Heatmap: Cluster_71 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Vegetative Sporophyte
Adult Sporophyte
Leaf (0 mg/L NH4NO3)
Leaf (30 mg/L NH4NO3)
Leaf (90 mg/L NH4NO3)
Sporophyte; w/o NH4NO3, w/o cyanobacteria
Sporophyte; w/o NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w/o cyanobacteria
Root Tip, D-3 6h mock treated
Root Tip, D-3 6h 0.1 uM IAA treated
Root Tip, D-3 6h 0.5 uM trans-zeatin treated
Microsporocarp
0.38 -1.0 0.16 0.36 0.5 0.17 0.36 0.51 0.38 -0.63 -0.78 -0.71 -1.28
1.35 -2.95 0.12 1.24 1.01 0.37 0.53 0.35 -0.41 - - - -3.36
0.49 -2.58 0.62 0.98 0.82 -0.14 0.27 0.14 0.16 -1.1 -0.98 -1.0 -1.45
0.51 -1.18 -0.08 0.32 0.14 0.04 0.33 0.45 0.28 -0.18 -0.34 -0.29 -1.05
0.71 -2.24 0.48 0.61 0.47 -0.08 -0.08 -0.02 0.03 -0.54 -0.55 -0.52 -0.16
0.67 -1.09 0.31 0.52 -0.02 0.09 0.43 0.44 0.28 -1.22 -1.22 -1.53 0.12
0.74 -2.5 0.04 1.08 0.16 0.25 -0.04 0.22 0.4 -0.61 -0.77 -1.02 -0.97
0.56 -3.83 0.41 0.8 0.66 -0.39 0.21 0.18 -0.05 -0.32 -0.29 -0.36 -1.37
0.68 -1.34 -0.05 0.18 -0.03 0.24 0.26 0.31 0.39 -0.34 -0.41 -0.4 -0.55
0.32 -2.92 0.92 0.87 0.99 0.01 0.01 -0.01 0.08 -1.15 -1.12 -1.19 -1.02
0.64 -1.57 0.49 0.41 0.3 0.13 0.22 0.28 0.3 -0.48 -0.4 -0.53 -1.96
0.64 -2.52 0.62 0.61 0.46 0.11 0.37 0.34 0.26 -0.7 -0.76 -0.76 -2.29
0.37 -1.36 0.18 0.43 0.47 0.37 0.33 0.29 0.53 -0.95 -1.17 -0.86 -0.46
0.57 -2.48 0.24 0.63 0.44 0.4 0.49 0.51 0.47 -1.03 -0.89 -0.84 -3.04
0.99 -2.35 -0.01 0.96 0.48 0.35 0.27 0.4 0.23 -1.56 -1.74 -1.76 -0.81
0.49 -2.33 0.01 0.52 0.17 -0.09 0.13 0.21 0.12 -0.11 -0.42 -0.25 0.07
0.87 -1.25 0.26 0.37 0.31 0.06 0.03 0.1 0.24 -0.33 -0.91 -0.8 -0.31
0.57 -0.25 -0.0 0.38 0.29 0.13 0.16 0.15 -0.05 -0.23 -0.48 -0.39 -0.94
0.89 -2.5 0.32 0.87 0.75 -0.19 0.15 0.26 0.13 -1.3 -1.71 -1.54 -0.19
0.79 -3.72 -0.18 0.5 0.43 0.09 0.28 0.39 0.04 -0.29 -0.39 -0.48 -0.64
0.69 -1.13 0.13 0.95 0.6 -0.16 0.33 0.25 0.29 -1.57 -1.95 -1.23 -0.33
0.61 -2.84 0.06 0.65 0.33 -0.13 0.28 0.36 0.2 -0.31 -0.45 -0.28 -0.87
0.8 -2.2 -0.78 1.43 1.02 -0.13 0.01 0.41 -1.63 -1.36 -2.05 0.01 -0.94
0.84 -1.85 -0.18 0.57 -0.02 0.28 0.43 0.36 0.45 -1.27 -1.46 -1.31 0.26
0.63 -3.91 -0.24 0.64 0.3 0.15 0.08 0.2 0.19 -0.46 -0.52 -0.43 0.17
