Heatmap: Cluster_85 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g127670.2.1 (Solyc00g127670.2)
-2.23 -0.5 -0.53 -1.59 -0.26 0.85 0.65 1.63 0.7 0.1 0.06 -0.59 0.35 -0.05 -0.36 -0.65 -0.84 -7.03 -7.92 -1.45 -0.81 0.37 0.79 0.41 0.14 -0.21 0.72 0.36 0.04 0.3 0.69 -0.08 -0.53 -1.31
Solyc01g008930.4.1 (Solyc01g008930.4)
-1.84 -0.85 -4.32 -3.75 0.31 0.42 1.07 0.85 0.86 -0.03 -0.47 -1.28 0.31 -0.07 -0.69 -0.34 -0.88 -9.1 -9.33 -2.28 -3.38 1.01 0.99 0.83 0.39 -1.53 0.97 0.64 0.19 0.99 1.13 0.57 -2.22 -2.13
Solyc01g058160.3.1 (Solyc01g058160.3)
-3.71 -3.17 -6.55 -7.78 0.99 1.07 1.69 0.73 1.54 0.86 0.11 0.22 1.51 0.75 0.59 0.06 -0.18 - -10.62 -2.47 -0.8 -0.0 -0.26 -0.28 -0.85 -1.11 -0.05 -0.27 -0.45 -0.23 0.18 -0.3 -3.41 -3.97
Solyc01g058170.3.1 (Solyc01g058170.3)
-3.32 -2.99 -4.75 -6.61 1.4 1.5 1.75 0.84 1.32 0.75 -0.46 -0.33 0.92 0.07 0.88 0.21 0.2 -8.06 - -3.14 -1.12 0.12 -0.22 -0.32 -0.71 -1.57 0.17 -0.15 -0.32 -0.08 0.33 -0.43 -3.06 -2.97
Solyc01g067180.3.1 (Solyc01g067180.3)
-0.91 0.0 -2.49 -1.66 1.23 0.82 -0.32 0.22 0.6 0.5 0.35 0.35 0.79 0.74 0.49 0.05 -0.2 -5.42 -6.38 -2.17 -0.42 0.29 -0.11 0.08 -0.05 -0.49 0.23 0.34 0.12 0.11 0.26 0.56 -2.41 -1.61
Solyc01g080700.3.1 (Solyc01g080700.3)
-2.71 -2.78 -5.15 -2.95 -0.01 0.26 1.15 0.43 0.63 -0.07 -1.3 -1.52 -0.94 -1.65 -1.18 -1.88 -1.98 -5.2 -7.05 -2.3 -1.1 1.49 0.95 1.14 0.93 -1.15 0.93 0.93 0.68 1.25 1.43 0.96 -4.37 -2.12
Solyc01g080705.1.1 (Solyc01g080705.1)
-2.14 -2.25 -4.4 -2.31 1.33 1.02 1.28 0.54 0.4 -0.1 -0.49 -1.62 -0.5 -1.38 -0.96 -2.14 -1.67 -4.69 -6.16 -3.21 -0.94 1.22 0.57 0.79 0.8 -0.84 0.48 0.6 0.41 1.07 1.33 0.74 -3.59 -1.59
Solyc01g081460.3.1 (Solyc01g081460.3)
-1.39 0.45 -1.63 -1.79 -0.91 0.69 0.16 1.08 0.28 0.02 -0.12 -0.58 0.0 -0.25 -0.68 -1.19 -0.74 -7.28 -5.28 -0.55 -0.75 0.68 0.41 0.41 0.31 0.63 0.65 0.53 0.47 0.76 0.75 0.73 -0.39 -1.36
Solyc01g086900.3.1 (Solyc01g086900.3)
-1.8 -0.24 -1.47 -1.86 0.1 0.85 0.46 1.46 -0.2 -0.43 -0.59 -0.66 -0.15 -0.56 -0.89 -1.93 -1.47 -4.54 -4.93 -2.33 -1.56 1.0 0.33 0.58 0.63 -0.81 0.83 0.72 0.49 1.16 1.06 0.89 -0.32 -1.65
Solyc01g088600.3.1 (Solyc01g088600.3)
-1.69 -0.17 -2.06 -2.18 -0.83 0.65 -0.17 1.38 -0.1 -1.17 -0.96 -0.35 -0.3 -0.31 1.45 1.41 1.08 -10.11 -9.07 -2.42 -1.23 0.32 0.18 0.11 0.02 -2.75 0.72 0.3 0.11 0.49 0.5 -0.07 0.75 -1.83
