Heatmap: Cluster_29 (HCCA cluster)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g009144.1.1 (Solyc00g009144.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g013182.1.1 (Solyc00g013182.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g017933.1.1 (Solyc00g017933.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g109450.1.1 (Solyc00g109450.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g268315.1.1 (Solyc00g268315.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g011075.1.1 (Solyc01g011075.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g011335.1.1 (Solyc01g011335.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g011530.1.1 (Solyc01g011530.1)
- - - - 4.2 - - - 3.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g012720.1.1 (Solyc01g012720.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g014536.1.1 (Solyc01g014536.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - -
Solyc01g016684.1.1 (Solyc01g016684.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g021705.1.1 (Solyc01g021705.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g034195.1.1 (Solyc01g034195.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc01g049765.1.1 (Solyc01g049765.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g049950.1.1 (Solyc01g049950.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g056693.1.1 (Solyc01g056693.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g057113.1.1 (Solyc01g057113.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g058245.1.1 (Solyc01g058245.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g059820.1.1 (Solyc01g059820.1)
- - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g065575.1.1 (Solyc01g065575.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g112330.1.1 (Solyc01g112330.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g005400.2.1 (Solyc02g005400.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g032105.1.1 (Solyc02g032105.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g032307.1.1 (Solyc02g032307.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g044935.1.1 (Solyc03g044935.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g046455.1.1 (Solyc03g046455.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g051800.1.1 (Solyc03g051800.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g058953.1.1 (Solyc03g058953.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g070410.2.1 (Solyc03g070410.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g071503.1.1 (Solyc03g071503.1)
- - - - - 3.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.39 - -
Solyc04g016195.1.1 (Solyc04g016195.1)
- - - - - - - - - - - - - - - 4.98 - - - - - - - - 1.33 - - - - - - - - -
Solyc04g017803.1.1 (Solyc04g017803.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g025997.1.1 (Solyc04g025997.1)
- - - - 5.0 1.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g048930.1.1 (Solyc04g048930.1)
- - - - 3.38 1.97 - - - - - - - 3.31 - - - - - - - - - - - - - 3.29 - - - - - -
Solyc04g050855.1.1 (Solyc04g050855.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g009765.1.1 (Solyc05g009765.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g015515.1.1 (Solyc05g015515.1)
- - - - - - - - - - - - 1.39 - - - - - - - - - - - - 4.92 - 0.1 - - - - - -
Solyc05g016290.1.1 (Solyc05g016290.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g018037.1.1 (Solyc05g018037.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g018431.1.1 (Solyc05g018431.1)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g018748.1.1 (Solyc05g018748.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g024440.1.1 (Solyc05g024440.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g026605.1.1 (Solyc05g026605.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g007453.1.1 (Solyc06g007453.1)
- - - - 4.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.43 - - - - - - - - -
Solyc06g009697.1.1 (Solyc06g009697.1)
- - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g019190.1.1 (Solyc06g019190.1)
- - - - - - 3.48 - - - - 4.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g024384.1.1 (Solyc06g024384.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g048825.1.1 (Solyc06g048825.1)
- - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g051665.1.1 (Solyc06g051665.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g065880.1.1 (Solyc06g065880.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g017605.1.1 (Solyc07g017605.1)
- - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g020966.1.1 (Solyc07g020966.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g041513.1.1 (Solyc07g041513.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g042555.1.1 (Solyc07g042555.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g052457.1.1 (Solyc07g052457.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g008405.1.1 (Solyc08g008405.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc08g016795.1.1 (Solyc08g016795.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g041666.1.1 (Solyc08g041666.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc08g041683.1.1 (Solyc08g041683.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g045800.2.1 (Solyc08g045800.2)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g053570.1.1 (Solyc08g053570.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g054575.1.1 (Solyc08g054575.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g007600.2.1 (Solyc09g007600.2)
- - - - - 0.5 2.42 - - - 3.04 - 4.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g014605.1.1 (Solyc09g014605.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g018530.2.1 (Solyc09g018530.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g031550.2.1 (Solyc09g031550.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g056455.1.1 (Solyc09g056455.1)
- - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g061530.1.1 (Solyc09g061530.1)
- - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g092585.1.1 (Solyc09g092585.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc10g019030.1.1 (Solyc10g019030.1)
- - - - - 0.26 - - 3.71 - 3.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.77 - - -
Solyc10g019105.1.1 (Solyc10g019105.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g044435.1.1 (Solyc10g044435.1)
- - - - - - - - - - 3.6 - - - - - - - - 2.48 - - - 2.85 - - - - 3.18 - - - - -
Solyc10g045030.1.1 (Solyc10g045030.1)
- - - - - - - - - - - - - 3.79 - - - - - - - - - - 2.3 - 3.93 - - - - - - -
Solyc10g050875.1.1 (Solyc10g050875.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g051365.1.1 (Solyc10g051365.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g061887.1.1 (Solyc10g061887.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g074370.1.1 (Solyc10g074370.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g020740.2.1 (Solyc11g020740.2)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g032072.1.1 (Solyc11g032072.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g032160.1.1 (Solyc11g032160.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g045420.2.1 (Solyc11g045420.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g045435.1.1 (Solyc11g045435.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g009950.1.1 (Solyc12g009950.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc12g015760.1.1 (Solyc12g015760.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g038175.1.1 (Solyc12g038175.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g062400.2.1 (Solyc12g062400.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.