0.67 -1.03 -0.17 0.39 0.1 0.04 0.0 0.01 0.19 -0.12 -0.28 -0.18 -0.26
0.33 -1.54 0.31 0.55 0.55 0.49 0.3 0.08 0.62 -0.82 -0.87 -0.83 -1.63
0.49 -0.66 0.07 0.22 0.43 0.18 0.22 0.18 0.48 -0.37 -0.48 -0.33 -1.77
0.62 -1.9 0.28 0.68 0.71 -0.48 -0.15 -0.08 -0.14 -0.06 -0.36 -0.27 -0.48
0.75 -3.7 0.28 0.33 0.5 -0.03 -0.0 -0.17 0.13 -0.17 -0.29 -0.13 -0.38
0.64 -1.44 0.43 0.77 0.65 0.27 0.1 -0.12 0.27 -0.93 -1.19 -1.0 -0.8
0.86 -1.21 -0.11 0.45 0.26 0.05 -0.11 -0.21 -0.08 -0.01 -0.37 -0.15 -0.29
0.55 -1.01 0.3 0.4 0.22 0.13 0.34 0.26 0.5 -0.95 -1.13 -0.79 -0.35
0.4 -1.31 0.01 0.47 0.39 0.2 0.25 0.35 0.5 -0.48 -0.68 -0.59 -0.88
0.92 -1.33 -0.21 0.71 0.14 -0.27 0.27 0.49 0.43 -0.89 -1.11 -1.07 -0.26
0.57 -2.98 0.45 1.09 1.12 0.29 0.39 0.46 0.17 -3.11 -2.48 -2.29 -2.47
0.7 -1.43 0.23 0.52 0.54 -0.18 0.27 0.57 0.29 -1.15 -0.99 -0.99 -0.51
0.55 -0.65 0.25 0.72 0.57 0.09 0.31 0.45 0.52 -1.69 -1.91 -1.59 -0.77
0.6 -1.9 0.05 0.46 0.3 -0.29 0.12 0.18 0.05 -0.16 -0.27 -0.15 -0.19
0.44 -0.7 -0.08 0.33 0.37 0.14 0.15 0.02 0.2 -0.08 -0.39 -0.02 -1.09
0.73 -2.76 -0.05 0.24 0.3 0.19 0.15 0.19 0.09 -0.16 -0.37 -0.28 -0.22
0.49 -1.73 0.56 0.75 0.42 0.17 0.32 0.66 0.64 -1.68 -1.86 -1.92 -1.21
0.37 -2.72 0.5 0.58 0.73 -0.12 0.15 0.24 0.1 -0.74 -0.89 -0.69 -0.07
0.6 -2.1 -0.03 0.2 -0.01 0.23 0.16 0.3 0.19 -0.08 -0.39 -0.4 0.0
0.5 -2.19 0.3 0.73 0.25 -0.02 0.26 0.35 0.33 -1.0 -1.04 -1.01 0.14
0.39 -0.39 -0.3 0.22 0.06 0.13 0.09 0.2 0.27 0.04 -0.37 -0.06 -0.67
0.69 -1.58 0.11 0.76 0.19 0.07 0.24 0.2 -0.06 -0.4 -0.46 -0.42 -0.78
0.75 -2.06 0.53 0.78 0.46 0.09 0.24 0.16 -0.04 -1.09 -1.47 -1.23 -0.07
0.69 -2.94 0.22 0.71 0.52 0.34 0.33 0.41 0.06 -0.76 -1.06 -0.95 -0.88
0.78 -1.05 -0.22 0.88 0.45 -0.43 0.14 0.4 -1.17 0.0 -0.54 -0.08 -1.04
0.51 -2.37 0.2 0.91 0.76 -0.09 0.23 0.35 0.3 -0.86 -1.43 -0.99 -0.7
0.51 -2.2 0.37 0.68 0.57 -0.19 0.01 -0.04 0.14 -0.42 -0.69 -0.59 0.01
0.69 -4.35 0.07 0.58 0.53 0.13 0.56 0.78 0.51 -1.21 -1.46 -1.19 -1.32
0.71 -4.51 0.48 1.01 0.73 0.05 0.53 0.58 0.19 -2.09 -2.18 -2.22 -1.08
0.69 -1.63 0.71 0.4 0.55 0.04 -0.09 0.02 0.14 -0.67 -0.87 -0.67 -0.41