Solyc01g090200.3.1 (Solyc01g090200.3)
-0.85 -0.07 -0.99 -1.31 -0.17 0.74 1.17 1.42 0.04 0.33 -0.56 -0.72 -0.09 -0.19 -0.42 -0.42 -0.53 -6.11 -5.4 -0.99 -0.91 0.62 0.52 0.39 0.17 0.28 0.57 0.37 0.07 0.48 0.58 0.41 -1.47 -1.27
Solyc01g091715.1.1 (Solyc01g091715.1)
-0.58 -1.38 -0.37 -1.4 1.81 0.89 0.23 0.15 0.09 -0.37 -0.91 -0.95 0.02 -0.4 -0.96 -0.77 -0.86 -4.27 -4.13 0.6 -0.43 0.43 -0.07 0.09 0.2 0.41 0.42 0.43 0.28 0.45 0.39 0.32 0.06 -0.42
Solyc01g093990.3.1 (Solyc01g093990.3)
-1.56 -0.94 -1.82 -1.11 1.31 0.95 1.71 1.42 0.93 0.0 -0.58 -1.39 -0.86 -1.35 -0.16 -0.45 -0.09 -6.01 -4.47 -3.25 -1.49 0.7 0.04 0.31 0.5 -4.33 0.29 0.2 0.08 0.56 0.64 0.13 -0.24 -1.87
Solyc01g094720.3.1 (Solyc01g094720.3)
-2.41 -2.87 -2.64 -2.91 0.23 0.9 1.01 0.92 -0.12 -1.1 -1.01 -0.77 -0.78 -0.55 0.37 0.18 -0.17 -10.6 -12.03 -0.75 -1.3 0.79 0.82 0.83 0.74 -1.46 0.94 0.82 1.04 0.69 0.64 0.32 -0.42 -2.49
Solyc01g098380.3.1 (Solyc01g098380.3)
-1.12 1.24 -1.38 -0.55 0.38 0.6 0.51 0.83 -0.23 -1.46 0.01 0.12 -0.67 -0.45 -1.25 -2.51 -2.35 -11.0 -9.69 -1.54 -1.31 0.65 0.81 0.63 0.55 -1.36 1.01 0.69 0.49 0.7 0.69 0.31 0.2 -0.98
Solyc01g100180.3.1 (Solyc01g100180.3)
-1.1 1.04 -0.86 0.33 -0.01 0.84 0.54 1.37 0.91 0.38 0.33 0.15 0.34 0.43 0.36 0.14 0.38 -5.64 -4.81 -1.14 -1.09 -0.41 -0.2 -0.42 -0.89 -0.72 0.19 -0.24 -0.47 -0.1 0.12 -0.61 -0.99 -0.74
Solyc01g100250.3.1 (Solyc01g100250.3)
-0.6 0.72 -0.86 -0.59 -0.98 1.03 0.98 1.43 0.55 0.3 -0.1 -0.29 0.0 -0.24 0.52 0.56 0.55 -6.52 -6.17 -0.63 -1.55 -0.36 0.41 -0.03 -0.37 -0.46 0.14 -0.02 -0.37 -0.38 -0.07 -0.94 -0.15 0.01
Solyc01g102820.3.1 (Solyc01g102820.3)
-1.58 0.2 -1.1 -0.77 -0.59 0.47 -0.47 0.81 0.25 0.04 -0.67 -1.23 -0.69 -1.19 0.78 0.41 0.48 -7.54 -8.67 -2.24 -2.32 0.84 0.62 0.64 0.52 -0.85 0.84 0.7 0.36 0.88 0.9 0.7 -1.34 -1.28
Solyc01g105160.3.1 (Solyc01g105160.3)
-0.78 -0.62 -1.46 -0.86 0.03 0.55 0.94 0.25 0.58 0.08 0.35 0.1 0.65 0.26 0.14 -0.16 0.04 -5.42 -6.38 -1.0 -0.06 0.29 0.44 0.28 0.11 0.01 0.51 0.34 0.26 0.15 0.33 0.08 -1.88 -0.7
Solyc01g107330.3.1 (Solyc01g107330.3)
