Heatmap: Cluster_1 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Vegetative Sporophyte
Adult Sporophyte
Leaf (0 mg/L NH4NO3)
Leaf (30 mg/L NH4NO3)
Leaf (90 mg/L NH4NO3)
Sporophyte; w/o NH4NO3, w/o cyanobacteria
Sporophyte; w/o NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w/o cyanobacteria
Root Tip, D-3 6h mock treated
Root Tip, D-3 6h 0.1 uM IAA treated
Root Tip, D-3 6h 0.5 uM trans-zeatin treated
Microsporocarp
0.02 0.09 0.49 0.67 1.0 0.01 0.01 0.0 0.06 0.01 0.02 0.02 0.0
0.17 0.14 0.42 0.4 1.0 0.18 0.08 0.05 0.08 0.3 0.25 0.21 0.04
0.03 0.06 0.06 0.08 1.0 0.07 0.03 0.0 0.07 0.0 0.04 0.04 0.0
0.01 0.01 0.3 1.0 0.65 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.03 0.03 0.0
0.11 0.03 0.72 0.92 1.0 0.09 0.1 0.09 0.09 0.09 0.08 0.08 0.04
0.03 0.11 0.06 0.15 1.0 0.1 0.07 0.07 0.09 0.15 0.13 0.15 0.3
0.03 0.11 0.91 0.69 1.0 0.05 0.06 0.14 0.05 0.03 0.02 0.01 0.0
0.2 0.03 0.92 1.0 0.94 0.19 0.21 0.18 0.22 0.21 0.25 0.21 0.07
0.11 0.05 0.79 0.85 1.0 0.06 0.06 0.03 0.03 0.1 0.11 0.11 0.05
0.05 0.0 0.6 1.0 0.95 0.05 0.07 0.06 0.07 0.02 0.02 0.02 0.11
0.0 0.0 0.86 1.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.86 1.0 0.75 0.39 0.1 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 1.0 0.98 0.98 0.24 0.2 0.04 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.64 1.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.02 0.52 0.67 1.0 0.08 0.07 0.07 0.08 0.09 0.06 0.07 0.15
0.16 0.23 0.86 1.0 0.78 0.08 0.1 0.1 0.11 0.12 0.08 0.07 0.16
0.12 0.02 0.54 1.0 0.98 0.1 0.14 0.15 0.18 0.04 0.03 0.03 0.07
0.01 0.03 0.85 1.0 0.79 0.0 0.02 0.05 0.03 0.01 0.03 0.01 0.09
0.18 0.08 1.0 0.96 0.75 0.16 0.13 0.12 0.22 0.19 0.18 0.19 0.29
0.06 0.15 0.36 0.45 1.0 0.01 0.06 0.02 0.02 0.08 0.04 0.04 0.04
0.07 0.02 0.59 1.0 0.95 0.08 0.14 0.15 0.11 0.19 0.15 0.19 0.27
0.0 0.0 0.64 1.0 0.62 0.01 0.01 0.02 0.0 0.09 0.06 0.06 0.01
0.0 0.06 0.58 0.6 1.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0
0.16 0.01 0.41 1.0 0.81 0.16 0.09 0.06 0.03 0.0 0.04 0.04 0.0
0.0 0.01 0.88 1.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.79 1.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.38 1.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0
0.0 0.0 0.28 0.43 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.06 0.11 0.0
0.14 0.05 1.0 0.91 0.72 0.2 0.2 0.2 0.24 0.19 0.22 0.2 0.21
0.1 0.05 0.61 0.81 1.0 0.25 0.13 0.16 0.17 0.0 0.0 0.01 0.05
0.03 0.02 0.85 1.0 0.46 0.1 0.19 0.03 0.05 0.06 0.06 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.03 0.18 0.63 1.0 0.14 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.5 1.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.07 0.86 0.97 1.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.06 0.01 0.02 0.16
0.0 0.03 0.46 1.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0
0.04 0.01 0.95 0.53 1.0 0.1 0.1 0.04 0.03 0.19 0.19 0.19 0.0
0.0 0.0 0.76 0.7 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.04
0.0 0.0 0.52 1.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 1.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.05 0.77 0.8 1.0 0.17 0.17 0.17 0.22 0.36 0.36 0.39 0.0
0.0 0.01 1.0 0.41 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.07 0.09 0.49 0.81 1.0 0.12 0.09 0.09 0.16 0.15 0.13 0.13 0.09
0.09 0.09 1.0 0.94 0.55 0.19 0.18 0.18 0.25 0.17 0.16 0.18 0.07
Azfi_s0033.g025136 (CYP71A25)
0.0 0.0 0.84 1.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.03 0.96 1.0 0.98 0.2 0.11 0.14 0.26 0.14 0.29 0.18 0.06
0.01 0.0 0.51 0.97 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.56 1.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.44 1.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.12 1.0 0.66 0.93 0.27 0.21 0.18 0.21 0.1 0.09 0.1 0.07