0.45 -3.2 0.48 0.63 0.74 0.03 0.21 0.24 0.24 -1.0 -1.12 -1.12 -0.08
0.47 -1.1 -0.01 1.04 0.53 -0.35 0.16 0.22 -0.32 -0.5 -0.63 -0.36 -0.59
0.8 -1.71 0.59 0.12 0.59 0.29 0.04 -0.0 -0.31 -0.5 -0.03 -0.38 -1.48
0.7 -1.91 0.59 1.17 1.07 -0.84 0.35 0.1 -1.06 -0.91 -1.33 -1.1 -1.08
0.83 -1.9 -0.21 0.57 0.81 0.5 0.65 0.52 -0.0 -1.9 -2.19 -1.91 -0.55
0.59 -2.09 0.44 0.64 0.75 0.09 0.19 0.26 0.53 -0.9 -1.1 -0.79 -2.12
0.4 -1.57 -0.02 0.7 0.42 0.01 0.22 0.34 0.4 -0.42 -0.62 -0.56 -0.83
0.81 -1.98 0.07 0.42 0.43 0.32 0.56 0.58 0.43 -1.36 -1.6 -1.62 -0.64
0.84 -2.26 -0.61 0.33 -0.12 0.47 0.64 0.71 0.59 -1.07 -1.42 -1.1 -0.37
0.71 -3.6 0.29 0.68 0.35 0.27 0.35 0.37 0.39 -0.68 -0.78 -0.78 -1.67
0.52 -2.21 0.53 0.83 1.06 -0.23 -0.06 -0.04 -0.24 -0.83 -0.89 -0.6 -0.62
0.67 -1.08 0.06 -0.03 0.21 0.43 0.29 0.22 0.16 -0.38 -0.61 -0.24 -0.64
0.8 -6.1 0.09 0.72 0.24 0.09 0.26 0.31 -0.05 -0.26 -0.43 -0.4 -0.89
0.68 -3.35 -0.21 0.85 0.74 -1.2 0.55 0.99 0.15 -0.9 -0.95 -0.89 -1.39
0.42 -3.39 0.32 0.8 0.84 -0.06 0.2 0.34 0.31 -0.85 -1.28 -0.84 -0.63
0.44 -1.88 0.02 0.41 0.39 0.2 0.02 -0.08 0.04 -0.14 -0.32 -0.27 0.06
0.58 -1.93 -0.09 0.59 0.06 0.41 0.31 0.31 0.18 -0.41 -0.72 -0.63 -0.3
0.62 -1.31 0.56 0.65 0.52 0.2 0.13 0.16 -0.15 -0.87 -0.93 -0.94 -0.5
0.4 -1.38 0.32 0.33 0.23 -0.03 0.22 0.4 0.22 -0.39 -0.37 -0.36 -0.56
0.34 -1.36 0.42 0.47 0.58 0.31 -0.0 -0.05 -0.05 -0.3 -0.38 -0.34 -0.78
0.83 -1.66 0.16 0.5 0.43 -0.15 -0.24 -0.29 0.01 0.13 -0.24 0.03 -1.02
0.62 -3.71 0.13 0.86 0.88 0.64 0.38 0.56 -0.15 -2.34 -2.92 -1.78 -0.37
0.59 -1.15 0.08 1.2 0.79 -0.21 0.21 0.3 0.19 -1.83 -1.83 -1.64 -0.54
0.69 -0.35 -0.08 0.23 0.0 0.22 0.03 0.03 0.15 -0.27 -0.52 -0.43 -0.15
0.63 -1.02 0.81 0.53 0.64 -0.05 -0.05 -0.2 -0.29 -0.97 -1.05 -0.81 0.04
0.91 -2.7 0.31 0.42 0.51 -0.53 -0.25 -0.11 -0.22 0.1 -0.03 0.11 -0.91
0.85 -3.94 0.3 0.85 0.64 0.27 0.37 0.48 -0.08 -1.28 -1.49 -1.42 -0.85
0.57 -2.0 0.09 0.7 0.51 0.13 0.34 0.54 0.55 -1.12 -1.38 -1.46 -0.6
0.78 -1.97 0.51 0.35 0.47 -0.08 0.01 0.08 0.35 -0.31 -0.47 -0.31 -1.69
0.33 -0.86 0.06 0.42 0.4 0.34 0.34 0.35 0.55 -0.71 -0.83 -0.69 -1.24
1.04 -1.02 -0.13 0.63 0.32 -0.15 0.32 0.51 0.04 -0.81 -0.91 -1.28 -0.7