-2.73 0.76 -2.42 -2.01 -0.62 1.57 1.44 2.25 -0.17 -1.26 -0.14 -0.59 -0.41 -0.32 -2.46 -3.97 -3.72 -6.62 -6.21 -1.3 -1.3 0.36 -0.16 -0.02 -0.06 -2.87 0.38 0.15 -0.14 0.4 0.5 -0.17 1.87 -2.25
Solyc02g021140.3.1 (Solyc02g021140.3)
-1.3 -0.47 -1.58 -2.83 -0.44 1.19 -0.14 1.47 0.16 0.02 0.2 -0.53 0.15 -0.32 0.47 0.53 0.24 -9.4 -9.52 -1.29 -1.37 0.48 0.07 0.23 0.34 -0.67 0.58 0.43 0.26 0.53 0.6 0.3 -0.31 -1.12
Solyc02g032970.3.1 (Solyc02g032970.3)
-1.6 0.44 -1.28 -0.1 0.31 0.78 1.43 1.58 0.07 -0.59 0.03 0.15 0.18 0.04 -0.56 -1.2 -1.14 -9.23 -8.5 -1.43 -0.9 0.37 0.56 0.51 0.07 -0.88 0.63 0.36 -0.05 0.3 0.4 -0.15 -1.81 -0.95
Solyc02g068930.3.1 (Solyc02g068930.3)
-1.59 -0.16 0.03 -0.69 0.1 1.14 0.04 1.6 0.26 -0.29 -0.11 -0.09 0.06 0.06 0.17 -0.56 -0.34 - - -0.88 -0.83 0.32 -0.4 -0.01 0.06 -0.66 0.33 0.48 0.37 0.64 0.45 0.39 -0.07 -1.62
Solyc02g077090.3.1 (Solyc02g077090.3)
-0.52 0.07 -1.78 -0.63 -0.38 0.42 1.83 0.76 0.89 -0.1 0.63 0.38 0.75 0.76 -1.84 -4.32 -3.58 -7.38 -7.78 -3.29 -2.68 0.13 0.95 0.54 -0.16 -6.05 0.9 0.59 -0.08 0.05 0.64 -1.05 -0.57 -0.28
Solyc02g077910.3.1 (Solyc02g077910.3)
-0.23 1.03 -0.71 -0.16 -0.02 0.71 0.44 1.39 0.25 -0.26 -0.05 -0.37 0.61 0.1 0.46 0.28 0.24 -7.2 -4.98 -1.95 -1.28 0.13 0.38 -0.06 -0.61 -2.88 1.05 0.37 -0.21 0.08 0.29 -0.77 -1.24 -1.0
Solyc02g079000.3.1 (Solyc02g079000.3)
-1.42 0.53 -0.76 -0.81 0.31 0.83 0.29 1.29 0.6 -0.4 0.07 0.27 0.16 0.3 0.06 -0.78 -0.78 -7.78 -10.74 -1.26 -0.56 0.34 0.55 0.41 -0.0 -0.71 0.75 0.42 0.1 0.35 0.55 -0.05 -1.96 -1.24
Solyc02g080320.3.1 (Solyc02g080320.3)
-1.5 0.39 -0.84 -2.19 -1.05 0.79 1.3 1.34 0.2 -0.47 -0.07 -0.95 0.05 -0.1 0.19 -0.77 1.15 -3.46 -3.97 -1.45 -1.16 0.44 -0.02 0.27 0.11 -1.76 0.7 0.54 0.25 0.39 0.53 0.31 -0.86 -1.38
Solyc02g080500.3.1 (Solyc02g080500.3)
-0.06 -1.27 0.17 -0.35 -0.87 -0.66 0.95 0.49 0.66 -0.44 -0.42 -0.57 -0.64 -0.84 -0.34 -1.52 -1.15 - - -1.07 -0.11 0.69 0.72 0.59 0.38 -0.48 1.0 0.89 0.44 0.97 0.85 0.51 -1.33 -0.52
Solyc02g085250.3.1 (Solyc02g085250.3)
-0.46 -0.55 -2.21 -1.47 -0.16 0.03 1.32 0.72 -0.41 -0.19 -0.76 -1.43 0.17 -0.48 -3.89 -4.38 -4.24 -10.49 -9.31 -1.22 -1.57 1.33 0.51 0.69 0.68 -1.1 1.05 0.86 0.54 1.25 1.28 1.13 -2.46 -1.11
Solyc02g086150.3.1 (Solyc02g086150.3)