0.16 0.01 0.71 1.0 0.79 0.13 0.15 0.16 0.13 0.15 0.14 0.14 0.07
0.11 0.04 1.0 0.84 0.67 0.19 0.13 0.08 0.1 0.16 0.14 0.14 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.59 1.0 0.66 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.09
0.07 0.02 0.67 1.0 0.54 0.14 0.13 0.03 0.0 0.07 0.0 0.05 0.0
0.09 0.21 0.59 0.38 1.0 0.11 0.07 0.09 0.04 0.04 0.03 0.04 0.18
0.24 0.24 1.0 0.95 1.0 0.22 0.28 0.3 0.37 0.37 0.36 0.37 0.3
0.11 0.0 1.0 0.92 1.0 0.15 0.17 0.2 0.18 0.36 0.38 0.35 0.19
0.14 0.15 0.9 1.0 0.92 0.15 0.13 0.12 0.11 0.09 0.06 0.11 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.02 0.59 1.0 1.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.56 0.66 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.01 0.16 0.34 1.0 0.11 0.15 0.14 0.16 0.07 0.06 0.07 0.26
0.05 0.05 0.59 1.0 0.33 0.02 0.07 0.09 0.07 0.03 0.01 0.02 0.17
0.03 0.0 0.56 1.0 0.74 0.02 0.01 0.0 0.02 0.02 0.01 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.1 0.43 0.53 1.0 0.05 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04
0.02 0.1 0.74 1.0 0.83 0.03 0.13 0.08 0.05 0.04 0.04 0.04 0.1
0.04 0.19 0.98 0.59 1.0 0.05 0.05 0.04 0.05 0.01 0.01 0.01 0.05
0.15 0.0 0.79 0.84 1.0 0.17 0.16 0.16 0.51 0.12 0.07 0.18 0.04
0.07 0.0 0.56 1.0 0.56 0.13 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.01 0.0 1.0 0.7 0.73 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.66 0.68 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.03 0.92 1.0 0.9 0.03 0.02 0.01 0.02 0.21 0.13 0.18 0.07
0.0 0.0 0.45 1.0 0.79 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.2 0.14 1.0 1.0 0.99 0.13 0.11 0.18 0.15 0.17 0.22 0.22 0.0
0.01 0.0 0.56 0.52 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.04 0.14 0.31
0.04 0.0 0.27 1.0 0.52 0.0 0.06 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.32 0.38 1.0 0.09 0.12 0.04 0.06 0.26 0.23 0.23 0.08
0.07 0.0 0.62 1.0 0.84 0.02 0.05 0.05 0.12 0.07 0.05 0.12 0.0
0.18 0.28 0.85 0.87 1.0 0.17 0.21 0.19 0.19 0.29 0.28 0.26 0.44
0.03 0.08 0.58 0.87 1.0 0.12 0.12 0.1 0.13 0.1 0.09 0.02 0.09
0.11 0.04 0.84 0.78 1.0 0.07 0.09 0.09 0.11 0.43 0.34 0.44 0.1
0.1 0.01 0.87 1.0 0.96 0.2 0.16 0.13 0.23 0.28 0.35 0.3 0.37
0.0 0.07 0.85 0.98 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.19
0.09 0.01 0.57 0.69 1.0 0.11 0.11 0.11 0.13 0.26 0.25 0.27 0.03
0.05 0.0 1.0 0.91 0.94 0.05 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.0
0.14 0.01 0.42 0.41 1.0 0.12 0.13 0.08 0.16 0.1 0.05 0.08 0.0
0.15 0.02 0.89 0.98 1.0 0.17 0.2 0.19 0.15 0.24 0.27 0.26 0.3
0.02 0.2 0.51 0.84 1.0 0.1 0.05 0.02 0.03 0.05 0.02 0.04 0.09
0.12 0.09 0.66 0.4 1.0 0.22 0.15 0.12 0.17 0.03 0.02 0.01 0.04
0.02 0.02 0.65 1.0 0.7 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22
0.05 0.02 0.42 0.72 1.0 0.2 0.14 0.18 0.31 0.13 0.05 0.08 0.0
0.15 0.15 0.88 1.0 0.99 0.24 0.18 0.28 0.12 0.37 0.33 0.31 0.14
0.07 0.0 0.39 1.0 0.18 0.04 0.02 0.03 0.08 0.03 0.03 0.0 0.0
0.12 0.01 0.78 1.0 0.77 0.04 0.11 0.14 0.05 0.07 0.07 0.08 0.11
0.0 0.0 0.55 1.0 0.71 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.6 0.36 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.18 0.06 0.49 0.76 1.0 0.08 0.16 0.1 0.18 0.21 0.19 0.21 0.15
0.05 0.01 0.82 1.0 0.72 0.09 0.12 0.09 0.13 0.07 0.16 0.08 0.0
0.04 0.06 0.7 0.66 1.0 0.03 0.02 0.06 0.04 0.06 0.1 0.05 0.05
Azfi_s0214.g058321 (NTMC2T5.1)
0.0 0.0 0.91 0.95 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.09 0.58 0.4 1.0 0.07 0.1 0.09 0.27 0.0 0.04 0.04 0.0
0.02 0.1 0.38 0.5 1.0 0.1 0.12 0.25 0.3 0.08 0.09 0.08 0.29
