Heatmap: Cluster_124 (HCCA cluster)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g006500.1.1 (Solyc00g006500.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc00g007570.2.1 (Solyc00g007570.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.99 - 3.8 - - - - - 3.6 -
Solyc00g017540.2.1 (Solyc00g017540.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.87 0.46 1.05 - 1.88 2.35 4.03 - 1.17 0.42 - -
Solyc01g014220.2.1 (Solyc01g014220.2)
- - - 1.56 - -3.2 - - 2.2 - 1.81 - - 0.57 - - - - - - - - - - 0.84 - - 0.93 2.6 3.36 - 0.35 - -
Solyc01g017760.1.1 (Solyc01g017760.1)
- - - - - - - - - - 1.09 - - - - - - - - - - - - 2.11 0.47 - 1.69 2.93 2.41 1.98 2.02 1.0 - -
Solyc01g020371.1.1 (Solyc01g020371.1)
- - - - 0.59 -2.71 - - - 0.17 - - - - - - - - - -1.92 -0.62 -2.04 - -2.12 -0.24 - -0.47 2.36 3.95 2.09 -0.72 1.47 - -
Solyc01g034067.1.1 (Solyc01g034067.1)
- - - - 2.45 - - - - - - - - - - - - - - - 4.13 2.7 - 2.17 - - - - - - - - - -
Solyc01g044543.1.1 (Solyc01g044543.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc01g049775.1.1 (Solyc01g049775.1)
- - - - - - - - - - 1.9 - - - - - - - - - - 3.08 - 1.48 2.14 - - 1.25 3.61 - - - - -
Solyc01g058380.1.1 (Solyc01g058380.1)
- - - -0.89 - -5.01 - - -3.53 - - - - - -3.85 -2.41 -4.22 - - -0.55 -3.28 2.15 1.68 0.81 2.06 - 0.06 0.49 1.84 2.1 - -2.23 0.21 2.8
Solyc01g060310.2.1 (Solyc01g060310.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.56 3.39 - - - - - -
Solyc01g087338.1.1 (Solyc01g087338.1)
- - - - - -0.92 -1.3 -0.86 - -0.99 1.78 0.28 0.34 -1.03 -0.11 -0.29 -0.04 - -1.41 - -0.87 -1.81 1.25 1.46 2.15 - 1.88 -0.02 -0.74 -1.13 -0.0 -0.2 1.43 0.85
Solyc02g032877.1.1 (Solyc02g032877.1)
- - - - - - 3.26 - - - - - - 2.17 - - - - - - - 2.72 - - - - - - - - - 3.74 - -
Solyc02g063542.1.1 (Solyc02g063542.1)
- - - - 2.62 - - - - - - - - - - - - - 4.8 - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g064790.1.1 (Solyc02g064790.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.82 -0.09 1.54 -0.84 - 1.27 2.6 2.42 3.18 - 2.3 - -
Solyc03g006715.1.1 (Solyc03g006715.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g013140.1.1 (Solyc03g013140.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - -
Solyc03g013225.1.1 (Solyc03g013225.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.3 - - - - - 3.27 3.86 - - - - -
Solyc03g034310.2.1 (Solyc03g034310.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.3 - - - - - - - - - - 2.69 1.75 - - 3.18 2.41 -
Solyc03g043665.1.1 (Solyc03g043665.1)
- - - - - -1.07 - - - - - - - 2.49 - - - - - -0.26 - -0.71 -0.51 -0.2 - - 4.08 -0.02 -1.32 - 1.74 0.64 - 0.78
Solyc03g043810.1.1 (Solyc03g043810.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.5 - 0.3 0.59 - 0.46 2.35 3.83 2.7 1.49 -0.96 - -
Solyc03g046370.2.1 (Solyc03g046370.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.38 - 2.24 3.38 - 2.88 3.16 - - -
Solyc03g051710.1.1 (Solyc03g051710.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.17 - - 4.0 - - - - - -
Solyc03g059290.1.1 (Solyc03g059290.1)
- - - - - 1.94 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.28 - - - - 1.6 4.12 - - - - -
Solyc03g097882.1.1 (Solyc03g097882.1)
3.84 - - - - - - - - - - - - - - 4.09 - - - - - - - 1.41 - - - - - - - - - -
Solyc03g116847.1.1 (Solyc03g116847.1)
1.49 0.28 - - 0.99 -1.5 0.73 -0.72 - -0.81 1.22 -0.24 0.63 -0.07 -1.26 - 1.11 -0.44 - -0.09 -0.01 0.14 -0.15 0.06 -0.1 - - 1.02 -0.1 2.21 - 0.55 - -0.25
