Heatmap: Cluster_60 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene	Vegetative Sporophyte	Adult Sporophyte	Leaf (0 mg/L NH4NO3)	Leaf (30 mg/L NH4NO3)	Leaf (90 mg/L NH4NO3)	Sporophyte; w/o NH4NO3, w/o cyanobacteria	Sporophyte; w/o NH4NO3, w cyanobacteria	Sporophyte; w NH4NO3, w cyanobacteria	Sporophyte; w NH4NO3, w/o cyanobacteria	Root Tip, D-3 6h mock treated	Root Tip, D-3 6h 0.1 uM IAA treated	Root Tip, D-3 6h 0.5 uM trans-zeatin treated	Microsporocarp
Azfi_s0002.g004312 (COX10)	0.0	0.0	0.58	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0019.g015165	0.07	0.02	2.08	0.78	1.1	0.0	0.09	0.16	0.12	0.0	0.07	0.08	0.0
Azfi_s0044.g027529	0.0	0.0	0.06	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0044.g028676 (PPT1)	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0086.g041254 (SSADH)	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0261.g060738	0.0	0.0	0.35	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0324.g064556	0.53	3.69	10.04	3.34	3.33	0.0	0.57	4.99	1.22	3.63	1.89	3.59	0.0
Azfi_s0423.g069212 (IAR1)	0.07	0.04	4.06	3.27	2.24	0.16	0.36	0.11	0.38	0.22	0.13	0.0	0.0
Azfi_s0470.g072884	0.0	0.0	1.69	1.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0517.g075060 (UBC27)	0.0	0.0	0.53	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0523.g075286 (MEKK4)	0.25	0.0	8.81	6.12	3.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0525.g075432 (OLI7)	0.0	0.0	1.91	0.79	0.99	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0536.g076230 (TSO2)	0.0	0.0	0.15	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0550.g076502 (CDC48)	0.0	0.0	0.28	0.09	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0582.g078377 (RPS6B)	0.0	0.0	0.8	0.27	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0645.g080821 (ATG8F)	0.0	0.09	5.66	1.84	2.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0659.g081418 (PAC1)	0.0	0.0	0.26	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0664.g081733	0.0	0.1	1.06	0.35	0.26	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23
Azfi_s0688.g082322	0.0	0.0	0.87	0.27	0.19	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0714.g083300 (STP1)	0.0	0.0	0.59	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0751.g085259 (HSP70)	0.0	0.05	5.66	2.78	1.7	0.0	0.07	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0772.g086234	0.0	0.0	0.22	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0790.g087148	0.0	0.0	0.48	0.11	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0823.g088042	0.0	0.0	5.04	3.12	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0843.g088826	0.0	0.0	1.52	1.11	0.12	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0920.g092629 (UBQ6)	0.0	0.0	0.38	0.2	0.14	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s0980.g094242	0.0	0.0	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s1007.g095044 (VPS26B)	0.0	0.0	0.32	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s1021.g095425	0.0	0.0	0.16	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s1030.g095535 (MPPBETA)	0.0	0.01	0.52	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s1090.g097180 (IMPA-4)	0.0	0.0	0.2	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s1104.g097641	0.0	0.0	0.46	0.29	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s1190.g099188	0.0	0.0	0.84	0.28	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s1201.g099547 (ACO1)	0.0	0.0	0.82	0.24	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s1249.g100378 (PDR2)	0.0	0.0	0.04	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s1261.g100550 (SQN)	0.0	0.0	0.26	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s1326.g101559	0.0	0.04	3.52	2.06	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s1380.g102460 (RBP45B)	0.0	0.0	1.2	0.22	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s1877.g107637	0.0	0.0	1.79	1.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s2163.g109715	0.0	0.0	16.21	5.63	5.79	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s2546.g112100	0.0	0.0	0.87	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s3903.g117279 (ATP3)	0.0	0.0	0.71	0.29	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Azfi_s4544.g119972	0.0	0.0	0.28	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)