Heatmap: Cluster_31 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g008180.3.1 (Solyc01g008180.3)
-0.16 -1.08 -1.31 -0.33 0.85 -0.08 1.9 -0.28 1.06 -0.27 1.06 0.76 1.72 1.87 -0.99 -1.98 -1.53 - -11.06 -1.3 0.1 -1.33 -0.95 -1.12 -1.58 -1.53 0.01 -0.17 -0.24 -1.02 -0.58 -1.4 -1.79 0.36
Solyc01g008960.3.1 (Solyc01g008960.3)
-0.02 -0.27 -2.35 -1.96 -1.11 -0.88 2.0 -0.94 0.55 -0.08 0.22 -0.22 1.21 0.81 0.21 -0.77 -0.71 -9.97 -10.58 -1.55 -0.35 0.28 0.25 0.2 -0.12 -0.69 0.56 0.51 0.34 0.44 0.53 0.16 -2.86 -0.16
Solyc01g067480.3.1 (Solyc01g067480.3)
-1.76 0.41 -2.36 -1.78 -0.32 0.15 2.01 0.45 0.72 -0.48 0.31 0.08 0.91 0.87 -0.56 -1.66 -1.44 - - -2.85 -0.67 0.4 0.53 0.4 0.09 -1.86 0.89 0.58 0.24 0.4 0.52 -0.02 -3.2 -1.76
Solyc01g068260.3.1 (Solyc01g068260.3)
-0.51 0.82 0.07 0.05 0.24 -0.94 2.05 0.01 0.61 -0.53 0.23 -0.03 0.66 0.99 -0.07 -1.18 -1.25 -7.31 -8.69 -1.49 -0.95 -0.08 0.55 -0.04 -0.6 -0.3 0.51 0.21 -0.14 0.06 0.24 -0.57 -4.48 -0.63
Solyc01g068263.1.1 (Solyc01g068263.1)
-1.37 0.65 -0.53 0.16 0.51 -0.82 2.0 0.0 0.61 -0.12 0.46 0.23 0.9 1.27 -0.15 -1.19 -1.19 -7.17 -6.3 -1.55 -0.52 -0.19 0.49 -0.06 -0.75 -0.3 0.44 0.17 -0.24 -0.25 0.15 -0.9 -4.68 -0.7
Solyc01g068267.1.1 (Solyc01g068267.1)
-0.28 0.89 -0.69 0.07 -0.8 -1.43 1.91 0.17 0.7 -0.03 0.48 0.34 1.06 1.15 -0.23 -1.01 -0.93 - -9.7 -0.98 -0.74 -0.15 0.49 -0.01 -0.92 -0.24 0.36 0.33 -0.11 -0.08 0.28 -0.9 -5.28 -1.18
Solyc01g091480.3.1 (Solyc01g091480.3)
-0.68 0.6 -1.01 -0.32 0.48 -0.11 1.86 0.06 0.72 -0.11 0.56 0.53 0.69 0.78 -0.44 -1.5 -1.28 -8.39 -7.8 -1.65 -0.11 -0.02 0.32 0.16 -0.24 -0.62 0.3 0.08 -0.26 0.08 0.18 -0.14 -3.7 -0.25
Solyc01g103570.3.1 (Solyc01g103570.3)
-0.45 0.22 -1.53 -1.23 1.05 0.46 1.51 0.14 0.61 0.17 0.54 0.55 0.13 0.45 -0.54 -0.89 -0.29 -3.43 -5.12 -2.03 -0.6 0.1 0.51 0.17 -0.26 -0.16 0.26 0.04 -0.22 -0.01 0.35 -0.21 -2.79 0.15
Solyc02g067710.2.1 (Solyc02g067710.2)
-1.77 -1.28 -1.87 -3.94 -1.27 -1.14 2.6 -1.86 0.97 0.98 1.32 0.05 1.81 0.81 -4.95 -4.38 -4.25 - - -2.91 -1.05 0.17 -0.17 0.17 -0.11 -1.23 0.49 0.2 -0.17 0.41 0.59 -0.35 -4.9 -0.52
Solyc03g019730.3.1 (Solyc03g019730.3)
-0.93 1.48 0.09 0.32 -1.11 -0.5 1.22 0.14 0.64 -0.07 -0.44 -0.17 -0.67 -0.16 0.76 0.45 0.49 -3.43 -4.74 -2.34 -2.1 0.16 0.28 0.01 -0.32 -1.1 0.67 0.37 0.2 0.27 0.54 -0.13 -2.53 -0.5
