Heatmap: Cluster_79 (HCCA cluster)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g008020.1.1 (Solyc00g008020.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g011673.1.1 (Solyc00g011673.1)
- - - - - - 2.2 - - - - - - - - - - - - - 4.88 - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g014170.1.1 (Solyc00g014170.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g014180.1.1 (Solyc00g014180.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g072405.1.1 (Solyc00g072405.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g011475.1.1 (Solyc01g011475.1)
- - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g016760.1.1 (Solyc01g016760.1)
- - - - - 2.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.72 - 3.82 2.41 - - - - - -
Solyc01g018025.1.1 (Solyc01g018025.1)
- - 0.37 2.12 3.49 -0.73 1.11 - 1.73 - - - - - - - -0.18 - - -0.15 0.91 - - -1.07 -1.7 1.73 - -1.28 - - 0.47 - 0.61 -
Solyc01g038230.1.1 (Solyc01g038230.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g038235.1.1 (Solyc01g038235.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g044373.1.1 (Solyc01g044373.1)
- - - - - 0.38 - - 3.26 - 2.09 2.31 2.17 - 1.1 - -0.27 - - -1.72 - - - - - 2.52 - - - - - - - -1.32
Solyc01g065621.1.1 (Solyc01g065621.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g032987.1.1 (Solyc02g032987.1)
2.61 - - - - - - - 4.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g043880.1.1 (Solyc02g043880.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g084470.1.1 (Solyc02g084470.1)
- - - - - - 3.02 - - - - - - - - 4.07 - - - - - - - - 2.24 - - 2.1 - - - - - -
Solyc03g013400.1.1 (Solyc03g013400.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g046545.1.1 (Solyc03g046545.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g061630.1.1 (Solyc03g061630.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g070420.1.1 (Solyc03g070420.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g078510.1.1 (Solyc03g078510.1)
- - - - - -0.72 - - - - 3.5 - - 2.37 - - - - - - - - - - 1.96 - - - 2.16 - - 3.1 - -
Solyc03g095783.1.1 (Solyc03g095783.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.39 - - - 2.19 - - - 3.78 2.37 - - - - -
Solyc03g097880.1.1 (Solyc03g097880.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g097886.1.1 (Solyc03g097886.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g017830.2.1 (Solyc04g017830.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.24 2.13 2.25 - 3.95 - - -
Solyc04g017833.1.1 (Solyc04g017833.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g017950.1.1 (Solyc04g017950.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g018020.2.1 (Solyc04g018020.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g025580.2.1 (Solyc04g025580.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g025710.2.1 (Solyc04g025710.2)
- 3.4 - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - 3.86 - -0.31 - 0.83 - - -1.35 1.6 0.88 - - - -
Solyc04g026278.1.1 (Solyc04g026278.1)
- - - - - - - - 4.93 - - - - - - - - - - - - - - 1.82 - - - - - - - - - -
Solyc04g039905.1.1 (Solyc04g039905.1)
- - - - -0.17 -0.53 - 3.19 1.26 3.07 0.94 - - - - 2.3 - - - - - - - 0.74 -0.18 - - - - 0.87 0.33 - - -
Solyc04g040220.3.1 (Solyc04g040220.3)
2.09 -2.69 0.8 -0.12 1.66 -0.99 2.88 -0.76 0.39 0.09 0.56 -0.16 -7.53 -7.73 - - -8.28 - -9.5 -5.61 -2.23 -1.56 0.56 -0.54 -2.03 -4.12 -3.7 -3.41 -3.07 -2.87 -1.2 -3.75 -1.68 2.65
Solyc04g049005.1.1 (Solyc04g049005.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc04g050090.1.1 (Solyc04g050090.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.57 4.47 - - - - -
Solyc04g051393.1.1 (Solyc04g051393.1)
- - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g016160.1.1 (Solyc05g016160.1)
- - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g016473.1.1 (Solyc05g016473.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g020005.1.1 (Solyc05g020005.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g025410.2.1 (Solyc06g025410.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g026603.1.1 (Solyc07g026603.1)
- - - - - 1.25 - - - - - - 3.88 - - - 4.08 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g032610.1.1 (Solyc07g032610.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc07g041860.1.1 (Solyc07g041860.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g028815.1.1 (Solyc08g028815.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g041715.1.1 (Solyc08g041715.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g062657.1.1 (Solyc08g062657.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g005136.1.1 (Solyc09g005136.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g014837.1.1 (Solyc09g014837.1)
- - - - - 3.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.4 - - - - - - -
Solyc09g031620.1.1 (Solyc09g031620.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g037010.2.1 (Solyc09g037010.2)
- - - - - 3.0 1.8 - - - - - - - - - 1.48 - - - 2.61 - 2.03 - 0.85 1.98 - 0.67 1.13 - - - - -
Solyc09g037070.2.1 (Solyc09g037070.2)
- - - - - - - - 3.34 - - - - - - - - - - - - - 1.68 2.27 1.41 - - 2.78 - - - - - 2.66
Solyc09g042695.1.1 (Solyc09g042695.1)
- - - - - 3.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.67 - - - - -
Solyc09g055200.1.1 (Solyc09g055200.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g056435.1.1 (Solyc09g056435.1)
- - - - - - 0.09 - 4.31 - - 0.83 - - - - 2.42 - - - - - - - 0.15 - - -0.34 0.08 - - 1.61 - -
Solyc09g059140.1.1 (Solyc09g059140.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g061370.1.1 (Solyc09g061370.1)
- - - - - 3.61 - - - - - - - - - - - - 2.96 - - - - - - - - 3.81 - - - - - -
Solyc10g045440.1.1 (Solyc10g045440.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g045690.1.1 (Solyc10g045690.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g052770.1.1 (Solyc10g052770.1)
- - - - 3.23 - - - - - - - - - - - - - - 4.62 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g054500.1.1 (Solyc10g054500.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g085665.1.1 (Solyc10g085665.1)
- - - -1.15 -2.14 0.18 1.07 -1.17 1.8 1.88 -0.73 - 0.82 -1.21 1.93 - 0.57 1.88 - -0.47 - -0.85 -1.81 -0.63 -0.81 1.46 0.98 -1.24 -0.19 -0.9 -0.09 -1.3 - -
Solyc10g085840.1.1 (Solyc10g085840.1)
- - - - - 4.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.06 - - - - - - - 3.47 - -
Solyc11g012817.1.1 (Solyc11g012817.1)
- - - - - - - - - 3.5 4.09 - 2.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g017435.1.1 (Solyc11g017435.1)
- - - - 4.39 1.88 - 1.8 - - - 0.49 - 0.72 - - - - - - - 1.11 - - - - - -0.52 - - - - - -
Solyc12g016150.1.1 (Solyc12g016150.1)
- - - - - - - - - - - - - 4.71 - - - - - - - - - - - - 2.98 - - - - - - -
Solyc12g035220.1.1 (Solyc12g035220.1)
- - - - - 3.89 - - - - - - - 3.55 - - - - - - - - - - 2.9 - - - - - - - - -
Solyc12g036745.1.1 (Solyc12g036745.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc12g038010.1.1 (Solyc12g038010.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc12g044430.1.1 (Solyc12g044430.1)
- - - - - 1.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.99
Solyc12g062430.1.1 (Solyc12g062430.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.