Heatmap: Cluster_96 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Vegetative Sporophyte	Adult Sporophyte	Leaf (0 mg/L NH4NO3)	Leaf (30 mg/L NH4NO3)	Leaf (90 mg/L NH4NO3)	Sporophyte; w/o NH4NO3, w/o cyanobacteria	Sporophyte; w/o NH4NO3, w cyanobacteria	Sporophyte; w NH4NO3, w cyanobacteria	Sporophyte; w NH4NO3, w/o cyanobacteria	Root Tip, D-3 6h mock treated	Root Tip, D-3 6h 0.1 uM IAA treated	Root Tip, D-3 6h 0.5 uM trans-zeatin treated	Microsporocarp
Azfi_s0001.g000056 (HXK1)	-0.34	-2.82	0.08	0.36	0.53	0.12	-0.18	-0.37	-0.2	0.29	0.45	0.65	-0.96
Azfi_s0001.g000346 (CK1)	0.16	-1.03	-0.54	-0.29	-0.09	0.06	-0.03	-0.02	0.09	0.58	0.5	0.54	-0.95
Azfi_s0001.g000618	0.33	-2.98	-0.25	0.33	0.17	-0.06	-0.12	-0.08	-0.17	0.39	0.24	0.38	-0.17
Azfi_s0001.g000961 (EMB140)	0.21	-3.36	-0.05	0.07	0.09	-0.2	-0.37	-0.54	-0.19	0.69	0.6	0.78	-0.68
Azfi_s0001.g000975 (EMB2780)	0.26	-1.88	-0.69	0.32	-0.23	-0.06	-0.06	0.15	0.27	0.48	0.15	0.54	-0.7
Azfi_s0002.g001151	0.24	-1.31	-0.67	-0.33	-0.21	-0.08	0.01	0.03	0.04	0.63	0.44	0.43	-0.21
Azfi_s0002.g001243	0.51	-2.78	0.44	0.92	0.44	-1.01	-0.87	-0.99	-1.24	0.47	0.44	0.44	-0.4
Azfi_s0002.g001474	0.56	-1.29	-0.78	0.04	-0.05	-0.81	-0.29	-0.11	-0.34	0.96	0.67	0.75	-2.19
Azfi_s0003.g007491 (OSA1)	0.12	-3.25	0.52	0.07	0.5	-0.11	-0.21	0.03	-0.1	0.46	0.32	0.35	-1.79
Azfi_s0003.g007726	0.19	-2.0	-0.87	-0.38	-0.45	0.41	0.19	0.19	0.13	0.7	0.54	0.64	-2.19
Azfi_s0003.g008094	0.26	-1.32	-0.03	-0.01	-0.17	-0.48	-0.08	-0.13	0.42	0.53	0.55	0.58	-2.17
Azfi_s0004.g008318	0.04	-2.36	-0.09	0.01	-0.05	0.42	0.1	0.01	-0.06	0.43	0.3	0.3	-0.55
Azfi_s0004.g008337	0.36	-3.4	-0.21	0.19	0.29	0.03	0.16	0.05	0.04	0.34	0.26	0.37	-1.18
Azfi_s0004.g008886	0.43	-3.89	-0.31	0.26	0.17	0.22	0.2	0.08	-0.11	0.43	0.3	0.39	-1.89
Azfi_s0005.g009064 (NF-YA8)	-0.0	-2.78	0.13	0.08	0.13	-0.05	0.09	0.01	-0.02	0.45	0.49	0.42	-1.11
Azfi_s0005.g009317	0.36	-2.31	-0.39	-0.5	-0.17	0.07	0.0	-0.13	0.22	0.64	0.45	0.64	-0.93
Azfi_s0006.g009625	0.18	-5.81	-0.42	0.58	0.36	-0.26	-0.1	0.01	-0.27	0.45	0.64	0.58	-1.7
Azfi_s0006.g009840	0.25	-1.32	-0.16	-0.11	0.2	0.22	0.01	-0.18	0.23	0.35	0.22	0.26	-0.79
Azfi_s0006.g009907	0.11	-1.42	-0.61	0.2	0.44	-0.4	-0.35	-0.22	-0.04	0.64	0.48	0.65	-1.01