Solyc04g016035.1.1 (Solyc04g016035.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.29 - - - - - - - 3.85 - - - - - - -
Solyc04g018067.1.1 (Solyc04g018067.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.89 3.6 - - 3.85 - -
Solyc04g049460.2.1 (Solyc04g049460.2)
- - - - - - - - 4.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.08 - - - - -
Solyc05g014570.1.1 (Solyc05g014570.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.05 - - 2.89 4.35 - - 2.06 - -
Solyc05g018525.1.1 (Solyc05g018525.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc05g018775.1.1 (Solyc05g018775.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.83 4.31 - - - - -
Solyc05g018860.1.1 (Solyc05g018860.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - -
Solyc05g023930.1.1 (Solyc05g023930.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - -
Solyc05g026330.2.1 (Solyc05g026330.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.77 - -0.64 1.69 - - 0.23 3.67 0.75 -0.5 3.6 - -
Solyc05g026335.1.1 (Solyc05g026335.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.42 - -0.15 1.16 - - -0.66 3.66 0.32 - 3.78 - -
Solyc05g032665.1.1 (Solyc05g032665.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc05g041260.1.1 (Solyc05g041260.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc05g041270.1.1 (Solyc05g041270.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 2.09 - - -0.47 3.59 1.73 - 3.65 - -
Solyc05g041320.1.1 (Solyc05g041320.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.14 - 0.3 0.67 - - 1.14 3.01 1.08 0.44 3.71 - -
Solyc05g041615.1.1 (Solyc05g041615.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.07 - -0.86 1.68 - - -0.19 3.59 0.61 - 3.77 - -
Solyc05g041670.2.1 (Solyc05g041670.2)
- - - - - - - - - - - - - 1.73 - - - - - - - 1.75 - 0.19 0.13 - 0.89 -0.78 2.27 2.66 0.81 3.29 - -
Solyc05g041940.1.1 (Solyc05g041940.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.39 2.51 - - 1.72 3.52 - - 3.68 - -
Solyc05g051110.2.1 (Solyc05g051110.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g050307.1.1 (Solyc06g050307.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc07g017827.1.1 (Solyc07g017827.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.71 - - - - - - - - - - - 3.45 4.05 - - - -
Solyc07g021467.1.1 (Solyc07g021467.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc08g015635.1.1 (Solyc08g015635.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.49 - 1.24 1.34 - - -0.28 -0.79 3.38 1.41 3.17 - -
Solyc08g061400.1.1 (Solyc08g061400.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.33 0.84 - - 1.13 3.01 2.8 - 3.87 - -
Solyc08g061410.2.1 (Solyc08g061410.2)
- -0.01 - 0.01 -0.71 -1.03 - - - - - - 0.6 - -0.27 - - - - - - - - -1.82 1.86 - - - 3.7 - - 3.36 - 0.45
Solyc08g061740.2.1 (Solyc08g061740.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - -
Solyc08g062110.2.1 (Solyc08g062110.2)
- - - - - - - - - - - - - 3.59 - - - - - - - - - - - - - 4.46 - - - - - -
Solyc08g062930.2.1 (Solyc08g062930.2)
1.27 - -4.1 - -0.54 0.63 - - -2.13 1.7 0.29 -3.32 - - 2.0 -0.67 -1.95 - - -2.92 -2.81 1.03 -5.13 -0.04 -0.84 -4.81 -3.91 2.3 1.21 1.33 0.74 1.88 - -0.94
Solyc08g062935.1.1 (Solyc08g062935.1)
1.06 - - - - -1.04 - - - - - - - - - - - - - - - -0.55 - 1.27 -0.44 - -0.65 3.6 -0.49 2.2 - 2.99 - 0.63
Solyc08g077670.2.1 (Solyc08g077670.2)
