91 0.99 0.23
0.41 0.12 0.7 0.63 1.0 0.3 0.28 0.26 0.32 0.93 0.9 0.96 0.08
Azfi_s0038.g026354 (CYP709B2)
0.38 0.08 0.63 0.61 0.94 0.42 0.39 0.34 0.49 0.97 0.94 1.0 0.33
0.35 0.09 0.62 0.57 0.75 0.37 0.46 0.4 0.48 0.98 0.99 1.0 0.28
0.35 0.07 0.45 0.42 0.53 0.29 0.32 0.34 0.34 0.93 0.98 1.0 0.17
0.27 0.1 0.55 0.52 0.62 0.21 0.19 0.14 0.21 0.92 1.0 1.0 0.2
0.36 0.05 0.61 0.85 0.45 0.36 0.36 0.33 0.41 0.94 0.95 1.0 0.09
0.48 0.15 0.8 0.78 0.94 0.47 0.4 0.38 0.49 0.94 0.97 1.0 0.52
0.3 0.09 0.84 0.84 0.54 0.35 0.38 0.33 0.43 0.81 1.0 0.94 0.22
0.25 0.04 0.3 0.31 0.55 0.25 0.29 0.31 0.37 0.98 0.92 1.0 0.17
0.19 0.04 0.56 0.68 0.67 0.21 0.21 0.18 0.22 0.95 0.98 1.0 0.18
0.13 0.02 0.43 0.42 0.6 0.2 0.11 0.08 0.09 1.0 0.91 1.0 0.13
0.34 0.08 0.61 0.53 0.63 0.28 0.28 0.19 0.29 0.87 0.97 1.0 0.26
0.42 0.07 0.56 0.57 0.76 0.41 0.39 0.43 0.48 0.91 1.0 0.98 0.39
Azfi_s0051.g031414 (5PTASE13)
0.3 0.05 0.5 0.4 0.65 0.27 0.24 0.2 0.27 0.95 0.88 1.0 0.1
0.25 0.01 0.46 0.52 0.68 0.17 0.19 0.2 0.18 1.0 0.84 0.97 0.12
0.34 0.09 0.77 0.75 0.9 0.3 0.27 0.25 0.34 0.88 0.97 1.0 0.32
0.37 0.18 0.62 0.6 0.76 0.52 0.48 0.43 0.57 1.0 0.9 1.0 0.24
0.25 0.11 0.36 0.37 0.66 0.22 0.22 0.21 0.27 0.95 0.94 1.0 0.1
0.36 0.14 0.62 0.62 0.73 0.48 0.45 0.42 0.52 0.94 1.0 0.92 0.37
0.33 0.2 0.68 0.52 0.69 0.52 0.41 0.37 0.44 0.96 1.0 0.92 0.28
0.29 0.26 0.51 0.53 0.54 0.23 0.24 0.22 0.29 0.93 0.91 1.0 0.24
0.42 0.27 0.74 0.69 0.77 0.41 0.37 0.36 0.43 0.96 1.0 1.0 0.28
0.3 0.13 0.7 0.75 0.75 0.3 0.24 0.22 0.21 0.85 1.0 0.93 0.11
0.25 0.2 0.46 0.44 0.63 0.27 0.21 0.16 0.27 0.92 0.86 1.0 0.09
0.28 0.16 0.45 0.43 0.63 0.22 0.24 0.19 0.21 1.0 0.88 0.91 0.06
0.23 0.06 0.57 0.65 0.56 0.17 0.21 0.24 0.18 0.95 0.92 1.0 0.1
0.37 0.01 0.5 0.64 0.56 0.29 0.29 0.26 0.28 0.96 1.0 0.97 0.23
0.43 0.15 0.98 0.69 0.86 0.43 0.36 0.34 0.35 1.0 0.95 0.97 0.23
0.14 0.08 0.66 0.61 0.64 0.14 0.11 0.09 0.13 0.91 0.9 1.0 0.21
0.3 0.04 0.49 0.56 0.69 0.26 0.26 0.27 0.28 0.99 0.97 1.0 0.3
0.39 0.1 0.72 0.79 0.72 0.43 0.41 0.39 0.43 0.91 1.0 0.92 0.23
0.21 0.13 0.67 0.65 0.67 0.37 0.24 0.21 0.26 0.97 0.99 1.0 0.1
0.4 0.2 0.79 0.77 0.83 0.4 0.4 0.45 0.45 1.0 1.0 1.0 0.33
0.42 0.06 0.73 0.71 0.85 0.32 0.29 0.29 0.35 0.87 0.94 1.0 0.2
0.35 0.1 0.84 0.87 0.88 0.44 0.38 0.33 0.42 0.92 1.0 0.98 0.41
0.18 0.03 0.32 0.31 0.59 0.15 0.16 0.16 0.14 0.93 1.0 0.99 0.15
0.23 0.05 0.43 0.43 0.5 0.32 0.28 0.2 0.24 1.0 0.91 1.0 0.05
0.44 0.03 0.58 0.51 0.71 0.34 0.27 0.25 0.31 0.95 1.0 0.96 0.27