Azfi_s0006.g010210	0.28	-1.27	-0.11	0.01	0.25	-0.07	-0.25	-0.33	-0.02	0.48	0.31	0.53	-0.76
Azfi_s0006.g010369 (LINC2)	0.19	-2.47	-0.01	-0.22	0.36	-0.08	-0.12	-0.26	0.06	0.49	0.5	0.63	-1.2
Azfi_s0007.g010670	-0.02	-2.72	-0.34	-0.24	0.02	0.19	0.12	-0.13	0.09	0.66	0.62	0.68	-1.77
Azfi_s0007.g010817 (UTP11)	0.11	-2.61	-0.71	-0.13	-0.48	0.23	0.24	0.15	0.3	0.46	0.45	0.48	-0.57
Azfi_s0007.g010945 (ATJ)	0.27	-3.62	-0.3	-0.26	-0.15	-0.24	-0.16	-0.17	0.06	0.76	0.71	0.73	-1.0
Azfi_s0007.g011013	0.39	-2.95	-0.11	0.13	0.39	-0.4	-0.59	-0.7	-0.42	0.77	0.5	0.67	-0.47
Azfi_s0008.g011364	0.52	-1.23	0.04	-0.39	0.09	0.03	-0.02	-0.18	0.0	0.24	0.13	0.31	-0.17
Azfi_s0008.g011447	0.4	-1.54	-0.66	-0.08	-0.02	-0.22	-0.03	0.14	-0.33	0.78	0.65	0.7	-2.96
Azfi_s0009.g011820 (RANBP1)	0.16	-2.32	-0.11	0.47	0.16	-0.39	-0.12	-0.07	-0.34	0.55	0.57	0.48	-1.04
Azfi_s0009.g011890	0.27	-1.85	-0.19	0.09	0.09	-0.11	0.14	0.04	0.26	0.29	0.26	0.36	-0.84
Azfi_s0010.g012094 (RALFL19)	0.1	-2.83	-0.66	-1.12	-0.46	0.43	0.18	0.09	0.18	0.75	0.7	0.7	-1.48
Azfi_s0010.g012131	-0.06	-1.32	-0.14	0.05	0.08	0.09	0.07	0.1	0.08	0.35	0.28	0.28	-0.52
Azfi_s0011.g012597	0.47	-3.3	-1.01	-0.24	-0.34	0.44	-0.03	-0.31	-0.64	0.67	0.87	0.65	-0.74
Azfi_s0012.g012802	0.1	-1.74	-0.33	0.08	0.13	-0.18	-0.08	-0.22	0.14	0.46	0.39	0.54	-0.42
Azfi_s0014.g013488 (RGD3)	0.49	-1.18	-0.09	-0.16	-0.02	0.12	-0.15	-0.22	0.21	0.37	0.08	0.38	-0.55
Azfi_s0015.g013710 (PFD3)	0.24	-5.97	0.02	0.44	0.36	-0.53	0.06	0.12	-0.34	0.32	0.44	0.4	-0.68
Azfi_s0015.g013788 (ESD4)	0.23	-1.71	-0.26	-0.31	-0.15	0.47	0.22	-0.03	0.07	0.37	0.17	0.23	-0.31
Azfi_s0015.g014027	0.44	-4.82	-0.39	0.38	0.16	-0.72	-0.72	-0.72	-0.59	0.93	0.77	0.9	-1.12
Azfi_s0015.g014144 (AtATG18a)	0.14	-3.39	0.13	0.2	0.28	-0.33	-0.23	-0.2	-0.14	0.3	0.48	0.63	-0.41
Azfi_s0015.g014211	-0.02	-3.76	-0.06	0.23	0.03	-0.24	-0.03	0.06	-0.15	0.39	0.45	0.51	-0.13
Azfi_s0016.g014392 (GPAT9)	0.07	-3.41	0.01	0.43	0.33	0.03	0.0	-0.17	0.08	0.42	0.28	0.38	-1.28
Azfi_s0017.g014511	0.19	-2.44	-0.6	-0.37	-0.1	0.25	0.25	0.22	0.41	0.34	0.22	0.4	-0.56
Azfi_s0019.g015005	0.22	-1.3	-0.5	0.12	0.06	0.09	0.07	-0.05	0.09	0.33	0.37	0.45	-0.93