-2.51 -1.98 - - - -1.47 0.07 - -2.41 1.31 -0.3 -1.07 - -3.08 - 0.03 -1.54 - - -2.99 -0.12 -1.2 0.69 -0.42 1.19 - -2.82 0.52 3.72 -1.69 -2.79 2.4 - -2.59
Solyc08g079560.1.1 (Solyc08g079560.1)
- - - - - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.9 - - - - -
Solyc09g014622.1.1 (Solyc09g014622.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc09g018685.1.1 (Solyc09g018685.1)
- - - - - - - - - - 3.83 2.8 - 2.95 - - - - - 0.88 - - - 0.17 - - - - 1.12 - - - - -
Solyc09g042790.1.1 (Solyc09g042790.1)
- - - - - - - - - - - - - 4.41 - - - - - - - - - - - - 3.29 1.54 - - - - - -
Solyc09g055325.1.1 (Solyc09g055325.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.34 - - - - - - 1.9 - 3.32 - - -
Solyc09g060023.1.1 (Solyc09g060023.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - -
Solyc09g060180.2.1 (Solyc09g060180.2)
- - - - - - - - - - - - 1.61 -0.41 - - - - - - 3.62 - - 2.54 -2.33 - - 2.31 2.17 - - 1.3 - -
Solyc09g064775.1.1 (Solyc09g064775.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.73 - - 2.13 - - 4.52 - - -
Solyc10g019095.1.1 (Solyc10g019095.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc10g019230.2.1 (Solyc10g019230.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.8 4.33 - - - - -
Solyc10g026523.1.1 (Solyc10g026523.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.6 3.28 - - - - - -
Solyc10g033560.2.1 (Solyc10g033560.2)
- - - - - - - - - - - - - 4.43 - - - - - - - - - - - - 3.01 - 2.12 - - - - -
Solyc10g044580.1.1 (Solyc10g044580.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc10g045453.1.1 (Solyc10g045453.1)
- - - - - -0.92 - - - - - - - - 0.08 - - - - -0.27 - - - -0.08 0.62 - - 0.24 4.34 0.59 - 2.61 - -
Solyc10g049555.1.1 (Solyc10g049555.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc10g050775.1.1 (Solyc10g050775.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.77 - - - 3.69 2.89 - - - - -
Solyc10g055310.1.1 (Solyc10g055310.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc10g062120.1.1 (Solyc10g062120.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.18 4.88 - - - - -
Solyc10g079760.1.1 (Solyc10g079760.1)
3.32 - - - - 0.56 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.79 - - - - 2.63 - 3.24 - - - -
Solyc11g013537.1.1 (Solyc11g013537.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.57 2.18 2.52 - - - - -
Solyc11g027893.1.1 (Solyc11g027893.1)
- - - - 0.04 - - - - - - - - - - - - - - 2.46 1.72 - - - 1.01 - - - 3.61 - - 3.31 - -
Solyc11g045550.1.1 (Solyc11g045550.1)
- - - - - - - - - - - - - 2.88 - - - - - - - 3.11 - - - - - - 2.39 - 3.68 - - -
Solyc11g050900.2.1 (Solyc11g050900.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.17 - -0.41 1.38 - - 2.15 2.93 2.76 0.5 3.02 - -
Solyc12g016215.1.1 (Solyc12g016215.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc12g017760.1.1 (Solyc12g017760.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - -
Solyc12g032940.1.1 (Solyc12g032940.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.49 - - - - - - 2.54 2.51 - - - - -
Solyc12g042963.1.1 (Solyc12g042963.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - -
Solyc12g049430.1.1 (Solyc12g049430.1)
- - - - 1.22 -4.36 -4.95 - 1.69 0.12 - - -3.4 - - - -3.82 0.63 -0.36 - - 1.31 - 0.79 -0.35 - -4.11 0.15 3.56 0.89 -0.27 2.05 - -
Solyc12g070150.1.1 (Solyc12g070150.1)
- - - - 1.8 -2.04 - - - 2.21 - - - - - - - - -0.76 - - - - - -0.4 - 0.75 0.63 4.4 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.