Solyc03g044380.3.1 (Solyc03g044380.3)
-0.81 1.66 -0.3 0.8 -0.25 -0.45 1.65 0.03 0.5 0.09 0.42 0.58 0.21 0.82 -0.09 -1.01 -0.76 -1.58 -0.06 -3.69 -0.72 -0.26 0.1 -0.16 -0.49 -2.49 -0.04 -0.42 -0.4 -0.32 -0.0 -0.69 -3.38 0.09
Solyc03g093850.2.1 (Solyc03g093850.2)
-0.76 1.47 -0.59 -0.38 -0.06 -0.62 1.59 0.27 0.88 0.25 0.0 0.08 1.24 0.97 0.32 0.35 0.07 -5.51 -5.27 -3.2 -1.06 -0.3 -0.01 -0.18 -0.84 -2.14 0.24 -0.04 -0.59 -0.46 -0.07 -0.85 -4.84 0.26
Solyc03g116880.3.1 (Solyc03g116880.3)
-0.63 -0.23 -0.78 -0.2 0.67 0.17 1.74 -0.02 0.83 -0.21 0.33 0.51 0.55 0.61 -0.11 -0.93 -0.64 -9.29 -9.89 -1.26 -0.64 0.12 0.21 0.04 -0.11 -1.41 0.34 0.17 0.01 0.15 0.27 -0.21 -0.92 -0.18
Solyc03g117010.3.1 (Solyc03g117010.3)
-0.61 -0.38 -1.92 -1.5 0.53 -0.43 1.92 -0.57 0.59 0.19 0.44 0.5 0.96 0.86 0.31 -0.38 -0.43 -10.82 - -1.33 0.22 0.08 0.2 -0.07 -0.5 -0.6 0.27 0.07 -0.28 0.14 0.28 0.09 -5.32 -0.31
Solyc03g117970.3.1 (Solyc03g117970.3)
-0.74 1.09 -1.14 0.21 -0.3 -0.81 1.72 -0.13 0.46 -0.37 0.08 -0.1 0.75 0.77 0.19 -0.36 -0.42 -4.63 -5.25 -1.52 -0.21 0.12 0.18 0.12 -0.19 -0.79 0.45 0.27 0.13 0.21 0.32 -0.09 -3.88 -0.39
Solyc03g120340.3.1 (Solyc03g120340.3)
0.14 0.58 -1.69 -0.41 -0.3 -1.18 2.01 -0.3 0.8 -0.22 0.62 0.74 0.71 1.08 -0.87 -1.6 -1.37 -7.09 -5.94 -2.15 -0.99 0.05 0.57 0.12 -0.41 -1.17 0.63 0.27 0.01 0.03 0.39 -0.4 -3.52 -0.08
Solyc04g040110.3.1 (Solyc04g040110.3)
-0.34 0.7 -1.31 -0.93 0.14 0.08 1.55 0.27 0.74 -0.16 0.73 0.33 1.25 1.29 0.2 -0.08 -0.3 -4.06 -4.6 -3.02 -0.98 -0.37 0.2 -0.13 -0.77 -1.51 0.36 0.11 -0.21 -0.34 -0.0 -0.83 -5.17 0.09
Solyc04g080600.3.1 (Solyc04g080600.3)
-0.72 -0.9 -1.45 -1.1 0.75 0.23 1.95 -0.51 0.61 0.34 1.63 1.26 1.48 1.39 -0.48 -1.19 -1.06 -7.67 -7.84 -4.35 -2.39 -0.85 -0.39 -0.9 -2.12 -3.43 0.52 0.1 -0.49 0.01 0.08 -1.2 -4.42 0.11
Solyc04g081450.3.1 (Solyc04g081450.3)
-0.43 0.85 -1.45 -1.13 0.55 0.04 1.52 0.19 0.75 0.15 0.59 0.75 1.17 1.01 -0.09 -0.7 -0.9 -1.7 -1.86 -1.09 -0.34 -0.55 -0.05 -0.7 -1.19 -0.63 0.4 -0.35 -0.23 -0.59 0.1 -0.93 -1.51 0.05
Solyc05g010610.3.1 (Solyc05g010610.3)
