Heatmap: Cluster_37 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Vegetative Sporophyte
Adult Sporophyte
Leaf (0 mg/L NH4NO3)
Leaf (30 mg/L NH4NO3)
Leaf (90 mg/L NH4NO3)
Sporophyte; w/o NH4NO3, w/o cyanobacteria
Sporophyte; w/o NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w/o cyanobacteria
Root Tip, D-3 6h mock treated
Root Tip, D-3 6h 0.1 uM IAA treated
Root Tip, D-3 6h 0.5 uM trans-zeatin treated
Microsporocarp
0.86 0.47 1.0 0.84 0.96 0.96 0.83 0.64 0.72 0.64 0.68 0.68 0.71
0.59 0.14 1.0 0.78 0.85 0.76 0.63 0.4 0.43 0.29 0.3 0.33 0.22
0.62 0.0 0.03 0.0 0.02 1.0 0.38 0.04 0.67 0.21 0.22 0.18 0.39
0.66 0.0 0.51 0.3 0.48 0.73 0.48 0.27 1.0 0.29 0.26 0.25 0.09
0.62 0.01 0.22 0.58 0.47 0.48 0.76 1.0 0.46 0.38 0.43 0.3 0.29
0.43 0.23 0.59 0.31 1.0 0.84 0.35 0.06 0.83 0.08 0.08 0.16 0.15
0.86 0.04 0.97 0.91 1.0 0.9 0.44 0.3 0.66 0.46 0.5 0.48 0.94
0.35 0.0 0.24 0.26 0.34 1.0 0.34 0.01 0.71 0.06 0.05 0.05 0.05
1.0 0.33 0.92 0.69 0.93 0.54 0.4 0.26 0.7 0.68 0.55 0.69 0.21
0.4 0.01 0.85 1.0 0.83 0.29 0.33 0.33 0.26 0.28 0.27 0.28 0.16
0.7 0.36 0.85 0.83 0.97 1.0 0.78 0.7 0.99 0.66 0.54 0.57 0.83
0.46 0.26 0.8 0.86 1.0 0.57 0.36 0.3 0.68 0.44 0.43 0.45 0.07
0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.28 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.13
0.44 0.18 0.44 0.35 0.39 1.0 0.4 0.0 1.0 0.19 0.19 0.16 0.17
0.22 0.0 0.65 1.0 0.71 0.82 0.35 0.0 0.55 0.13 0.07 0.21 0.37
0.41 0.26 0.84 0.5 1.0 0.7 0.47 0.4 0.47 0.46 0.47 0.41 0.44
0.34 0.0 0.18 0.16 0.11 1.0 0.34 0.0 0.85 0.09 0.07 0.05 0.38
0.54 0.18 0.34 0.48 0.25 0.63 0.82 1.0 0.74 0.7 0.49 0.53 0.02
0.51 0.0 0.91 1.0 0.97 0.62 0.5 0.63 0.6 0.17 0.24 0.17 0.19
0.32 0.05 1.0 0.18 0.71 0.21 0.21 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0
0.78 0.04 0.23 0.62 0.39 0.89 0.38 0.0 1.0 0.75 0.68 0.9 0.28
1.0 0.16 0.85 0.68 0.87 0.68 0.42 0.29 0.7 0.18 0.07 0.1 0.22
0.98 0.48 0.86 0.83 0.96 0.93 0.92 0.84 1.0 0.78 0.88 0.8 0.66
0.66 0.21 0.9 0.84 1.0 0.88 0.59 0.5 0.46 0.43 0.46 0.47 0.44
0.38 0.01 0.4 0.46 0.13 0.48 0.32 0.0 1.0 0.21 0.17 0.24 0.17
0.25 0.01 0.76 1.0 0.75 0.36 0.17 0.11 0.3 0.08 0.03 0.05 0.25
0.27 0.0 0.0 0.01 0.0 0.45 0.37 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.09
0.27 0.02 0.34 0.31 0.28 0.89 0.38 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.17
0.54 0.0 0.26 0.59 0.64 0.76 0.78 0.66 1.0 0.39 0.42 0.44 0.38
0.51 0.13 0.4 0.49 0.42 0.83 0.58 0.4 1.0 0.09 0.07 0.08 0.5
0.58 0.0 0.6 0.7 0.54 0.9 0.47 0.0 1.0 0.23 0.25 0.29 0.82
0.41 0.02 0.55 0.91 0.67 1.0 0.34 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.45