Azfi_s0020.g015435	0.23	-1.76	-0.69	-0.46	-0.43	0.14	0.16	0.13	0.05	0.74	0.55	0.63	-1.31
Azfi_s0020.g015475	0.23	-2.53	0.18	0.26	0.32	-0.24	-0.08	-0.1	0.11	0.29	0.27	0.35	-0.83
Azfi_s0021.g015784	0.33	-1.48	0.33	0.09	0.33	0.08	-0.24	-0.33	-0.05	0.37	0.3	0.42	-1.81
Azfi_s0021.g015838	0.4	-4.76	-0.91	-0.14	-0.22	-0.2	-0.07	-0.27	0.16	0.71	0.61	0.8	-0.59
Azfi_s0022.g015897	0.24	-1.27	-0.47	-0.27	-0.08	0.08	-0.02	-0.01	0.27	0.52	0.4	0.52	-1.06
Azfi_s0022.g015927 (PEX6)	0.38	-1.07	-0.67	-0.3	-0.34	0.08	-0.05	0.05	0.36	0.43	0.32	0.43	-0.54
Azfi_s0024.g020300 (PSAT1)	0.45	-1.21	-0.49	0.12	0.09	-0.09	0.06	0.12	0.15	0.35	0.23	0.51	-1.79
Azfi_s0027.g023572	0.09	-1.99	-0.03	0.46	0.56	-0.12	-0.27	-0.34	-0.16	0.33	0.24	0.57	-1.02
Azfi_s0027.g023602 (ATM1)	0.47	-4.26	-0.54	-0.62	-0.1	-0.75	-0.01	-0.05	-0.34	1.05	0.94	0.97	-
Azfi_s0027.g023718	-0.04	-1.79	-0.23	-0.2	-0.01	0.24	0.19	0.2	0.13	0.4	0.37	0.47	-1.16
Azfi_s0027.g023719	0.15	-1.69	-0.06	0.23	0.28	0.05	0.11	0.12	0.16	0.28	0.2	0.3	-1.59
Azfi_s0030.g024383	0.25	-1.12	-0.45	0.18	0.24	-0.44	-0.37	-0.33	-0.26	0.72	0.51	0.66	-0.94
Azfi_s0030.g024385 (TON1)	-0.02	-1.95	-0.21	0.05	0.13	0.15	0.01	-0.0	-0.07	0.43	0.32	0.39	-0.32
Azfi_s0032.g024823	0.33	-1.96	-0.29	0.34	0.32	-0.55	-0.59	-0.5	-0.55	0.77	0.53	0.68	-0.59
Azfi_s0032.g024872 (GTE6)	0.05	-2.7	-0.82	-0.36	-0.0	0.2	0.05	0.0	0.37	0.56	0.49	0.56	-0.67
Azfi_s0032.g024917	-0.03	-2.48	0.03	0.49	0.31	-0.35	-0.2	-0.24	-0.2	0.44	0.4	0.67	-0.9
Azfi_s0033.g025070	0.36	-0.52	-0.2	-0.36	-0.41	0.07	-0.0	-0.03	0.17	0.26	0.18	0.17	0.03
Azfi_s0035.g025479 (HSP60)	0.33	-0.9	-0.57	0.01	-0.01	-0.39	-0.11	0.07	0.06	0.69	0.45	0.42	-1.21
Azfi_s0035.g025535	0.07	-1.57	0.15	0.16	0.15	-0.15	-0.3	-0.22	-0.25	0.51	0.6	0.51	-1.0
Azfi_s0037.g025970 (HD1)	0.23	-2.36	-0.14	0.23	0.35	-0.17	-0.18	-0.19	0.05	0.47	0.35	0.41	-0.76
Azfi_s0038.g026165	0.23	-1.29	-0.02	-0.08	0.31	-0.0	0.02	0.08	0.05	0.3	0.28	0.33	-1.22
Azfi_s0038.g026198	-0.3	-1.66	0.12	0.05	0.18	-0.03	-0.02	-0.07	-0.11	0.31	0.45	0.47	-0.38
Azfi_s0042.g026934	-0.03	-2.82	-0.21	-0.03	-0.0	0.21	0.21	-0.03	0.3	0.39	0.45	0.4	-0.97
Azfi_s0045.g029905 (RHS17)	0.04	-2.84	-0.17	0.2	0.2	0.2	-0.03	-0.37	0.09	0.44	0.42	0.46	-0.73