0.13 0.72 -1.4 -0.01 -0.54 -0.58 1.87 -0.37 0.43 0.26 0.62 0.51 1.23 1.03 -0.41 -1.19 -0.8 -6.3 -11.18 -2.01 -0.81 -0.19 -0.33 -0.41 -0.69 -1.23 0.35 0.07 -0.34 0.13 0.2 0.03 -2.57 0.66
Solyc05g014400.3.1 (Solyc05g014400.3)
-0.32 0.52 -0.67 -0.47 -0.99 -0.99 1.44 -0.02 0.76 0.23 0.9 -0.17 1.12 0.44 0.44 -0.18 -0.31 -2.95 -2.28 -2.57 -0.71 0.22 0.6 0.19 -0.31 -1.54 0.5 0.22 0.04 0.05 0.35 -0.34 -2.89 -0.76
Solyc05g044480.3.1 (Solyc05g044480.3)
0.35 -1.24 -1.96 -3.03 0.58 -0.34 1.58 -0.65 0.79 0.42 0.74 0.0 1.43 0.91 0.95 0.48 0.43 -4.64 -4.83 -3.31 -1.92 -0.14 0.11 -0.14 -0.69 -1.34 0.03 -0.03 -0.11 -0.25 0.04 -0.53 -3.91 0.16
Solyc05g056530.3.1 (Solyc05g056530.3)
-1.62 1.22 -1.32 -0.32 0.56 0.13 1.2 -0.45 0.33 -0.41 0.3 0.3 1.29 1.22 0.58 -0.09 -0.09 -1.51 -1.45 -3.56 -0.71 -0.43 0.36 -0.01 -0.72 -1.38 0.46 0.1 0.01 -0.46 -0.13 -1.15 -4.2 -0.16
Solyc06g048970.3.1 (Solyc06g048970.3)
-0.08 0.96 -1.2 -0.06 -0.83 -0.68 1.67 0.1 0.72 -0.29 0.43 0.73 0.59 0.93 -0.61 -1.12 -0.71 -1.14 -1.04 -2.08 -1.04 -0.13 0.25 -0.03 -0.46 -1.37 0.42 0.09 -0.13 0.0 0.29 -0.28 -2.08 0.28
Solyc06g054560.3.1 (Solyc06g054560.3)
-0.66 0.96 -1.03 -0.33 0.58 -0.26 1.74 -0.03 0.86 -0.1 0.72 0.22 1.1 1.17 -0.51 -0.87 -0.77 -2.38 -2.2 -2.22 -0.46 -0.4 0.24 -0.13 -0.76 -1.76 0.39 0.24 -0.22 -0.26 -0.02 -0.93 -3.4 -0.34
Solyc06g073540.3.1 (Solyc06g073540.3)
-0.79 -0.4 -4.38 -3.7 -2.07 -0.96 2.28 -0.76 1.08 -0.04 0.37 -0.4 0.84 0.77 0.24 -0.9 -0.92 -12.9 -12.77 -0.99 0.36 0.31 0.08 0.3 0.03 -0.15 0.46 0.38 0.15 0.32 0.43 0.12 -2.59 -0.73
Solyc06g083410.3.1 (Solyc06g083410.3)
0.67 -0.36 -0.59 -0.64 0.33 -0.74 1.71 -1.02 1.27 -0.09 0.01 -0.85 0.84 0.9 -0.59 -1.18 -1.31 0.78 -2.54 -0.08 -1.78 -0.34 0.61 0.08 -0.63 0.64 0.25 -0.07 -0.07 -0.44 -0.29 -1.06 -3.63 -0.46
Solyc06g083760.3.1 (Solyc06g083760.3)
0.08 0.14 -1.28 -1.5 -0.59 -0.63 1.57 -0.44 0.7 0.72 0.62 0.02 1.3 0.78 0.03 -0.36 -0.36 -2.01 -0.55 -2.6 -0.95 0.11 0.25 -0.05 -0.55 -1.26 0.41 0.09 -0.03 0.08 0.25 -0.19 -2.03 -0.31
Solyc07g062410.3.1 (Solyc07g062410.3)
-0.55 0.69 -1.32 -1.15 -1.27 -0.43 1.99 -0.3 0.36 -0.43 0.95 0.8 1.3 1.3 -0.03 -0.68 -0.76 - -11.39 -2.32 -0.57 -0.06 0.25 -0.01 -0.28 -3.33 0.37 0.02 -0.02 -0.12 0.19 -0.41 -2.35 -0.22
Solyc07g066660.3.1 (Solyc07g066660.3)