0.41 0.07 0.5 0.59 0.81 0.38 0.35 0.31 0.42 1.0 0.91 1.0 0.3
0.22 0.09 0.6 0.64 0.69 0.26 0.23 0.2 0.26 0.96 0.89 1.0 0.14
0.5 0.21 0.66 0.65 0.8 0.44 0.4 0.35 0.45 0.96 0.85 1.0 0.48
0.19 0.02 0.48 0.53 0.49 0.12 0.12 0.11 0.14 0.86 1.0 0.92 0.2
0.36 0.11 0.51 0.53 0.79 0.3 0.24 0.22 0.23 1.0 0.91 0.95 0.3
0.35 0.07 0.63 0.67 0.66 0.36 0.3 0.27 0.37 0.87 0.95 1.0 0.27
0.37 0.09 0.56 0.58 0.75 0.3 0.26 0.25 0.3 0.97 0.96 1.0 0.35
0.27 0.01 0.91 0.94 0.82 0.55 0.25 0.11 0.45 0.93 0.88 1.0 0.34
0.34 0.1 0.68 0.73 0.81 0.27 0.25 0.22 0.26 0.91 0.93 1.0 0.16
0.16 0.04 0.48 0.54 0.55 0.06 0.05 0.04 0.03 0.96 0.97 1.0 0.33
0.24 0.15 0.7 0.68 0.91 0.29 0.25 0.21 0.34 0.92 0.88 1.0 0.24
0.24 0.03 0.66 0.79 0.81 0.31 0.29 0.28 0.33 0.95 1.0 1.0 0.27
0.24 0.03 0.57 0.56 0.63 0.24 0.23 0.22 0.22 0.93 0.96 1.0 0.29
0.34 0.13 0.42 0.44 0.61 0.39 0.35 0.29 0.35 0.93 0.82 1.0 0.23
0.13 0.01 0.55 0.62 0.79 0.13 0.09 0.07 0.09 0.91 1.0 0.95 0.24
0.38 0.02 0.53 0.61 0.74 0.35 0.32 0.32 0.36 0.94 0.94 1.0 0.36
0.42 0.12 0.51 0.52 0.74 0.42 0.42 0.34 0.43 1.0 0.9 0.98 0.2
0.2 0.07 0.52 0.45 0.57 0.15 0.19 0.18 0.16 0.9 0.94 1.0 0.35
0.43 0.01 0.55 0.48 0.61 0.22 0.22 0.21 0.19 0.99 1.0 0.96 0.15
0.37 0.27 0.71 0.71 0.72 0.45 0.45 0.41 0.45 0.92 1.0 0.95 0.25
0.27 0.02 0.96 0.67 0.71 0.33 0.26 0.2 0.23 0.83 1.0 0.94 0.2
0.41 0.1 0.58 0.59 0.74 0.33 0.3 0.25 0.29 0.92 1.0 0.96 0.36
0.24 0.12 0.67 0.67 0.54 0.24 0.23 0.19 0.3 0.7 1.0 0.81 0.29
0.11 0.0 0.58 0.65 0.8 0.25 0.09 0.0 0.22 0.87 1.0 0.88 0.16
0.16 0.03 0.84 0.7 0.79 0.12 0.11 0.08 0.07 0.98 1.0 0.97 0.19
0.25 0.03 0.69 0.66 0.82 0.34 0.29 0.29 0.4 0.87 1.0 0.97 0.52
0.24 0.12 0.39 0.36 0.5 0.14 0.11 0.12 0.16 0.96 0.95 1.0 0.18
0.37 0.18 0.66 0.7 0.95 0.47 0.34 0.3 0.45 0.98 0.88 1.0 0.38
0.35 0.12 0.78 0.7 0.61 0.31 0.3 0.29 0.32 0.94 0.92 1.0 0.47
0.19 0.04 0.37 0.54 0.63 0.11 0.14 0.15 0.11 0.91 0.96 1.0 0.02
0.32 0.02 0.6 0.73 1.0 0.22 0.22 0.23 0.28 0.76 0.97 0.89 0.11
0.34 0.08 0.49 0.57 0.64 0.37 0.32 0.32 0.36 0.91 1.0 0.87 0.41
0.3 0.12 0.54 0.38 0.8 0.31 0.31 0.25 0.3 0.94 0.93 1.0 0.22
0.33 0.06 0.75 0.77 0.82 0.38 0.36 0.34 0.37 0.97 1.0 0.97 0.18
0.3 0.15 0.43 0.41 0.58 0.3 0.33 0.32 0.41 1.0 1.0 0.99 0.18
0.33 0.1 0.4 0.37 0.57 0.26 0.26 0.25 0.33 1.0 0.83 0.97 0.09
0.27 0.11 0.41 0.46 0.5 0.19 0.2 0.18 0.21 0.96 0.91 1.0 0.22
0.34 0.05 0.53 0.6 0.87 0.28 0.23 0.21 0.22 1.0 0.91 0.99 0.09