0.54 0.0 1.0 0.62 0.79 0.64 0.16 0.0 0.38 0.07 0.08 0.06 0.03
0.52 0.01 0.86 0.68 0.74 1.0 0.33 0.0 0.98 0.14 0.14 0.13 0.09
0.22 0.0 0.74 0.57 0.51 0.33 0.23 0.0 1.0 0.03 0.06 0.0 0.5
0.45 0.01 1.0 0.63 0.93 0.76 0.26 0.0 0.8 0.57 0.45 0.44 0.03
0.48 0.0 0.74 0.42 0.68 0.53 1.0 0.96 0.3 0.33 0.28 0.34 0.3
0.94 0.3 0.74 0.65 0.94 1.0 0.62 0.3 0.91 0.59 0.63 0.5 0.32
0.58 0.0 0.61 1.0 0.47 0.34 0.33 0.26 0.93 0.11 0.06 0.05 0.28
0.42 0.05 0.85 1.0 0.89 0.86 0.23 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.73
1.0 0.03 0.98 0.79 0.68 0.2 0.88 0.81 0.3 0.0 0.03 0.0 0.28
0.84 0.0 0.21 0.15 0.15 0.88 0.39 0.01 1.0 0.25 0.2 0.22 0.02
0.41 0.0 0.47 0.5 0.66 0.49 0.38 0.03 1.0 0.27 0.2 0.39 0.09
0.74 0.13 0.38 1.0 0.48 0.55 0.22 0.0 0.39 0.12 0.11 0.12 0.33
0.64 0.16 0.52 0.58 0.76 0.72 0.82 1.0 0.71 0.65 0.62 0.68 0.23
0.69 0.02 0.72 0.86 0.95 0.55 0.85 1.0 0.46 0.46 0.42 0.5 0.2
0.54 0.0 0.59 0.17 0.57 0.39 0.9 1.0 0.55 0.49 0.48 0.4 0.0
0.4 0.1 0.96 0.96 1.0 0.56 0.41 0.3 0.58 0.38 0.43 0.39 0.31
0.15 0.0 0.86 1.0 1.0 0.46 0.48 0.08 0.55 0.07 0.07 0.07 0.0
0.58 0.36 0.36 0.84 0.53 0.68 0.41 0.0 1.0 0.07 0.04 0.03 0.0
0.71 0.02 0.97 0.57 0.73 0.96 1.0 0.92 0.92 0.64 0.55 0.64 0.1
0.63 0.35 0.71 0.47 0.75 1.0 0.36 0.06 0.51 0.43 0.5 0.51 0.27
0.26 0.0 0.8 0.77 1.0 0.44 0.21 0.02 0.49 0.01 0.0 0.0 0.33
0.44 0.01 0.05 0.13 0.12 1.0 0.37 0.0 0.64 0.12 0.08 0.16 0.09
0.25 0.0 0.96 0.5 1.0 0.4 0.21 0.07 0.63 0.13 0.23 0.0 0.0
0.85 0.02 0.13 0.11 0.08 1.0 0.34 0.01 0.77 0.09 0.1 0.08 0.18
0.54 0.0 0.03 0.18 0.0 0.95 0.48 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.49
0.34 0.03 0.69 1.0 0.72 0.35 0.21 0.08 0.31 0.17 0.23 0.17 0.05
0.72 0.27 0.81 0.77 0.9 1.0 0.41 0.12 0.99 0.63 0.66 0.51 0.21
0.62 0.22 0.52 0.25 0.32 0.84 0.38 0.01 1.0 0.28 0.27 0.25 0.16
0.56 0.0 0.72 0.68 0.63 1.0 0.74 0.78 0.92 0.68 0.59 0.73 0.27
0.37 0.0 0.04 0.05 0.0 0.71 0.39 0.0 1.0 0.29 0.15 0.06 0.1
0.75 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.28 0.0 0.63 0.56 0.43 0.51 0.03
0.38 0.0 0.94 0.38 0.62 1.0 0.36 0.0 0.84 0.1 0.07 0.07 0.01
0.4 0.01 0.79 0.79 1.0 0.55 0.28 0.0 0.67 0.27 0.31 0.31 0.33
0.27 0.01 0.6 0.7 1.0 0.67 0.3 0.03 0.72 0.04 0.04 0.04 0.4
0.42 0.09 0.68 1.0 0.82 0.63 0.3 0.0 0.65 0.24 0.14 0.1 0.23
0.56 0.01 1.0 0.91 0.8 0.54 0.7 0.77 0.61 0.11 0.11 0.12 0.02
0.48 0.04 0.36 0.43 0.32 0.65 0.3 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.14
0.3 0.0 0.19 0.17 0.14 0.78 0.34 0.0 1.0 0.07 0.08 0.08 0.04
0.31 0.0 1.0 0.38 0.62 0.48 0.19 0.0 0.42 0.22 0.2 0.19 0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)