Azfi_s0048.g030542	0.43	-2.89	0.28	0.3	0.41	-0.73	-0.43	-0.4	-0.74	0.77	0.61	0.67	-2.16
Azfi_s0050.g031023 (XIK)	0.11	-1.59	0.02	0.35	0.62	0.02	-0.07	-0.25	0.1	0.25	0.02	0.29	-1.13
Azfi_s0050.g031167	0.46	-2.13	-0.3	0.26	0.16	-0.42	-0.4	-0.32	-0.6	0.88	0.69	0.63	-1.72
Azfi_s0051.g031255	0.12	-4.31	-0.31	0.18	-0.05	-0.14	0.02	-0.19	-0.05	0.52	0.5	0.53	-0.15
Azfi_s0054.g033607 (UGLYAH)	0.2	-1.74	-0.26	0.16	0.14	-0.25	-0.01	-0.05	-0.19	0.59	0.42	0.53	-0.9
Azfi_s0054.g033776	-0.04	-1.38	0.17	0.41	0.4	-0.0	-0.09	-0.24	-0.09	0.41	0.19	0.4	-1.47
Azfi_s0054.g033848 (ATX1)	0.46	-1.15	-0.01	0.05	0.31	0.28	0.0	-0.12	0.18	0.21	-0.07	0.23	-1.54
Azfi_s0056.g034245 (FLD)	-0.11	-2.09	0.07	-0.04	0.32	0.11	-0.08	-0.15	0.22	0.29	0.43	0.41	-0.83
Azfi_s0059.g034649 (BET9)	0.06	-1.98	-0.73	-0.44	-0.07	0.08	-0.11	-0.18	0.26	0.58	0.74	0.77	-1.05
Azfi_s0061.g035104 (TRB1)	0.24	-1.4	0.17	0.2	0.2	0.24	0.23	0.09	0.03	0.05	0.17	0.12	-1.61
Azfi_s0064.g035602 (HISN6B)	0.27	-3.96	-0.2	0.18	0.22	-0.44	-0.08	0.19	-0.05	0.56	0.54	0.51	-1.26
Azfi_s0064.g035716	0.55	-2.23	-0.05	-0.14	0.37	-0.36	-0.46	-0.43	-0.75	0.81	0.64	0.88	-2.56
Azfi_s0065.g035753 (TOR)	0.8	-1.51	-0.3	-0.16	0.07	0.07	-0.09	-0.23	0.17	0.42	0.31	0.45	-2.15
Azfi_s0065.g035823	0.29	-1.52	0.18	0.48	0.32	-0.2	-0.08	-0.11	-0.22	0.35	0.23	0.13	-0.99
Azfi_s0065.g035911 (CYCD3)	0.08	-3.72	0.04	0.28	0.45	-0.3	-0.04	0.13	-0.12	0.44	0.41	0.78	-3.93
Azfi_s0065.g035945	0.34	-2.33	0.01	0.16	0.21	-0.06	-0.12	-0.07	-0.15	0.57	0.48	0.5	-2.26
Azfi_s0065.g035974	0.07	-1.46	0.15	0.48	0.52	-0.12	-0.23	-0.36	-0.33	0.29	0.12	0.27	-0.34
Azfi_s0068.g036358	-0.03	-1.93	-0.42	-0.29	-0.11	0.32	0.15	0.02	0.17	0.54	0.39	0.5	-0.75
Azfi_s0075.g037587	0.2	-2.73	-0.42	-0.14	-0.15	0.32	0.02	-0.13	0.08	0.56	0.49	0.59	-0.93
Azfi_s0075.g037618	-0.26	-3.81	0.03	0.01	0.42	0.04	0.02	-0.16	-0.0	0.4	0.49	0.55	-0.7
Azfi_s0076.g037833	0.16	-1.58	-0.07	0.16	0.33	-0.05	-0.12	-0.29	0.24	0.39	0.2	0.47	-1.03
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Azfi_s0077.g038019 (SAE2)	0.31	-2.69	0.13	0.29	0.42	-0.35	-0.26	-0.2	0.08	0.41	0.2	0.39	-0.7
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.