Heatmap: Cluster_40 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Vegetative Sporophyte
Adult Sporophyte
Leaf (0 mg/L NH4NO3)
Leaf (30 mg/L NH4NO3)
Leaf (90 mg/L NH4NO3)
Sporophyte; w/o NH4NO3, w/o cyanobacteria
Sporophyte; w/o NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w/o cyanobacteria
Root Tip, D-3 6h mock treated
Root Tip, D-3 6h 0.1 uM IAA treated
Root Tip, D-3 6h 0.5 uM trans-zeatin treated
Microsporocarp
- -0.42 1.41 3.16 -0.61 - - - - - - - -
-4.83 - 1.77 2.78 1.33 - - - - - -2.45 - -
- - 1.68 3.29 - - - - - - - - -
Azfi_s0044.g028744 (mtHsc70-1)
- -3.06 -0.57 3.24 1.34 - -2.09 - - - - - -
- - 0.36 3.4 0.19 - - - - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -
- - - 3.42 0.43 - - - - - -0.04 - -
-3.18 -0.37 1.46 3.08 - - - -0.12 - - - - -
- - - 3.0 2.33 - - - - - - - -
- -5.23 1.84 2.97 0.56 -4.67 - -5.2 - - - - -
- -1.54 1.45 2.9 1.09 - - -1.48 - - - - -
- -1.61 1.88 3.17 - - - - - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -
- - 1.47 3.35 - - - - - - - - -
-2.4 - 1.12 3.41 - - - - - - - - -
- - - 3.21 1.9 - - - - - - - -
- - 1.23 2.82 1.85 - - - - - - - -
- - 1.91 3.21 - - - - - - - - -
- -3.23 1.36 3.08 0.89 - - - - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -
- - 1.91 3.21 - - - - - - - - -
- - 1.12 3.0 1.51 - - - - - - - -
- - 1.69 3.04 0.62 - - - - - - - -
- - 1.87 3.02 0.27 - - - - - - - -
- -2.89 2.1 2.68 1.06 - -3.7 -4.85 - - - - -
- - 1.55 2.84 1.53 - - - - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -
- - 1.58 2.88 1.41 - - - - - - - -
-2.92 -3.23 2.15 2.67 0.6 - - - -1.88 - - -2.61 -
- - - 2.85 2.54 - - - - - - - -
- - 0.48 3.36 0.46 - - - - - - - -
- - 1.3 2.91 1.52 - - - - - - - -2.54
- - 0.42 2.95 1.98 - - - - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -
- - - 2.85 2.54 - - - - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -
- - 1.91 3.21 - - - - - - - - -
- - 2.42 2.72 0.08 - - - - - - - -
- - - 3.39 1.31 - - - - - - - -
- - 1.47 3.35 - - - - - - - - -
- -4.18 0.63 3.28 0.44 - -4.02 -3.12 - - - - -3.13
- - 1.33 3.21 0.31 - - - - - - - -
- - 1.49 2.91 1.42 - - - - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -
- - 1.77 2.84 1.25 - - -4.13 - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -
- - 1.66 3.22 -0.94 - - - - - - - -
- - -0.39 3.27 0.59 - -1.36 -0.58 - - - - -
- - 2.3 3.01 - - - - - - - - -
- -2.82 0.67 2.92 1.65 - -2.99 -1.25 - - - - -
- - 1.91 3.21 - - - - - - - - -
- -2.59 1.89 2.76 1.24 - - - - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -
- -2.36 2.03 2.75 0.89 - - - - - - - -2.74
- - 1.2 3.08 1.18 - - - - - - - -
- - 1.33 3.21 - - - - 0.32 - - - -
- - 2.39 2.69 0.37 - - - - - - - -
- - 0.99 3.28 -0.36 - - -0.94 - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -
- - 1.77 2.98 0.75 - - - - - - - -
- - - 2.96 1.65 - - - - - 1.04 - -
- - - 3.4 1.28 - - - - - - - -
- - 2.37 2.97 - - - - - - - - -
- - 2.15 2.8 0.45 - -4.83 -2.32 - - - - -
- - 1.47 3.35 - - - - - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -
- - 1.55 2.84 1.53 - - - - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -
- - 2.55 2.84 - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.