-0.4 1.06 -1.1 0.4 -0.72 -1.03 1.25 0.03 0.85 -0.12 -0.19 0.49 0.22 0.76 -0.09 0.41 0.35 -3.25 -3.67 -2.35 -1.07 0.09 0.56 0.18 -0.29 -0.96 0.67 0.22 -0.12 0.04 0.39 -0.43 -3.67 -0.37
Solyc08g006870.3.1 (Solyc08g006870.3)
-1.16 -1.37 -1.32 -0.88 -0.7 -0.0 2.27 -0.42 1.1 -0.21 0.09 0.18 0.77 0.21 -0.86 -2.36 -1.41 - -10.94 -3.04 -0.43 0.52 0.34 0.09 0.17 -1.7 0.59 0.6 0.48 0.57 0.49 0.53 -2.31 -0.25
Solyc08g065820.2.1 (Solyc08g065820.2)
-1.43 -1.93 -3.87 -4.86 -0.09 -0.15 2.0 -0.19 0.62 0.38 1.36 0.95 0.64 0.46 0.26 -0.41 -0.54 - - -2.23 -0.4 0.33 0.44 0.07 -0.48 -0.66 0.2 0.08 -0.19 0.34 0.56 0.39 -6.43 -0.99
Solyc08g078470.3.1 (Solyc08g078470.3)
-1.45 0.43 -2.02 -0.59 0.21 -0.88 2.28 -0.33 0.53 -0.96 0.82 1.55 1.05 1.99 -1.09 -1.81 -2.26 -5.7 -3.99 -3.56 -0.16 -0.41 0.16 -0.24 -0.87 -3.29 0.4 -0.1 -0.62 -0.52 0.03 -1.03 -5.44 -0.32
Solyc08g080580.3.1 (Solyc08g080580.3)
-0.24 1.18 -1.17 -0.46 -0.47 -0.66 1.6 0.11 0.98 -0.22 -0.23 -0.24 -0.26 0.22 -0.1 -0.16 -0.39 -6.95 -8.4 -1.74 -0.55 0.28 0.94 0.57 0.09 -1.24 0.67 0.41 0.12 0.28 0.49 -0.36 -3.14 -0.9
Solyc08g081120.3.1 (Solyc08g081120.3)
-1.09 0.66 0.45 0.32 -0.08 -0.54 1.4 0.02 0.87 -0.03 -0.35 -0.18 0.18 0.35 0.49 -0.06 -0.04 -3.37 -1.69 -2.0 -1.35 0.1 0.58 0.19 -0.52 -1.36 0.86 0.42 -0.28 0.28 0.46 -0.34 -2.85 -1.01
Solyc08g081650.2.1 (Solyc08g081650.2)
-2.73 -2.48 -4.76 - 0.67 0.16 1.84 -1.29 0.21 0.38 1.01 0.15 1.53 0.72 0.94 0.39 0.59 - - -1.92 0.21 -0.28 -0.06 -0.15 -0.33 -2.09 0.25 -0.08 -0.15 0.0 0.25 0.41 -4.06 -1.69
Solyc09g065630.3.1 (Solyc09g065630.3)
0.34 -1.16 -0.81 -2.74 0.68 -1.14 1.51 -0.92 1.19 0.09 0.78 0.53 1.61 1.3 -0.44 -1.24 -1.16 -2.09 -1.63 -0.58 0.07 -0.61 -0.09 -0.44 -0.86 -0.29 0.1 -0.34 -0.74 -0.53 -0.04 -0.86 -2.0 0.68
Solyc09g072890.2.1 (Solyc09g072890.2)
-0.56 0.4 -1.1 -0.73 0.03 -0.87 1.91 -0.9 0.4 -0.22 0.0 0.02 0.51 0.35 0.41 -0.22 -0.1 - - -1.18 -0.11 0.27 0.1 0.13 -0.06 -0.15 0.39 0.33 0.42 0.18 0.3 0.11 -2.63 -0.05
Solyc09g090870.3.1 (Solyc09g090870.3)
-0.85 -0.41 0.65 -2.28 0.0 0.09 2.16 0.37 0.42 0.35 0.24 -0.38 1.12 0.69 0.09 -0.36 -0.43 -7.45 -8.0 -1.56 -0.33 -0.11 0.0 -0.19 -0.57 -0.49 0.29 0.08 -0.35 -0.07 0.13 -0.24 -3.47 -0.36
Solyc09g091280.3.1 (Solyc09g091280.3)
