Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Vegetative Sporophyte	Adult Sporophyte	Leaf (0 mg/L NH4NO3)	Leaf (30 mg/L NH4NO3)	Leaf (90 mg/L NH4NO3)	Sporophyte; w/o NH4NO3, w/o cyanobacteria	Sporophyte; w/o NH4NO3, w cyanobacteria	Sporophyte; w NH4NO3, w cyanobacteria	Sporophyte; w NH4NO3, w/o cyanobacteria	Root Tip, D-3 6h mock treated	Root Tip, D-3 6h 0.1 uM IAA treated	Root Tip, D-3 6h 0.5 uM trans-zeatin treated	Microsporocarp
Azfi_s0001.g000059	0.71	0.61	0.28	0.3	0.26	0.59	0.76	1.0	0.75	0.11	0.11	0.12	0.15
Azfi_s0001.g000168	0.87	0.79	0.37	0.31	0.35	0.82	0.86	0.81	1.0	0.22	0.21	0.21	0.38
Azfi_s0001.g000431 (KNAT7)	1.0	0.74	0.23	0.2	0.39	0.97	0.95	0.87	0.81	0.0	0.01	0.01	0.25
Azfi_s0002.g001658 (GPX7)	1.0	0.94	0.57	0.36	0.47	0.55	0.64	0.69	0.59	0.26	0.26	0.25	0.17
Azfi_s0003.g007473	0.94	0.8	0.54	0.67	0.68	0.78	0.89	0.91	1.0	0.35	0.32	0.4	0.09
Azfi_s0003.g007891	0.67	0.49	0.27	0.32	0.28	0.71	0.8	1.0	0.77	0.16	0.15	0.16	0.22
Azfi_s0003.g007899	0.79	0.89	0.51	0.3	0.33	0.76	0.88	1.0	0.77	0.02	0.02	0.02	0.05
Azfi_s0003.g008062 (RPT3)	1.0	0.69	0.44	0.18	0.26	0.98	0.96	0.76	0.99	0.04	0.03	0.04	0.44
Azfi_s0004.g008527 (CFM2)	1.0	0.99	0.52	0.53	0.63	0.71	0.9	0.91	0.97	0.36	0.34	0.34	0.3
Azfi_s0006.g009967	1.0	0.81	0.44	0.38	0.39	0.79	0.84	0.81	0.93	0.21	0.19	0.19	0.25
Azfi_s0006.g010052	1.0	0.59	0.83	0.18	0.42	0.45	0.51	0.47	0.44	0.06	0.06	0.06	0.15
Azfi_s0007.g010852	1.0	0.86	0.32	0.49	0.43	0.94	0.95	0.9	0.9	0.47	0.39	0.38	0.17
Azfi_s0007.g011024	0.91	0.62	0.54	0.56	0.56	0.84	0.89	1.0	0.93	0.16	0.14	0.16	0.48
Azfi_s0008.g011414 (PHR2)	0.92	1.0	0.42	0.29	0.36	0.6	0.62	0.63	0.63	0.11	0.1	0.1	0.15
Azfi_s0008.g011463	1.0	0.62	0.46	0.24	0.33	0.53	0.67	0.71	0.61	0.22	0.2	0.21	0.22
Azfi_s0015.g013857	0.88	0.78	0.55	0.43	0.46	0.87	0.92	0.95	1.0	0.3	0.31	0.3	0.17
Azfi_s0018.g014722	1.0	0.88	0.34	0.19	0.25	0.9	0.87	0.99	0.82	0.19	0.16	0.17	0.15
Azfi_s0018.g014976	1.0	0.75	0.55	0.29	0.4	0.54	0.58	0.71	0.62	0.05	0.06	0.05	0.22
Azfi_s0035.g025463 (PSRP4)	0.69	0.5	0.3	0.17	0.2	0.64	0.79	1.0	0.73	0.08	0.08	0.07	0.09
Azfi_s0041.g026719	1.0	0.89	0.39	0.4	0.36	0.74	0.74	0.7	0.81	0.43	0.4	0.44	0.17
Azfi_s0045.g029766	0.83	0.47	0.01	0.0	0.0	0.67	0.88	1.0	0.83	0.16	0.15	0.16	0.08
Azfi_s0049.g030700 (PDF1A)	0.98	1.0	0.89	0.55	0.63	0.78	0.77	0.73	0.8	0.27	0.27	0.22	0.43
Azfi_s0072.g036982 (PTAC16)	0.86	0.95	0.62	0.2	0.35	1.0	0.82	0.86	0.82	0.05	0.04	0.05	0.15
Azfi_s0076.g037757	0.92	0.86	0.4	0.58	0.52	0.91	0.95	1.0	0.86	0.25	0.27	0.29	0.26
Azfi_s0076.g037912 (RBOHF)	0.88	1.0	0.37	0.28	0.4	0.82	0.74	0.68	0.69	0.07	0.07	0.08	0.12
Azfi_s0078.g038191	1.0	0.59	0.65	0.53	0.56	0.48	0.61	0.68	0.54	0.09	0.08	0.08	0.11
