Heatmap: Cluster_247 (HCCA cluster)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g012430.1.1 (Solyc00g012430.1)
-2.54 -1.43 0.28 0.17 -3.12 -4.44 0.2 - -2.88 - -2.99 -4.06 - -3.29 1.34 1.26 1.51 - -3.77 3.69 2.16 -2.07 -1.87 -2.45 -3.11 - - -2.79 -0.63 -1.4 -0.83 -1.96 0.13 -1.95
Solyc00g018970.1.1 (Solyc00g018970.1)
- -2.0 -1.89 - -3.34 -3.88 -2.78 -1.97 2.06 - - - - - -2.55 -1.87 0.62 - - 3.93 2.79 -3.06 -2.65 -1.58 -1.69 - -1.24 -2.03 -0.18 - -0.36 0.51 - -
Solyc00g090650.1.1 (Solyc00g090650.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g102000.2.1 (Solyc00g102000.2)
-2.27 0.47 0.81 1.6 -3.75 -2.66 1.12 -5.49 0.28 -4.19 -3.25 -3.48 -5.22 -3.43 -0.97 -1.64 -0.91 -6.24 -1.64 1.24 -1.1 -0.85 -0.81 0.06 0.02 -4.71 -0.3 0.3 0.92 -1.74 -0.31 1.12 3.04 -1.25
Solyc00g111170.2.1 (Solyc00g111170.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc01g014537.1.1 (Solyc01g014537.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.97 - - - - 2.33 3.45 3.82 - - - - -
Solyc01g056577.1.1 (Solyc01g056577.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g056970.1.1 (Solyc01g056970.1)
- - - - - 0.07 - - 3.82 - - 1.68 3.06 - - - - - - - - - - - - - 2.39 - 0.99 - - - - -
Solyc01g057003.1.1 (Solyc01g057003.1)
- - - - - - - - 4.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.39 - - - - -
Solyc01g058130.1.1 (Solyc01g058130.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.17 - - 2.69 2.39 - 4.33 - - - -
Solyc01g059843.1.1 (Solyc01g059843.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc01g099615.1.1 (Solyc01g099615.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.56 - - - 2.17 - - - - 2.58 - - - - -
Solyc01g103866.1.1 (Solyc01g103866.1)
-0.46 - - 0.17 0.1 -2.04 - - - - 0.44 1.24 1.6 1.85 0.91 -1.57 0.89 1.84 -0.49 - -1.28 -2.24 - - - 0.41 0.14 0.51 0.6 1.76 1.44 - - -
Solyc02g005335.1.1 (Solyc02g005335.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g020930.1.1 (Solyc02g020930.1)
- - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g030387.1.1 (Solyc02g030387.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc02g030410.2.1 (Solyc02g030410.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.36 - - - - - - 3.75 - - - - -
Solyc02g033085.1.1 (Solyc02g033085.1)
- 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g062840.1.1 (Solyc02g062840.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.9 - 4.73 - - - - - - - -
Solyc02g068520.1.1 (Solyc02g068520.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - -
Solyc02g080700.2.1 (Solyc02g080700.2)
- - - 1.22 2.24 -0.31 0.47 - 0.65 - 0.64 - - - - - - 3.62 0.94 - - - - - - - - - - - 0.85 - 2.49 -
Solyc03g058365.1.1 (Solyc03g058365.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g063580.1.1 (Solyc03g063580.1)
- - 1.12 - - -0.56 - - 2.18 0.67 - - - - - - - - - 4.47 - - 0.41 -0.72 - - - -0.0 - - - - - -
Solyc03g096193.1.1 (Solyc03g096193.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g113890.1.1 (Solyc03g113890.1)
0.92 -0.61 -0.83 -0.97 1.47 -0.35 0.11 1.79 0.58 -0.18 -1.15 -0.22 -2.75 -2.13 -0.03 -1.22 -1.57 -3.11 -3.22 -6.88 -3.34 -0.93 -1.68 -1.47 -1.31 -4.44 -1.14 -0.85 -1.29 -0.37 -0.22 -0.27 2.95 1.53
Solyc03g116295.1.1 (Solyc03g116295.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g117220.1.1 (Solyc03g117220.1)
- - - - - - - - 2.92 - - - - - - - - - - - - - - - 1.64 - 2.88 2.8 - 3.17 - - - -
Solyc04g025910.1.1 (Solyc04g025910.1)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g026060.1.1 (Solyc04g026060.1)
- - - - - - - - 3.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.04 1.83 - - 3.42 - -
Solyc04g078180.1.1 (Solyc04g078180.1)
4.54 - - - - - - - - - 3.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g011910.2.1 (Solyc05g011910.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.04 - - - - 1.67 - - - 2.81 3.96 - - - - -
Solyc05g015007.1.1 (Solyc05g015007.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc05g017850.2.1 (Solyc05g017850.2)
- - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g025950.1.1 (Solyc05g025950.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - -
Solyc05g032732.1.1 (Solyc05g032732.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - -
Solyc05g032738.1.1 (Solyc05g032738.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc05g041300.2.1 (Solyc05g041300.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc06g005210.2.1 (Solyc06g005210.2)