0.17 0.04 0.65 0.57 0.6 0.16 0.2 0.17 0.15 0.92 0.89 1.0 0.3
0.3 0.05 0.34 0.38 0.55 0.24 0.21 0.2 0.24 1.0 0.98 0.94 0.16
0.37 0.07 0.62 0.64 0.88 0.34 0.37 0.34 0.46 0.93 0.92 1.0 0.33
0.33 0.11 0.6 0.59 0.74 0.26 0.22 0.22 0.23 1.0 1.0 0.98 0.17
0.33 0.12 0.72 0.82 0.91 0.32 0.34 0.29 0.37 0.94 0.93 1.0 0.32
0.25 0.13 0.49 0.42 0.6 0.26 0.17 0.19 0.24 0.9 1.0 0.92 0.26
0.37 0.2 0.61 0.54 0.81 0.29 0.27 0.24 0.32 0.97 0.9 1.0 0.43
0.21 0.06 0.52 0.37 0.66 0.24 0.2 0.16 0.19 0.91 1.0 0.98 0.31
0.45 0.14 0.71 0.85 1.0 0.58 0.48 0.43 0.66 0.95 0.98 0.97 0.32
0.36 0.06 0.71 0.68 0.78 0.47 0.36 0.31 0.43 0.97 0.97 1.0 0.2
0.26 0.04 0.33 0.33 0.56 0.12 0.12 0.13 0.16 0.94 1.0 0.96 0.18
0.36 0.11 0.53 0.61 0.78 0.29 0.24 0.22 0.29 1.0 0.9 0.99 0.31
0.37 0.12 0.62 0.68 0.58 0.47 0.44 0.42 0.52 0.88 1.0 0.98 0.11
0.29 0.08 0.69 0.68 0.77 0.23 0.23 0.21 0.18 0.94 0.98 1.0 0.16
0.23 0.02 0.64 0.71 0.65 0.23 0.23 0.21 0.24 0.87 1.0 0.94 0.3
0.4 0.12 0.7 0.72 0.76 0.43 0.33 0.31 0.43 0.93 1.0 0.98 0.17
0.44 0.07 0.54 0.47 0.69 0.26 0.28 0.26 0.31 0.94 0.99 1.0 0.23
0.42 0.04 0.83 0.72 0.91 0.37 0.4 0.41 0.35 0.95 1.0 1.0 0.3
0.27 0.04 0.58 0.56 0.78 0.27 0.26 0.23 0.23 1.0 0.9 0.99 0.28
0.25 0.04 0.61 0.44 0.78 0.23 0.21 0.18 0.19 0.95 1.0 0.97 0.25
0.14 0.03 0.59 0.55 0.5 0.13 0.12 0.11 0.14 0.84 0.84 1.0 0.09
0.25 0.1 0.67 0.6 0.85 0.24 0.22 0.2 0.27 0.98 0.86 1.0 0.21
0.42 0.18 0.61 0.49 0.69 0.42 0.36 0.33 0.39 1.0 0.98 0.97 0.27
0.3 0.08 0.68 0.6 0.7 0.33 0.31 0.31 0.42 0.88 1.0 0.96 0.28
0.17 0.05 0.67 0.61 0.8 0.22 0.19 0.15 0.18 0.89 0.93 1.0 0.09
0.26 0.02 0.43 0.48 0.62 0.17 0.2 0.23 0.33 0.91 1.0 0.99 0.21
0.12 0.05 0.4 0.41 0.65 0.06 0.06 0.05 0.06 1.0 1.0 0.91 0.04
0.25 0.06 0.4 0.39 0.66 0.15 0.14 0.12 0.15 0.93 0.91 1.0 0.05
0.33 0.22 0.51 0.47 0.64 0.24 0.22 0.21 0.27 0.94 0.96 1.0 0.29
0.18 0.04 0.65 0.54 0.81 0.05 0.07 0.05 0.06 0.93 0.89 1.0 0.09
0.22 0.03 0.35 0.45 0.49 0.23 0.23 0.23 0.24 1.0 0.97 0.99 0.13
0.38 0.12 0.45 0.47 0.54 0.31 0.29 0.27 0.28 0.91 0.98 1.0 0.25
0.32 0.01 0.42 0.59 0.78 0.37 0.32 0.3 0.33 0.98 0.92 1.0 0.18
0.32 0.1 0.58 0.65 0.71 0.42 0.36 0.33 0.4 0.84 1.0 0.97 0.24
0.22 0.1 0.49 0.48 0.58 0.2 0.2 0.18 0.28 0.97 0.86 1.0 0.21
0.4 0.28 0.7 0.68 0.86 0.52 0.44 0.39 0.58 0.9 0.91 1.0 0.22
0.22 0.02 0.74 0.81 0.69 0.28 0.12 0.05 0.27 0.91 0.98 1.0 0.19
0.28 0.16 0.45 0.43 0.63 0.22 0.24 0.19 0.21 1.0 0.88 0.91 0.06

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)