-2.38 -1.28 -2.56 -3.75 1.28 1.36 1.05 1.39 0.5 -0.13 0.44 0.23 0.66 0.26 0.03 0.03 -0.11 - -10.57 -0.89 -0.76 0.18 0.23 -0.05 -0.33 -0.89 0.26 -0.23 -0.37 -0.0 0.35 -0.47 0.08 -2.09
Solyc02g088540.3.1 (Solyc02g088540.3)
-0.63 0.28 -1.91 -1.91 -0.19 0.51 0.9 1.08 0.39 -0.55 -0.17 -0.48 0.25 -0.16 -0.64 -1.64 -1.61 -4.71 -4.18 -1.23 -0.74 0.7 0.5 0.55 0.39 -0.91 0.76 0.74 0.36 0.9 0.84 0.52 -0.64 -0.93
Solyc02g094590.3.1 (Solyc02g094590.3)
-1.34 -0.74 -2.53 -2.64 -0.31 0.58 0.76 0.89 0.43 0.39 0.27 -0.24 0.91 0.51 0.58 0.32 0.17 -5.01 -4.42 -1.23 -0.65 0.33 0.42 0.28 -0.09 0.13 0.55 0.33 0.01 0.24 0.42 -0.0 -1.45 -1.49
Solyc03g005010.3.1 (Solyc03g005010.3)
-0.94 -1.38 -2.15 -2.84 0.77 1.1 0.81 0.98 0.4 0.07 -0.11 -0.31 0.65 0.28 -0.8 -1.32 -1.2 -4.07 -3.71 -1.46 -0.84 0.6 0.2 0.32 0.35 -0.41 0.58 0.32 0.12 0.66 0.71 0.6 -0.44 -0.87
Solyc03g006280.3.1 (Solyc03g006280.3)
-0.42 0.95 -0.41 -0.93 0.14 0.27 0.85 0.94 0.59 -0.1 0.26 -0.6 0.33 -0.35 -0.35 -0.42 -0.57 -6.86 -10.14 -1.54 -0.78 0.5 0.34 0.33 0.17 -0.27 0.45 0.36 0.02 0.44 0.53 0.11 -1.01 -0.7
Solyc03g031560.3.1 (Solyc03g031560.3)
-0.9 0.93 -0.47 -1.09 1.34 1.16 1.05 0.96 0.86 -0.03 0.38 0.25 -0.07 -0.27 -1.86 -2.14 -2.18 -3.98 -4.89 -1.98 -0.65 0.35 0.3 0.08 -0.3 -1.15 0.6 0.4 -0.07 0.3 0.53 -0.18 -2.87 -0.99
Solyc03g033260.3.1 (Solyc03g033260.3)
-0.93 0.4 -0.7 -1.8 -0.33 0.99 0.08 1.92 1.05 0.92 -0.72 -1.03 0.01 -1.56 0.69 1.0 -0.08 - -6.54 -1.41 -1.77 -0.03 -0.27 -0.17 -0.4 -0.04 0.91 0.34 -0.18 -0.28 -0.07 0.11 -2.17 -1.12
Solyc03g033270.3.1 (Solyc03g033270.3)
-1.22 -0.07 -1.05 -1.92 0.7 1.12 0.28 1.8 0.29 0.39 -0.43 -1.11 0.22 -0.23 0.04 0.51 -0.12 -8.04 -6.07 -1.4 -1.16 0.2 0.01 -0.05 -0.14 -1.14 1.11 0.48 0.3 0.3 0.61 0.06 -2.85 -2.2
Solyc03g053023.1.1 (Solyc03g053023.1)
-1.35 0.22 -1.66 -1.44 -1.75 0.22 -0.11 1.3 0.35 0.27 -1.22 -1.05 -0.74 -0.86 1.34 1.66 1.29 -10.26 -9.05 -0.56 -1.18 0.2 -0.05 -0.22 -0.13 -0.87 0.4 0.16 0.23 0.43 0.4 0.11 0.1 -2.06
Solyc03g078610.3.1 (Solyc03g078610.3)
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Solyc03g095220.3.1 (Solyc03g095220.3)
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Solyc03g095760.3.1 (Solyc03g095760.3)
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Solyc03g098610.3.1 (Solyc03g098610.3)