-0.07 -0.02 -0.77 -0.87 -0.62 -0.93 1.46 -0.39 1.06 -0.48 0.53 -0.49 1.16 0.79 -0.3 -0.85 -0.89 -4.97 -8.32 -1.19 -0.0 0.18 0.46 0.2 -0.23 -0.68 0.58 0.52 0.15 0.26 0.45 0.01 -2.7 0.07
Solyc10g080280.2.1 (Solyc10g080280.2)
-0.31 0.42 -1.07 -0.62 0.88 0.15 1.77 0.11 0.6 0.36 0.33 -0.51 0.96 0.79 -0.36 -0.54 -0.61 -7.16 -6.86 -1.53 -0.45 0.09 0.01 -0.1 -0.54 -0.22 0.15 0.08 -0.16 0.01 0.26 -0.1 -3.16 -0.39
Solyc10g081250.2.1 (Solyc10g081250.2)
-0.75 0.21 -1.66 -1.21 -0.38 -1.22 1.87 -0.44 1.05 -0.41 0.65 0.25 1.36 1.34 -1.42 -2.64 -2.73 -10.33 - -1.81 -0.87 0.21 0.57 0.16 -0.56 -0.49 0.96 0.69 0.09 0.15 0.51 -0.26 -4.63 -0.93
Solyc11g008090.2.1 (Solyc11g008090.2)
-1.02 1.18 -0.41 -0.02 0.99 -0.0 1.59 0.24 0.31 -0.47 0.49 0.86 0.77 0.91 -0.33 -0.61 -0.55 -5.46 -6.09 -2.32 -0.14 -0.07 0.09 -0.18 -0.54 -1.56 0.18 -0.06 -0.41 -0.14 0.17 -0.53 -4.2 -0.47
Solyc11g008670.2.1 (Solyc11g008670.2)
-0.47 0.65 -0.65 -0.31 0.34 -0.37 1.69 -0.21 0.96 -0.47 0.96 0.54 1.27 1.38 -1.56 -2.67 -2.54 -3.28 -3.31 -2.38 0.18 -0.31 0.28 -0.04 -0.35 -2.91 0.41 0.18 -0.24 -0.26 0.1 -0.61 -3.8 -0.03
Solyc11g066340.2.1 (Solyc11g066340.2)
0.12 1.32 0.37 0.51 -0.67 -0.97 1.4 -0.44 0.67 -0.57 0.05 0.03 0.63 0.64 0.08 -0.22 -0.59 -5.1 -5.82 -1.15 -0.88 -0.32 0.71 0.12 -0.37 -1.7 0.69 0.51 0.08 -0.17 0.12 -0.71 -3.95 -0.37
Solyc11g066790.2.1 (Solyc11g066790.2)
-0.73 0.4 -0.97 -1.16 -1.12 -0.43 1.83 0.46 1.21 0.22 0.62 -0.72 0.95 0.09 0.33 -0.01 -0.09 -3.63 -4.48 -2.55 -0.46 0.32 0.78 0.46 -0.07 -1.53 0.33 0.23 -0.29 -0.03 0.24 -0.55 -4.24 -1.39
Solyc12g013970.2.1 (Solyc12g013970.2)
-0.81 0.6 -1.9 -0.25 -0.6 -0.52 1.87 0.23 1.14 0.7 -0.24 -0.2 0.51 0.13 0.42 -0.58 -0.27 - - -3.52 -1.4 0.3 0.66 0.49 -0.11 -2.32 0.67 0.44 -0.05 0.13 0.43 -0.09 -3.61 -0.85
Solyc12g044340.2.1 (Solyc12g044340.2)
-0.28 1.32 -0.85 0.39 -0.43 -0.95 1.25 0.06 0.52 -0.14 -0.25 -0.52 0.34 0.25 0.39 0.45 0.06 -3.07 -2.74 -1.98 -0.73 0.08 0.64 0.26 -0.13 -1.08 0.49 0.3 0.13 0.11 0.44 -0.29 -4.67 -0.48
Solyc12g099420.2.1 (Solyc12g099420.2)
-0.09 0.09 -1.28 -0.88 0.04 -0.29 1.32 -0.24 0.81 -0.36 0.18 -0.02 0.83 0.9 0.61 0.24 0.16 -4.95 -4.85 -1.47 -0.78 -0.04 0.11 -0.04 -0.41 -0.77 0.43 0.4 0.41 0.0 0.23 -0.22 -2.45 0.17

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.