-1.97 -2.16 -0.41 -0.01 -0.57 -1.3 0.66 - -3.03 -3.27 -3.03 -4.29 - -2.03 1.43 0.66 1.83 -4.12 -1.73 2.83 - -1.34 -2.86 -2.43 -1.71 - -3.23 -1.24 -1.23 -2.23 -1.4 0.4 3.21 -
Solyc06g010020.1.1 (Solyc06g010020.1)
- - - - - - - - - - - - 3.75 3.46 - - - - - - - - - - - - 2.72 - 1.56 - - - - -
Solyc06g016827.1.1 (Solyc06g016827.1)
- - - - - 0.57 - - - - - - - - - - - - - 2.84 - - 3.9 1.4 2.01 - - - 1.93 - - - - -
Solyc06g024210.2.1 (Solyc06g024210.2)
-0.94 -0.22 0.75 0.9 -3.81 -3.66 -1.72 -5.62 -4.15 -1.26 -3.46 -5.36 -5.71 -4.71 1.31 0.58 1.31 -4.98 -1.3 -0.96 -2.9 -2.55 -3.94 -3.14 -2.56 -5.55 -3.49 -2.73 -2.49 -3.96 -3.88 -1.19 4.23 -2.6
Solyc06g024386.1.1 (Solyc06g024386.1)
-2.91 -2.39 -1.53 -1.02 -2.42 -3.05 0.79 -3.85 -0.38 -7.01 -3.38 -5.83 -5.42 -4.33 -0.11 -0.77 -0.33 -7.78 -5.16 3.85 1.45 -0.63 -1.61 -0.42 -1.08 -4.16 -1.23 -0.38 0.83 -2.48 -0.33 1.79 -3.4 -0.99
Solyc06g051835.1.1 (Solyc06g051835.1)
- - - - 0.2 1.09 - -1.61 - 0.26 - - - - -0.12 0.83 1.02 - - - - -2.54 - 3.56 -3.69 -0.59 - 3.48 - - - -0.68 - -
Solyc07g017433.1.1 (Solyc07g017433.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.3 - 4.6 - - - -
Solyc07g020830.1.1 (Solyc07g020830.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.56 - - - - - - - - 3.37 - - - -
Solyc07g020840.1.1 (Solyc07g020840.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - -
Solyc07g032290.2.1 (Solyc07g032290.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g032570.1.1 (Solyc07g032570.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.7 - - - - 4.39 - - - - -
Solyc07g039280.1.1 (Solyc07g039280.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.01 4.16 - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g040843.1.1 (Solyc07g040843.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.29 3.44 - - - 3.74 - - - - - - - - - - - -
Solyc07g041360.1.1 (Solyc07g041360.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.51 - 3.48 - - - - -
Solyc07g045280.2.1 (Solyc07g045280.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - 2.82 - - - - - - - - - -
Solyc08g029010.1.1 (Solyc08g029010.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.5 - - - - - 3.5 - - - - -
Solyc08g062060.1.1 (Solyc08g062060.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.06 4.68 - - - -
Solyc08g074850.2.1 (Solyc08g074850.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.36 4.57 - - - - -
Solyc08g075980.1.1 (Solyc08g075980.1)
-0.88 1.24 3.11 - 2.02 -2.18 - - 2.83 - - - - -1.72 - 0.38 - - -2.29 - -0.86 -0.36 2.05 -0.36 - - -1.45 -2.73 - -0.99 0.21 - - -0.3
Solyc09g015290.1.1 (Solyc09g015290.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.61 - - - 2.16 2.42 - - - 4.4 -
Solyc09g037060.2.1 (Solyc09g037060.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc09g075310.2.1 (Solyc09g075310.2)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g005420.1.1 (Solyc10g005420.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.8 - 4.76 - - - -
Solyc10g008290.1.1 (Solyc10g008290.1)
- - - - - 0.1 - - - - - - 3.92 - - - - - - - - - - - - - - 2.33 3.67 - - - - -
Solyc10g047800.1.1 (Solyc10g047800.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - -
Solyc10g055040.2.1 (Solyc10g055040.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.39 - 3.7 - - - - -
Solyc10g079237.1.1 (Solyc10g079237.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g020494.1.1 (Solyc11g020494.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.23 - - - - 4.87 -
Solyc11g027630.1.1 (Solyc11g027630.1)
-1.85 -4.07 -2.44 - 2.51 1.0 -3.43 -3.9 -2.66 -2.26 - -5.05 - -4.81 0.98 0.81 1.25 - -0.18 2.68 0.88 -4.85 -4.2 - -3.64 1.05 -3.65 -3.1 -3.01 - -2.38 -0.38 2.69 -
Solyc11g027760.1.1 (Solyc11g027760.1)
-1.67 -3.08 -3.03 -2.54 -0.4 -0.35 2.25 -1.66 -4.13 -1.22 2.01 0.32 0.05 0.67 0.48 2.34 2.0 -2.54 -0.44 0.43 -1.58 -3.27 -5.55 -3.62 -3.85 0.87 -4.36 -3.46 -3.08 -3.75 -4.05 -2.07 1.32 -5.22
Solyc11g030900.1.1 (Solyc11g030900.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - -
Solyc11g044630.1.1 (Solyc11g044630.1)
- - - - - - - - 1.88 - - - - - - - - - - 3.18 - 1.61 - 1.34 - - - -0.19 0.67 - 1.5 3.08 0.97 -
Solyc11g045440.1.1 (Solyc11g045440.1)
-0.9 -5.91 -1.69 -1.93 -0.14 -1.12 -0.78 -3.56 -3.96 -0.66 1.06 0.31 -0.38 -0.22 0.11 -1.36 -0.25 -5.54 -4.31 -1.4 -1.67 -1.13 -0.48 -0.09 -0.84 -2.63 -0.18 -0.06 0.15 -1.49 0.4 0.88 3.39 1.24
Solyc12g062710.1.1 (Solyc12g062710.1)
- - - - - 1.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.74 - 2.71 - 3.51 - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.