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Solyc03g111650.3.1 (Solyc03g111650.3)
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Solyc03g118500.3.1 (Solyc03g118500.3)
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Solyc03g118680.3.1 (Solyc03g118680.3)
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Solyc03g119740.3.1 (Solyc03g119740.3)
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Solyc04g058090.3.1 (Solyc04g058090.3)
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Solyc04g074130.3.1 (Solyc04g074130.3)
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Solyc04g081540.3.1 (Solyc04g081540.3)
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Solyc04g082680.3.1 (Solyc04g082680.3)
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Solyc05g007100.3.1 (Solyc05g007100.3)
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Solyc07g015980.3.1 (Solyc07g015980.3)
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Solyc07g015985.1.1 (Solyc07g015985.1)
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Solyc07g042820.3.1 (Solyc07g042820.3)
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Solyc07g045570.2.1 (Solyc07g045570.2)
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Solyc07g062750.3.1 (Solyc07g062750.3)
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Solyc07g064280.3.1 (Solyc07g064280.3)
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Solyc07g064750.1.1 (Solyc07g064750.1)
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Solyc07g064830.3.1 (Solyc07g064830.3)
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Solyc07g065040.3.1 (Solyc07g065040.3)
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Solyc07g065870.3.1 (Solyc07g065870.3)
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Solyc08g006830.3.1 (Solyc08g006830.3)
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Solyc08g042140.3.1 (Solyc08g042140.3)
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Solyc08g075680.3.1 (Solyc08g075680.3)
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Solyc08g077200.3.1 (Solyc08g077200.3)
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Solyc08g081080.3.1 (Solyc08g081080.3)