Azfi_s0078.g038218 (THX)	0.78	0.48	0.23	0.11	0.16	0.85	0.98	1.0	0.8	0.17	0.18	0.17	0.09
Azfi_s0081.g038594 (PGR7)	1.0	0.74	0.56	0.6	0.61	0.67	0.81	0.91	0.61	0.32	0.3	0.28	0.1
Azfi_s0087.g042342	0.76	0.99	0.32	0.4	0.45	0.69	0.83	1.0	0.9	0.27	0.24	0.26	0.17
Azfi_s0090.g042629	0.91	0.76	0.41	0.49	0.44	0.81	0.88	0.81	1.0	0.36	0.38	0.4	0.2
Azfi_s0090.g042722	0.92	1.0	0.52	0.42	0.44	0.72	0.66	0.67	0.73	0.24	0.23	0.25	0.51
Azfi_s0103.g044663 (NOL)	0.98	0.68	0.55	0.46	0.51	0.87	0.88	0.84	1.0	0.55	0.56	0.57	0.29
Azfi_s0111.g045653	0.75	1.0	0.74	0.31	0.48	0.43	0.56	0.66	0.66	0.12	0.1	0.09	0.23
Azfi_s0113.g045994 (ATS2)	0.81	0.68	0.43	0.2	0.29	0.62	0.92	1.0	0.85	0.06	0.05	0.05	0.29
Azfi_s0126.g048645	0.74	0.8	0.3	0.39	0.4	0.75	0.83	0.87	1.0	0.15	0.21	0.2	0.07
Azfi_s0129.g048901	0.99	1.0	0.72	0.58	0.61	0.77	0.83	0.97	0.92	0.16	0.17	0.18	0.14
Azfi_s0136.g050962	0.83	0.76	0.21	0.38	0.36	0.84	0.92	1.0	0.95	0.22	0.23	0.21	0.14
Azfi_s0141.g051350	0.81	0.89	0.36	0.32	0.46	0.69	0.8	0.89	1.0	0.18	0.2	0.17	0.18
Azfi_s0186.g056695 (CP24)	0.93	0.82	0.38	0.16	0.24	0.91	0.95	1.0	0.75	0.05	0.04	0.04	0.18
Azfi_s0207.g057922	0.79	1.0	0.44	0.19	0.25	0.68	0.77	0.75	0.67	0.12	0.1	0.11	0.18
Azfi_s0216.g058480 (STN8)	0.93	0.97	0.14	0.09	0.13	0.76	0.9	1.0	0.91	0.08	0.08	0.09	0.13
Azfi_s0224.g058869 (CXIP2)	0.83	0.88	0.48	0.34	0.39	0.63	0.86	1.0	0.9	0.35	0.34	0.33	0.22
Azfi_s0245.g060001	0.75	0.85	0.53	0.32	0.38	0.81	0.87	1.0	0.72	0.07	0.07	0.07	0.11
Azfi_s0261.g060754 (OEP37)	0.81	1.0	0.25	0.21	0.27	0.74	0.82	0.83	0.71	0.32	0.31	0.3	0.09
Azfi_s0262.g060841	0.96	1.0	0.85	0.39	0.66	0.59	0.65	0.68	0.67	0.13	0.11	0.12	0.46
Azfi_s0301.g063735 (ATML1)	0.67	0.68	0.28	0.26	0.3	0.74	0.81	1.0	0.8	0.01	0.01	0.01	0.09
Azfi_s0308.g064026 (PSAL)	0.96	0.89	0.23	0.1	0.14	1.0	0.92	0.94	0.77	0.08	0.07	0.06	0.07
Azfi_s0336.g065546	1.0	0.71	0.61	0.36	0.49	0.54	0.64	0.72	0.85	0.19	0.19	0.19	0.25
Azfi_s0384.g067461 (PSRP6)	0.79	0.57	0.19	0.13	0.15	0.74	0.93	1.0	0.83	0.19	0.17	0.15	0.12
Azfi_s0506.g073968	1.0	0.94	0.39	0.08	0.2	0.83	0.8	0.8	0.93	0.15	0.12	0.13	0.3
Azfi_s0529.g075794	0.86	1.0	0.87	0.6	0.71	0.76	0.86	0.96	0.85	0.16	0.15	0.18	0.35
Azfi_s0551.g076592	0.69	0.57	0.23	0.09	0.19	0.56	0.71	0.7	1.0	0.02	0.02	0.02	0.23
Azfi_s0551.g076608 (LHCA5)	0.86	0.68	0.63	0.23	0.41	0.8	0.8	1.0	0.8	0.11	0.1	0.09	0.17
Azfi_s0591.g078757 (ATML1)	0.67	0.68	0.28	0.26	0.3	0.74	0.81	1.0	0.8	0.01	0.01	0.01	0.09
Azfi_s0624.g079791	0.8	0.49	0.11	0.12	0.17	0.78	0.78	0.76	1.0	0.12	0.11	0.12	0.35
Azfi_s1188.g099173	0.73	0.67	0.41	0.34	0.41	0.81	0.85	0.85	1.0	0.28	0.18	0.26	0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)