0.49 -2.0 0.09 0.84 0.67 -0.01 0.41 0.47 0.37 -1.2 -1.73 -1.32 -0.38
0.37 -1.53 0.19 0.69 0.74 0.1 0.23 0.42 0.16 -0.73 -0.84 -0.86 -0.9
0.53 -2.04 0.42 1.0 0.78 -0.06 0.5 0.01 -0.13 -1.54 -1.01 -0.79 -0.84
0.54 -3.35 -0.05 0.43 0.44 -0.26 0.07 0.17 -0.07 -0.13 -0.34 -0.31 0.38
0.74 -3.9 -0.1 1.05 0.79 -0.16 0.33 -0.21 0.08 -0.56 -0.93 -0.59 -0.76
0.51 -2.18 0.38 0.76 0.58 0.05 0.06 0.07 0.05 -0.52 -0.84 -0.72 -0.24
0.5 -2.46 0.08 0.72 0.55 -0.03 0.07 0.22 -0.24 -0.47 -0.09 -0.56 -0.23
0.63 -2.33 -0.06 0.45 0.32 0.12 0.15 0.18 0.19 -0.5 -0.8 -0.59 0.33
0.59 -3.57 0.45 1.01 0.69 0.15 0.07 0.2 0.47 -1.15 -1.69 -1.33 -0.84
0.45 -3.37 -0.15 0.39 0.34 0.27 0.37 0.38 0.27 -0.25 -0.49 -0.59 -0.24
0.91 -2.1 -0.07 0.91 0.56 -0.05 0.63 0.63 -0.27 -1.56 -1.59 -1.4 -0.65
0.93 -3.71 0.61 0.39 0.54 -0.04 -0.0 0.09 0.03 -0.32 -0.62 -0.46 -1.01
0.66 -1.18 0.11 0.65 0.35 0.02 0.01 0.11 0.35 -0.52 -0.77 -0.62 -0.42
0.66 -2.78 0.02 1.05 1.0 -0.31 -0.05 0.32 -0.05 -1.11 -1.48 -1.04 -0.13
0.42 -2.89 0.18 0.67 0.5 0.1 0.23 0.19 0.33 -0.65 -0.75 -0.75 -0.14
0.64 -2.02 0.23 -0.06 0.32 0.32 0.31 0.31 0.09 -0.58 -0.65 -0.71 0.14
0.69 -2.98 0.25 0.55 0.75 0.03 0.08 0.15 0.3 -0.91 -0.62 -0.72 -0.47
0.6 -2.35 0.41 0.64 0.68 -0.17 -0.0 -0.08 -0.06 -0.1 -0.27 -0.1 -1.72
0.43 -1.45 0.74 0.69 0.53 -0.02 -0.09 -0.14 -0.33 -0.39 -0.37 -0.3 -0.8
0.75 -6.22 0.33 0.8 0.51 -0.41 0.06 0.47 -0.65 -0.45 -0.66 -0.31 -0.17
0.5 -3.03 0.46 0.76 0.95 0.01 0.21 0.6 0.44 -1.56 -1.11 -1.53 -1.89
0.82 -2.0 0.11 1.04 0.39 -0.11 -0.21 -0.58 -0.38 -0.04 -0.27 -0.03 -0.91
0.51 -2.62 0.13 0.46 0.23 0.21 0.28 0.3 0.42 -0.43 -0.7 -0.51 -0.38
0.62 -1.31 0.1 1.27 1.04 -0.28 -0.21 0.26 -0.92 -1.27 -1.25 -0.79 -0.56
0.67 -2.1 0.13 0.53 0.37 0.36 0.08 0.05 0.22 -0.45 -0.69 -0.54 -0.38
0.5 -2.29 0.55 0.46 0.42 0.31 0.13 0.02 0.03 -0.47 -0.7 -0.48 -0.34
0.68 -0.92 -0.33 0.13 0.29 0.36 0.1 0.15 -0.13 0.06 -0.09 -0.12 -1.07
0.3 -1.76 0.65 0.87 0.89 -0.58 -0.09 0.17 0.04 -0.47 -0.64 -0.44 -1.53
0.5 -2.4 0.2 0.53 0.27 0.04 0.26 0.32 0.74 -0.63 -0.86 -0.55 -0.78
0.84 -2.05 0.55 0.61 0.77 0.15 0.19 0.33 0.41 -1.81 -1.56 -1.82 -0.98

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.