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-1.33 -1.07 -1.0 -2.65 1.02 1.4 0.99 1.01 0.46 0.02 0.15 0.05 0.73 0.59 0.19 0.32 0.04 -5.61 -7.8 -2.27 -1.03 0.31 0.16 0.03 -0.54 -2.89 0.61 0.3 -0.17 0.29 0.51 -0.42 -1.52 -1.46
Solyc11g069510.2.1 (Solyc11g069510.2)
-1.54 -0.15 -1.79 -2.24 0.13 0.67 1.45 0.75 0.34 -0.52 1.24 1.41 1.34 1.37 -0.8 -1.18 -1.23 -8.68 -8.94 -1.96 -1.09 -0.18 -0.35 -0.47 -0.65 -2.21 0.49 0.07 -0.09 0.05 0.17 -0.53 0.1 -1.7
Solyc11g070160.2.1 (Solyc11g070160.2)
-0.54 0.6 -1.2 -0.57 -0.04 -0.13 0.48 0.07 0.35 0.11 0.09 -0.39 1.03 0.53 0.36 0.4 0.43 -3.46 -4.3 -1.4 -0.01 0.01 0.21 0.15 0.03 -0.49 0.41 0.32 0.17 0.11 0.29 0.1 -2.23 -0.12
Solyc12g011270.2.1 (Solyc12g011270.2)
0.54 1.81 -0.08 0.76 -0.04 0.04 0.2 -0.03 -0.43 -0.42 0.14 0.07 0.2 0.14 0.07 -0.49 -0.52 -7.45 -9.11 -0.72 -0.66 -0.15 0.27 0.04 -0.24 -0.15 0.37 0.13 0.05 0.01 0.04 -0.24 -1.03 0.0
Solyc12g013890.2.1 (Solyc12g013890.2)
-0.91 0.16 -1.03 -0.93 0.36 0.81 0.61 0.97 0.03 -0.52 0.29 0.43 0.47 0.38 -0.2 -0.72 -0.67 -7.99 -8.58 -1.45 -0.76 0.35 0.38 0.17 -0.01 -0.41 0.81 0.22 0.02 0.34 0.65 0.01 -0.22 -0.58
Solyc12g015710.2.1 (Solyc12g015710.2)
-1.75 -1.78 -2.73 -2.68 -0.21 0.58 0.32 1.6 -0.02 0.57 -0.8 -1.28 -0.05 -0.92 0.42 0.28 0.12 - - -0.62 -0.63 0.79 0.35 0.44 0.35 0.26 0.8 0.52 0.17 0.58 0.8 0.48 -0.81 -2.02
Solyc12g021230.2.1 (Solyc12g021230.2)
-1.2 1.56 -0.87 -0.59 -0.62 0.89 0.83 1.54 -0.12 -0.67 0.13 -0.1 0.43 0.46 -0.74 -1.29 -1.21 -9.06 -12.86 -0.67 -0.75 0.04 0.22 0.02 -0.31 0.18 0.67 0.29 0.01 0.06 0.3 -0.21 -1.08 -0.61
Solyc12g041880.2.1 (Solyc12g041880.2)
-2.58 -2.33 -2.78 -2.05 0.36 0.7 -0.05 1.2 0.75 0.7 -0.79 -1.05 -0.78 -1.28 0.79 0.75 0.91 -9.53 -12.13 -2.14 -1.3 0.76 0.42 0.54 0.4 -1.87 0.62 0.47 0.21 0.73 0.82 0.47 -0.77 -2.04
Solyc12g049510.2.1 (Solyc12g049510.2)
-1.26 0.02 -1.92 -1.65 0.66 0.62 1.88 0.5 0.81 0.01 0.38 0.06 0.79 0.34 -0.65 -1.87 -1.81 - - -5.44 -1.2 0.46 0.66 0.41 -0.14 -3.59 0.75 0.47 -0.01 0.46 0.61 0.05 -3.44 -0.6
Solyc12g099960.1.1 (Solyc12g099960.1)
-1.29 -0.55 -1.69 -2.58 -0.1 0.29 0.55 0.46 -0.8 -0.4 1.04 1.63 1.68 1.52 -1.23 -1.58 -1.8 -4.87 -5.69 -1.73 -0.66 0.11 0.23 -0.12 -0.24 -0.81 0.35 -0.24 -0.16 -0.07 0.24 -0.04 0.82 -1.51

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.