0.01 0.01 0.41 1.0 0.66 0.12 0.07 0.05 0.04 0.09 0.11 0.05 0.0
Azfi_s0233.g059352 (CYP706A3)
0.01 0.0 0.73 1.0 0.57 0.08 0.06 0.04 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01
0.19 0.11 0.52 1.0 0.99 0.08 0.11 0.12 0.12 0.2 0.22 0.21 0.09
0.02 0.0 0.34 1.0 0.34 0.0 0.04 0.0 0.0 0.16 0.08 0.08 0.0
0.09 0.04 0.75 1.0 0.7 0.11 0.13 0.16 0.14 0.09 0.1 0.11 0.21
0.12 0.24 0.48 0.49 1.0 0.35 0.25 0.11 0.11 0.2 0.19 0.18 0.05
0.08 0.08 0.94 0.92 1.0 0.0 0.14 0.2 0.11 0.06 0.0 0.0 0.12
0.25 0.11 0.65 1.0 0.87 0.17 0.17 0.2 0.2 0.33 0.31 0.33 0.16
0.07 0.08 0.61 0.64 1.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.24 0.17 0.16 0.0
0.01 0.02 0.23 0.21 1.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.14 0.48 0.7 1.0 0.16 0.21 0.22 0.24 0.18 0.15 0.21 0.3
0.07 0.0 0.27 1.0 0.58 0.12 0.11 0.11 0.17 0.07 0.07 0.04 0.0
0.1 0.0 0.86 0.97 1.0 0.0 0.08 0.07 0.0 0.19 0.1 0.15 0.0
0.22 0.03 0.85 0.97 1.0 0.26 0.26 0.23 0.27 0.21 0.14 0.19 0.07
0.12 0.05 0.56 1.0 0.47 0.16 0.15 0.33 0.27 0.09 0.03 0.03 0.0
0.0 0.0 0.82 1.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.34 0.69 1.0 0.73 0.12 0.07 0.04 0.0 0.16 0.19 0.14 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.42 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.59 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.07 0.41 0.41 1.0 0.13 0.16 0.16 0.14 0.08 0.1 0.1 0.18
0.01 0.1 0.61 0.94 1.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.06 0.05 0.03 0.01
Azfi_s0583.g078505 (NTMC2T5.2)
0.05 0.04 0.51 0.87 1.0 0.0 0.03 0.14 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
0.09 0.09 0.51 1.0 0.79 0.08 0.04 0.04 0.08 0.07 0.06 0.05 0.14
0.0 0.01 0.87 0.97 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.65 1.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.91 1.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.4 0.74 1.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.43 1.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.54 1.0 0.37 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.01 0.61 1.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01
0.04 0.02 0.38 0.92 1.0 0.02 0.09 0.16 0.04 0.0 0.0 0.0 0.06
0.03 0.01 0.93 0.6 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.01 0.6 0.92 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.21 1.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.76 1.0 0.76 0.2 0.13 0.08 0.12 0.08 0.01 0.03 0.0
0.0 0.09 1.0 0.96 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.01 1.0 0.73 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.1 0.0
0.0 0.0 0.17 1.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26
0.01 0.04 0.61 1.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.06
0.0 0.17 0.92 0.89 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.03 0.12 0.98 0.99 1.0 0.06 0.11 0.0 0.0 0.0 0.23 0.03 0.0
0.0 0.0 0.26 0.77 1.0 0.12 0.05 0.07 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0
0.03 0.13 0.8 0.87 1.0 0.04 0.03 0.02 0.03 0.1 0.11 0.09 0.0
0.03 0.02 0.85 1.0 0.46 0.1 0.19 0.03 0.05 0.06 0.06 0.09 0.0
0.0 0.0 0.71 0.71 1.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.18 0.11 0.79 0.74 1.0 0.09 0.11 0.15 0.1 0.44 0.48 0.45 0.05
0.03 0.18 0.44 1.0 0.88 0.08 0.04 0.06 0.08 0.03 0.01 0.01 0.0
0.01 0.01 0.4 1.0 0.64 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 1.0 0.93 0.67 0.07 0.1 0.11 0.06 0.01 0.0 0.01 0.0
0.02 0.0 1.0 0.69 0.86 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.04 0.08 0.18
0.13 0.04 0.38 1.0 0.39 0.06 0.06 0.17 0.0 0.09 0.14 0.0 0.14
0.03 0.04 1.0 0.7 1.0 0.0 0.16 0.07 0.08 0.05 0.02 0.13 0.0
0.0 0.03 0.71 1.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)